Heatmap: Cluster_90 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.55 1.0 0.04 0.04 0.06 0.05 0.08 0.05 0.04 0.02 0.1 0.02 0.01 0.12
0.03 0.22 1.0 0.05 0.04 0.02 0.07 0.04 0.09 0.04 0.02 0.04 0.01 0.0 0.06
0.0 0.15 0.29 1.0 0.03 0.08 0.03 0.1 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 1.0 0.15 0.08 0.38 0.12 0.09 0.04 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
0.04 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.37 1.0 0.0 0.0 0.3 0.03 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.78 1.0 0.02 0.03 0.01 0.01 0.09 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01
0.0 0.07 1.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.03 0.01 0.04 0.01 0.04 0.06 0.0 0.0
0.0 0.51 1.0 0.05 0.07 0.05 0.06 0.06 0.05 0.07 0.02 0.01 0.05 0.01 0.04
1.0 0.66 0.71 0.32 0.05 0.0 0.11 0.07 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.16 0.07 1.0 0.22 0.03 0.02 0.03 0.05 0.01 0.03 0.01 0.03 0.01 0.0 0.02
0.0 0.31 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.12 1.0 0.04 0.03 0.0 0.02 0.03 0.01 0.04 0.02 0.06 0.0 0.01 0.03
0.0 0.05 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.1 1.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0
0.0 0.33 1.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.91 1.0 0.18 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 1.0 0.08 0.02 0.12 0.04 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.27 0.03 0.14 0.72 0.54 0.46 0.06 0.33 0.14 0.1 0.2 0.48 1.0
0.0 0.02 0.46 1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.69 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.28 0.8 0.25 0.14 0.4 0.25 0.24 0.03 0.09 0.12 0.19 0.32 0.32 1.0
0.0 0.05 0.12 0.11 0.07 0.47 0.18 0.39 0.02 0.16 0.2 0.12 0.69 0.76 1.0
0.0 0.06 0.16 0.01 0.05 0.09 0.19 0.42 0.01 0.25 0.06 0.01 0.18 0.58 1.0
0.0 0.09 1.0 0.23 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0
0.0 1.0 0.87 0.41 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.96 0.45 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 1.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.42 0.04 0.1 0.27 0.35 0.4 0.04 0.14 0.18 0.15 0.6 0.46 1.0
0.0 0.41 1.0 0.03 0.07 0.22 0.13 0.22 0.02 0.05 0.04 0.15 0.03 0.02 0.05
0.12 0.03 0.49 1.0 0.03 0.0 0.03 0.07 0.08 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01
0.44 0.03 0.56 1.0 0.04 0.0 0.06 0.08 0.17 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.05
0.0 0.49 1.0 0.03 0.02 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02
0.0 0.09 1.0 0.28 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.3 1.0 0.11 0.12 0.03 0.04 0.05 0.02 0.02 0.03 0.01 0.52 0.0 0.04
0.0 0.16 1.0 0.09 0.02 0.02 0.03 0.03 0.07 0.02 0.04 0.03 0.02 0.0 0.04
0.0 0.02 1.0 0.03 0.04 0.02 0.05 0.06 0.04 0.03 0.02 0.08 0.05 0.01 0.08
0.0 0.16 1.0 0.06 0.01 0.01 0.04 0.02 0.05 0.04 0.01 0.03 0.0 0.0 0.06
0.0 0.18 1.0 0.12 0.07 0.07 0.08 0.08 0.1 0.05 0.05 0.06 0.04 0.04 0.06
0.0 0.47 1.0 0.09 0.04 0.03 0.05 0.05 0.0 0.03 0.01 0.07 0.01 0.0 0.03
0.0 0.18 1.0 0.32 0.01 0.29 0.02 0.0 0.04 0.09 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.17 1.0 0.17 0.05 0.0 0.03 0.09 0.02 0.05 0.02 0.15 0.01 0.0 0.0
0.0 0.16 1.0 0.19 0.05 0.0 0.03 0.1 0.01 0.02 0.01 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 1.0 0.02 0.08 0.02 0.05 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.18 1.0 0.02 0.02 0.03 0.08 0.06 0.19 0.07 0.01 0.03 0.0 0.0 0.03
0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.13
0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.2
0.0 0.25 0.27 0.28 0.38 0.66 0.36 0.43 0.25 0.41 0.24 0.48 0.29 0.35 1.0
0.0 0.3 1.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 1.0 0.21 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.18 0.22 0.27 0.28 0.23 0.24 0.68 0.22 0.19 0.18 0.52 0.27 0.14 1.0
0.0 0.03 0.1 0.08 0.17 1.0 0.21 0.5 0.01 0.09 0.1 0.0 0.07 0.41 0.48
0.0 0.23 1.0 0.07 0.06 0.13 0.07 0.06 0.01 0.04 0.01 0.03 0.0 0.0 0.06
0.0 0.21 1.0 0.06 0.06 0.1 0.09 0.04 0.01 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.62 1.0 0.48 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 1.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.28 1.0 0.11 0.06 0.13 0.08 0.12 0.01 0.08 0.04 0.02 0.15 0.09 0.41
