Heatmap: Cluster_13 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
3.26 -2.89 2.38 -5.48 - - -6.46 - - - - - - - -
3.02 -0.43 0.84 -0.96 -1.19 -1.37 -0.62 -1.14 -1.37 -1.87 -3.3 -1.42 -3.33 -3.79 -0.77
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.64 - 0.32 0.15 -7.36 - -2.54 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.76 - 0.08 -1.83 - - -3.13 - - - - - - - -
2.72 - -2.83 3.04 - - -4.04 - - - - - - - -
3.41 - - 2.12 - - - - - - - - - - -
3.47 -0.61 1.67 -4.1 -12.74 - -5.47 - -13.0 - - - - - -
3.81 - - - - - - - -2.23 - - -0.32 - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.47 - 1.97 - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.56 -2.62 1.34 -2.05 -5.62 - -2.75 -4.38 -7.19 -7.51 -8.17 - -5.23 - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.81 - - - -4.08 - -2.37 - - - - -0.51 - - -
3.73 - - - -2.5 - - - - - -3.13 - - - 0.5
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.58 - 1.62 - - - - - - - - - - - -
3.54 - 1.76 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
3.85 -1.5 -4.08 - - - -4.22 - - -4.12 - - -3.87 - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.91 - - - - - - - - - - - -
3.71 -3.67 0.75 -3.12 - - -4.48 - -11.96 - - - - - -
3.43 0.86 0.78 -1.88 -10.27 - -2.97 - -4.2 -5.17 -6.92 -2.84 - - -4.55
3.64 - 1.01 -1.42 - - -2.54 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.34 -0.18 1.63 -0.88 - - -1.7 - -5.06 - -11.53 - - - -
3.9 - - - -4.09 - - - - - - - - - -
3.42 - 2.1 - - - - - - - - - - - -
3.86 -1.18 - - -4.64 - - - - - -7.33 -5.04 - - -
3.66 -1.29 -0.45 -2.97 -2.65 - -3.64 -4.18 -3.2 -3.09 -3.69 -2.38 - - -1.62
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.89 -2.9 - - -8.49 - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.5 - 1.87 - - - - - - - - - - - -
- - - 3.32 -0.35 - -0.32 - -1.94 -0.99 -0.78 -2.02 0.53 - -1.45
- - 3.91 - - - - - - - - - - - -
3.76 - 0.55 - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.73 - 0.81 - - - -6.29 - - - -9.1 - -6.77 - -
3.91 - - - -8.19 - - - - - - - - - -
3.83 - -0.47 - -7.91 - - - -5.46 - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
2.07 - 3.03 1.38 - - - - - - -5.84 - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.39 - 2.04 - -4.31 - - - - - -6.55 - -1.48 - -
3.62 - 1.43 - - - -5.14 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.38 - 2.19 - - - - - - - - - - - -
3.87 - - - -2.58 - - - - - -2.19 - - - -
3.69 - - - - - 1.06 - - - - - - - -
3.9 - - - -3.23 - - - - - - - - - -
3.37 -1.99 2.0 -1.82 -3.58 - -6.39 - -5.1 - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - -6.59 - - - - - - - - - -
3.62 - 1.44 - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.78 - 0.28 - -6.18 - - - - - -5.33 - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.9 - - - -4.7 - - - - - -3.85 - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.5 - 1.68 - - - - - - - - -1.1 - - -
3.38 -0.34 1.91 - -12.18 - -5.87 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.46 -0.49 1.5 -1.8 -6.51 - -4.47 - -5.88 -3.53 -5.01 - - - -
3.67 - - - -2.75 - 0.89 - - - -2.13 - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.28 -1.52 1.93 -0.19 - - -2.07 - - - - - - - -
3.3 -2.87 1.98 -0.15 - - -2.44 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.66 -3.97 1.16 -10.39 -12.18 - -4.2 - - - - - - - -
3.25 -2.37 2.39 - - - -3.88 - - - - - - - -
3.6 -3.04 1.42 -5.95 - - -3.77 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.63 -1.31 0.7 -1.87 -3.81 - -2.91 -5.42 - -4.02 -10.9 - - - -
1.87 0.6 1.02 0.32 -1.41 -0.59 -0.53 -0.97 -0.04 -0.63 -1.45 -0.2 -0.05 -1.12 -6.02
3.43 -4.02 2.01 - - - -6.3 - - - - - -3.35 - -
3.43 -3.01 1.58 - - - -5.85 - -2.49 -5.21 -6.23 - -0.21 - -
