Heatmap: Cluster_35 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.52 0.52 0.23 0.03 0.26 0.05 1.0 0.85 0.0
0.26 0.81 0.45 0.31 0.31 1.0 0.41 0.31 0.3 0.5 0.48 0.43 0.72 0.34 0.03
0.0 0.69 0.22 0.09 0.21 0.0 0.45 0.06 0.05 0.0 0.06 0.0 1.0 0.24 0.0
0.0 1.0 0.14 0.12 0.24 0.0 0.72 0.09 0.03 0.0 0.08 0.0 0.86 0.22 0.0
0.0 1.0 0.6 0.0 0.32 0.0 0.56 0.0 0.09 0.0 0.16 0.0 0.74 0.09 0.0
0.0 0.43 1.0 0.91 0.16 0.0 0.19 0.23 0.19 0.31 0.17 0.0 0.52 0.63 0.0
0.02 0.65 0.99 0.39 0.35 0.96 1.0 0.32 0.41 0.19 0.38 0.24 0.9 0.6 0.04
0.0 0.86 0.87 0.32 0.23 0.78 0.32 0.35 0.29 0.28 0.32 0.09 1.0 0.38 0.03
0.0 0.29 0.3 0.51 0.07 1.0 0.28 0.01 0.18 0.11 0.31 0.09 0.66 0.47 0.03
0.0 0.39 0.15 0.11 0.08 1.0 0.18 0.31 0.12 0.14 0.28 0.05 0.81 0.38 0.02
0.0 1.0 0.81 0.39 0.25 0.57 0.36 0.35 0.21 0.18 0.18 0.05 0.29 0.18 0.01
0.56 0.38 0.81 0.57 0.23 1.0 0.34 0.3 0.23 0.39 0.23 0.22 0.55 0.1 0.45
0.0 0.26 0.55 0.32 0.12 1.0 0.26 0.27 0.1 0.21 0.18 0.03 0.41 0.09 0.01
0.0 0.27 0.26 0.21 0.25 0.0 0.19 1.0 0.08 0.07 0.13 0.26 0.12 0.14 0.03
0.0 0.27 0.24 0.28 1.0 0.59 0.25 0.94 0.24 0.06 0.11 0.07 0.2 0.02 0.02
0.03 0.35 0.46 0.47 1.0 0.69 0.36 0.97 0.29 0.17 0.19 0.15 0.37 0.09 0.26
0.0 0.67 0.81 0.36 0.25 1.0 0.45 0.45 0.1 0.09 0.17 0.06 0.3 0.4 0.02
0.0 0.39 0.5 0.37 0.29 1.0 0.42 0.3 0.27 0.2 0.3 0.11 0.48 0.31 0.02
0.0 0.03 0.08 0.09 1.0 0.4 0.16 0.54 0.08 0.05 0.03 0.02 0.05 0.03 0.07
0.0 0.29 0.18 0.15 1.0 0.81 0.85 0.26 0.73 0.67 0.38 0.14 0.44 0.1 0.11
0.0 0.21 0.55 0.0 0.47 0.0 0.41 0.0 0.1 0.25 0.74 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.59 0.45 0.29 0.25 1.0 0.39 0.27 0.54 0.4 0.35 0.12 0.89 0.54 0.04
0.0 0.95 0.57 0.34 0.22 1.0 0.52 0.39 0.69 0.35 0.27 0.28 0.91 0.29 0.0
0.0 0.18 0.14 0.16 1.0 0.93 0.18 0.88 0.08 0.02 0.05 0.0 0.15 0.01 0.01
0.0 0.0 0.01 0.1 1.0 0.6 0.04 0.34 0.07 0.14 0.02 0.0 0.1 0.0 0.04
0.0 0.09 0.05 0.11 0.27 0.12 0.07 1.0 0.08 0.01 0.02 0.01 0.04 0.0 0.03
0.01 0.17 0.16 0.25 1.0 0.88 0.14 0.6 0.07 0.07 0.06 0.03 0.27 0.04 0.07
0.01 0.97 0.55 0.51 0.56 0.96 0.72 1.0 0.88 0.3 0.32 0.11 0.68 0.64 0.03
0.1 0.63 0.58 0.58 0.36 0.62 1.0 0.75 0.55 0.27 0.47 0.16 0.79 0.71 0.03
0.0 0.51 0.92 0.67 0.33 0.48 0.41 1.0 0.41 0.48 0.27 0.2 0.85 0.55 0.6
