Heatmap: Cluster_247 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.35 0.36 0.26 0.48 0.94 1.0 0.41 0.68 0.7 0.6 0.43 0.78 0.91 0.51
0.0 0.75 0.84 0.75 0.79 1.0 0.86 0.83 0.72 0.78 0.83 0.62 0.91 0.58 0.83
0.0 0.67 0.96 0.62 0.65 1.0 0.77 0.85 0.61 0.68 0.58 0.52 0.65 0.5 0.78
0.0 0.95 1.0 0.29 0.27 0.34 0.29 0.32 0.26 0.35 0.23 0.19 0.31 0.15 0.24
0.16 1.0 0.69 0.41 0.41 0.75 0.61 0.6 0.49 0.43 0.47 0.39 0.54 0.36 0.43
0.14 0.08 0.25 0.17 0.89 0.2 0.85 1.0 0.82 0.49 0.3 0.35 0.43 0.11 0.36
0.0 0.61 0.64 0.49 0.78 0.69 0.86 0.6 1.0 0.79 0.53 0.66 0.96 0.45 0.59
0.0 0.72 0.75 0.47 0.73 0.88 1.0 0.99 0.77 0.75 0.63 0.48 0.76 0.46 0.91
0.0 0.21 0.55 0.54 0.63 0.19 1.0 0.31 0.66 0.7 0.25 0.16 0.43 0.19 0.32
0.34 0.77 0.86 0.63 0.6 0.92 1.0 0.73 0.87 0.73 0.56 0.66 0.72 0.38 0.76
0.0 1.0 0.86 0.65 0.55 0.58 0.62 0.68 0.51 0.55 0.53 0.55 0.54 0.41 0.5
0.0 0.98 0.9 0.77 0.9 0.95 1.0 0.94 0.7 0.6 0.95 0.51 0.54 0.39 0.49
0.17 1.0 0.88 0.58 0.47 0.59 0.58 0.58 0.74 0.57 0.46 0.51 0.48 0.29 0.52
0.0 0.97 0.83 0.69 0.75 0.55 1.0 0.84 0.62 0.72 0.86 0.6 0.76 0.75 0.55
0.0 0.25 0.33 0.38 0.54 0.91 0.67 0.42 0.63 0.64 0.86 0.47 0.83 1.0 0.44
1.0 0.78 0.99 0.46 0.39 0.56 0.5 0.35 0.44 0.45 0.43 0.32 0.33 0.34 0.32
0.0 0.55 0.46 0.74 0.69 0.87 1.0 0.79 0.88 0.99 0.83 0.81 0.78 0.95 0.64
0.09 1.0 0.81 0.57 0.49 0.56 0.65 0.56 0.5 0.43 0.55 0.4 0.37 0.33 0.5
0.0 0.78 0.68 1.0 0.84 0.13 0.53 0.28 0.1 0.16 0.72 0.11 0.47 0.05 0.18
0.18 0.73 0.58 0.48 0.34 0.63 0.5 0.26 0.48 0.53 0.64 0.33 1.0 0.44 0.43
0.03 1.0 0.92 0.61 0.46 0.47 0.71 0.4 0.65 0.56 0.54 0.3 0.8 0.51 0.47
0.0 0.91 1.0 0.95 0.63 0.95 0.89 0.7 0.62 0.67 0.8 0.59 0.58 0.67 0.46
0.18 0.44 0.59 0.57 0.38 1.0 0.56 0.41 0.36 0.36 0.45 0.39 0.41 0.39 0.53
0.39 0.7 0.77 0.53 0.58 1.0 0.73 0.53 0.67 0.59 0.6 0.44 0.54 0.44 0.54
0.03 0.66 0.73 0.77 0.55 0.87 1.0 0.53 0.4 0.73 0.8 0.71 0.85 0.87 0.62