3.17 - 2.58 - -4.89 - - - - - - - - - -
3.48 -1.11 1.44 - -3.98 - -4.31 - -6.52 -4.1 -4.16 - - -1.25 -
3.39 -2.96 2.08 - -3.96 - -3.62 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.45 - 0.58 1.1 -4.08 - - - -1.86 - -3.84 - - - -
3.38 -2.91 1.56 -0.54 -2.86 - -2.36 -4.53 -4.8 -4.4 -3.82 -3.23 -3.86 -6.05 -3.99
3.68 -2.92 1.03 - - - -7.4 - - - -8.74 - -5.53 - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.8 - 0.04 - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.85 - - - - - - - - - -0.89 - - - -
3.71 -3.8 0.67 -2.49 - - -4.68 - -7.04 - -10.17 -6.65 - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.43 - 2.08 - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.37 -1.34 1.79 -0.72 -4.53 - -2.86 - -5.1 - - - - - -
3.74 - 0.69 - - - - - - - - - - - -
3.48 -1.23 1.52 -1.31 - - -2.67 - -9.68 - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.47 -0.87 1.75 - - - -6.75 - - - - - - - -
3.66 -2.12 0.47 -0.87 -7.77 - -3.53 - -4.97 -5.99 -8.25 -7.32 -8.93 -6.15 -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.9 - - - -3.44 - - - - - - - - - -
3.15 -1.68 1.51 -0.84 -4.56 - -2.57 -4.83 -4.22 -3.29 -6.76 -0.03 -4.63 - -0.06
3.67 - 1.18 - - - - - - - - - - - -
3.57 -2.43 1.32 -1.59 - - -3.91 - - - -7.19 - - - -
3.85 - - - - - -0.87 - - - - - - - -
3.89 - - - -2.92 - - - - - - - - - -
- - 3.91 - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.8 - 0.1 - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.69 - 1.09 - - - - - - - - - - - -
3.56 -5.02 1.32 -0.96 -9.13 - -3.09 - - - -7.08 - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
- 2.28 3.33 - - - - - - - -3.43 - -4.92 - -
- - - - 0.42 - - - 3.1 - 2.34 - - - -
3.44 - - - - - - 1.91 - - -1.39 - - - -
3.89 - -2.68 - - - - - - - - - - - -
3.81 -0.91 - - -7.19 - -1.97 - -4.33 - -3.37 - - - -
3.58 1.11 -0.42 - - - -2.96 - - - - - - - -
3.79 - - - -5.52 - 0.14 - - - - - - - -
3.55 -5.2 1.63 -4.51 -13.83 - -2.7 - - - - - - - -
3.21 - 2.26 -0.53 - - -1.93 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.33 - 2.31 - - - - - - - - - - - -
3.19 -1.56 2.03 -0.1 - - -0.9 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.84 - - -0.52 - - - - - - -6.4 - - - -
3.27 - -0.91 0.92 -2.86 - -3.9 0.95 -3.48 -2.37 -2.82 -1.65 -5.58 - -
3.44 - - - - - - - - 0.97 -2.86 0.58 -0.85 - -
3.4 1.22 0.92 - - - - - -2.22 - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - 3.91 - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.84 -8.55 -1.3 -2.11 -13.89 - -4.86 - -10.61 - - - - - -
3.54 -1.73 1.11 -0.23 -10.19 - -3.61 - - - - - - - -
3.9 - - - -5.04 - - - - - - - - - -
- - 3.91 - - - - - - - - - - - -
3.71 -3.3 0.19 -1.68 -11.85 - -3.62 - -4.44 -4.6 -4.61 -3.8 -7.11 -4.75 -4.79
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.73 - -0.13 -0.63 -8.93 - -2.33 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.91 - - - - - - - - - - - -
- - 3.91 - - - - - - - - - - - -
3.57 - 1.2 -0.54 - - -2.98 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - 3.55 - -4.3 - - - - - - 1.69 - - -
- - 3.39 2.07 - - -1.7 - - - - - - - -
3.69 -2.86 0.96 - - - - - -4.9 - -7.91 - - - -
3.51 - 1.74 - -4.93 - -2.72 - -3.78 - - - - - -
3.69 -2.6 0.33 -0.99 - - -2.73 - -7.12 - - - - - -
3.31 - 2.34 - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.55 - 1.68 - -4.47 - - - - - - - - - -
- - - - 3.18 - - - - - 2.57 - - - -
3.8 -4.71 -0.51 -1.97 -13.95 - -4.62 - -11.62 - - - - - -
2.65 - - -0.04 -4.03 - - 2.75 - -1.29 -3.44 -1.12 - - -
3.54 -4.19 1.25 -1.97 -4.42 - -3.59 - -1.15 -6.78 -6.36 - -3.56 - -
3.52 - 1.82 - - - - - - - - - - - -
3.73 -0.98 -0.19 - -5.2 - - - - - - -2.33 - - -3.35

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.