Heatmap: Cluster_22 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
1.0 0.75 0.9 0.51 0.47 0.55 0.73 0.44 0.58 0.59 0.66 0.3 0.56 0.41 0.58
0.11 0.72 0.9 0.7 0.82 0.66 0.93 0.84 0.78 0.93 1.0 0.4 0.54 0.6 0.53
0.48 0.8 0.89 0.73 0.88 1.0 0.57 0.73 0.73 0.81 0.9 0.49 0.62 0.16 0.36
0.01 0.35 0.45 0.77 0.39 0.4 0.72 0.57 0.62 0.8 0.72 1.0 0.64 0.66 0.56
0.02 0.59 0.66 0.76 0.55 1.0 0.59 0.59 0.73 0.8 0.84 0.44 0.53 0.75 0.45
0.04 0.67 0.62 0.72 0.5 0.54 0.47 0.62 0.91 0.87 0.84 1.0 0.71 0.43 0.76
0.07 0.73 1.0 0.72 0.47 0.36 0.58 0.75 0.66 0.63 0.91 0.78 0.5 0.33 0.27
0.08 0.74 1.0 0.7 0.36 0.43 0.45 0.4 0.61 0.45 0.55 0.3 0.41 0.34 0.43
0.0 0.39 0.72 1.0 0.25 0.37 0.53 0.38 0.41 0.4 0.74 0.13 0.47 0.31 0.37
0.01 0.48 0.65 0.94 0.59 0.83 0.79 0.48 0.81 0.86 1.0 0.5 0.75 0.7 0.78
0.36 0.59 0.56 0.44 0.49 0.52 0.68 0.66 0.82 0.77 0.9 0.68 0.56 1.0 0.45
0.0 0.35 0.4 0.45 0.56 0.54 0.71 0.56 0.56 0.64 0.98 0.32 1.0 0.46 0.35
0.0 0.91 1.0 0.92 0.31 0.9 0.46 0.17 0.26 0.57 0.63 0.14 0.3 0.06 0.19
0.34 1.0 0.57 0.38 0.23 0.46 0.31 0.14 0.27 0.27 0.4 0.18 0.26 0.33 0.13
0.01 0.39 0.76 1.0 0.48 0.82 0.58 0.43 0.81 0.93 0.93 0.65 0.71 0.38 0.47
0.0 0.56 0.76 0.96 0.49 1.0 0.68 0.32 0.53 0.65 0.75 0.41 0.53 0.56 0.49
0.02 0.42 0.37 0.51 0.24 0.49 0.54 0.45 0.32 0.33 1.0 0.05 0.85 0.6 0.34
0.0 0.13 0.18 0.28 0.18 1.0 0.23 0.13 0.51 0.29 0.65 0.02 0.78 0.45 0.41
0.0 0.53 1.0 0.56 0.14 0.63 0.32 0.13 0.12 0.27 0.31 0.28 0.16 0.12 0.22
0.02 0.38 0.32 0.32 0.18 0.33 0.28 0.26 0.45 0.44 0.39 1.0 0.28 0.19 0.26
0.02 0.46 0.57 0.84 0.46 0.61 0.55 0.5 0.86 1.0 0.88 0.71 0.87 0.6 0.87
0.0 1.0 0.9 0.58 0.63 0.58 0.65 0.7 0.6 0.69 0.75 0.6 0.56 0.5 0.64
1.0 0.87 0.75 0.51 0.49 0.74 0.52 0.52 0.65 0.7 0.73 0.8 0.5 0.68 0.64
0.2 0.8 0.86 0.51 0.65 1.0 0.68 0.93 0.88 0.97 0.84 0.73 0.64 0.36 0.77
0.02 1.0 0.99 0.6 0.23 0.26 0.4 0.37 0.26 0.33 0.49 0.27 0.47 0.21 0.17
0.0 0.5 0.72 0.28 0.38 0.55 0.42 0.45 1.0 0.77 0.67 0.19 0.31 0.43 0.34
0.02 0.9 1.0 0.63 0.25 0.68 0.65 0.23 0.54 0.78 0.59 0.64 0.32 0.28 0.36
0.23 0.83 1.0 0.92 0.78 0.83 0.99 0.77 0.78 0.71 0.89 0.57 0.56 0.54 0.76
0.01 0.18 0.3 0.29 0.58 0.67 0.78 0.66 0.79 0.75 1.0 0.48 0.8 0.93 0.64
0.02 0.56 0.78 0.67 0.6 0.74 0.77 0.41 0.77 0.98 1.0 0.41 0.59 0.92 0.84
