Heatmap: Cluster_95 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.31 1.0 0.35 0.47 0.3 0.35 0.15 0.4 0.38 0.17 0.18 0.3 0.18 0.28
0.0 0.29 0.23 0.96 0.4 0.03 0.2 0.14 0.05 0.2 0.19 1.0 0.07 0.01 0.39
0.0 0.35 0.23 0.54 0.47 0.02 0.12 0.19 0.04 0.23 0.18 1.0 0.08 0.01 0.46
0.0 0.01 0.0 0.04 1.0 0.0 0.05 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.29 1.0 0.0 0.03 0.32 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.38 0.16 0.44 1.0 0.11 0.05 0.5 0.0 0.04 0.01 0.03 0.01 0.04 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.57 0.0 0.04 0.02 0.05 0.42 0.1 0.16 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.27 0.63 0.26 1.0 0.07 0.07 0.81 0.03 0.03 0.3 0.12 0.15 0.34 0.06
0.0 0.07 0.18 0.04 1.0 0.22 0.07 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.29 0.09 1.0 0.06 0.12 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.22 0.5 1.0 0.0 0.78 0.03 0.01 0.07 0.08 0.0 0.02 0.18 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 1.0 0.46 0.08 0.14 0.13 0.0 0.0 0.17
0.0 0.63 0.61 0.47 0.56 0.79 1.0 0.18 0.03 0.23 0.09 0.22 0.13 0.66 0.14
0.0 0.39 1.0 0.32 0.3 0.63 0.42 0.32 0.01 0.36 0.1 0.59 0.04 0.2 0.21
0.0 0.17 0.03 0.25 0.4 0.0 0.27 0.03 1.0 0.19 0.59 0.47 0.31 0.0 0.15
0.08 1.0 0.55 0.56 0.61 0.67 0.92 0.64 0.5 0.48 0.59 0.84 0.58 0.41 0.68
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.32 0.0 0.0 1.0 0.0 0.97 0.22 0.05 0.04 0.08 0.2 0.0 0.0 0.1
0.0 0.03 0.01 0.02 0.29 0.0 1.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.07 0.0 0.02 0.29 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.31 0.0 0.0 0.01 0.04 0.36 0.5 0.28 1.0 0.15 0.12
0.0 0.95 0.0 0.0 1.0 0.0 0.31 0.79 0.16 0.04 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.02 0.09 1.0 0.02 0.07 0.03 0.01 0.2 0.1 0.09 0.38 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.76 0.46 0.0 1.0 0.0 0.6 0.65 0.13 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.17 0.0 0.0 0.43 0.63
0.0 0.22 0.33 0.14 1.0 0.19 0.62 0.73 0.45 0.42 0.41 0.53 0.33 0.17 0.58
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.34 0.0 0.0
0.0 0.36 0.19 1.0 0.29 0.05 0.25 0.56 0.18 0.15 0.2 0.49 0.16 0.04 0.39
1.0 0.0 0.0 0.25 0.69 0.0 0.57 0.28 0.52 0.21 0.21 0.28 0.08 0.04 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.44 0.0 1.0 0.78 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.03 0.02 0.09 0.0 0.1 0.03 0.27 0.06 0.15 0.05 0.02 0.0 1.0
0.0 0.02 0.03 0.0 0.19 0.0 0.03 0.05 0.09 0.09 0.1 0.15 0.02 0.01 1.0
0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.01 0.53 0.0 0.13 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.12 0.07 0.72 1.0 0.69 0.41 0.25 0.45 0.37 0.35 0.34 0.03 0.31
0.0 0.28 0.21 0.12 0.98 1.0 0.59 0.42 0.39 0.47 0.35 0.46 0.53 0.04 0.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.44 0.4 0.16 0.14 0.9 0.5 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0
