Heatmap: Cluster_3 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.1 0.05 0.34 0.82 0.0 0.33 0.0 0.2 0.0 1.0 0.0 0.69 0.0 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.72 0.56 0.2 0.24 0.27 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.0 0.0 0.02 0.04 0.19 0.0 0.15 0.12 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.24 0.0 0.13 0.47 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.06 0.12 1.0 0.34 0.1 0.35 0.44 0.1 0.3 0.02 0.45 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.15 0.0 0.15 0.24 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.32 0.01 0.0 0.11 0.17 0.1 1.0 0.03 0.08 0.05 0.4 0.13 0.0 0.41
0.0 0.0 0.0 1.0 0.09 0.0 0.15 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.52 0.1 0.37 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.04 0.03 0.0 1.0 0.02 0.17 0.0 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.19 0.04 0.0 0.07 0.21 0.06 1.0 0.11 0.09 0.07 0.0 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.04 1.0 0.02 0.23 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.24 0.0 0.04 0.0 0.29 0.0 0.96 1.0 0.0
0.0 0.6 0.0 0.13 1.0 0.0 0.98 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.07 0.1 0.0 0.05 1.0 0.17 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.38 1.0 0.33 0.0 0.16 0.65 0.56 0.13 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.12 0.43 1.0 0.24 0.0 0.12 0.14 0.1 0.32 0.26 0.35 0.33 0.06 0.14
0.0 0.0 1.0 0.0 0.75 0.0 0.34 0.0 0.06 0.0 0.24 0.0 0.14 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.18 0.05 0.05 0.76 0.04 1.0 0.0 0.0 0.08
0.0 0.23 0.0 1.0 0.64 0.0 0.54 0.0 0.05 0.11 0.16 0.59 0.26 0.0 0.0
0.05 0.13 0.07 0.17 0.45 1.0 0.06 0.03 0.11 0.03 0.1 0.0 0.15 0.14 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.73 0.0 0.13 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.76 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.7 0.09 0.34 0.29 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.44 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.48 1.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.32 0.56 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.27 0.0 0.6 0.0 0.04 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.06 0.07 0.33 0.0 0.28 0.01 0.25 0.16 0.11 0.0 1.0 0.0 0.24
0.0 0.05 0.22 0.0 0.49 0.0 0.6 0.02 0.06 0.03 0.48 0.04 1.0 0.04 0.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.13 1.0 0.0 0.84 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.57 0.21 0.27 0.24 1.0 0.33 0.11 0.01 0.05 0.3 0.0 0.01 0.45 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0
0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 1.0 0.78 0.72 0.78 0.15 0.54 0.64 0.74 0.74 0.65 0.76 0.76 0.53 0.13
0.0 0.05 0.02 0.04 1.0 0.19 0.04 0.6 0.01 0.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.1 0.33 0.57 0.0 0.6 0.0 0.25 0.08 0.58 0.24 1.0 0.17 0.05
0.0 0.01 0.05 0.46 0.23 0.0 0.07 0.05 0.25 0.33 0.32 1.0 0.17 0.0 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.21 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.51 0.0 0.0 1.0 0.92 0.0 0.05 0.55 0.21 0.0 0.12 0.56 0.98 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.1 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.21 0.0 0.0 0.07 0.0 0.24 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.05 0.6 0.0 0.15 1.0 0.12 0.2 0.09 0.33 0.15 0.0 0.06

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)