0.14 0.52 0.6 0.68 0.46 0.83 0.74 0.65 1.0 0.8 0.88 0.75 0.69 0.67 0.94
0.28 0.15 0.61 0.65 0.4 1.0 0.8 0.31 0.53 0.71 1.0 0.82 0.89 0.94 0.72
0.04 0.25 0.24 1.0 0.39 0.0 0.76 0.57 0.72 0.6 0.8 0.57 0.47 0.62 0.41
0.02 0.3 0.31 0.5 0.38 0.0 0.93 0.38 0.71 0.47 1.0 0.3 0.29 0.59 0.41
0.11 1.0 0.95 1.0 0.61 0.69 0.66 0.65 0.82 0.69 0.91 0.54 0.61 0.76 0.81
0.21 1.0 0.34 0.24 0.49 0.64 0.47 0.56 0.71 0.37 0.87 0.43 0.7 0.3 0.47
0.36 0.6 0.79 0.66 0.65 0.59 0.79 0.58 0.91 0.86 1.0 0.77 0.92 0.91 0.67
0.6 0.48 0.6 0.49 0.76 0.93 0.69 0.89 0.76 0.68 1.0 0.6 0.53 0.41 0.59
0.0 0.51 1.0 0.53 0.25 0.28 0.4 0.33 0.44 0.63 0.63 0.38 0.46 0.59 0.24
0.03 0.34 0.69 0.62 0.41 0.49 0.6 0.46 0.68 0.83 1.0 0.21 0.8 0.6 0.39
0.2 0.87 0.68 0.45 0.59 1.0 0.36 0.47 0.67 0.85 0.93 0.37 0.6 0.38 0.35
0.0 1.0 0.97 0.5 0.66 0.51 0.85 0.69 0.84 0.78 0.88 0.36 0.88 0.95 0.85
0.03 0.74 0.32 0.6 0.46 0.45 0.35 0.53 0.34 0.78 1.0 0.05 0.7 0.06 0.11
0.01 1.0 0.53 0.42 0.24 0.47 0.23 0.44 0.49 0.6 0.64 0.13 0.53 0.12 0.17
0.0 0.77 0.3 0.29 0.14 0.53 0.23 0.17 0.47 0.65 1.0 0.08 0.77 0.17 0.0
0.0 0.4 0.73 0.44 0.49 0.14 0.54 0.56 0.52 0.58 0.71 0.34 1.0 0.52 0.99
0.0 0.44 0.3 0.25 0.53 1.0 0.75 0.37 0.56 0.68 0.8 0.32 0.64 0.5 0.45
0.0 0.42 0.29 0.29 0.15 1.0 0.6 0.13 0.33 0.65 0.37 0.4 0.25 0.22 0.11
0.34 0.92 1.0 0.28 0.31 0.47 0.44 0.6 0.48 0.43 0.68 0.26 0.71 0.4 0.3
0.03 0.61 1.0 0.47 0.33 0.57 0.41 0.31 0.74 0.65 0.58 0.46 0.36 0.28 0.35
1.0 0.54 0.66 0.57 0.3 0.65 0.52 0.45 0.49 0.64 0.81 0.52 0.74 0.49 0.48
0.01 0.3 0.18 0.31 0.3 0.3 0.32 0.59 1.0 0.44 0.7 0.23 0.35 0.21 0.51
0.02 0.91 0.45 0.62 0.53 0.42 0.74 0.36 0.63 0.97 0.86 0.39 1.0 0.83 0.67
0.01 1.0 0.46 0.6 0.32 0.62 0.38 0.31 0.4 0.42 0.53 0.36 0.3 0.54 0.27
0.0 0.55 0.83 0.61 0.62 0.96 0.68 0.98 0.8 0.78 1.0 0.89 0.64 0.86 0.41
0.01 0.24 0.4 0.45 0.29 0.44 0.61 0.28 0.39 0.55 0.77 0.65 0.71 1.0 0.5
0.0 1.0 0.87 0.49 0.32 0.19 0.22 0.37 0.42 0.41 0.57 0.35 0.4 0.33 0.26
0.02 0.56 1.0 0.72 0.61 0.94 0.79 0.48 0.81 0.67 0.77 0.51 0.53 0.48 0.63
0.0 0.18 0.29 0.83 0.74 0.46 0.31 0.59 0.33 0.93 1.0 0.15 0.72 0.61 0.06
0.03 0.83 0.6 0.85 0.55 0.88 0.55 0.55 0.52 0.62 1.0 0.51 0.8 0.95 0.44
0.13 0.75 1.0 0.48 0.79 0.72 0.65 0.92 0.9 0.69 0.66 0.28 0.7 0.24 0.5
