Heatmap: Cluster_236 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.0 0.01 0.01 0.15 0.0 0.14 0.53 0.07 0.14 0.2 0.0 1.0 0.13 0.05
0.03 0.39 0.38 0.3 0.34 0.31 0.42 0.44 0.34 0.31 0.41 0.37 1.0 0.49 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.12 0.0 0.02 0.06 0.15 0.0 0.58 0.24 0.0
0.0 0.08 0.3 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.05 0.1 0.22 0.09 1.0 0.23 0.0
0.0 1.0 0.13 0.05 0.13 0.0 0.26 0.24 0.25 0.12 0.27 0.18 0.79 0.04 0.09
0.0 0.1 0.28 0.06 0.11 0.0 0.18 0.06 0.2 0.5 0.18 0.16 1.0 0.0 0.0
0.0 0.16 0.33 0.31 0.16 0.07 0.24 0.31 0.24 0.21 0.19 0.12 1.0 0.15 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.1 0.0 1.0 0.3 0.03
0.0 1.0 0.14 0.04 0.26 0.0 0.6 0.29 0.43 0.33 0.42 0.14 0.99 0.13 0.2
0.0 0.16 0.14 0.24 0.36 0.6 0.3 0.12 1.0 0.53 0.4 0.04 0.28 0.04 0.4
0.4 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.17 0.0 0.07 0.0 0.12 0.0 1.0 0.12 0.0
0.0 0.21 0.15 0.2 0.1 0.49 0.07 0.37 0.05 0.03 0.17 0.0 1.0 0.13 0.0
0.0 0.26 0.0 0.0 0.04 0.0 0.31 0.0 0.04 0.0 0.32 0.0 1.0 0.18 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.2 0.15 0.13 0.26 0.04 0.37 0.63 0.26 0.23 0.3 0.5 1.0 0.2 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.47 0.32 0.38 0.11 0.61 0.26 0.44 0.28 0.37 0.34 0.54 0.26 0.18
0.0 0.43 0.16 0.12 0.17 1.0 0.35 0.17 0.17 0.18 0.17 0.19 0.17 0.13 0.22
0.0 0.17 0.08 0.07 0.24 0.62 0.52 0.34 0.3 0.25 0.26 0.29 1.0 0.03 0.54
0.0 0.37 0.36 0.26 0.59 1.0 0.71 0.72 0.48 0.53 0.49 0.48 0.95 0.35 0.63
0.01 0.18 0.25 0.23 0.48 1.0 0.51 0.43 0.36 0.37 0.32 0.4 0.6 0.28 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.04 0.99 0.0 0.01
0.0 0.0 0.08 0.17 0.32 1.0 0.59 0.35 0.27 0.4 0.36 0.2 1.0 0.25 0.21
0.0 0.0 0.1 0.21 0.17 1.0 0.33 0.01 0.12 0.23 0.21 0.12 0.2 0.05 0.31
0.0 0.05 0.02 0.0 0.05 1.0 0.04 0.0 0.07 0.11 0.07 0.08 0.44 0.0 0.0
0.0 0.0 0.24 0.49 0.29 1.0 0.47 0.0 0.18 0.75 0.35 0.33 0.89 0.0 0.09
0.0 0.03 0.02 0.01 0.07 1.0 0.18 0.01 0.08 0.08 0.17 0.08 0.29 0.0 0.01
0.0 0.97 0.19 0.11 0.39 0.0 0.78 0.29 0.7 0.47 0.67 0.33 1.0 0.1 0.25
0.61 1.0 0.94 0.9 0.28 0.27 0.46 0.3 0.35 0.49 0.38 0.55 0.31 0.2 0.27
0.0 0.41 0.14 0.07 0.16 1.0 0.24 0.02 0.13 0.16 0.18 0.05 0.24 0.1 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 1.0 0.28 0.0 0.13 0.05 0.24 0.0 0.07 0.41 0.0
0.26 0.16 0.11 0.23 0.55 0.28 0.39 0.05 0.83 0.67 1.0 0.1 0.43 0.06 0.58
0.0 0.0 0.0 0.1 0.32 0.0 0.38 0.03 1.0 0.47 0.36 0.0 0.19 0.0 0.0
0.0 0.06 0.12 0.0 0.09 0.0 0.26 0.96 0.04 0.01 0.05 0.0 1.0 0.12 0.03