0.02 1.0 0.86 0.49 0.31 0.5 0.43 0.52 0.46 0.43 0.36 0.14 0.6 0.54 0.03
0.0 0.65 0.42 0.43 0.85 1.0 0.29 0.67 0.3 0.35 0.23 0.55 0.3 0.25 0.09
0.0 0.14 0.28 0.41 0.22 0.58 0.39 0.58 0.26 0.23 0.33 0.73 0.54 1.0 0.31
0.0 0.44 1.0 0.09 0.7 0.0 0.78 0.72 0.27 0.1 0.18 0.12 0.37 0.18 0.04
0.02 0.14 0.14 0.08 0.04 1.0 0.08 0.08 0.09 0.21 0.09 0.02 0.36 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.6 0.67 1.0 0.8 0.82 0.93 0.18 0.58 0.51 0.42 0.54 0.86 0.46 0.69
0.0 1.0 0.78 0.75 0.2 0.56 0.19 0.33 0.11 0.21 0.31 0.14 0.59 0.37 0.02
0.0 1.0 0.88 0.45 0.09 0.97 0.26 0.0 0.06 0.32 0.09 0.04 0.81 0.16 0.0
0.0 0.14 0.16 0.33 0.36 0.34 0.47 1.0 0.36 0.28 0.2 0.59 0.22 0.38 0.45
1.0 0.56 0.52 0.56 0.5 0.55 0.38 0.39 0.29 0.51 0.34 0.59 0.26 0.3 0.52
0.03 0.85 0.4 0.05 0.27 0.46 0.39 0.19 0.14 0.13 0.18 0.08 1.0 0.17 0.8
0.0 0.12 0.15 0.22 0.67 0.37 0.24 1.0 0.09 0.04 0.07 0.03 0.15 0.02 0.25
0.0 0.92 0.69 0.38 0.18 1.0 0.37 0.31 0.19 0.21 0.28 0.05 0.94 0.16 0.01
0.0 0.73 0.59 0.25 0.15 1.0 0.28 0.24 0.14 0.17 0.2 0.04 0.76 0.08 0.02
0.02 0.33 0.75 0.43 0.4 1.0 0.81 0.21 0.71 0.58 0.64 0.34 0.53 0.43 0.18
0.0 0.48 0.29 0.49 0.37 0.68 1.0 0.78 0.58 0.39 0.5 0.3 0.67 0.33 0.1
0.0 0.59 0.64 0.79 0.78 1.0 0.99 0.91 0.71 0.67 0.81 0.81 0.86 0.61 0.62
0.08 0.41 0.44 0.47 0.41 1.0 0.43 0.42 0.32 0.31 0.38 0.31 0.62 0.52 0.17
0.0 0.0 0.04 0.0 0.16 0.55 0.54 0.33 0.12 0.37 0.16 0.07 1.0 0.13 0.36
0.07 0.61 0.37 0.44 0.47 1.0 0.58 0.55 0.52 0.43 0.42 0.47 0.74 0.46 0.54
0.0 0.35 0.49 0.26 0.14 0.67 0.15 0.0 0.07 0.27 0.15 0.0 1.0 0.22 0.02
0.0 0.48 0.03 0.11 0.46 0.76 1.0 0.71 0.32 0.17 0.47 0.24 0.85 0.58 0.05
0.0 0.49 0.04 0.04 0.14 0.0 0.21 0.15 0.05 0.03 0.09 0.0 1.0 0.17 0.0
0.0 0.47 0.42 0.45 0.36 1.0 0.51 0.67 0.29 0.3 0.29 0.1 0.47 0.11 0.03
0.0 0.93 0.25 0.16 0.26 0.0 0.67 0.54 0.23 0.05 0.25 0.19 1.0 0.35 0.0
0.0 0.23 0.36 0.4 0.67 1.0 0.57 0.44 0.46 0.37 0.6 0.36 0.5 0.44 0.17
0.0 0.5 0.1 0.04 0.27 0.0 1.0 0.02 0.42 0.06 0.22 0.15 0.32 0.02 0.04
0.0 0.05 0.12 0.13 0.34 0.0 0.8 1.0 0.29 0.07 0.3 0.0 0.39 0.0 0.0
0.02 0.58 0.42 0.27 0.29 0.82 0.62 0.32 0.61 0.28 0.48 0.19 0.84 1.0 0.03
0.0 0.13 0.11 0.07 0.06 1.0 0.13 0.09 0.05 0.04 0.05 0.01 0.08 0.03 0.01
