Heatmap: Cluster_12 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
- - - - 1.76 - 0.02 - - 3.38 -2.27 - - - -
- - 2.82 - 0.35 - - 0.86 -0.83 - -1.55 - -0.74 - 1.74
- - - - 0.32 - - - - - 3.78 - - - -
- 3.2 -2.32 -3.54 -5.74 - -2.52 - 1.73 -0.38 -2.53 -2.52 -1.03 - -1.28
- - - - -2.69 - 0.49 2.31 1.26 - 1.23 - 0.02 1.44 -
- - - - 2.48 - - - 0.28 3.04 - - - - -
- - - - 0.82 - - 2.35 - 3.02 - - - - -
- - 2.82 - 1.81 - - - - 1.86 -0.32 - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - 3.09 - - - - - 2.69 - - - -
- - - 0.97 -1.65 - -0.06 - 3.47 - -0.54 - - - -
- - - - -0.73 - - - 3.79 - -0.9 - - - -
- - - - -2.69 - - - - 3.89 - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
-1.55 1.5 1.12 1.33 -3.09 - 2.37 - -2.13 -1.22 -0.31 -1.87 -3.09 - -
- - - - 2.74 - - - 3.06 - - - - - -
- - - - - - - - - - 0.44 - - 3.77 -
- -4.32 -4.22 -2.43 -0.32 3.24 -0.76 -0.98 0.9 0.39 -3.66 - -4.14 -4.69 -
- - -4.76 -1.74 0.55 - -2.36 -0.61 0.41 2.93 -0.76 0.58 - - 0.4
- 1.89 1.01 0.64 -2.44 -1.09 -0.41 -1.75 1.36 -0.83 -2.74 -0.75 -0.55 -2.9 0.4
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 1.92 - - - 0.34 - -1.55 - 3.26 - -
-3.04 - -4.88 3.67 -2.78 - - -0.56 -0.42 -1.94 -2.12 -5.72 -5.91 - -5.86
- - - - 1.65 - 1.08 2.2 -2.43 - 2.32 - - - -
- - - - 2.96 - 1.93 1.67 -2.06 - - - - - -
- - - - 2.19 - - 1.09 2.12 - 1.99 - - - -
- 0.13 -0.2 2.69 0.25 - 1.61 -0.1 -5.95 -1.59 -5.08 - - - 0.05
- -0.33 -1.21 3.48 -1.64 - 1.04 -2.09 - - -6.61 - - - -
- 1.7 - - 1.71 - -0.99 - -1.83 0.44 0.38 2.33 - - -
- - 2.29 - 0.25 - 2.7 - - - 1.29 - - - -
- - - - -1.59 - - - - - -0.46 - - 3.8 -
- - - - -2.5 - - - - - - - - 3.89 -
- - - - -1.23 3.75 - - -6.65 - -0.5 -1.44 - - -
- - - - 0.07 - - - 3.8 - - - - - -
- - - - 2.73 - - - 2.11 - 2.02 - - - -
- - 0.56 1.95 -1.08 - -1.14 - 2.2 -1.68 0.07 1.07 -2.13 - -1.14
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - 0.08 - -1.68 - - - 1.82 -1.13 - 3.27 -
3.05 - - -0.49 1.25 - - -2.39 0.93 0.52 -3.15 - - - -
- - - - -1.18 - - - -2.93 3.84 -3.33 - - - -
- - - - -0.9 - -2.56 - 1.06 3.07 0.45 1.11 - - -1.72
3.53 - - - -1.18 - - - 0.86 0.01 -4.16 - -2.71 - -
- - - - 1.84 - - - - 3.51 - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 1.6 - 1.45 1.06 0.01 1.97 0.24 -0.25 -2.36 - -
- - - - 1.53 - 1.26 0.54 0.81 1.12 -1.65 0.16 -0.86 1.08 -1.99
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
-9.38 2.85 -1.2 -2.81 -1.96 -0.27 -0.24 -1.31 1.35 -0.01 -1.97 -2.09 -3.29 -2.1 -0.96
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.33 - - - - - 2.31 - - - -