0.0 0.0 0.0 1.0 0.07 0.0 0.08 0.0 0.06 0.24 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.11 0.0 1.0 0.52 0.58 0.3 0.0 0.0 0.0
0.02 0.4 0.26 0.07 0.19 0.0 0.36 0.78 0.14 0.06 0.18 0.01 1.0 0.08 0.48
0.0 0.09 1.0 0.0 0.01 0.0 0.14 0.0 0.04 0.27 0.15 0.0 0.95 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.06 0.12 0.29 0.0 1.0 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.11 0.0 0.21 0.0 0.15 0.48 0.27 0.0 0.0 0.48 0.0
0.17 0.13 0.28 0.19 0.02 1.0 0.3 0.2 0.05 0.14 0.21 0.01 0.67 0.25 0.01
0.0 0.89 0.33 0.0 0.3 0.0 0.62 0.0 0.6 0.73 0.78 0.32 1.0 0.0 0.57
0.03 0.45 0.46 0.09 0.07 0.38 0.2 0.15 0.13 0.08 0.14 0.05 1.0 0.13 0.01
0.0 0.12 0.0 0.0 0.16 0.0 0.24 0.0 0.21 0.1 0.11 0.18 1.0 0.08 0.2
0.01 0.44 0.31 0.23 0.43 0.46 0.43 0.41 0.51 0.5 0.62 0.95 1.0 0.61 0.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.25 0.0 0.22 0.23 0.34 0.46 1.0 0.54 0.0
0.0 0.13 0.11 0.17 0.31 0.71 0.46 0.19 0.22 0.3 0.47 0.37 1.0 0.16 0.41
0.0 0.35 0.09 0.12 0.11 0.06 0.33 0.12 0.15 0.07 0.14 0.2 1.0 0.12 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.94 0.57 0.61 0.84 1.0 0.0 0.23 0.31 0.0
0.0 0.1 0.07 0.1 0.18 0.0 0.25 0.31 0.25 0.26 0.45 0.58 1.0 0.16 0.36
0.05 0.66 0.48 0.23 0.34 0.49 0.49 0.41 0.43 0.35 0.36 0.45 1.0 0.47 0.39
0.0 0.0 0.02 0.1 0.04 0.39 0.1 0.02 0.08 0.14 0.09 0.09 1.0 0.28 0.06
0.0 0.16 0.44 0.0 0.03 0.0 0.06 0.19 0.05 0.08 0.17 0.0 1.0 0.32 0.0
0.0 1.0 0.11 0.03 0.21 0.0 0.42 0.51 0.24 0.3 0.46 0.25 0.69 0.04 0.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.15 0.02 0.0 0.11 0.0 1.0 0.28 0.0
0.0 0.92 0.29 0.0 0.05 0.0 0.04 0.07 0.01 0.12 0.13 0.03 1.0 0.04 0.0
0.03 0.52 0.54 0.06 0.07 0.0 0.27 0.51 0.05 0.08 0.15 0.0 1.0 0.22 0.0
0.0 0.12 0.34 1.0 0.06 0.0 0.16 0.0 0.14 0.4 0.08 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.29 0.14 0.0 0.23 0.83 0.15 0.84 0.11 0.02 0.2 0.01 1.0 0.17 0.02
0.0 0.33 0.61 0.39 0.01 0.0 0.02 0.0 0.06 0.24 0.47 0.04 1.0 0.0 0.05
0.0 0.53 0.27 0.19 0.17 0.66 0.28 0.46 0.16 0.14 0.21 0.09 1.0 0.15 0.04
0.0 0.34 0.29 0.0 0.12 1.0 0.17 0.4 0.05 0.07 0.05 0.0 0.45 0.23 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.0 0.24 0.25 0.0 0.43 0.21 0.25 1.0 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.36 0.33 0.04 0.09 0.88 0.28 0.03 0.07 0.1 0.16 0.08 1.0 0.24 0.07
0.0 0.15 0.06 0.3 0.45 0.38 0.16 0.99 1.0 0.48 0.39 0.04 0.28 0.02 0.64
0.0 0.23 0.16 0.04 0.3 0.57 0.31 0.2 0.4 0.29 0.3 0.25 0.54 0.09 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.82 0.86 0.67 0.38 0.76 0.61 0.48 0.5 0.48 0.51 0.6 1.0 0.79 0.65

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)