0.33 0.52 0.73 0.44 1.0 0.5 0.55 0.79 0.46 0.37 0.19 0.21 0.24 0.17 0.34
0.0 0.91 0.67 0.29 0.18 1.0 0.42 0.59 0.18 0.27 0.35 0.13 0.74 0.38 0.01
0.01 1.0 0.7 0.35 0.12 0.55 0.24 0.54 0.15 0.18 0.24 0.04 0.28 0.39 0.01
0.0 0.19 0.35 0.3 0.11 1.0 0.27 0.29 0.19 0.17 0.21 0.12 0.68 0.11 0.02
0.96 0.09 0.32 0.13 1.0 0.62 0.13 0.37 0.08 0.06 0.03 0.02 0.13 0.01 0.02
0.0 0.33 0.13 0.0 0.19 0.64 0.3 1.0 0.4 0.07 0.62 0.18 0.27 0.19 0.0
0.0 0.21 0.2 0.33 1.0 0.68 0.31 0.92 0.15 0.09 0.1 0.06 0.24 0.04 0.04
0.0 0.69 0.55 0.57 0.67 0.89 1.0 0.57 0.82 0.65 0.71 0.76 0.85 0.65 0.42
0.0 1.0 0.99 0.44 0.29 0.45 0.48 0.11 0.11 0.1 0.16 0.05 0.3 0.04 0.02
0.0 0.14 0.12 0.12 1.0 0.53 0.46 0.61 0.53 0.42 0.1 0.01 0.38 0.41 0.03
0.0 0.19 0.2 0.0 0.08 1.0 0.24 0.19 0.07 0.05 0.08 0.02 0.47 0.18 0.01
0.0 0.18 0.26 0.26 0.18 0.63 0.38 0.59 0.32 0.23 0.25 0.03 0.52 1.0 0.01
0.0 0.24 0.23 0.17 0.42 1.0 0.29 0.69 0.31 0.05 0.17 0.05 0.45 0.06 0.01
0.0 0.43 0.27 0.2 0.26 1.0 0.23 0.3 0.23 0.05 0.1 0.03 0.34 0.1 0.01
0.0 0.39 1.0 0.65 0.08 0.0 0.09 0.03 0.13 0.53 0.22 0.2 0.68 0.41 0.08
0.84 1.0 0.57 0.4 0.22 0.61 0.32 0.48 0.21 0.32 0.15 0.05 0.51 0.25 0.01
0.0 0.16 0.49 0.26 0.21 1.0 0.35 0.24 0.36 0.21 0.32 0.14 0.36 0.27 0.05
0.0 0.18 0.35 0.25 0.84 0.41 0.29 1.0 0.07 0.03 0.06 0.06 0.24 0.07 0.01
0.0 0.35 0.5 0.39 0.37 1.0 0.52 0.49 0.64 0.69 0.54 0.21 0.96 0.24 0.04
0.0 0.95 0.88 0.68 0.38 0.73 0.51 0.63 0.5 0.25 0.38 0.18 1.0 0.66 0.02
0.01 0.78 0.94 1.0 0.44 0.53 0.59 0.46 0.55 0.42 0.42 0.5 0.52 0.34 0.07
0.0 0.14 0.21 0.16 0.28 0.3 0.2 1.0 0.09 0.11 0.08 0.14 0.22 0.09 0.16
0.56 1.0 0.63 0.48 0.2 0.23 0.35 0.33 0.38 0.11 0.19 0.11 0.48 0.54 0.01
0.03 0.65 0.65 0.42 0.47 1.0 0.96 0.53 0.58 0.35 0.46 0.14 1.0 0.86 0.06
0.0 0.75 0.92 0.32 0.18 1.0 0.27 0.27 0.27 0.25 0.2 0.0 0.8 0.45 0.01
0.0 0.64 0.77 0.14 0.11 1.0 0.17 0.1 0.19 0.2 0.16 0.0 0.66 0.38 0.0
0.0 0.44 0.35 0.41 0.22 1.0 0.53 0.34 0.22 0.25 0.3 0.1 0.67 0.46 0.03
0.0 0.43 0.54 0.27 0.33 1.0 0.36 0.45 0.18 0.19 0.15 0.03 0.3 0.11 0.01
0.38 0.7 0.77 0.88 0.42 1.0 0.75 0.52 0.62 0.6 0.51 0.87 0.69 0.57 0.91
0.1 0.0 0.19 0.21 0.02 0.0 0.03 0.0 0.24 0.09 0.4 0.21 0.08 1.0 0.0
0.57 1.0 0.09 0.13 0.07 0.0 0.19 0.0 0.09 0.0 0.05 0.01 0.03 0.0 0.0
