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Heatmap: Cluster_238 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
-7.91 -0.49 -0.36 -0.02 -0.29 0.17 0.72 0.54 0.61 0.29 -0.26 0.6 -0.17 -0.3 -0.6
-8.23 -0.35 -0.37 0.32 -0.02 -0.35 0.73 -0.1 0.57 0.42 0.16 0.03 0.0 -0.47 0.18
-2.57 0.43 0.06 -0.33 -0.53 0.54 0.42 -0.04 0.33 0.12 -0.31 0.23 -0.6 -0.97 0.76
-6.15 -0.34 0.0 -0.03 0.05 0.44 0.37 0.28 0.28 -0.16 -0.3 0.23 -0.05 -0.34 0.54
-1.83 0.21 0.16 0.05 -0.05 0.14 0.57 0.01 0.31 -0.08 -0.13 0.04 -0.26 -0.32 0.11
-7.67 -1.2 -0.73 -0.04 -0.17 -0.24 0.38 0.49 0.37 0.36 0.12 0.65 -0.25 -0.26 0.72
-4.87 0.41 0.23 -0.15 -0.07 0.55 0.28 -0.17 0.15 0.12 -0.56 0.14 -0.02 -0.37 0.4
-10.34 -0.84 -0.3 0.01 0.25 -0.49 0.27 0.21 0.17 0.42 0.08 0.35 0.48 -0.69 0.62
- -0.59 0.03 0.27 -0.54 -0.36 0.03 -0.17 0.39 0.73 -0.37 0.7 0.4 -1.6 0.77
- -1.24 -0.72 0.16 -0.02 -0.03 0.75 1.1 0.55 -0.25 -0.14 -0.34 -0.92 -0.99 1.01
- -2.11 -1.48 -0.73 0.11 -1.24 0.47 0.51 0.26 0.25 -0.31 1.48 -0.75 -2.76 1.47
-4.16 -1.77 -0.77 -0.05 -0.31 -0.52 0.98 0.42 0.27 -0.04 -0.14 0.75 -0.4 0.09 0.75
-3.0 -0.63 -0.14 0.01 -0.14 -0.11 0.39 0.36 0.45 0.18 -0.06 0.14 0.03 -0.22 0.54
-2.43 -0.72 -0.25 0.15 0.16 -1.31 0.65 -0.12 0.51 -0.07 -0.05 0.78 0.25 -1.0 0.59
-3.4 -0.38 -0.07 0.22 -0.22 0.63 0.21 0.27 0.13 0.1 -0.58 1.07 -1.07 -0.67 0.27
-3.7 0.36 0.41 0.04 0.01 -0.14 0.29 0.04 0.41 -0.03 -0.43 0.56 -0.39 -0.99 0.4
-0.83 -0.44 0.04 0.04 -0.18 0.27 0.1 -0.49 0.15 0.25 0.1 0.4 0.15 -0.26 0.19
-1.05 -0.62 -0.49 0.17 -0.35 -0.32 0.34 0.1 0.54 0.4 -0.46 0.76 -0.83 -1.16 0.93
-2.42 0.31 -0.25 0.01 -0.28 -0.21 0.25 0.08 0.2 0.19 -0.11 0.72 -0.68 -1.52 0.97
- -0.1 0.0 0.06 -0.25 0.25 0.62 -0.14 0.5 0.15 -0.15 0.27 -0.24 -0.31 0.33
-1.68 0.98 0.32 0.03 -0.21 -0.34 0.47 -0.1 0.27 0.09 -0.44 -0.25 -0.33 -0.23 -0.04
-3.4 0.2 0.5 0.22 0.03 0.23 0.05 -0.07 0.53 0.13 -0.28 -0.01 -0.22 -0.62 0.19
- -1.3 -0.06 -0.69 0.06 0.45 0.59 0.16 0.72 0.48 -0.3 -0.41 0.29 0.07 0.17
-2.53 -1.19 -0.63 0.25 -0.17 -0.46 0.45 0.17 0.26 0.23 -0.38 1.11 -0.52 -1.25 1.02
-2.83 0.12 0.11 0.32 -0.18 -0.2 0.24 -0.0 0.38 0.28 -0.34 0.4 0.02 -0.63 0.3
-8.84 -0.12 -0.23 0.13 -0.21 -0.11 0.51 0.18 0.26 0.19 -0.08 0.15 0.18 -0.33 0.54
-3.22 0.9 0.92 -0.02 0.1 0.11 0.52 -0.0 0.21 0.1 -0.31 -0.8 -0.85 -1.28 0.0
-5.9 0.87 0.35 -0.03 -0.53 0.72 0.24 -0.2 0.24 -0.18 -0.1 -0.42 -0.4 -0.04 0.06
-2.61 0.63 0.71 -0.13 0.05 -0.19 0.43 0.28 0.35 0.14 -0.11 -0.38 -0.7 -0.8 0.02
-7.23 -1.06 -1.39 -0.59 0.14 -0.5 0.65 0.53 0.65 0.44 0.11 0.3 -0.11 -0.25 0.72
-2.53 -0.96 -0.46 -0.49 0.1 0.36 0.29 0.73 0.63 0.27 -0.01 0.09 -0.07 -0.7 0.33
- -1.64 -1.27 -0.83 -0.49 -0.9 0.62 0.78 0.9 0.66 -0.28 0.77 -0.47 -1.25 1.07
-4.93 -0.27 -0.02 0.43 -0.01 0.18 0.51 0.0 0.26 0.32 -0.11 0.13 -0.49 -0.56 0.49
- 0.38 0.26 0.12 -0.0 0.01 0.63 -0.34 0.33 0.25 -0.13 0.09 -0.38 -0.79 0.39
