Heatmap: Cluster_4 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.1 0.0 1.0 0.39 0.03 0.11 0.03 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.11 0.0 1.0 0.33 0.03 0.06 0.01 0.29 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.28 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.4 0.0 0.5 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.02 0.06 0.1 0.13 0.0 0.46 0.03 0.68 0.81 0.13 0.01 0.64 1.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.01 0.01 0.23 0.05 0.1 0.0
0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.06 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.02 0.19 0.3 0.16 0.19 0.42 0.14 0.84 1.0 0.13 0.09 0.85 0.76 0.16
0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.33 0.09 0.91 0.6 0.09 0.08 1.0 0.28 0.06
0.46 0.12 0.23 0.21 0.42 0.06 0.47 0.66 1.0 0.19 0.02 0.03 0.08 0.07 0.06
0.16 0.01 0.08 0.33 0.23 0.08 0.86 0.2 1.0 0.66 0.14 0.04 0.6 0.88 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.78 0.0 1.0 0.49 0.07 0.05 0.0 0.0 0.03
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 0.13 0.02 0.0 0.37 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.11 0.02 0.0 0.25 0.18 0.0
0.0 0.05 0.02 0.06 0.25 0.0 0.19 0.01 1.0 0.22 0.02 0.0 0.28 0.2 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.12 0.0 0.06 1.0 0.0
0.0 0.18 0.1 0.09 0.31 0.0 0.32 0.16 1.0 0.36 0.21 0.08 0.51 0.83 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 1.0 0.33 0.04 0.03 0.69 0.88 0.03
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.5 0.32 0.05 1.0 0.09 0.04 0.13 0.03 0.0 0.25
0.0 0.0 0.01 0.07 0.04 0.0 0.22 0.21 1.0 0.4 0.06 0.11 0.38 0.27 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.13 0.03 1.0 0.82 0.04 0.0 0.83 0.15 0.0
0.0 0.01 0.03 0.13 0.12 0.0 0.26 0.04 1.0 0.2 0.14 0.03 0.26 0.81 0.05
0.0 0.02 0.05 0.02 0.14 0.06 0.31 0.04 1.0 0.42 0.11 0.12 0.34 0.12 0.32
0.0 0.06 0.13 0.06 0.15 0.12 0.4 0.07 1.0 0.48 0.16 0.15 0.52 0.21 0.4
0.0 0.04 0.09 0.05 0.13 0.04 0.31 0.07 1.0 0.4 0.11 0.13 0.48 0.21 0.26
0.0 0.04 0.08 0.05 0.13 0.05 0.32 0.07 1.0 0.48 0.12 0.12 0.56 0.23 0.3
0.0 0.05 0.1 0.06 0.15 0.04 0.3 0.09 1.0 0.42 0.15 0.19 0.41 0.18 0.3
0.0 0.01 0.07 0.03 0.13 0.04 0.22 0.08 0.63 0.58 0.07 0.08 1.0 0.73 0.21
0.0 0.01 0.06 0.05 0.3 0.04 0.33 0.17 1.0 0.55 0.1 0.1 0.89 0.34 0.24
0.0 0.01 0.08 0.08 0.23 0.05 0.39 0.14 1.0 0.38 0.09 0.07 0.89 0.44 0.18
0.0 0.01 0.05 0.06 0.28 0.02 0.3 0.16 1.0 0.69 0.12 0.21 0.61 0.32 0.61
0.0 0.0 0.05 0.01 0.19 0.08 0.26 0.17 0.63 0.43 0.08 0.1 1.0 0.18 0.27
0.0 0.01 0.05 0.05 0.28 0.03 0.31 0.16 1.0 0.58 0.1 0.13 0.71 0.32 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.14 0.0 1.0 0.14 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 1.0 0.0 0.0
0.26 0.1 0.82 0.23 0.26 0.62 0.64 0.0 1.0 0.41 0.06 0.01 0.06 0.08 0.01
0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.03 0.0 0.68 0.52 0.05 0.44 0.01 0.03 1.0
0.0 0.34 0.48 0.27 0.19 0.27 0.74 0.36 0.95 1.0 0.67 0.3 0.93 0.84 0.33
0.01 0.66 0.94 0.84 0.32 0.4 0.89 0.39 0.71 0.65 0.28 0.14 0.76 1.0 0.09