- - - -0.42 -1.34 - -2.14 - - 1.23 -1.3 - - - 3.44
2.23 - - - -1.5 - -1.81 -0.85 3.09 - -1.61 - -1.92 - -
2.17 - - - -1.42 - - 1.45 2.68 - -1.01 - -1.02 - -
- - - - 1.39 - - - -0.37 0.61 1.21 2.69 -1.51 - -0.05
- - -5.0 2.5 -1.02 - 0.68 -1.49 -0.4 0.62 1.06 0.72 -1.65 -2.35 -1.69
-0.76 - - - -3.11 3.82 - - -2.62 - -5.0 - - - -
-0.44 - -1.9 -0.57 0.86 - 0.6 0.42 -3.58 2.97 -2.76 -0.75 - - -
- - - - 1.71 - 2.63 - 2.46 - - - - - -
- - - - -0.81 - - - -1.11 - -0.66 - -0.43 3.65 -
- - - - -0.06 - - 1.3 - - 3.04 - 1.73 - -
- - - - 3.36 - - - - - 2.25 - - - -
- 3.38 -2.51 1.16 -5.49 - -3.34 -3.85 0.74 -4.55 -3.83 -4.99 -4.32 -3.82 -5.48
- - - - 1.3 - - - 3.54 - -0.22 - - - -
- - - - 0.04 - 0.33 1.39 3.23 - -1.9 - -1.21 - -
- - - - 0.09 - - - 3.58 - 0.98 - - - -
- - - - -0.22 - - - 3.72 - -0.02 - - - -
- - - - - - 1.47 - - 3.48 0.09 - - - -
- - - - 1.75 - - - - - 3.54 - - - -
- - - - -0.27 - 0.05 3.01 2.12 - -1.78 - -1.18 - -
- - - - -0.53 - 0.23 2.22 2.88 - -1.23 - -0.55 - -
- - - - 1.65 - - - 0.11 - 0.21 - 3.27 - -
- -3.66 - -1.12 -1.98 - -5.42 - -0.56 1.8 1.96 0.29 -1.8 1.8 0.19
- - -5.87 0.29 -2.79 - -3.97 - -1.21 1.15 1.71 0.63 -1.58 2.27 -0.09
- - -3.77 0.57 -1.1 - - - -4.76 2.89 2.12 -4.14 -0.93 -5.24 -0.85
- - - 3.84 -2.85 - - - - - -0.96 - - - -
- - - - 1.34 - -1.22 - -2.19 3.27 -3.0 1.05 - - -
- - - - -2.43 - -0.98 - 0.6 3.15 0.23 -0.21 0.47 - -1.08
2.05 -4.43 -2.35 -0.71 -0.56 0.26 0.78 -0.68 0.41 1.5 -2.53 -1.61 -4.2 -2.65 -0.14
- - - - 0.03 - - - 3.69 - 0.16 - - - -
- - - - -1.75 - - - 3.8 - -0.32 - - - -
- - - - - - - - 3.36 - 2.25 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - -3.25 - -0.54 - -0.18 -1.99 1.63 0.68 -1.09 0.04 -2.37 - 2.74
- 0.01 -0.39 0.34 0.12 -2.06 -0.61 -1.84 0.06 2.4 -0.97 -2.87 0.09 0.69 -4.24
-3.8 2.3 2.06 2.03 -2.95 - -1.23 - -2.95 -2.16 -3.7 -1.35 - - -1.52
- - - - 3.2 - - - 1.87 - 1.13 - - - -
- - - - 1.27 - -4.99 - -1.71 3.61 -4.17 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - 3.32 -0.85 - 0.22 - -2.51 - 1.63 - - - -
- - - - -2.68 3.89 - - - - -5.57 - - - -
- - - - 3.79 - - - - - 0.2 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - -0.98 - - - 2.99 - 2.71 - - - -
0.58 - 1.16 -0.35 -2.84 - -1.28 - 2.08 0.38 0.75 - 0.67 0.17 -
- - - - 0.22 - - - 0.16 - 1.7 - 2.52 - 1.9
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 2.85 - - - - - 2.96 - - - -
- - - - 1.67 - - - - - 1.67 - 3.11 - -
- - - 3.68 0.87 - - - - - -1.65 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - -3.83 - - 2.49 -1.88 - 0.65 -0.23 1.81 1.14 -0.79 -3.56 -2.06
