1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_101 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
- - 3.07 - - - - - 0.29 - - 2.43 - - -
1.7 - - - 1.33 - - - -2.04 - 3.17 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - 2.27 -1.09 - 0.83 - 0.65 2.32 0.44 - - - -
- - - - 0.45 - - - 3.42 - 1.56 - - - -
- - - - - - 0.22 - 1.68 - - - 3.41 - -
- - 1.75 3.54 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.91 - -
- - - - -0.74 - - - -1.86 -1.28 -0.09 - 3.02 2.22 -
- - - - - - - - 3.46 - 2.01 - - - -
- - - - -2.98 - - - - 3.07 -3.33 - 2.68 - -
- - - - -0.43 - 2.65 - 1.38 - -1.69 - 2.35 - -
- - - - -2.41 3.83 - - -1.51 - -2.16 - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - -0.31 - - - - - - - 3.83 - -
- - - 2.86 -4.72 2.55 - - - - - 0.92 - - -
- - - - - - - - - - - - 3.91 - -
- 3.18 0.66 - -0.53 - - - 1.05 - -0.95 - 0.09 - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - -1.86 - -2.44 -1.19 1.11 0.57 -4.12 2.66 0.66 - 1.32
- - - - - - - - - - - - 3.91 - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - -1.0 - - - - - - 3.86 - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
3.85 - - - -2.44 - - - -1.27 - - - - - -
- - - - - - 2.95 - 2.86 - - - - - -
- - - - 0.6 - - - - - -0.02 - 3.64 - -
- - - - - - 3.73 - - - 0.77 - - - -
- - - - 0.27 - - - 3.79 - - - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.91 - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - 2.25 - - - 3.36 - - - - - -
- -0.39 - 3.59 -0.64 - - - 0.26 - -2.43 - -2.82 - -
- - - - 0.58 - - - 3.42 - 1.48 - - - -
- - - - 3.1 - - - 2.68 - - - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - 3.75 - - - - - 0.67 - - - -
- - - - - - - - - - 0.68 - 3.74 - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.91 - -
- - - 1.96 -4.37 - -5.2 - -6.2 -1.41 2.68 -2.06 1.81 -1.04 -6.46
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.91 - -
- - - - 1.23 - - - - - - - 3.66 - -
- - - - 0.24 - - - 0.81 1.14 -1.21 2.36 0.88 - 1.31
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- -2.09 -0.29 2.77 -8.16 -0.78 -0.9 - -4.03 - 0.53 -3.32 1.27 0.99 -
-0.63 3.42 1.41 - -6.5 - - - -2.87 - -0.71 - -2.06 - -
- - - - - - - - 3.45 - 2.03 - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.91 - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- -4.46 -2.09 -1.3 0.59 - 0.66 1.17 1.08 1.04 -1.41 -1.65 1.71 -0.67 -2.18
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- 0.18 -0.55 -3.67 1.51 1.27 0.55 1.21 -0.21 -1.48 -0.83 -4.7 0.37 -0.75 -1.53
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- 0.69 - - -0.05 - -0.27 0.81 -1.82 1.4 -0.44 1.42 -0.91 - 1.57
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - 2.43 -2.94 - -0.94 0.43 0.84 - 0.32 - 2.19 - -
-4.57 -0.43 -2.12 -1.54 -0.51 -0.36 0.69 -2.45 0.24 -0.46 0.61 -1.1 2.41 0.02 -3.08
- - - - - - - - - - - - 3.91 - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - -0.2 - - - 3.65 - 0.68 - - - -
- - - 3.89 -3.87 - - - - - -3.24 - - - -
- -0.41 -0.99 -1.32 0.57 -1.0 0.04 1.01 0.86 0.07 0.88 0.59 -0.73 -0.89 -0.04
- -0.13 -0.75 -1.09 0.56 -1.2 0.26 1.16 0.88 -0.2 0.56 0.13 -0.28 -0.55 -0.15
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
1.75 - - 3.54 - - - - - - - - - - -
- - - - 1.57 - - - 3.4 - 0.55 - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - 1.1 - - - - - 3.68 - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - - 1.99 - - - 3.11 - 1.26 - - - -
- - - - - - - - 3.61 - 1.49 - - - -
- 1.33 - - - - - - - - -1.3 3.3 1.17 - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - -2.57 - 1.06 - 1.65 - - - 3.27 - -
- - 3.91 - - - - - - - - - - - -
- - - - -3.27 - - - 0.86 - 0.64 2.2 2.79 - -
- 1.8 - 3.47 -5.41 - - - -2.8 - -1.75 - - - -
2.37 -0.84 -0.34 - -3.07 - - - 0.67 1.24 -0.35 - 1.86 - -
- - - - -2.71 - - - - - -2.46 - 3.87 - -
- - - - - - - - 3.2 - 2.53 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
2.6 - 3.16 - - - - - - - - - - - -
- - - - -5.76 2.64 - - -1.6 1.86 0.1 - 0.9 0.89 -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- 3.74 - - -3.93 - - - 0.4 - -1.79 - - - -
- -0.69 0.34 -0.8 0.3 0.52 -0.2 0.39 0.07 -0.39 0.16 -0.19 -0.38 0.99 0.18
-3.42 -0.32 -0.64 -2.41 1.16 1.13 -0.47 0.83 0.46 -0.09 0.07 -0.15 -1.01 -0.25 -0.39
- - - - -2.12 - - - 1.08 - 0.79 - 3.45 - -
- - - 2.04 -2.95 - - - -1.22 0.52 1.19 - 2.72 - -
- - 3.91 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - - - - - - - 1.33 - 3.64 - -
- - - 3.02 - - - - 2.32 - -2.14 0.73 - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - 3.9 - - - - - - -4.02 - - - -
1.31 - - 3.65 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 1.2 - - 3.67 - - -
- 3.47 - - - - - - - - 1.97 - - - -
2.17 - - - -2.93 - - - 1.04 0.95 0.07 -1.97 2.34 - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- -3.56 -1.58 -0.34 0.73 - 0.32 1.0 0.89 0.79 -1.14 -0.62 1.67 -1.17 -0.81

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.