Heatmap: Cluster_99 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.15 0.17 0.06 0.69 0.39 1.0 0.66 0.42 0.36 0.28 0.31 0.47 0.54 0.53
0.0 0.01 0.07 0.04 0.54 0.28 0.79 1.0 0.4 0.33 0.31 0.38 0.48 0.41 0.52
0.0 0.07 0.12 0.08 0.8 0.36 1.0 0.97 0.86 0.37 0.15 0.23 0.39 0.2 0.33
0.0 0.07 0.46 0.28 0.83 0.28 1.0 0.16 0.23 0.66 0.33 0.35 0.48 0.22 0.41
0.0 0.06 0.29 0.28 0.72 0.09 1.0 0.39 0.28 0.45 0.24 0.26 0.83 0.27 0.16
0.0 0.06 0.13 0.31 0.73 0.72 0.57 0.4 0.3 0.48 0.42 1.0 0.45 0.22 0.47
0.0 0.0 0.04 0.03 1.0 0.11 0.57 0.31 0.03 0.21 0.17 0.07 0.34 0.07 0.14
0.46 0.08 0.26 0.0 0.83 0.77 0.61 0.91 0.21 0.25 0.15 0.07 1.0 0.58 0.27
0.0 0.0 0.1 0.06 0.76 0.77 0.75 0.44 0.45 1.0 0.13 0.56 0.11 0.2 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.23 0.33 0.01 0.11 0.05 0.06 0.07 0.04 0.05
0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.32 0.67 0.0 0.09 0.05 0.04 0.09 0.15 0.08
0.17 0.0 0.15 0.11 1.0 0.0 0.78 0.69 0.02 0.23 0.17 0.09 0.09 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.37 0.57 0.21 0.07 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0
0.01 0.5 0.43 0.13 0.86 0.32 1.0 0.22 0.3 0.57 0.43 0.25 0.73 0.22 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.55 0.0 0.0 0.06 0.22 0.47 1.0 0.37 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.6 0.08 0.23 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.73 0.23 0.08 0.04 0.03 0.07 0.03 0.0 0.0
0.17 0.01 0.57 0.4 1.0 0.71 0.74 0.45 0.25 0.48 0.5 0.19 0.46 0.4 0.34
0.01 0.01 0.31 0.06 1.0 0.22 0.77 0.3 0.27 0.34 0.25 0.68 0.11 0.04 0.03
0.12 0.0 0.17 0.0 1.0 0.0 0.48 0.14 0.03 0.05 0.09 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.08 0.07 0.9 0.05 1.0 0.12 0.38 0.29 0.23 0.15 0.67 0.04 0.18
0.0 0.12 0.21 0.13 1.0 0.32 0.89 0.56 0.53 0.49 0.22 0.21 0.59 0.03 0.08
0.0 1.0 0.53 0.19 0.34 0.2 0.27 0.14 0.18 0.16 0.21 0.13 0.2 0.15 0.16
0.0 0.43 0.02 0.0 1.0 0.0 0.83 0.09 0.2 0.3 0.47 0.73 0.62 0.25 0.0
0.0 0.02 0.0 0.02 1.0 0.22 0.69 0.23 0.05 0.08 0.06 0.02 0.07 0.05 0.06
0.0 0.0 0.06 0.07 0.72 0.3 0.57 0.11 1.0 0.46 0.04 0.22 0.09 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.11 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.51 0.02 0.0 1.0 0.0 0.15 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 1.0 0.06 0.0 0.27 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.18 0.0 0.07 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 1.0 0.11 0.05 0.23 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.67 0.48 1.0 0.0 0.77 0.0 0.08 0.08 0.17 0.47 0.46 0.0 0.31
0.14 0.0 0.07 0.41 0.83 0.38 0.79 0.44 0.81 0.53 0.31 0.6 0.65 0.42 1.0
0.0 0.0 0.06 0.03 1.0 0.02 0.66 0.21 0.01 0.05 0.03 0.01 0.03 0.0 0.05
0.0 0.0 0.1 0.05 1.0 0.02 0.44 0.23 0.01 0.1 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01
0.0 0.0 0.03 0.1 1.0 0.0 0.48 0.07 0.0 0.02 0.03 0.01 0.1 0.01 0.02
0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.36 0.55 0.05 0.03 0.08 0.07 0.03 0.18 0.04 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.34 0.08 0.0 0.04 0.04 0.01 0.05 0.0 0.02