0.22 1.0 0.41 0.0 0.01 0.0 0.2 0.0 0.48 0.12 0.05 0.0 0.11 0.41 0.01
0.01 0.18 0.45 0.29 0.15 0.2 0.8 0.09 1.0 0.78 0.22 0.1 0.61 0.46 0.4
0.0 0.02 0.31 0.11 0.16 0.0 0.09 0.1 1.0 0.48 0.05 0.1 0.46 0.38 0.14
0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 1.0 0.17 0.01 0.0 0.1 0.51 0.02
0.56 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.36 0.48 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0
0.0 1.0 0.79 0.2 0.22 0.19 0.29 0.17 0.63 0.36 0.23 0.09 0.53 0.47 0.18
0.0 0.03 0.08 0.54 0.11 0.03 0.38 0.22 1.0 0.73 0.09 0.45 0.9 0.32 0.34
0.0 0.02 0.0 0.19 0.1 0.0 0.23 0.03 0.82 0.19 0.01 0.32 0.04 0.04 1.0
0.01 0.14 0.38 0.27 0.28 0.03 0.29 0.06 1.0 0.6 0.1 0.09 0.34 0.38 0.1
0.02 0.15 0.04 0.11 0.51 0.0 0.71 0.42 0.64 0.63 0.24 0.87 1.0 0.39 0.04
0.29 0.02 0.02 0.02 1.0 0.04 0.64 0.32 0.99 0.74 0.12 0.12 0.31 0.1 0.04
0.17 0.08 0.1 0.08 0.32 0.22 0.48 0.09 0.91 1.0 0.08 0.09 0.33 0.07 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.4 0.0 0.4 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.01 0.03 0.14 0.0 0.31 0.09 1.0 0.23 0.1 0.01 0.45 0.28 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.95 0.0 1.0 0.58 0.06 0.43 0.0 0.0 0.0
0.0 0.13 0.69 0.21 0.24 0.04 0.98 0.11 0.97 0.88 0.19 0.1 0.68 1.0 0.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.24 0.23 0.19 0.01 0.32 0.06 1.0 0.57 0.1 0.06 0.44 0.21 0.1
0.0 0.36 0.43 0.38 0.25 0.06 0.46 0.15 1.0 0.89 0.24 0.2 0.59 0.11 0.17
0.0 0.06 0.17 0.31 0.14 0.03 0.31 0.07 1.0 0.6 0.31 0.23 0.15 0.15 0.11
0.0 0.09 0.22 0.47 0.06 0.03 0.19 0.03 1.0 0.5 0.16 0.05 0.4 0.13 0.07
0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.18 0.0 1.0 0.13 0.09 0.03 0.05 0.35 0.22
0.26 0.14 0.13 0.13 0.27 0.23 0.94 0.21 1.0 0.33 0.49 0.14 0.68 0.51 0.04
0.0 0.29 0.17 0.23 0.05 0.03 0.42 0.0 1.0 0.16 0.03 0.01 0.05 0.04 0.06
0.0 0.16 0.43 0.13 0.19 0.02 0.28 0.13 1.0 0.55 0.17 0.13 0.7 0.29 0.12
0.0 0.01 0.04 0.19 0.19 0.0 0.39 0.01 1.0 0.63 0.08 0.02 0.48 0.58 0.04
0.01 0.26 0.57 0.13 0.24 0.09 0.39 0.23 1.0 0.7 0.1 0.21 0.22 0.59 0.31
0.0 0.3 0.59 0.35 0.2 0.22 0.85 0.32 1.0 0.8 0.33 0.49 0.39 0.78 0.46
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.06 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.04 0.18 0.0 0.18 0.09 1.0 0.45 0.08 0.01 0.35 0.08 0.04
0.0 0.0 0.09 0.13 0.25 0.1 0.61 0.3 1.0 0.74 0.28 0.26 0.32 0.64 0.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.05 0.14 0.17 0.03 0.32 0.21 1.0 0.49 0.08 0.09 0.42 0.43 0.22
0.0 0.01 0.07 0.13 0.09 0.03 0.3 0.12 1.0 0.38 0.05 0.06 0.42 0.58 0.06
0.0 0.01 0.01 0.04 0.22 0.0 0.31 0.03 1.0 0.48 0.16 0.02 0.2 0.07 0.18
0.0 0.01 0.01 0.02 0.12 0.0 0.31 0.02 1.0 0.26 0.07 0.01 0.21 0.08 0.09
0.0 0.0 0.01 0.03 0.09 0.0 0.25 0.05 1.0 0.29 0.1 0.03 0.22 0.09 0.1
0.0 0.13 0.01 0.03 0.09 0.0 0.3 0.0 1.0 0.24 0.05 0.01 0.1 0.03 0.07
0.0 0.06 0.02 0.02 0.07 0.0 0.18 0.0 1.0 0.22 0.04 0.01 0.05 0.02 0.07
0.0 0.09 0.03 0.02 0.07 0.0 0.19 0.0 1.0 0.23 0.04 0.01 0.06 0.03 0.08
0.0 0.04 0.02 0.02 0.08 0.0 0.32 0.03 1.0 0.2 0.06 0.01 0.13 0.05 0.05