0.0 0.01 1.0 0.05 0.04 0.0 0.03 0.04 0.01 0.07 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.19 1.0 0.1 0.11 0.45 0.16 0.21 0.01 0.04 0.07 0.02 0.29 0.1 0.5
0.0 0.58 1.0 0.06 0.06 0.02 0.04 0.07 0.06 0.04 0.03 0.0 0.0 0.02 0.06
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.22 1.0 0.27 0.02 0.0 0.13 0.01 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 1.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03
0.03 0.24 1.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.22 0.01 0.06 0.01 0.07 0.01 0.01 0.06
0.0 1.0 0.76 0.0 0.01 0.0 0.03 0.06 0.01 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 1.0 0.04 0.03 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 1.0 0.43 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.73 1.0 0.07 0.1 0.18 0.16 0.11 0.09 0.14 0.07 0.08 0.07 0.08 0.14
0.05 1.0 0.72 0.94 0.03 0.0 0.09 0.09 0.04 0.02 0.02 0.1 0.14 0.01 0.62
0.0 0.05 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.14 1.0 0.81 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.19 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.27 1.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.02 0.31 0.71 0.21 0.18 0.25 0.17 1.0 0.43 0.51 0.28 0.32 0.35 0.15 0.32
0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.58 1.0 0.01 0.02 0.03 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.65 1.0 0.8 0.07 0.14 0.15 0.07 0.13 0.12 0.05 0.13 0.04 0.02 0.06
0.0 0.66 1.0 0.41 0.0 0.04 0.07 0.0 0.03 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.17 0.04 0.06 0.7 0.16 0.4 0.02 0.14 0.06 0.03 0.12 0.14 1.0
0.0 0.05 0.35 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 1.0 0.9 0.21 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.63 1.0 0.92 0.03 0.0 0.04 0.02 0.02 0.02 0.05 0.0 0.02 0.06 0.0
0.06 1.0 0.91 0.36 0.03 0.0 0.05 0.01 0.02 0.02 0.06 0.01 0.06 0.03 0.01
0.0 0.48 1.0 0.07 0.02 0.01 0.04 0.08 0.0 0.03 0.01 0.22 0.02 0.01 0.08
0.0 0.39 0.8 1.0 0.16 0.7 0.35 0.83 0.01 0.16 0.15 0.01 0.23 0.73 0.86
0.0 0.16 1.0 0.04 0.04 0.0 0.03 0.06 0.05 0.11 0.03 0.18 0.02 0.0 0.16
0.0 0.26 1.0 0.09 0.01 0.06 0.03 0.11 0.02 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.1
0.0 0.04 0.23 0.01 0.13 0.88 0.43 0.92 0.06 0.4 0.23 0.09 0.4 0.66 1.0
0.0 0.9 1.0 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.07
0.0 1.0 0.54 0.26 0.05 0.19 0.02 0.03 0.0 0.03 0.02 0.0 0.09 0.0 0.21
0.0 0.1 1.0 0.02 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.45 1.0 0.09 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.84 1.0 0.88 0.68 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.02 1.0 0.03 0.01 0.0 0.05 0.02 0.04 0.07 0.08 0.0 0.09 0.01 0.0
0.0 0.05 1.0 0.31 0.1 0.72 0.18 0.06 0.12 0.15 0.02 0.02 0.0 0.01 0.05
0.0 1.0 0.92 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01
0.12 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.57 0.78 0.55 0.47 0.39 0.38 0.52 0.33 0.28 0.49 0.85 0.69 0.22 1.0
0.0 0.35 1.0 0.02 0.08 0.05 0.07 0.07 0.01 0.03 0.01 0.06 0.01 0.0 0.05
0.0 0.45 1.0 0.19 0.07 0.22 0.07 0.08 0.07 0.04 0.03 0.05 0.02 0.0 0.06
0.0 0.0 1.0 0.93 0.01 0.0 0.03 0.26 0.02 0.14 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.2 1.0 0.02 0.0 0.03 0.37 0.02 0.11 0.13 0.0 0.05 0.12 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.22 1.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.01 0.11 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.4 1.0 0.01 0.0 0.01 0.37 0.03 0.2 0.01 0.0 0.03 0.1 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.12 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.88 0.55 0.01 0.17 0.13 0.0 0.01 0.01 0.01 0.27 0.01 0.0 0.15
0.0 0.04 0.27 0.03 0.05 0.76 0.27 0.48 0.02 0.1 0.12 0.04 0.34 1.0 0.84
0.0 0.03 0.24 0.05 0.06 0.73 0.31 0.18 0.02 0.24 0.13 0.06 0.19 0.58 1.0
0.0 0.52 1.0 0.29 0.11 0.16 0.12 0.11 0.05 0.08 0.07 0.09 0.09 0.07 0.09
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.65 1.0 0.28 0.01 0.04 0.07 0.05 0.03 0.11 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03
0.37 0.12 0.24 0.1 0.28 1.0 0.5 0.76 0.26 0.35 0.38 0.42 0.29 0.33 0.74
0.0 0.03 0.52 0.08 0.17 1.0 0.43 0.86 0.02 0.16 0.08 0.06 0.11 0.31 1.0
0.0 0.38 1.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.39 0.37 0.4 0.45 0.2 0.44 0.48 0.49 0.42 0.56 0.62 1.0 0.34 0.6
0.02 0.02 1.0 0.17 0.01 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)