Heatmap: Cluster_264 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.47 0.81 1.0 0.4 0.84 0.94 0.47 0.45 0.61 0.45 0.18 0.56 0.61 0.29
0.0 1.0 0.79 0.49 0.95 0.57 0.88 0.87 0.59 0.85 0.35 0.26 0.9 0.54 0.07
0.65 1.0 0.95 0.73 0.76 0.67 0.76 1.0 0.85 0.67 0.6 0.46 0.56 0.41 0.54
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.15 0.0 0.02 0.0 0.03 0.22 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.36 1.0 0.36 0.81 0.84 0.66 0.98 0.65 0.57 0.57 0.45 0.51 0.27 0.33
0.0 0.93 1.0 0.44 0.64 0.56 0.46 0.85 0.4 0.42 0.31 0.17 0.27 0.06 0.12
0.0 0.0 0.03 0.02 1.0 0.0 0.11 0.08 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 1.0 0.95 0.09 0.5 0.06 0.18 0.16 0.0 0.03
0.04 1.0 0.99 0.52 0.72 0.47 0.74 0.73 0.66 0.44 0.43 0.34 0.47 0.46 0.8
0.25 0.86 0.76 0.83 0.84 0.93 1.0 0.86 0.68 0.7 0.7 0.53 0.64 0.99 0.66
0.03 0.4 0.35 0.63 0.84 0.13 0.46 0.64 0.55 0.44 0.29 1.0 0.46 0.18 0.98
0.07 0.44 0.44 0.49 1.0 0.58 0.49 0.86 0.39 0.31 0.43 0.27 0.48 0.17 0.5
0.08 0.48 0.57 0.67 1.0 0.57 0.75 0.92 0.83 0.7 0.41 0.58 0.45 0.14 0.69
0.58 0.74 0.81 0.55 0.68 0.56 0.67 1.0 0.76 0.65 0.53 0.5 0.44 0.34 0.6
0.0 0.05 0.12 0.19 0.69 0.2 0.26 1.0 0.09 0.12 0.08 0.16 0.07 0.06 0.36
0.0 0.05 0.13 0.2 0.45 0.23 0.36 1.0 0.21 0.24 0.13 0.38 0.12 0.12 0.5
0.0 0.74 0.75 0.24 0.65 0.21 0.36 1.0 0.34 0.27 0.27 0.29 0.28 0.17 0.35
0.98 0.72 1.0 0.72 0.54 0.4 0.51 0.83 0.59 0.58 0.43 0.44 0.32 0.19 0.34
0.06 0.85 0.86 0.56 0.54 1.0 0.76 0.56 0.67 0.66 0.55 0.47 0.5 0.52 0.45
0.0 0.76 0.73 1.0 0.55 0.54 0.35 0.66 0.43 0.34 0.31 0.32 0.58 0.17 0.36
0.77 0.44 0.95 0.31 0.69 0.46 0.43 1.0 0.53 0.47 0.26 0.37 0.35 0.19 0.38
0.0 0.02 0.21 0.15 0.88 0.0 0.43 0.37 0.36 0.47 0.27 0.48 1.0 0.0 0.11
0.4 0.83 1.0 0.7 0.78 0.69 0.86 0.97 0.91 0.68 0.67 0.52 0.75 0.53 0.47
0.23 0.06 0.14 0.07 0.64 0.4 0.64 0.39 0.39 0.42 0.29 1.0 0.38 0.24 0.1
0.28 1.0 0.98 0.59 0.8 0.61 0.71 0.83 0.52 0.49 0.46 0.42 0.89 0.39 0.5
0.0 0.33 0.12 0.11 0.82 1.0 0.31 0.9 0.06 0.04 0.06 0.01 0.04 0.01 0.06
0.0 0.0 0.11 0.03 1.0 0.0 0.73 0.43 0.28 0.2 0.08 0.07 0.14 0.0 0.0
0.19 0.7 0.73 0.58 0.72 0.4 0.72 1.0 0.74 0.56 0.57 0.63 0.55 0.23 0.65
0.35 1.0 1.0 0.74 0.95 0.75 0.94 0.89 0.89 0.75 0.59 0.34 0.57 0.54 0.63
0.02 0.61 0.68 0.46 0.81 0.78 0.8 0.62 1.0 0.59 0.53 0.36 0.54 0.43 0.55
0.0 0.0 0.17 0.2 1.0 0.04 0.21 0.31 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.07 0.96 0.68 0.44 0.65 0.57 0.59 0.81 1.0 0.6 0.38 0.59 0.29 0.17 0.43
0.0 0.09 0.14 0.16 0.38 0.44 0.5 0.71 0.3 0.48 0.16 1.0 0.13 0.13 0.6
0.0 0.16 0.4 0.33 0.44 1.0 0.6 0.47 0.45 0.7 0.21 0.75 0.16 0.24 0.74
0.0 0.29 0.63 0.41 0.75 0.25 0.42 0.67 0.46 0.45 0.32 0.25 1.0 0.06 0.22