0.0 1.0 0.28 0.13 0.14 0.08 0.15 0.09 0.33 0.21 0.4 0.1 0.21 0.35 0.15
0.0 1.0 0.08 0.76 0.14 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.32 0.34 0.24 0.6 0.62 0.61 0.37 0.88 0.54 0.82 0.42 1.0 0.58 0.23
0.04 0.68 0.77 0.7 0.53 0.69 0.74 0.59 0.83 0.95 1.0 0.67 0.75 0.8 0.88
0.0 1.0 0.73 0.6 0.28 0.6 0.49 0.25 0.53 0.69 0.62 0.34 0.49 0.44 0.51
0.14 0.55 0.53 0.46 0.54 1.0 0.46 0.53 0.72 0.82 0.69 0.49 0.29 0.42 0.26
0.16 0.91 0.99 1.0 0.33 0.89 0.38 0.39 0.33 0.51 0.7 0.44 0.45 0.45 0.27
0.0 0.95 0.71 1.0 0.48 0.51 0.58 0.36 0.67 0.59 0.81 0.58 0.63 0.82 0.65
0.22 0.7 0.94 1.0 0.71 0.58 0.6 0.72 0.76 0.81 0.78 0.88 0.56 0.76 0.54
0.21 0.38 0.6 0.48 0.52 0.92 0.82 0.49 0.73 0.93 0.8 1.0 0.58 0.5 0.89
0.11 0.9 0.95 0.75 0.6 0.8 0.79 0.44 0.84 0.75 1.0 0.78 0.73 0.96 0.63
0.01 0.96 1.0 0.61 0.25 0.43 0.21 0.19 0.22 0.49 0.42 0.12 0.31 0.18 0.13
0.04 0.78 0.79 0.73 0.54 0.77 0.73 0.56 0.94 0.77 1.0 0.68 0.79 0.61 0.81
0.04 0.72 1.0 0.5 0.33 0.79 0.56 0.23 0.44 0.5 0.52 0.26 0.67 0.41 0.24
0.07 0.86 0.71 0.66 0.75 1.0 0.78 0.92 0.69 0.67 0.88 0.72 0.62 0.65 0.68
0.11 1.0 0.6 0.45 0.19 0.21 0.33 0.19 0.27 0.34 0.54 0.54 0.51 0.58 0.67
0.27 0.96 0.79 0.67 0.58 1.0 0.72 0.53 0.73 0.78 0.73 0.51 0.54 0.58 0.6
0.12 0.4 0.53 0.49 0.63 0.9 0.61 0.42 1.0 0.85 0.74 0.45 0.59 0.44 0.67
0.01 0.48 0.46 0.47 0.7 0.49 0.75 0.7 0.84 0.67 1.0 0.48 0.66 0.62 0.59
0.0 0.69 1.0 0.65 0.51 0.65 0.79 0.57 0.47 0.84 0.57 0.29 0.63 0.27 0.46
0.0 0.72 0.66 0.5 0.15 0.28 0.43 0.31 0.41 1.0 0.88 0.06 0.74 0.29 0.51
0.0 0.85 1.0 0.81 0.17 0.41 0.43 0.18 0.47 0.76 0.56 0.11 0.27 0.17 0.43
0.0 0.69 0.81 1.0 0.53 0.7 0.68 0.56 0.89 0.95 0.91 0.42 0.54 0.59 0.43
0.48 1.0 0.59 0.42 0.21 0.42 0.32 0.12 0.19 0.37 0.57 0.56 0.43 0.32 0.15
0.0 0.22 0.31 0.59 0.25 0.59 0.53 0.56 0.83 1.0 0.85 0.32 0.89 0.72 0.37
0.0 0.26 0.04 0.18 0.16 0.27 0.23 0.14 0.48 0.37 0.39 0.08 1.0 0.35 0.04
0.16 0.88 0.85 0.76 0.65 0.96 0.71 0.66 1.0 0.88 0.67 0.61 0.67 0.46 0.48
0.0 0.17 0.13 0.24 0.12 0.06 0.22 0.1 0.08 0.19 1.0 0.17 0.28 0.6 0.07
0.0 0.34 1.0 0.39 0.44 0.62 0.42 0.43 0.44 0.93 0.4 0.08 0.07 0.27 0.13
0.75 0.98 0.99 0.75 0.64 0.91 0.89 0.72 1.0 0.92 0.94 0.45 0.58 0.58 0.56
0.13 0.46 0.57 0.67 0.51 0.54 0.48 0.49 0.71 0.77 0.69 1.0 0.53 0.41 0.56