0.0 0.55 0.92 0.64 0.67 0.89 1.0 0.88 0.36 0.77 0.64 0.96 0.4 0.78 0.83
1.0 0.63 0.81 0.41 0.38 0.51 0.42 0.32 0.59 0.49 0.37 0.26 0.45 0.2 0.25
0.2 0.63 1.0 0.77 0.66 0.88 0.75 0.7 0.86 0.82 0.68 0.6 0.68 0.52 0.7
0.0 1.0 0.84 0.47 0.36 0.47 0.45 0.43 0.43 0.43 0.45 0.45 0.38 0.31 0.36
0.04 0.77 1.0 0.64 0.56 0.72 0.67 0.57 0.57 0.63 0.52 0.54 0.48 0.39 0.58
0.0 0.53 0.56 0.27 0.66 0.38 0.8 0.86 1.0 0.65 0.53 0.34 0.7 0.62 0.5
0.0 0.85 1.0 0.39 0.38 0.44 0.5 0.41 0.42 0.37 0.31 0.24 0.23 0.25 0.25
0.0 0.09 0.13 0.22 0.17 1.0 0.18 0.32 0.26 0.3 0.24 0.14 0.19 0.19 0.16
0.2 0.98 0.98 0.68 0.65 0.69 1.0 0.84 0.81 0.8 0.75 0.51 0.72 0.56 0.62
0.0 0.19 0.45 0.49 0.52 1.0 0.67 0.57 0.41 0.41 0.54 0.44 0.43 0.57 0.77
0.0 0.82 0.75 0.61 0.66 1.0 0.85 0.66 0.8 0.85 0.74 0.72 0.67 0.58 0.74
0.0 0.54 0.36 0.34 0.55 0.52 0.66 0.68 1.0 0.69 0.7 0.66 0.73 0.88 0.61
0.0 0.83 1.0 0.81 0.68 0.73 0.96 0.75 0.76 0.9 0.74 0.72 0.85 0.47 0.77
0.0 0.53 0.73 0.54 0.61 1.0 0.66 0.77 0.7 0.66 0.76 0.81 0.76 0.56 0.83
0.0 0.85 0.76 0.6 0.59 0.7 1.0 0.72 0.93 0.57 0.67 0.62 0.66 0.55 0.51
0.18 0.88 0.94 0.68 0.79 0.86 1.0 0.61 0.87 0.76 0.69 0.61 0.87 0.4 0.92
0.0 0.78 0.87 1.0 0.38 0.57 0.47 0.43 0.31 0.37 0.36 0.34 0.32 0.33 0.4
0.0 0.13 1.0 0.29 0.26 0.24 0.44 0.2 0.54 0.61 0.38 0.25 0.6 0.31 0.26
0.0 1.0 0.82 0.79 0.59 0.7 0.71 0.46 0.32 0.49 0.52 0.22 0.43 0.32 0.39
0.19 0.84 0.93 0.64 0.66 0.84 1.0 0.63 0.93 0.79 0.73 0.59 0.65 0.7 0.64
0.05 1.0 0.68 0.53 0.47 0.61 0.67 0.55 0.49 0.56 0.43 0.47 0.39 0.45 0.5
0.06 0.71 0.76 0.46 0.61 1.0 0.77 0.57 0.67 0.66 0.56 0.47 0.6 0.44 0.51
0.02 0.81 0.45 0.82 0.47 0.89 0.82 0.63 0.61 0.62 0.88 0.68 0.69 1.0 0.75
0.63 0.74 1.0 0.67 0.48 0.76 0.65 0.52 0.47 0.49 0.48 0.4 0.48 0.28 0.34
0.0 0.53 0.77 1.0 0.29 0.75 0.64 0.27 0.57 0.58 0.4 0.29 0.46 0.43 0.44
0.01 1.0 0.51 0.33 0.48 0.47 0.48 0.36 0.53 0.43 0.39 0.36 0.55 0.23 0.48
0.06 1.0 0.99 0.68 0.63 0.98 0.92 0.63 0.78 0.86 0.7 0.63 0.85 0.7 0.81
