Heatmap: Cluster_145 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
3.47 1.08 0.83 - - - - - - - - - - - -
3.31 - 2.34 - - - - - - - - - - - -
3.32 -1.89 2.2 - -4.14 - -3.64 - - - -6.49 - - - -
3.9 - - - -4.36 - - - - - - - - - -
3.69 - - 0.77 -2.49 - - - -2.5 - -4.45 - - - -
3.91 - - - -5.77 - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.4 -2.56 -0.06 -3.64 -1.32 - -1.47 -4.65 -1.17 -0.85 -1.92 -1.09 -1.37 -1.8 -
3.4 -0.79 1.32 - -3.0 - -1.95 -6.35 -3.05 -3.11 -5.36 -3.25 -1.45 -3.22 -2.94
3.71 - - - -1.05 - -2.42 - - - -1.94 -1.17 - -0.84 -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
2.43 - 3.01 - -3.93 - 0.57 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.8 - -1.47 - -6.8 - -0.65 - - - -5.09 - - - -
3.04 - 2.76 - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.7 - - - -2.83 - - - - - -3.78 - 0.8 - -
3.81 - - - - - 0.0 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.12 - - 2.65 -4.03 - - - - - - - - - -
3.39 1.96 - - -3.77 - -1.1 - - - -3.97 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
2.9 - 2.91 - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.28 -0.66 1.88 - - - - -0.07 - - - - - - -
3.75 - 0.63 - - - - - - - - - - - -
3.65 -2.18 1.08 -3.82 -10.08 - -6.5 - -7.13 - - - - - -
3.76 - - - -4.19 - - - - - -1.09 - - -0.07 -
3.15 - - - -4.58 - 0.03 - - 1.66 -1.55 - - 0.64 -
- - - - 2.25 - - - - - 3.36 - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.88 - - - - - - - -1.76 - - - - - -
3.9 - - - -3.78 - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.17 0.27 -1.91 - -1.75 - -1.06 -0.41 -2.61 - -0.69 - 0.91 -1.52 -
3.65 -3.26 -1.52 - -1.66 - -3.27 -2.66 -1.79 0.04 -4.18 - -5.45 - -
- - 3.91 - - - - - - - - - - - -
2.93 - 2.88 - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.73 - 0.79 - - - - - - - - - - - -
- - 3.91 - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- 2.72 -0.41 - -0.67 - -1.73 2.65 - -1.29 -5.09 - - - -
- 2.86 -1.54 -2.35 -0.67 - -0.33 1.33 -7.56 0.81 -3.5 -0.59 -2.47 - -0.81
- 3.79 -2.27 - -1.04 - -2.25 -4.4 -6.92 - -5.6 - -4.83 -2.6 -
- -0.94 1.09 - 1.98 - 0.88 2.59 - -2.19 -6.69 -2.58 -6.78 - -2.77
3.83 - - - -0.9 - - - - - -1.91 - - - -
3.76 - - - -5.93 - - - -1.6 0.1 -4.45 - - - -
3.9 - - - -5.57 - - - - - -5.72 - - - -
3.61 - - - - - - - - 1.43 -2.98 - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.78 - - - - - 0.34 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.61 - 1.48 - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.9 - - - -5.24 - - - -4.37 - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.45 -2.59 -0.07 1.36 - - -1.35 - - - - - - - -
3.5 -3.59 0.89 0.58 - - -2.14 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.