Heatmap: Cluster_64 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.18 0.0 0.0 0.25 0.0 1.0 0.18 1.0 0.07 0.05 0.02 0.3 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.63 0.0 0.81 0.23 0.98 0.59 0.23 0.0 0.0
0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.03 0.03 1.0 0.07 0.03 0.01 0.47 0.01 0.14
0.0 0.15 0.01 0.08 0.02 0.0 0.07 0.05 1.0 0.13 0.08 0.01 0.54 0.01 0.17
0.0 1.0 0.04 0.02 0.06 0.01 0.12 0.13 0.89 0.11 0.43 0.04 0.28 0.05 0.02
1.0 0.49 0.38 0.42 0.06 0.02 0.32 0.13 0.67 0.34 0.12 0.05 0.75 0.18 0.0
0.01 0.58 0.4 0.23 0.19 0.27 0.3 0.21 1.0 0.5 0.21 0.11 0.22 0.26 0.08
0.04 0.07 0.09 0.14 0.2 0.36 0.27 0.14 1.0 0.62 0.15 0.02 0.19 0.06 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 1.0 0.52 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 0.06 0.04 0.0 0.19 0.0 0.01
0.0 0.14 0.0 0.08 0.0 0.0 0.14 0.0 1.0 0.04 0.06 0.04 0.1 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 1.0 0.05 0.27 0.01 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.09 0.15 1.0 0.86 0.16 0.0 0.02 0.0 0.05
0.0 0.6 0.0 0.0 0.34 0.0 0.2 0.13 1.0 0.38 0.16 0.08 0.75 0.08 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.03 0.03 0.1 0.0 0.27 0.02 1.0 0.19 0.05 0.05 0.01 0.0 0.01
0.0 0.0 0.02 0.01 0.07 0.0 0.14 0.01 1.0 0.21 0.04 0.04 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.02 0.03 0.38 0.06 0.22 0.2 1.0 0.33 0.04 0.02 0.12 0.0 0.26
0.0 0.01 0.02 0.0 0.04 0.0 0.04 0.02 1.0 0.2 0.01 0.0 0.0 0.01 0.18
0.0 0.0 0.02 0.16 0.19 0.0 0.32 1.0 0.76 0.35 0.25 0.19 0.76 0.71 0.34
0.02 0.1 0.17 0.75 0.36 0.8 0.68 0.43 1.0 0.46 0.76 0.79 0.84 0.39 0.52
0.01 0.65 0.6 0.26 0.27 0.34 0.43 0.63 1.0 0.56 0.57 0.31 0.45 0.16 0.34
0.0 0.0 1.0 0.55 0.17 0.0 0.11 0.0 0.44 0.98 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0
0.16 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.02 0.0 1.0 0.02 0.0 0.1 0.0 0.2 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.04 0.02 0.08 0.0 0.12 0.04 1.0 0.08 0.05 0.11 0.06 0.07 0.16
0.33 0.0 0.5 0.83 0.05 0.0 0.0 0.06 1.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.07 0.03 1.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.18
0.0 0.16 0.02 0.02 0.06 0.01 0.08 0.08 1.0 0.45 0.23 1.0 0.56 0.02 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.31
0.0 0.1 0.2 0.35 0.65 0.3 0.33 0.67 1.0 0.7 0.17 0.73 0.51 0.05 0.6
0.0 0.67 0.26 0.12 0.22 0.08 0.41 0.31 0.91 0.32 0.19 0.04 1.0 0.11 0.1
0.51 1.0 0.4 0.23 0.03 0.01 0.04 0.02 0.25 0.09 0.09 0.02 0.12 0.02 0.06
0.1 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 1.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.06 0.14 0.0 0.37 0.0 0.0
0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 1.0 0.3 0.06 0.02 0.0 0.0 0.14
0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.97 0.16 0.09 0.01 1.0 0.0 0.51
0.0 0.01 0.0 0.12 0.1 0.0 0.21 0.07 1.0 0.09 0.25 0.1 0.05 0.0 0.2
0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.13 0.0 1.0 0.01 0.18 0.04 0.05 0.01 0.0
0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.01 1.0 0.0 0.22 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.17 0.0 1.0 0.19 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.23 0.04 0.0 0.06 0.0 0.18 0.0 1.0 0.16 0.02 0.01 0.01 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.02 0.06 0.0 0.32 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.84 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.16 0.08 0.12 0.09 0.08 0.11 0.17 1.0 0.11 0.32 0.01 0.46 0.04 0.02
0.0 0.0 0.02 0.08 0.07 0.2 0.11 0.08 0.61 0.35 0.37 0.14 1.0 0.09 0.27
0.0 0.05 0.12 0.08 0.46 0.09 0.4 0.68 1.0 0.51 0.56 0.18 1.0 0.37 0.17
1.0 0.94 0.93 0.74 0.46 0.16 0.22 0.47 0.79 0.13 0.04 0.05 0.05 0.05 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.03 0.04 0.0 0.05 0.07 1.0 0.15 0.28 0.01 0.36 0.0 0.02
0.04 0.22 0.04 0.08 0.07 0.04 0.15 0.11 1.0 0.14 0.22 0.02 0.2 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.78 0.01 0.0 0.03 0.0 1.0 0.24 0.16 0.0 0.75 0.05 0.0
0.0 0.02 0.01 0.07 0.04 0.0 0.07 0.01 1.0 0.13 0.08 0.06 0.41 0.0 0.59
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 1.0 0.11 0.06 0.06 0.0 0.16 0.0
0.0 0.61 0.13 0.07 0.17 0.35 0.34 0.17 1.0 0.29 0.09 0.3 0.21 0.06 0.67
0.0 0.19 1.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.59 0.01 0.14 0.0 0.21 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.81 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.0 1.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 1.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.24 0.02 0.0 0.03 0.0 1.0 0.55 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.03 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.09 0.39 0.01 0.0 0.66
0.72 0.0 0.19 0.9 0.01 0.0 0.02 0.0 1.0 0.02 0.55 0.66 0.05 0.08 0.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.62 0.0 0.12 0.0 1.0 0.27 0.0
0.0 0.51 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.14 0.08 0.0 0.04 1.0 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.16 0.0 1.0 0.0 0.14 0.65 0.24 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.1 0.01 0.0 0.52 0.0 1.0 0.3 0.3 0.27 0.51 0.0 0.9
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.04 0.01 1.0 0.07 0.02 0.01 0.07 0.0 0.04
0.0 0.0 0.04 0.0 0.09 0.0 0.08 0.0 1.0 0.08 0.04 0.14 0.04 0.04 0.07
0.0 0.0 0.02 0.03 0.34 0.02 0.31 0.14 1.0 0.38 0.03 0.02 0.09 0.0 0.32
0.0 0.39 0.0 0.0 0.26 0.0 0.44 0.6 1.0 0.12 0.37 0.19 0.21 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)