0.71 0.76 0.57 1.0 0.66 0.0 0.02 0.1 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.1 0.02 0.09 1.0 0.0 0.06 0.28 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.24 0.05 0.09 1.0 0.05 0.07 0.31 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.11 0.02 0.06 1.0 0.04 0.07 0.27 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 1.0 0.0 0.02 0.21 0.33 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.16 0.63 0.32 0.35 0.85 0.26 0.38 0.52 0.21 0.36 0.14 0.25 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.02 0.12 0.13 1.0 0.12 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04
0.0 0.06 0.64 0.29 1.0 0.0 0.19 0.26 0.02 0.11 0.1 0.0 0.02 0.0 0.08
0.0 0.27 0.26 0.36 1.0 0.0 0.11 0.27 0.0 0.11 0.07 0.0 0.02 0.0 0.05
0.0 0.01 0.34 0.37 0.84 0.49 0.31 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.36 0.27 0.61 1.0 0.45 0.48 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.09 0.21
0.0 1.0 0.04 0.12 0.05 0.03 0.03 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.2 1.0 0.8 0.68 0.24 0.33 0.12 0.13 0.08 0.18 0.03 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.24 1.0 0.33 0.22 0.35 0.32 0.44 0.02 0.21 0.09 0.25 0.05 0.07 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 1.0 0.14 0.78 0.24 0.0 0.02 0.01 0.04 0.0 0.13 0.02 0.02
0.0 0.8 0.95 0.69 0.43 1.0 0.25 0.31 0.1 0.38 0.11 0.12 0.08 0.08 0.36
0.0 0.34 1.0 0.44 0.2 0.6 0.23 0.11 0.05 0.11 0.06 0.03 0.03 0.05 0.09
0.02 0.03 0.0 0.14 1.0 0.31 0.14 0.19 0.03 0.22 0.14 0.13 0.05 0.0 0.02
0.04 0.02 0.0 0.08 1.0 0.26 0.17 0.27 0.03 0.11 0.15 0.12 0.03 0.0 0.01
0.1 0.01 1.0 0.13 0.55 0.15 0.27 0.11 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.08 0.01 0.91 0.14 1.0 0.2 0.28 0.16 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.53 0.19 0.22 0.34 0.77 0.98 0.98 0.65 0.48 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.17 0.26 0.21 0.19 0.98 0.14 0.43 0.03 0.02 0.06 0.16 0.08 0.0 0.06
0.0 0.16 0.59 0.99 0.88 1.0 0.33 0.45 0.02 0.08 0.06 0.02 0.03 0.01 0.01
0.39 0.24 0.14 0.16 0.35 1.0 0.13 0.28 0.04 0.06 0.08 0.09 0.22 0.0 0.22
0.0 0.07 0.26 0.31 0.46 1.0 0.23 0.39 0.01 0.04 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01
0.19 0.14 0.11 0.19 0.42 1.0 0.14 0.45 0.05 0.21 0.08 0.26 0.12 0.0 0.18
0.34 0.1 0.13 0.21 0.1 0.07 0.34 0.04 0.04 0.08 0.32 0.09 0.15 1.0 0.0
0.01 0.11 0.46 0.65 0.32 1.0 0.22 0.23 0.06 0.06 0.11 0.0 0.12 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.63 0.0 0.25 0.07 0.56 0.09 1.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.21 0.12 0.2 0.0 0.15 0.18 0.38 0.11 0.08 0.12 0.06 0.05 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.31 1.0 0.24 0.22 0.0 0.27 0.02 0.07 0.19 0.15 0.27 0.14 0.08 0.24
0.0 0.44 0.01 0.01 0.07 0.0 0.08 0.04 0.23 0.18 0.12 1.0 0.13 0.0 0.11
0.0 0.42 0.0 0.01 0.03 0.0 0.05 0.0 0.19 0.18 0.11 1.0 0.13 0.0 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.16 0.18 0.11 1.0 0.0 0.69 0.23 0.31 0.22 0.67 0.41 0.5 0.04 0.02
0.0 0.51 1.0 0.06 0.36 0.0 0.05 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.01 0.82 1.0 0.1 0.52 0.0 0.05 0.13 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)