0.0 0.33 0.17 0.06 1.0 0.78 0.24 0.31 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.44 0.33 0.31 0.78 1.0 0.31 0.86 0.3 0.15 0.23 0.06 0.71 0.12 0.0
0.01 0.21 0.31 0.46 0.75 0.39 0.58 1.0 0.58 0.33 0.37 0.44 0.42 0.21 0.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 1.0 0.19 0.2 0.52 0.48 0.13 0.0 0.0
0.0 0.26 0.98 0.38 0.14 1.0 0.25 0.01 0.25 0.38 0.14 0.09 0.42 0.31 0.04
0.0 0.05 0.09 0.43 0.81 0.0 0.24 1.0 0.11 0.11 0.04 0.05 0.07 0.0 0.01
0.02 0.36 0.41 0.82 0.87 0.91 0.55 1.0 0.42 0.24 0.55 0.28 0.86 0.36 0.3
0.0 0.52 0.49 0.27 0.12 0.71 0.33 0.27 0.16 0.2 0.27 0.01 1.0 0.32 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.16 1.0 0.13 0.13 0.28 0.54 0.03 0.0 0.0
0.1 0.79 0.75 0.75 0.54 0.83 0.95 0.4 0.35 0.32 0.5 0.35 1.0 0.85 0.05
0.0 0.0 0.03 0.04 0.82 0.52 0.04 1.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.06
0.0 0.24 0.33 0.52 0.37 0.63 0.8 1.0 0.31 0.17 0.45 0.24 0.53 0.61 0.02
0.0 0.92 0.66 0.48 0.3 0.84 0.64 0.62 0.57 0.38 0.54 0.18 0.87 1.0 0.06
0.0 0.0 0.1 0.26 0.71 1.0 0.75 0.49 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.42 0.33 0.79 0.43 0.15 0.0 0.38 0.25 0.11 0.36 0.22 0.0 1.0 0.5 0.02
0.0 0.37 0.48 0.38 0.25 0.0 1.0 0.3 0.38 0.44 0.46 0.36 0.69 0.53 0.05
0.0 0.94 1.0 0.78 0.61 0.55 0.87 0.61 0.57 0.55 0.62 0.38 0.97 0.51 0.36
0.02 0.25 0.42 0.23 1.0 0.31 0.24 1.0 0.2 0.1 0.09 0.05 0.14 0.03 0.07
0.05 0.83 0.62 0.61 0.45 1.0 0.73 0.51 0.75 0.43 0.53 0.38 0.94 0.7 0.29
0.0 0.42 0.02 0.0 0.36 0.27 0.2 1.0 0.06 0.0 0.06 0.0 0.77 0.04 0.0
0.0 0.85 0.67 1.0 0.38 0.43 0.86 0.29 0.39 0.3 0.63 0.27 0.86 0.66 0.03
0.45 0.68 0.72 1.0 0.56 0.92 0.82 0.7 0.67 0.55 0.57 0.89 0.49 0.37 0.75
0.0 0.31 0.51 0.2 0.11 0.6 0.27 0.3 0.1 0.23 0.22 0.05 1.0 0.29 0.01
0.0 0.1 0.11 0.26 0.28 0.0 1.0 0.5 0.44 0.33 0.3 0.19 0.27 0.72 0.05
0.0 0.2 0.34 0.42 0.26 0.1 0.59 1.0 0.48 0.1 0.39 0.15 0.56 0.77 0.04
0.02 0.11 0.3 0.58 0.34 0.0 0.28 0.84 0.36 0.34 0.53 1.0 0.52 0.4 0.03
0.0 0.55 1.0 0.83 0.1 0.83 0.49 0.17 0.12 0.26 0.26 0.12 0.77 0.56 0.01
0.15 0.42 0.44 0.36 1.0 0.9 0.39 0.81 0.27 0.14 0.18 0.09 0.25 0.13 0.15
0.0 0.75 1.0 0.16 0.33 0.75 0.58 0.45 0.35 0.25 0.49 0.48 0.9 0.42 0.25
0.0 0.37 0.32 0.03 0.16 0.65 0.22 0.46 0.15 0.04 0.26 0.05 1.0 0.35 0.02