0.0 0.02 0.0 0.01 0.18 0.0 0.32 0.07 1.0 0.24 0.11 0.01 0.04 0.03 0.04
0.0 0.4 0.15 0.17 0.24 0.0 0.46 0.12 0.65 0.4 0.13 0.12 0.64 1.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.0 0.46 0.0 1.0 0.5 0.04 0.01 0.19 0.23 0.04
0.0 0.45 0.01 0.01 0.02 0.09 0.14 0.1 1.0 0.18 0.05 0.07 0.22 0.01 0.19
0.0 0.17 0.36 0.07 0.19 0.4 0.39 0.14 0.84 0.6 0.47 0.3 0.81 1.0 0.87
0.0 0.18 0.29 0.05 0.12 0.21 0.38 0.2 0.43 0.21 0.27 0.16 0.77 1.0 0.44
0.0 0.13 0.33 0.12 0.35 0.12 0.58 0.22 1.0 0.54 0.34 0.29 0.7 0.5 0.42
0.0 0.09 0.19 0.1 0.3 0.12 0.53 0.26 0.81 0.55 0.3 0.27 0.69 1.0 0.35
0.0 0.09 0.23 0.12 0.22 0.21 0.45 0.2 0.5 0.67 0.36 0.46 0.64 0.41 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.09 0.06 0.32 0.11 0.68 0.86 0.67 0.55 0.25 0.5 1.0 0.2 0.75
0.0 0.06 0.11 0.23 0.36 0.13 0.73 1.0 0.58 0.44 0.26 0.29 0.68 0.31 0.44
0.01 0.26 0.19 0.07 0.22 0.02 0.39 0.19 1.0 0.76 0.13 0.41 0.61 0.29 0.18
0.0 0.03 0.18 0.07 0.31 0.42 0.68 0.4 1.0 0.43 0.44 0.15 0.51 0.19 0.22
0.0 0.04 0.09 0.11 0.27 0.03 0.48 0.09 1.0 0.5 0.16 0.12 0.56 0.35 0.18
0.0 0.07 0.07 0.07 0.12 1.0 0.3 0.0 0.95 0.53 0.34 0.29 0.88 0.23 0.02
0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.18 0.05 1.0 0.16 0.04 0.01 0.05 0.06 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.46 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.03 0.01 0.41 0.18 0.1 0.49 0.08 1.0 0.3 0.08 0.01 0.11 0.06 0.07
0.01 0.21 0.19 0.24 0.26 0.67 0.47 0.35 1.0 0.72 0.34 0.44 0.64 0.23 0.5
0.13 0.04 0.06 0.08 0.18 0.0 0.1 0.15 1.0 0.66 0.13 0.05 0.57 0.69 0.02
0.0 0.0 0.02 0.21 0.33 0.0 0.22 0.05 1.0 0.57 0.1 0.04 0.3 0.4 0.04
0.02 0.01 0.03 0.18 0.11 0.0 0.1 0.09 1.0 0.43 0.12 0.01 0.28 0.8 0.02
0.0 0.05 0.31 0.11 0.21 0.0 0.8 0.12 0.74 0.64 0.35 0.22 1.0 0.6 0.51
0.0 0.11 0.06 0.02 0.22 0.0 0.19 0.27 1.0 0.3 0.06 0.03 0.34 0.18 0.25
0.0 0.01 0.01 0.09 0.61 0.09 1.0 0.57 0.91 0.37 0.04 0.03 0.02 0.17 0.06
0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.44 0.0 1.0 0.12 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.48 0.05 0.12 0.12 0.17 0.06 0.6 0.19 0.07 0.06 0.19 0.05 0.22
0.0 0.0 0.01 0.05 0.38 0.0 1.0 0.83 0.98 0.43 0.18 0.37 0.96 0.62 0.28
0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.09 0.0 0.8 0.18 0.02 0.0 0.22 1.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.17 1.0 0.06 0.04 0.0 0.12 0.23 0.0
0.0 0.23 0.07 0.13 0.04 0.01 0.16 0.06 1.0 0.22 0.15 0.03 0.42 0.94 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.38 0.0 1.0 0.15 0.05 0.0 0.09 0.09 0.02
0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.0 0.3 0.01 1.0 0.21 0.04 0.0 0.23 0.06 0.04
0.0 0.01 0.0 0.06 0.09 0.0 0.38 0.03 1.0 0.33 0.08 0.01 0.14 0.05 0.05
0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.0 0.25 0.0 1.0 0.28 0.04 0.01 0.2 0.03 0.06
0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.23 0.0 1.0 0.36 0.04 0.01 0.18 0.04 0.11
0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.0 0.25 0.0 1.0 0.31 0.05 0.01 0.15 0.07 0.1
0.0 0.0 0.0 0.03 0.15 0.0 0.25 0.0 1.0 0.24 0.09 0.02 0.22 0.12 0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)