0.0 0.16 0.0 0.4 1.0 0.71 0.35 0.44 0.01 0.04 0.03 0.0 0.31 0.48 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.08 0.3 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.09 1.0 0.0 0.06 0.25 0.03 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.19 1.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.09 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.78 0.24 0.53 0.01 0.22 0.01 0.0 0.37 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 1.0 0.0 0.15 0.27 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.18 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.06 0.14 0.42 0.08 0.14 0.13 0.07 0.29 0.16 0.75 0.14 0.03 1.0
0.0 0.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.18 0.33 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.51 1.0 0.0 0.2 0.81 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.2 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.39 0.0 0.0 0.61 1.0 0.03 0.75 0.14 0.12 0.11 0.38 0.11 0.15 0.06
0.0 0.0 0.21 0.0 1.0 0.0 0.27 0.17 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.42 0.51 0.38 1.0 0.6 0.45 0.88 0.44 0.27 0.33 0.27 0.66 0.13 0.51
0.04 0.47 0.37 0.25 0.86 0.42 0.37 1.0 0.33 0.2 0.25 0.22 0.62 0.16 0.44
0.0 0.69 0.54 0.39 0.95 0.35 0.49 1.0 0.32 0.24 0.28 0.21 0.36 0.22 0.22
0.03 1.0 0.84 0.64 0.74 0.77 0.78 0.73 0.69 0.7 0.71 0.52 0.78 0.93 0.49
0.06 1.0 0.8 0.57 0.75 0.8 0.77 0.76 0.99 0.81 0.38 0.65 0.33 0.25 0.63
0.03 0.75 0.3 0.2 0.4 1.0 0.2 0.45 0.18 0.06 0.05 0.3 0.1 0.0 0.01
0.0 0.09 0.28 1.0 0.6 0.22 0.22 0.9 0.32 0.32 0.45 0.13 0.77 0.46 0.19
0.5 0.08 0.21 0.05 0.55 0.58 1.0 0.36 0.57 0.36 0.06 0.02 0.25 0.0 0.2
0.0 0.06 0.59 0.23 0.59 0.4 1.0 0.51 0.11 0.14 0.11 0.04 0.05 0.05 0.17
0.0 0.57 0.44 0.43 1.0 0.38 0.76 0.56 0.67 0.56 0.61 0.52 0.56 0.64 0.85
0.0 0.07 0.2 0.25 0.92 0.1 0.92 0.52 0.8 0.89 0.48 0.4 1.0 0.76 0.22
0.0 0.27 0.3 0.48 0.53 0.72 0.63 0.47 0.4 0.47 0.33 0.84 0.33 0.22 1.0
0.14 1.0 0.99 0.56 0.82 0.57 0.55 0.34 0.54 0.48 0.41 0.26 0.34 0.27 0.36
0.0 0.18 0.27 0.25 1.0 0.25 0.37 0.74 0.2 0.13 0.19 0.24 0.17 0.12 0.21
0.0 0.43 0.69 0.54 1.0 0.73 0.88 0.82 0.77 0.64 0.53 0.41 0.56 0.42 0.65
1.0 0.79 0.88 0.52 0.85 0.55 0.66 0.88 0.63 0.69 0.33 0.5 0.48 0.44 0.36
0.0 0.04 0.17 0.06 0.8 0.3 0.38 1.0 0.22 0.22 0.54 0.31 0.35 0.79 0.12
0.0 0.23 0.35 0.49 0.86 0.41 0.52 1.0 0.31 0.33 0.42 0.49 0.32 0.39 0.41
0.0 0.0 0.09 0.14 0.22 0.6 0.2 0.27 0.02 0.21 0.04 1.0 0.07 0.0 0.29
0.0 0.29 0.47 0.21 0.61 0.2 1.0 0.42 0.47 0.59 0.28 0.33 0.54 0.2 0.31
0.0 0.2 0.31 0.29 0.8 0.02 0.14 1.0 0.08 0.5 0.13 0.01 0.06 0.02 0.02
0.0 0.12 0.16 0.15 1.0 0.0 0.08 0.8 0.05 0.32 0.06 0.01 0.01 0.04 0.02
0.0 0.88 0.86 0.63 0.51 1.0 0.57 0.5 0.4 0.41 0.44 0.42 0.37 0.47 0.41
0.17 1.0 0.94 0.76 0.71 0.82 0.97 0.68 0.84 0.74 0.69 0.67 0.66 0.86 0.97
0.01 0.51 1.0 0.46 0.64 0.76 0.62 0.93 0.35 0.4 0.57 0.36 0.37 0.38 0.35