0.0 0.03 0.11 0.14 0.16 1.0 0.38 0.11 0.17 0.52 0.41 0.04 0.34 0.26 0.24
0.12 1.0 0.74 0.56 0.45 0.6 0.49 0.52 0.56 0.55 0.73 0.53 0.67 0.45 0.54
0.18 0.62 0.73 0.6 0.57 1.0 0.54 0.5 0.72 0.75 0.71 0.28 0.45 0.52 0.46
0.0 0.11 0.14 0.12 0.17 0.46 0.66 0.19 0.37 0.55 0.71 0.37 0.34 1.0 0.42
0.02 0.66 0.58 0.44 0.63 0.65 0.69 0.41 1.0 0.79 0.97 0.48 0.77 0.53 0.54
0.61 0.8 0.71 0.55 0.58 0.86 0.85 0.65 0.93 0.88 1.0 0.47 0.84 0.7 0.57
0.35 0.68 1.0 0.7 0.16 0.52 0.45 0.21 0.56 0.83 0.59 0.1 0.34 0.09 0.27
0.05 0.59 0.82 1.0 0.5 0.63 0.7 0.64 0.8 0.82 0.74 0.53 0.6 0.41 0.64
0.0 0.52 0.06 0.66 0.15 0.1 0.19 0.17 0.97 0.42 1.0 0.09 0.67 0.08 0.06
0.0 0.43 0.17 0.07 0.32 0.12 0.6 0.1 1.0 0.41 0.82 0.66 0.69 0.45 0.11
0.0 0.98 0.32 0.05 0.13 0.0 0.31 0.14 1.0 0.56 0.44 0.42 0.4 0.28 0.09
0.0 0.73 0.63 0.06 0.24 0.79 0.37 0.04 0.87 0.53 1.0 0.44 0.62 0.07 0.18
0.0 0.32 0.29 0.43 0.54 0.24 0.65 0.27 1.0 0.86 0.98 0.34 0.5 0.67 0.35
0.12 0.58 0.64 1.0 0.38 0.68 0.63 0.46 0.86 0.7 0.77 0.44 0.73 0.51 0.62
0.0 0.18 0.47 0.46 0.35 0.45 0.41 0.35 1.0 0.67 0.63 0.08 0.41 0.38 0.16
0.0 0.4 0.23 0.2 0.6 0.5 0.46 0.41 0.69 0.51 0.66 0.27 1.0 0.42 0.46
0.0 0.02 0.02 0.1 0.53 0.0 0.18 0.29 0.42 0.45 0.74 0.24 1.0 0.42 0.41
0.0 0.01 0.11 0.56 0.36 0.08 0.31 0.23 0.45 1.0 0.68 0.14 0.38 0.44 0.37
0.0 0.6 0.67 0.7 0.54 0.91 0.77 0.48 0.66 0.71 1.0 0.77 0.89 0.73 0.62
0.0 0.6 0.83 0.54 0.54 0.74 0.77 0.83 1.0 0.96 0.86 0.71 0.78 0.77 0.77
0.04 0.96 1.0 0.69 0.46 0.67 0.57 0.43 0.74 0.63 0.79 0.38 0.69 0.29 0.45
0.42 0.53 0.66 0.35 0.41 0.63 0.46 0.43 1.0 0.79 0.78 0.88 0.91 0.61 0.67
0.02 0.59 0.93 0.61 0.4 0.43 0.33 0.84 0.41 0.56 1.0 0.29 0.67 0.41 0.26
0.0 0.48 0.47 0.69 0.28 0.55 0.58 0.3 0.64 0.83 1.0 0.49 0.48 0.32 0.69
0.0 0.23 0.28 0.4 0.52 0.44 0.48 0.39 0.55 0.87 1.0 0.79 0.47 0.96 0.83
0.0 0.34 0.44 0.7 0.57 0.3 0.51 0.36 0.62 0.83 1.0 0.47 0.93 0.76 0.59
0.0 0.62 0.08 0.45 0.24 0.4 0.4 0.34 0.85 0.52 0.74 0.09 1.0 0.41 0.05
0.0 0.11 0.12 0.15 0.49 0.0 0.74 0.05 0.61 0.27 1.0 0.13 0.31 0.54 0.89
0.05 1.0 0.68 0.81 0.46 0.5 0.84 0.49 0.58 0.63 0.76 0.55 0.59 0.46 0.33
0.09 1.0 0.81 0.93 0.55 0.69 0.99 0.5 0.69 0.79 0.88 0.63 0.66 0.48 0.6

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)