Heatmap: Cluster_192 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
- - - - -0.15 - - - 3.82 - - - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 2.11 - 0.02 - 1.96 1.63 1.42 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- 3.79 - - - - - - 0.26 - - - - - -
- - - - 0.32 - 0.99 - 3.49 - -0.89 - - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - 0.16 - 2.39 - 3.1 - -3.56 - - - -
-3.51 0.92 0.48 0.32 -1.02 0.9 -0.41 -0.38 0.38 -0.21 0.02 0.06 0.17 -0.79 -0.83
-2.83 2.27 -1.52 -0.18 -3.02 1.85 -1.3 -1.26 -0.52 -0.39 -1.44 0.38 -2.69 - -0.02
- - - - 2.52 - - - - - 3.21 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- 2.83 2.51 - -2.08 - -0.94 0.51 - - -5.33 - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- 3.91 - - - - - - - - - - - - -
2.59 - - - 0.69 - - - - - -2.64 - 2.85 - -
- - - 0.25 0.49 - 0.46 -1.75 3.14 -0.89 -0.97 - -2.75 -0.45 -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
3.71 - - - 0.9 - - - - - - - - - -
- - - - 0.69 - - - 3.46 - 1.25 - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - 0.65 - - - 3.75 - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- 3.49 0.84 -0.12 -3.82 - -1.08 - -4.48 -2.44 -2.48 -3.57 - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - 0.07 - - - 3.49 - 1.43 - - - -
0.35 -1.94 -0.36 -0.05 0.19 -0.43 -0.39 -0.38 1.96 0.89 -1.15 -0.81 -1.44 -3.23 0.09
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- 3.29 1.76 0.45 -5.81 - -1.74 - - - - - - - -3.02
- - - - 0.07 - 3.57 - - - 1.04 - - - -
- 3.14 2.52 - -7.81 - -1.24 - - - -6.8 - -5.29 - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - -1.23 - 2.83 - 2.86 - -2.2 - - - -
- - - - 0.68 - - - 3.47 - 1.2 - - - -
- - - - 0.18 - - - 1.56 - 3.45 - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - 3.88 - - - - - - -1.67 - - - -
- - - - 1.62 - - 3.42 - - 0.27 - - - -
- - - - 3.5 - - - 1.25 - 0.35 - - - -
- - - - 3.52 - - - - - 1.81 - - - -
- - - - 2.42 - - 1.86 0.46 0.99 0.54 0.27 - - -
- - - - 2.61 - - 2.89 0.18 - -1.55 - - - -
- 3.91 - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.36 - 2.29 - 1.09 - -0.21 - - 2.54 -
- - - - -4.84 - 2.34 - 3.24 -3.71 -3.85 -3.0 - - -2.28
- - - - - - 3.62 - 1.42 - - - - - -
2.74 -3.63 - - -5.16 - -4.39 - 2.96 -3.09 -4.91 - -2.13 - -
- - - - 1.57 - 0.03 - 2.62 2.27 -4.28 - - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- - - - 0.12 - - - 3.8 - - - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - - - - - 3.6 - 1.51 - - - -
- - - - - - - - 3.6 - 1.54 - - - -
- - -1.27 0.28 -0.41 - 1.81 -1.74 2.1 0.03 -0.75 - -1.66 1.28 -2.45
- 3.84 -4.95 -2.29 -2.66 - -2.78 -3.36 - -4.15 - - - - -
- 3.74 - 0.66 - - - - - - -4.97 - - - -
3.54 - - - - - - - 1.74 - - - - - -
- - - - - - 1.8 - 3.53 - - - - - -
- - - - -1.02 - -0.19 - -0.18 - 2.01 2.86 0.53 - -
- - - -2.37 -0.2 - 1.26 -4.33 2.11 0.74 -1.21 0.49 -1.97 1.41 -0.47
- 2.74 -4.29 3.01 -4.62 - -2.97 - - - -5.87 - - - -
- - - - - - - - 0.76 - 2.83 - 2.63 - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - -0.38 - - - 3.83 - - - - - -
- - - - 1.31 - 2.02 - 2.98 - -0.81 - - - -
- - - - 0.4 - -1.03 1.05 2.48 -0.52 -0.66 -0.81 1.86 - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.25 - 2.17 - -0.02 - - - -
- - - - - - 1.38 - 3.47 - 0.37 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - 2.22 - - - - - 1.21 3.0 - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- 3.04 2.04 -1.28 -2.25 -1.69 -1.05 -4.13 -1.08 -1.17 -2.57 - -4.04 - -4.34
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- 3.91 - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.71 - 0.78 - 2.57 - - - -0.43 2.59 -
- - - - - - - - 3.48 - 1.93 - - - -
-2.42 3.3 -0.25 1.39 -2.17 -0.94 -0.88 -2.83 -4.52 -4.07 -7.24 - - - -
- 3.52 -0.44 0.73 -3.19 -0.87 -1.52 -3.61 -6.42 -5.4 - - - - -
- - - - 0.85 - 3.1 - - - 2.2 - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - 0.41 - 2.39 - 3.03 - -2.0 - - - -
-1.21 - - 0.21 -1.81 - 1.42 - 2.66 -0.41 -2.39 - -2.25 1.57 -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - -2.15 - 3.88 - - - - - - - -
- - 2.36 - 0.59 - - - - - 1.86 1.5 0.92 - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.53 - 1.79 - - - -
- - - - 0.26 - 2.25 - 2.85 -0.15 -2.44 -0.41 - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - -1.85 - 3.19 - 2.23 - -0.15 - - - -
- - - - -1.39 - 1.12 - 3.3 - 0.2 - - 0.51 -
- - - - -1.0 - 2.15 - 2.91 - -0.4 - 0.83 - -
- - - - -1.85 - 2.26 - 3.31 - - - - - -
- - - - 1.19 - 1.23 - 3.36 - -3.14 - - - -
- - - - 0.52 - 3.08 - 2.29 - -2.35 - - - -
- - - - -0.51 - 2.08 - 3.32 - -3.64 - - - -
- - - - -1.17 - 1.03 2.54 2.15 - -3.0 -0.35 -1.98 0.13 -
- 1.47 - - -0.13 - 0.55 - 3.23 - -1.17 - - - -
- - - - 0.42 - 0.75 -1.88 3.29 -1.44 0.53 - -3.1 - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.