Heatmap: Cluster_250 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.0 0.0 0.21 0.02 0.0 0.21 0.01 0.19 1.0 0.51 0.0 0.29 0.3 0.49
0.0 0.05 0.07 0.04 0.16 0.06 0.79 0.22 0.36 0.68 0.88 0.22 1.0 0.6 0.32
0.0 0.01 0.0 0.18 0.02 0.11 0.08 0.0 0.08 0.51 1.0 0.23 0.58 0.13 0.02
0.0 0.25 0.24 0.58 0.3 0.67 0.37 0.51 0.31 0.52 0.47 1.0 0.32 0.57 0.82
0.0 0.05 0.17 0.17 0.14 0.24 0.71 0.08 0.34 0.7 0.46 0.49 0.17 1.0 0.41
0.0 0.02 0.11 0.07 0.17 0.09 0.99 0.02 0.31 1.0 0.58 0.19 0.12 0.36 0.16
0.0 0.12 0.13 0.13 0.16 0.19 0.48 0.11 0.38 1.0 0.62 0.59 0.17 0.62 0.55
0.0 0.11 0.14 0.22 0.37 0.13 0.99 0.05 0.45 1.0 0.71 0.39 0.11 0.21 0.22
0.01 0.21 0.34 0.23 0.18 0.36 0.8 0.1 0.26 0.65 0.5 0.37 0.23 1.0 0.3
0.0 0.18 0.5 0.3 0.19 0.31 0.8 0.13 0.21 0.79 0.42 0.65 0.19 1.0 0.38
0.0 0.22 0.02 0.0 0.58 0.0 0.8 0.84 0.52 0.36 0.72 0.32 0.41 0.42 1.0
0.0 0.19 0.19 0.51 1.0 0.0 0.98 0.95 0.43 0.79 0.65 0.29 0.2 0.44 0.31
0.0 0.61 0.47 0.32 0.42 0.14 0.91 0.17 0.35 0.39 1.0 0.29 0.61 0.84 0.33
0.0 0.01 0.03 0.2 0.03 0.0 0.16 0.06 0.17 0.19 0.15 1.0 0.64 0.05 0.94
0.0 0.01 0.03 0.03 0.04 0.28 0.26 0.09 0.1 0.44 0.36 1.0 0.21 0.4 0.61
0.0 0.31 0.25 0.21 0.19 0.37 0.25 0.22 0.29 0.25 0.33 0.78 0.23 0.19 1.0
0.0 0.4 0.79 0.39 0.66 0.59 0.82 0.68 0.64 0.57 1.0 0.26 0.51 0.61 0.35
0.0 0.0 0.05 0.15 0.07 0.0 0.03 0.06 0.07 0.31 0.66 1.0 0.0 0.0 0.33
0.0 0.26 0.27 0.46 0.33 1.0 0.65 0.36 0.35 0.5 0.63 0.34 0.34 0.49 0.65
0.0 0.81 0.6 0.79 0.28 0.46 0.48 0.27 0.52 0.32 0.79 1.0 0.46 0.34 0.53
0.04 0.22 0.3 0.25 0.28 0.28 0.28 0.33 0.42 0.43 0.48 1.0 0.36 0.39 0.64
0.0 0.22 0.32 0.19 0.15 0.18 0.51 0.41 0.16 0.42 0.61 1.0 0.12 0.37 0.59
0.09 0.52 0.48 0.48 0.35 0.55 0.38 0.39 0.41 0.47 0.55 1.0 0.44 0.45 0.76
0.0 0.02 0.04 0.01 0.02 0.0 0.14 0.0 0.15 0.16 0.17 0.08 0.38 0.0 1.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.08 0.09 0.06 0.34 0.0 1.0
0.02 0.71 0.7 0.82 0.48 0.69 0.79 0.54 0.35 0.71 0.79 1.0 0.5 0.64 0.76
0.0 0.59 0.26 0.15 0.5 0.28 0.89 0.87 0.74 0.54 0.82 1.0 0.45 0.71 0.82
0.0 0.3 0.26 0.19 0.33 0.16 1.0 0.56 0.32 0.31 0.45 0.66 0.42 0.58 0.55
0.0 0.4 0.23 0.14 0.33 0.35 0.59 1.0 0.28 0.25 0.39 0.46 0.6 0.56 0.43
0.0 0.8 0.61 0.31 0.51 0.98 0.76 0.68 0.54 0.57 0.61 0.7 0.7 0.46 1.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.42 0.58 0.0 0.13 0.78 0.27 0.48 0.38 0.26 1.0
0.01 0.0 0.03 0.06 0.01 0.04 0.06 0.0 0.03 0.99 1.0 0.0 0.11 0.03 0.05
0.0 0.21 0.31 0.64 0.18 0.3 0.34 0.32 0.39 1.0 0.86 0.31 0.44 0.41 0.54
0.0 0.27 0.17 0.06 0.13 0.07 0.15 0.34 0.08 0.17 0.23 0.48 0.16 0.06 1.0
0.0 0.09 0.06 0.15 0.03 0.07 0.24 0.07 0.18 0.29 0.51 0.77 0.19 0.11 1.0
0.0 0.33 0.22 0.19 0.15 1.0 0.31 0.24 0.16 0.46 0.42 0.69 0.41 0.25 0.9
0.0 0.15 0.17 0.19 0.18 0.11 0.26 0.56 0.37 0.32 0.45 0.48 0.3 0.05 1.0
0.0 0.2 0.07 0.17 0.06 0.5 0.17 0.06 0.17 0.45 0.19 0.92 0.24 0.3 1.0
0.25 0.56 0.56 0.63 0.28 0.34 0.57 1.0 0.51 0.63 0.71 0.66 0.64 0.4 0.68
