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Heatmap: Cluster_20 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- 2.77 - - 0.52 - - - - - - - -0.16 2.55 -
- - - 3.89 -2.97 - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- 0.1 - 2.28 -0.77 - -1.34 -1.15 2.11 -0.21 -0.49 -0.07 -0.33 - -
-1.65 -2.14 -4.0 1.83 -0.94 - 0.15 -3.7 -0.39 -5.08 -1.44 -1.72 -1.28 -3.8 2.85
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - 3.89 -2.42 - - - - - - - - - -
- - - - -3.27 - -3.24 - - - - - - - 3.89
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
2.78 - 2.82 - -1.38 - -1.17 - -2.12 - - - - - -
- - - 3.83 -0.75 - - - - - -2.5 - - - -
- - - - 3.05 - - - 2.75 - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
2.06 - - 3.44 - - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - -0.51 3.53 1.25 - - - - - -2.48 - -2.38 - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.04 - - - - - 2.76 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.3 - - - - - 2.37 - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - - 0.5 - - - 2.21 - 3.16 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - 3.78 - 0.02 - - - - - -2.18 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - -0.83 - - - - - -1.57 - - 3.82 -
- - - 2.6 0.08 - - - 1.93 - 1.59 - 0.11 - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - 3.89 -2.98 - - - - - - - - - -
- -3.86 -1.69 -1.98 0.92 0.61 -0.25 1.01 -1.41 0.02 -1.86 - 1.86 0.0 0.85
- - - 3.82 - - - - -0.27 - - - - - -
- - - - 2.19 - - - 3.22 - 0.13 - - - -
- - 1.76 2.86 1.36 - - - - - 0.84 - - - -
- - - - 3.04 - - - - - 2.76 - - - -
- - 1.9 - -0.15 - 0.39 - 3.06 - -0.52 - - - -
- - - - 2.33 - 3.04 - - - 0.81 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - 3.89 - - -2.65 - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - -0.39 -1.13 - - - 0.82 -1.81 0.12 0.28 -1.79 - 3.19
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
0.36 - - - 1.05 - 2.39 - 0.81 -1.66 -0.74 - -0.79 1.66 -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 2.51 - - - 2.71 - 1.45 - - - -
- 3.47 - - 0.69 - 0.7 - - - -0.52 - - - -
- - - - -0.59 - 3.27 - - - 2.23 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - 3.88 -2.1 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.