- - -5.13 -6.13 -5.32 2.48 -1.04 -8.03 1.41 -0.22 1.07 -0.75 1.05 -2.31 -1.39
- - - - -4.87 - -2.51 - -1.01 0.31 2.77 1.99 0.53 - -0.27
-5.13 - -3.93 -5.47 -3.33 2.34 -0.87 -8.88 1.36 0.02 1.03 -0.89 0.72 -1.13 -0.15
- - - - -4.6 -1.21 1.05 -5.31 0.84 1.59 1.93 -0.42 -0.37 - 1.2
- - - - 2.46 - - - - - 3.25 - - - -
- - - - 3.32 - - - 2.32 - - - - - -
- - - - - - - - - - 2.39 3.29 - - -
-3.92 - -4.68 0.65 -0.26 - -0.84 -1.5 0.34 2.78 0.73 0.55 - - -1.68
- - - - -0.57 - - - - - 3.84 - - - -
- - - - 0.47 - 3.55 - - - 0.92 - - - -
- - - - -3.56 3.9 - - - - - - - - -
- - - - -0.26 - -0.01 - 1.3 2.76 -1.04 0.63 0.93 - -
- - - - 0.5 - - - 0.18 3.34 1.22 - - - -
- - - - -1.8 - - - - - 2.78 - 2.98 - -
- - - - -1.16 - -2.04 2.54 3.02 - -2.08 - -2.71 - -
- - - - 2.17 - - - - - 3.39 - - - -
-0.32 - - - -3.24 - - - -4.17 - 1.94 1.36 2.73 0.06 -
- -0.27 -0.24 1.12 -1.26 0.87 0.13 -1.33 -0.9 0.48 -0.25 1.35 -0.67 -1.13 0.02
- - - 3.79 - - - - - - -1.53 - - -0.28 -
- - - 3.87 - - - - - - -1.44 - - - -
- - - - -2.49 - - - - 0.97 0.45 - 3.52 - -
- -1.25 1.91 - -2.24 - -3.12 2.07 -1.36 -2.21 1.09 -0.53 0.04 0.87 -
- - -0.71 3.62 -2.76 - - -1.39 -1.38 -1.22 -0.49 - - - -
- 2.43 - - -3.01 - - 2.85 - - 0.86 - -1.03 - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - - - - - 3.91 - - - - - -
- - - - 2.45 - - - - - 3.25 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- 2.49 0.78 - -2.27 - 0.65 -1.13 -0.92 1.57 -0.06 - -0.03 - -
- - - - - - - - 0.9 3.64 -0.67 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.64 - - - - - 1.32 - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - -0.98 - - 1.14 3.53 - -1.05 - -1.94 - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - -4.6 -3.44 -1.0 - -0.23 -3.1 2.4 1.37 -1.34 0.89 - - 1.73
- - -2.51 - 0.99 - 0.27 -0.12 0.35 0.78 0.15 1.0 2.17 -3.01 -
- - - - 0.9 - 3.43 - - - 1.24 - - - -
- 2.65 - - -4.36 - - - -1.65 - 0.23 - - 2.84 -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- - - - 2.24 - - - 1.48 2.91 - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
1.49 - -0.73 0.6 -0.27 - -0.72 -3.72 0.01 2.83 -1.85 - - - -2.67
3.52 - 1.53 - -3.04 - -3.0 - -5.25 - -4.22 - -1.58 - -
- - - - -1.38 - - - 0.24 3.22 0.66 -0.25 0.76 - -
2.44 - - - 0.21 - 0.93 - -1.93 2.62 -3.46 - - - -
- - - 0.69 -1.47 2.1 -0.35 -2.39 - -1.75 -0.09 1.87 -3.68 - 1.48
- - 1.95 1.5 -0.26 - -2.72 - 1.97 0.55 0.37 -1.82 - - -1.5

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.