Heatmap: Cluster_135 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.16 0.0 1.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.1 0.0 1.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.04 0.24 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.11 0.0 1.0 0.11 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 0.16 0.08 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.18 0.0 1.0 0.33 0.24 0.01 0.74 0.24 0.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.12 0.0 1.0 0.14 0.04 0.02 0.01 0.0 0.01
0.0 0.04 0.16 0.08 0.36 0.7 0.58 0.27 0.63 0.4 0.28 0.31 0.05 0.09 1.0
0.0 0.2 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.03 1.0 0.02 0.05 0.03 0.01 0.06 0.63
0.0 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 1.0 0.11 0.06 0.03 0.32 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.01 0.02 0.01 0.0 0.06 0.01 1.0 0.02 0.01 0.11 0.07 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.09 0.06 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.05 0.01 0.0 0.05 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.07 0.35 0.03 0.4 0.38 0.09 0.01 0.17 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.17 0.0 0.99 0.62 0.23 0.04 0.92 0.0 1.0
1.0 0.02 0.05 0.08 0.1 0.0 0.13 0.06 0.13 0.19 0.11 0.29 0.11 0.06 0.11
1.0 0.01 0.05 0.03 0.06 0.08 0.07 0.02 0.22 0.1 0.04 0.08 0.01 0.01 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05
0.0 0.07 0.02 0.03 0.14 0.0 0.14 0.0 1.0 0.16 0.08 0.02 0.45 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.14 0.04 0.05 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.09 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 1.0 0.12 0.02 0.01 0.31 0.0 0.07
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.04 0.0 1.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.45 0.11 0.0 0.13 0.47 0.03 0.17 1.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.15 0.0 0.0 1.0 0.0 0.16 0.76 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.17 0.01 0.0 0.24 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.17 0.0 1.0 0.29 0.21 0.0 0.0 0.0 0.11
0.0 0.32 0.46 0.18 0.22 0.5 1.0 0.11 0.81 0.88 0.28 0.08 0.38 0.04 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.09 0.06 0.13 0.4 0.0 0.06
1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.19 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.23 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.29 1.0 0.0 0.02 0.0 0.12 0.0 0.3
0.07 0.19 0.39 0.46 0.56 0.64 0.55 0.4 0.9 0.73 0.44 0.91 0.5 0.17 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 1.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.33 0.01 0.0 0.15 0.01 1.0 0.23 0.13 0.03 0.86 0.14 0.02
0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.01 0.16 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.13 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 1.0 0.18 0.03 0.01 0.54 0.01 0.19
0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.01 1.0 0.33 0.13 0.02 0.77 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.11 0.04 0.0 0.11 0.0 0.04
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.12 0.0 0.8 0.2 0.31 0.05 1.0 0.01 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.61 0.17 0.17 0.03 1.0 0.01 0.04
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 0.56 0.19 0.16 0.02 1.0 0.01 0.05
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.12 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)