-7.72 -1.18 -0.66 -0.19 0.09 0.2 0.47 0.08 0.46 0.29 0.04 0.84 0.12 -0.57 0.28
-1.37 0.54 0.34 -0.33 -0.37 0.54 0.49 -0.44 0.27 -0.03 0.1 -0.48 -0.35 0.02 -0.06
- 0.7 0.34 0.16 -0.22 -0.04 0.34 0.14 0.15 0.11 -0.22 0.21 -0.44 -0.99 0.43
- 0.15 0.17 -0.17 0.01 0.52 0.35 0.42 0.74 -0.01 -0.09 0.08 -0.71 -1.04 0.11
-1.81 0.47 0.02 0.33 -0.27 -0.73 -0.05 0.46 0.27 -0.06 -0.46 0.79 -0.28 -1.24 0.5
-0.5 1.36 0.6 -0.16 -0.23 -0.23 -0.13 0.14 0.33 -0.18 -0.84 -0.07 -0.61 -1.47 -0.1
-4.84 0.54 0.3 0.07 -0.1 0.63 0.27 0.28 0.27 0.07 -0.33 -0.1 -0.45 -0.77 0.03
-3.77 -0.67 -0.41 0.15 0.03 0.5 0.29 0.69 0.63 0.2 -0.59 0.5 -0.56 -1.16 0.34
-3.18 -0.41 -0.45 -0.54 -0.36 0.26 0.51 0.14 0.51 0.27 0.64 0.06 -0.28 0.18 0.05
-5.15 -0.35 -0.11 0.1 0.13 -0.01 0.21 0.24 0.24 0.1 -0.15 0.55 -0.07 -0.25 0.43
-7.05 0.23 0.48 -0.21 -0.37 0.72 0.54 0.16 0.42 -0.18 -0.33 -0.47 -0.2 -0.88 0.51
-0.81 0.38 -0.09 -0.32 -0.18 0.66 0.37 0.25 0.13 -0.29 -0.38 0.0 0.12 -0.83 0.15
-8.04 -0.26 0.07 0.21 0.18 -0.16 0.6 0.47 0.37 0.14 -0.33 0.08 -0.34 -0.97 0.55
-7.46 -0.42 -0.3 0.02 0.02 0.14 0.47 0.33 0.41 0.17 -0.15 0.19 -0.15 -0.67 0.72
-3.47 0.62 0.28 -0.0 -0.12 -0.1 0.33 0.31 0.39 0.15 -0.37 0.46 -0.65 -1.61 0.36
-1.67 0.7 0.39 0.3 -0.21 -0.05 0.44 -0.2 0.23 -0.21 -0.12 0.09 -0.58 -0.71 0.2
-2.89 -0.44 -0.36 -0.26 0.07 0.66 0.29 0.21 0.3 0.02 0.03 0.14 0.15 -0.59 0.44
-7.54 0.36 0.57 0.44 -0.35 0.68 0.46 -0.46 0.24 0.03 -0.28 -0.35 -0.51 -0.82 0.39
-4.8 -0.79 -1.25 -1.12 -0.15 -0.37 0.33 0.0 0.65 0.18 0.22 1.0 0.36 -0.07 0.56
-0.82 -0.21 0.74 0.14 -0.24 0.1 0.55 -0.08 0.34 0.03 -0.42 -0.12 -0.39 -0.54 0.07
-10.52 -1.24 -0.69 -0.02 0.02 -0.55 0.83 0.31 0.6 0.09 0.14 0.41 -0.11 0.26 0.17
-2.52 0.05 0.66 0.3 0.09 0.3 0.64 0.31 0.02 0.18 -0.22 -0.53 -0.74 -0.58 -0.14
-1.62 0.13 -0.24 -0.2 -0.12 0.44 0.45 0.18 0.47 0.02 -0.39 0.59 -0.25 -1.25 0.22
-0.43 0.44 0.53 -0.2 -0.01 0.41 0.24 0.11 -0.05 -0.08 0.05 -0.32 -0.53 -0.52 -0.2
-1.13 -0.29 -0.77 -0.14 -0.38 0.66 0.1 0.2 0.36 -0.04 -0.33 0.62 -0.17 -0.01 0.25
-4.98 -0.57 -0.23 -0.08 -0.05 0.01 0.23 0.36 0.45 0.18 0.16 0.44 -0.15 0.03 0.22
- -0.51 -0.05 -0.12 0.13 0.18 0.4 0.54 0.38 0.14 -0.02 0.24 -0.31 -0.62 0.47
-3.67 -0.39 -0.45 0.27 -0.19 0.13 0.49 -0.12 0.15 0.24 0.11 0.5 -0.03 -0.41 0.51
-2.1 0.44 0.85 0.11 -0.17 0.37 0.16 -0.13 0.31 0.21 -0.12 -0.04 -0.74 -1.43 0.09
-6.55 0.13 -0.05 0.08 -0.02 0.37 0.33 0.07 -0.32 0.24 -0.33 0.99 -0.29 -0.76 0.16
-6.16 -0.17 -0.13 0.15 -0.03 -0.04 0.23 0.24 0.38 0.11 0.02 0.07 0.07 0.1 0.27
- -0.72 -0.69 -0.5 -0.37 0.67 0.56 0.52 0.24 0.16 0.02 0.3 -0.02 -0.3 0.55
-2.12 -0.16 0.0 -0.15 0.06 0.23 0.17 0.17 -0.05 -0.0 0.02 0.73 -0.29 -0.77 0.55
0.5 0.15 0.7 0.16 -0.44 -0.19 0.21 -0.42 0.22 -0.11 -0.52 0.05 -0.78 -1.04 0.41

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.