0.0 0.77 0.67 0.59 0.61 0.57 0.96 0.58 1.0 0.68 0.73 0.71 0.71 0.63 0.76
0.06 1.0 0.9 0.52 0.4 0.58 0.51 0.82 0.49 0.52 0.54 0.55 0.6 0.31 0.47
0.46 0.63 0.75 0.57 0.61 1.0 0.81 0.51 0.74 0.69 0.58 0.48 0.74 0.48 0.67
0.0 1.0 0.77 0.4 0.21 0.56 0.76 0.34 0.24 0.44 0.41 0.31 0.48 0.37 0.46
0.17 0.78 0.85 0.69 0.88 1.0 0.9 0.75 0.98 0.74 0.61 0.37 0.52 0.58 0.7
0.11 1.0 1.0 0.49 0.41 0.49 0.47 0.47 0.42 0.51 0.34 0.31 0.44 0.19 0.31
0.35 0.75 1.0 0.69 0.7 0.87 0.83 0.85 0.85 0.79 0.68 0.61 0.79 0.47 0.76
0.03 0.94 0.79 0.66 0.5 1.0 0.78 0.48 0.6 0.55 0.66 0.45 0.45 0.37 0.54
0.0 0.69 0.52 0.25 0.39 0.68 0.53 0.36 1.0 0.55 0.3 0.37 0.42 0.21 0.23
0.02 1.0 0.68 0.46 0.53 0.6 0.69 0.61 0.59 0.49 0.62 0.61 0.54 0.48 0.61
0.05 1.0 0.93 0.55 0.62 0.7 0.75 0.66 0.65 0.55 0.62 0.55 0.57 0.36 0.6
0.0 0.18 0.31 0.39 0.28 1.0 0.4 0.33 0.28 0.28 0.39 0.25 0.35 0.22 0.46
0.18 1.0 0.7 0.61 0.54 0.8 0.83 0.66 0.87 0.73 0.58 0.71 0.54 0.44 0.56
0.08 1.0 0.77 0.58 0.46 0.5 0.71 0.5 0.9 0.58 0.67 0.49 0.79 0.58 0.49
0.0 0.91 0.95 0.95 0.69 1.0 0.96 0.74 0.97 0.82 0.72 0.75 0.87 0.65 0.77
0.0 0.17 0.37 0.59 0.6 0.44 0.69 0.69 0.77 0.65 0.64 0.34 1.0 0.61 0.3
0.05 1.0 0.97 0.58 0.63 0.89 0.8 0.53 0.76 0.64 0.53 0.61 0.49 0.46 0.49
0.0 1.0 0.47 0.4 0.59 0.51 0.75 0.69 0.59 0.53 0.73 0.55 0.49 0.6 0.73
0.0 0.46 0.55 1.0 0.56 0.57 0.86 0.53 0.9 0.77 0.61 0.58 0.84 0.57 0.61
0.19 1.0 0.65 0.51 0.41 0.41 0.43 0.43 0.55 0.41 0.35 0.36 0.34 0.28 0.39
0.06 0.73 0.71 0.59 0.88 0.68 0.97 0.76 1.0 0.78 0.71 0.74 0.86 0.5 0.92
0.0 1.0 0.92 0.56 0.43 0.73 0.52 0.54 0.52 0.5 0.47 0.48 0.42 0.26 0.42
0.02 0.36 0.46 0.29 0.52 0.53 0.88 0.44 0.5 0.56 0.66 0.35 1.0 0.56 0.33
0.13 0.45 0.45 0.31 0.42 0.36 0.54 0.46 0.52 0.53 0.46 0.38 1.0 0.56 0.39
0.31 1.0 0.83 0.61 0.4 0.57 0.59 0.48 0.48 0.5 0.41 0.48 0.39 0.36 0.48

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)