0.0 0.0 0.0 0.27 0.16 0.0 0.26 0.0 0.04 0.0 1.0 0.29 0.35 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.14 0.07 0.99 0.22 0.0 0.1 0.4 1.0 0.06 0.55 0.18 0.4
0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.21 0.5 0.06 0.84 0.55 0.19 0.54 1.0 0.74 0.98 0.65 0.62
0.0 0.22 0.26 0.55 0.39 0.61 0.69 0.28 0.35 0.33 1.0 0.61 0.67 0.8 0.59
0.0 0.03 0.09 0.25 0.14 0.5 0.53 0.2 0.25 0.37 0.56 0.61 0.49 0.19 1.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.15 0.0 0.4 0.2 0.12 0.14 1.0 0.29 0.53 0.08 0.06
0.0 0.59 0.94 1.0 0.54 0.46 0.3 0.7 0.52 0.74 0.58 0.83 0.45 0.57 0.33
0.0 0.33 0.82 1.0 0.25 0.0 0.1 0.16 0.17 0.19 0.26 0.41 0.26 0.44 0.06
0.0 0.42 0.24 0.4 0.19 0.45 0.31 0.57 0.44 0.44 0.45 0.94 1.0 0.49 0.83
0.94 0.2 0.31 0.23 0.37 0.24 0.32 0.37 0.41 0.7 1.0 0.62 0.37 0.25 0.86
0.0 0.11 0.11 0.18 0.04 0.06 0.26 0.14 0.12 0.19 0.41 1.0 0.14 0.13 0.26
0.0 0.04 0.11 0.05 0.18 0.0 0.62 0.37 0.16 0.46 0.42 1.0 0.25 0.03 0.09
0.0 0.01 0.07 0.13 0.07 0.7 0.41 0.04 0.25 0.5 0.33 0.25 0.12 0.33 1.0
0.0 0.06 0.14 0.19 0.1 1.0 0.49 0.1 0.33 0.41 0.52 0.36 0.32 0.59 0.31
0.0 0.0 0.03 0.16 0.06 0.0 0.43 0.0 0.11 0.0 1.0 0.0 0.29 0.94 0.01
0.54 0.35 0.28 0.25 0.5 0.71 0.8 0.87 0.75 0.32 1.0 0.9 0.84 0.22 0.3
0.72 0.5 0.37 0.24 0.44 1.0 0.84 0.1 0.43 0.41 0.81 0.64 0.66 0.32 0.47
0.0 0.0 0.01 0.02 0.14 0.31 0.23 0.13 0.26 0.16 1.0 0.09 0.04 0.05 0.11
0.01 0.49 0.55 1.0 0.48 0.92 0.65 0.61 0.45 0.53 0.63 0.82 0.46 0.63 0.83
0.0 0.73 0.86 1.0 0.17 0.04 0.2 0.08 0.04 0.09 0.69 0.18 0.15 0.14 0.29
0.0 0.02 0.03 0.08 0.01 0.0 0.07 0.01 0.03 0.29 1.0 0.04 0.25 0.28 0.0
0.0 0.01 0.19 0.18 0.28 0.36 0.36 0.33 0.12 0.28 1.0 0.1 0.32 0.18 0.18
0.0 0.11 0.08 0.19 0.08 0.04 0.25 0.04 0.35 0.2 1.0 0.3 0.07 0.23 0.68
0.03 0.78 0.41 0.3 0.33 0.06 0.32 0.9 0.37 0.42 0.61 0.13 1.0 0.3 0.7
0.09 0.19 0.28 0.36 0.37 0.37 0.46 0.34 0.36 0.49 0.51 1.0 0.42 0.25 0.77
0.0 0.5 0.37 0.53 0.32 0.66 0.51 0.34 0.45 0.53 0.52 1.0 0.4 0.29 0.7
0.27 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.32 0.0 0.34 0.82 0.71 1.0 0.76 0.21 0.26
0.0 0.43 0.18 0.0 0.02 0.0 0.16 0.0 0.03 0.11 1.0 0.02 0.56 0.05 0.01
0.0 1.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.22 0.0 0.03 0.05 0.76 0.01 0.1 0.0 0.02
0.0 0.23 0.39 0.23 0.06 0.09 0.39 0.11 0.08 0.29 0.22 0.35 0.1 0.21 1.0
0.02 0.04 0.03 0.11 0.1 0.04 0.1 0.08 0.13 0.17 1.0 0.65 0.15 0.41 0.87
0.0 0.02 0.04 0.17 0.28 0.21 0.47 0.11 0.29 0.34 1.0 0.61 0.17 0.3 0.41
0.03 0.0 0.16 0.62 0.37 0.0 0.28 0.11 0.4 0.5 1.0 0.03 0.01 0.09 0.02
0.0 0.02 0.27 0.99 0.53 0.63 0.59 0.47 0.36 0.44 1.0 0.08 0.41 0.55 0.22
0.0 0.15 0.09 0.15 0.04 0.17 0.31 0.03 0.12 0.25 0.26 0.48 0.13 0.05 1.0
0.0 0.12 0.01 0.14 0.01 0.11 0.16 0.0 0.38 0.41 0.34 0.76 0.54 0.04 1.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.1 0.17 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)