0.0 0.1 0.25 0.5 1.0 0.47 0.36 0.63 0.15 0.1 0.15 0.14 0.3 0.16 0.18
0.0 0.01 0.07 0.24 1.0 0.44 0.25 1.0 0.11 0.1 0.25 0.07 0.15 0.27 0.22
0.0 0.88 1.0 0.56 0.67 0.97 0.88 0.77 0.55 0.51 0.55 0.23 0.41 0.92 0.32
0.06 0.23 0.55 0.24 0.74 0.32 0.27 1.0 0.1 0.24 0.46 0.23 0.28 0.51 0.24
0.09 1.0 0.74 0.62 0.65 0.82 0.85 0.71 0.86 0.7 0.65 0.71 0.81 0.57 0.7
0.0 0.16 0.1 0.06 0.86 0.25 0.26 1.0 0.15 0.04 0.03 0.05 0.01 0.0 0.2
0.3 1.0 0.59 0.57 0.52 0.47 0.47 0.54 0.47 0.5 0.54 0.56 0.54 0.63 0.39
0.28 1.0 0.64 0.49 0.54 0.53 0.57 0.55 0.39 0.52 0.49 0.53 0.62 0.57 0.59
0.1 0.58 1.0 0.56 0.77 0.58 0.66 0.9 0.67 0.59 0.48 0.5 0.4 0.39 0.59
0.04 0.73 0.87 0.48 0.65 1.0 0.63 0.66 0.44 0.49 0.49 0.49 0.71 0.3 0.54
0.0 0.59 0.78 0.61 0.59 0.72 0.75 0.62 0.8 0.72 0.8 0.99 0.86 1.0 0.96
0.09 0.54 0.69 0.47 1.0 0.48 0.54 0.86 0.35 0.31 0.54 0.37 0.67 0.51 0.29
0.04 0.65 0.5 0.65 0.55 0.49 0.71 0.61 0.68 0.65 0.68 0.77 0.69 1.0 0.89
0.31 0.61 1.0 0.58 0.65 0.54 0.74 0.46 0.58 0.6 0.5 0.4 0.56 0.44 0.54
0.0 0.17 0.18 0.17 1.0 0.35 0.33 0.73 0.17 0.14 0.17 0.17 0.17 0.13 0.21
0.0 0.34 0.43 0.23 0.51 0.49 0.39 1.0 0.19 0.53 0.19 0.23 0.26 0.1 0.25
0.0 1.0 0.35 0.23 0.92 0.69 0.95 0.83 0.66 0.36 0.29 0.28 0.19 0.22 0.36
0.03 1.0 0.79 0.61 0.7 0.81 0.63 0.78 0.61 0.55 0.64 0.54 0.59 0.6 0.63
0.15 0.45 0.8 0.37 1.0 0.26 0.63 0.88 0.67 0.48 0.45 0.53 0.42 0.2 0.7
0.0 0.52 0.39 0.61 0.61 0.24 0.43 0.59 0.47 0.6 0.44 0.34 1.0 0.51 0.29
0.16 0.95 0.68 0.49 0.8 1.0 0.54 0.8 0.47 0.46 0.4 0.32 0.3 0.38 0.43
0.0 0.45 1.0 0.34 0.56 0.39 0.6 0.51 0.62 0.45 0.35 0.27 0.35 0.29 0.3
0.0 0.54 0.89 0.52 0.9 0.41 1.0 0.97 0.82 0.73 0.45 0.35 0.73 0.3 0.5
0.09 1.0 1.0 0.77 0.87 0.78 0.88 0.75 0.94 0.71 0.53 0.55 0.46 0.38 0.72
0.0 0.91 0.88 0.58 1.0 0.71 0.91 0.68 0.87 0.65 0.59 0.68 0.58 0.43 0.6
0.0 0.55 0.52 0.29 0.33 0.23 0.49 0.32 0.43 0.5 0.46 1.0 0.48 0.73 0.47
0.18 1.0 0.8 0.58 0.57 0.71 0.7 0.56 0.73 0.6 0.53 0.76 0.57 0.5 0.61
0.0 0.44 0.52 0.39 0.95 0.6 0.56 0.83 0.67 0.64 0.36 0.36 1.0 0.22 0.69
0.17 0.8 1.0 0.83 0.6 0.56 0.68 0.4 0.48 0.58 0.5 0.45 0.48 0.41 0.38
0.2 0.62 0.9 0.68 0.72 0.81 0.69 1.0 0.52 0.63 0.46 0.69 0.44 0.34 0.63
0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.0 0.08 0.37 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.01 0.17 0.68 0.04 1.0 0.2 0.71 0.25 0.17 0.04 0.26 0.3 0.1
0.0 0.01 0.01 0.17 0.67 0.04 1.0 0.1 0.67 0.24 0.15 0.04 0.25 0.28 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.18 0.26 0.13 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.08 0.2 0.02 0.0 0.02 0.04 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.15 0.3 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.66 1.0 0.56 0.6 0.85 0.89 0.68 0.48 0.44 0.52 0.2 0.37 0.53 0.3

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)