0.03 0.37 0.36 0.44 0.76 0.5 0.6 0.7 0.52 0.54 0.4 1.0 0.35 0.35 0.8
1.0 0.12 0.16 0.0 0.07 0.0 0.09 0.0 0.01 0.06 0.02 0.07 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.21 0.06 0.71 0.23 1.0 0.46 0.05 0.38 0.09 0.13 0.16 0.0 0.4
0.0 0.11 0.3 0.13 0.79 0.38 0.83 1.0 0.07 0.35 0.13 0.29 0.16 0.02 0.15
0.0 0.0 0.02 0.06 0.54 0.0 1.0 0.64 0.03 0.18 0.18 0.19 0.1 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.34 1.0 0.14 0.47 0.44 0.1 0.43 0.05 0.12 0.18 0.22 0.01
0.0 0.0 0.02 0.0 0.92 0.0 1.0 0.04 0.16 0.41 0.59 0.26 0.41 0.31 0.81
0.0 0.05 0.11 0.02 0.86 0.05 1.0 0.11 0.35 0.34 0.54 0.3 0.52 0.36 0.6
0.0 0.0 0.05 0.08 0.64 0.05 1.0 0.17 0.25 0.4 0.71 0.31 0.32 0.15 0.52
0.0 0.5 0.17 0.0 0.37 0.0 1.0 0.03 0.55 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.92 0.11 0.47 0.12 0.06 0.02 0.13 0.0 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 1.0 0.04 0.36 0.17 0.05 0.04 0.08 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.18 0.0 0.32 1.0 0.45 0.56 0.2 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.49 0.31 0.49 0.24 0.23 0.3 0.74 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.25 0.0 0.04 0.29 0.16 0.38 0.15 0.0 1.0
0.0 0.0 0.09 0.2 0.2 0.0 1.0 0.0 0.04 0.17 0.15 0.05 0.02 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.53 0.0 0.53 0.0 0.06 0.0 0.29 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.06 1.0 0.1 0.86 0.45 0.15 0.18 0.09 0.04 0.11 0.01 0.03
0.0 0.01 0.45 0.04 1.0 0.04 0.91 0.37 0.16 0.08 0.05 0.03 0.08 0.0 0.06
0.01 0.0 0.02 0.1 1.0 0.0 0.12 0.37 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.17 0.15 1.0 0.02 0.39 0.21 0.01 0.07 0.05 0.02 0.04 0.0 0.08
0.0 0.16 0.15 0.11 0.89 0.53 0.93 0.63 0.34 0.63 0.32 0.7 0.41 0.2 1.0
0.0 0.28 0.31 0.43 0.87 0.6 1.0 0.93 0.43 0.61 0.44 0.59 0.78 0.31 0.79
0.0 0.01 0.18 0.2 1.0 0.25 0.46 0.24 0.12 0.16 0.07 0.0 0.14 0.11 0.03
0.0 0.0 0.1 0.33 1.0 0.0 0.6 0.34 0.17 0.11 0.14 0.0 0.11 0.0 0.0
0.0 0.14 0.02 0.0 1.0 0.0 0.47 0.25 0.26 0.13 0.03 0.12 0.27 0.02 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.21 0.25 0.12 0.08 0.06 0.01 0.06 0.0 0.0
0.0 0.11 1.0 0.09 0.39 0.0 0.05 0.01 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.1 0.0 1.0 0.0 0.72 0.23 0.26 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.04 0.0 1.0 0.0 0.22 0.17 0.09 0.03 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0
0.0 0.2 0.45 0.19 0.74 1.0 0.95 0.46 0.48 0.59 0.36 0.45 0.43 0.3 0.58
0.0 0.12 0.0 0.0 0.31 0.0 1.0 0.68 0.59 0.39 0.04 0.08 0.11 0.0 0.0
0.0 0.03 0.08 0.09 0.62 1.0 0.9 0.81 0.4 0.36 0.26 0.44 0.22 0.0 0.71
0.0 0.06 0.04 0.07 0.55 1.0 0.8 0.82 0.29 0.3 0.26 0.44 0.24 0.01 0.48
0.0 0.01 0.13 0.22 0.52 0.1 1.0 0.21 0.17 0.42 0.18 0.09 0.83 0.41 0.1
0.1 0.28 0.13 0.03 0.55 0.0 0.23 1.0 0.31 0.2 0.33 0.38 0.34 0.24 0.25
0.0 0.34 0.57 0.02 0.39 0.02 0.34 1.0 0.18 0.18 0.16 0.18 0.27 0.12 0.21
0.0 0.49 0.46 0.17 0.76 0.0 0.77 1.0 0.55 0.42 0.31 0.28 0.37 0.11 0.63
0.0 0.48 0.53 0.05 0.46 0.09 0.64 0.47 0.18 0.42 0.21 0.19 0.16 0.04 1.0