0.0 0.65 0.79 0.26 0.28 1.0 0.58 0.6 0.14 0.08 0.26 0.1 0.42 0.09 0.02
0.28 0.87 0.66 0.25 0.13 1.0 0.41 0.21 0.21 0.23 0.25 0.13 0.42 0.59 0.02
0.92 0.34 0.78 0.13 0.01 1.0 0.24 0.03 0.09 0.12 0.11 0.01 0.09 0.15 0.02
0.0 0.23 0.16 0.2 0.57 1.0 0.35 0.66 0.08 0.04 0.14 0.09 0.34 0.1 0.03
0.0 0.05 0.07 0.41 0.24 0.57 0.34 1.0 0.22 0.13 0.2 0.14 0.34 0.31 0.01
0.01 0.98 0.94 0.76 0.34 0.47 0.52 0.71 0.46 0.34 0.55 0.34 1.0 0.9 0.14
0.0 0.67 0.96 0.82 0.34 1.0 0.62 0.44 0.39 0.32 0.55 0.28 0.84 0.61 0.0
0.0 0.17 0.13 0.0 0.25 0.0 0.07 1.0 0.07 0.03 0.04 0.0 0.12 0.13 0.03
0.0 0.02 0.02 0.01 0.53 0.13 0.05 1.0 0.05 0.02 0.01 0.0 0.08 0.02 0.03
0.0 0.02 0.02 0.07 0.46 1.0 0.1 0.5 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
0.0 0.09 0.11 0.16 0.84 1.0 0.18 0.81 0.08 0.0 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.35 0.09 0.04 0.37 0.46 0.51 0.74 0.81 0.13 0.45 0.34 1.0 0.46 0.02
0.01 0.54 0.65 1.0 0.39 0.69 0.43 0.34 0.51 0.58 0.36 0.57 0.23 0.1 0.23
0.0 1.0 0.64 0.63 0.3 0.0 0.48 0.23 0.06 0.14 0.1 0.01 0.51 0.21 0.02
0.0 0.0 0.0 0.01 0.27 0.13 0.02 0.04 0.26 0.2 0.05 0.09 0.06 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.99 1.0 0.05 0.09 0.14 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.66
0.0 0.0 0.0 0.01 0.6 0.4 0.02 0.04 0.25 0.06 0.03 0.04 0.01 0.0 1.0
0.02 0.49 0.58 0.3 0.31 0.68 0.49 0.45 0.28 0.27 0.3 0.08 1.0 0.33 0.02
0.0 0.84 0.44 0.0 0.19 1.0 0.45 0.52 0.15 0.38 0.3 0.14 0.75 0.12 0.05
0.04 0.0 0.04 0.24 0.87 0.46 0.58 0.95 1.0 0.14 0.03 0.01 0.01 0.06 0.1
0.0 0.0 0.05 0.32 0.57 0.85 0.57 1.0 0.73 0.27 0.1 0.03 0.01 0.0 0.65
0.03 0.0 0.04 0.13 1.0 0.51 0.82 0.64 0.62 0.2 0.09 0.04 0.02 0.03 0.32
0.0 0.01 0.0 0.18 1.0 0.0 0.02 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.01 0.04 0.13 0.84 0.51 0.45 0.97 1.0 0.25 0.06 0.01 0.02 0.06 0.13
0.0 0.01 0.03 0.21 1.0 0.02 0.03 0.5 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 1.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.06 1.0 0.33 0.25 0.5 0.63 0.11 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.11 1.0 0.83 0.7 0.9 0.79 0.24 0.06 0.01 0.01 0.0 0.22
0.07 0.38 0.38 0.54 0.21 1.0 0.25 0.24 0.09 0.13 0.28 0.1 0.46 0.83 0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)