0.08 0.3 0.43 0.03 0.66 0.0 0.74 0.61 0.27 0.39 0.22 0.33 0.35 0.06 1.0
0.0 0.44 0.35 0.03 0.47 0.0 0.68 0.52 0.34 0.39 0.65 0.83 1.0 0.56 0.54
0.03 0.26 0.19 0.04 0.61 0.0 0.58 1.0 0.32 0.21 0.17 0.21 0.27 0.18 0.29
0.0 0.64 1.0 0.0 0.81 0.0 0.78 0.38 0.12 0.21 0.21 0.21 0.22 0.05 0.63
0.0 0.12 0.13 0.0 0.34 0.0 0.12 1.0 0.34 0.06 0.25 0.22 0.11 0.03 0.33
0.0 0.07 0.51 0.08 0.81 0.11 1.0 0.39 0.61 0.36 0.24 0.3 0.38 0.0 0.7
0.0 0.49 0.24 0.01 0.64 0.0 0.41 1.0 0.46 0.22 0.24 0.26 0.44 0.0 0.25
0.0 0.24 0.34 0.0 0.73 0.07 1.0 0.26 0.1 0.13 0.11 0.2 0.21 0.0 0.48
0.0 0.04 0.26 0.0 0.74 0.0 0.37 1.0 0.3 0.11 0.15 0.06 0.09 0.0 0.18
0.0 0.41 0.43 0.04 0.86 0.07 1.0 0.68 0.28 0.18 0.26 0.1 0.67 0.09 0.17
0.0 0.46 0.23 0.0 0.92 0.0 0.46 1.0 0.55 0.11 0.45 0.48 0.57 0.0 0.0
0.0 0.11 0.19 0.0 1.0 0.0 0.69 0.92 0.96 0.12 0.23 0.18 0.37 0.0 0.57
0.0 0.12 0.12 0.03 0.84 0.0 1.0 0.06 0.03 0.1 0.08 0.11 0.42 0.0 0.38
0.0 0.37 0.34 0.15 0.83 0.08 0.77 0.38 0.29 0.36 0.25 0.24 0.44 0.07 1.0
0.0 0.0 0.02 0.7 1.0 0.0 0.88 0.31 0.15 0.35 0.11 0.02 0.4 0.0 0.01
0.0 0.0 0.18 0.35 1.0 0.05 0.88 0.39 0.21 0.51 0.17 0.05 0.57 0.07 0.05
0.0 0.0 0.21 0.25 0.87 0.0 1.0 0.41 0.21 0.51 0.2 0.03 0.44 0.03 0.01
0.0 0.0 0.0 0.24 0.56 0.0 0.61 0.05 0.11 1.0 0.14 0.06 0.79 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.48 0.8 0.0 0.6 0.0 0.23 1.0 0.2 0.06 0.45 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.23 0.46 0.0 0.91 0.06 0.17 1.0 0.13 0.08 0.44 0.0 0.0
0.0 0.05 0.09 0.05 1.0 0.0 0.7 0.14 0.17 0.45 0.14 0.18 0.37 0.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.12 0.1 0.36 0.18 0.03 0.13 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.06 1.0 0.0 0.06 0.17 0.44 0.25 0.03 0.08 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.03 0.81 0.69 0.45 0.09 1.0 0.06 0.0 0.21 0.01 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.03 0.87 0.21 1.0 0.31 0.04 0.09 0.06 0.05 0.03 0.0 0.08
0.0 0.0 0.02 0.04 0.96 0.39 1.0 0.28 0.06 0.13 0.09 0.03 0.05 0.0 0.12
0.0 0.0 0.09 0.03 0.9 0.2 1.0 0.29 0.02 0.04 0.05 0.02 0.08 0.02 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.19 0.03 0.27 1.0 0.59 0.01 0.08 0.34 0.13 0.1 0.18 0.15 0.0
0.0 0.3 0.15 0.02 0.69 0.0 1.0 0.18 0.8 0.79 0.24 0.79 0.33 0.24 0.5
0.0 0.0 0.03 0.04 0.54 0.77 0.82 0.16 1.0 0.18 0.07 0.01 0.02 0.52 0.07
0.0 0.04 0.03 0.0 1.0 0.46 0.3 0.16 0.05 0.32 0.07 0.15 0.08 0.0 0.24
0.0 0.0 0.05 0.01 1.0 0.0 0.42 0.29 0.03 0.43 0.04 0.06 0.03 0.0 0.14
0.07 0.23 0.42 0.5 1.0 0.31 0.65 0.47 0.4 0.61 0.35 0.08 0.33 0.28 0.22
0.0 0.08 0.04 0.0 0.63 1.0 0.19 0.19 0.07 0.13 0.07 0.12 0.04 0.0 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.3 0.06 0.0 0.15 0.03 0.08 0.04 0.0 0.0
1.0 0.0 0.59 0.0 0.26 0.0 0.36 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.0 0.43 0.21 0.01 0.06 0.02 0.04 0.03 0.06 0.03
0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.53 0.44 0.0 0.03 0.02 0.02 0.04 0.0 0.0
0.35 0.0 0.28 0.0 1.0 0.0 0.87 0.29 0.07 0.32 0.16 0.06 0.1 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)