Heatmap: Cluster_96 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
1.0 0.44 0.49 0.29 0.25 0.29 0.29 0.33 0.34 0.41 0.3 0.15 0.35 0.28 0.15
0.06 0.59 0.63 1.0 0.38 0.61 0.48 0.43 0.44 0.65 0.64 0.64 0.44 0.34 0.6
0.0 0.0 0.66 0.38 0.32 0.73 0.98 0.01 0.54 1.0 0.42 0.25 0.27 0.09 0.44
0.46 0.41 1.0 0.39 0.48 0.83 0.39 0.39 0.46 0.44 0.54 0.45 0.47 0.37 0.31
0.0 0.32 0.4 0.37 0.3 0.3 0.29 0.4 0.47 0.41 0.5 0.38 0.73 0.18 1.0
0.01 0.58 0.52 0.54 0.38 1.0 0.53 0.58 0.55 0.56 0.67 0.86 0.54 0.42 0.68
0.0 0.57 1.0 0.63 0.34 0.71 0.44 0.36 0.44 0.53 0.61 0.46 0.51 0.27 0.45
0.0 0.95 1.0 0.68 0.57 0.89 0.65 0.66 0.63 0.68 0.74 0.72 0.84 0.55 0.83
0.08 0.8 1.0 0.55 0.57 0.74 0.69 0.5 0.7 0.68 0.65 0.54 0.69 0.37 0.59
0.0 0.86 0.7 0.6 0.56 0.87 1.0 0.64 0.7 0.61 0.61 0.73 0.63 0.5 0.67
0.0 1.0 0.93 0.62 0.37 0.92 0.72 0.34 0.56 0.55 0.66 0.36 0.51 0.55 0.41
0.0 0.81 0.92 0.83 0.42 1.0 0.77 0.34 0.75 0.72 0.76 0.35 0.34 0.34 0.48
0.03 1.0 0.44 0.29 0.22 0.72 0.36 0.31 0.38 0.32 0.51 0.67 0.72 0.45 0.52
0.12 1.0 1.0 0.46 0.34 0.45 0.43 0.47 0.48 0.43 0.39 0.32 0.33 0.29 0.52
0.01 0.45 0.6 1.0 0.24 0.43 0.41 0.02 0.35 0.36 0.6 0.85 0.55 0.32 0.96
0.0 0.45 0.44 0.81 0.28 0.73 0.54 0.04 0.23 0.35 0.43 0.67 0.44 0.19 1.0
0.12 1.0 0.94 0.68 0.3 0.63 0.38 0.57 0.31 0.28 0.46 0.93 0.67 0.49 0.71
0.07 1.0 0.82 0.37 0.18 0.43 0.28 0.2 0.36 0.36 0.26 0.17 0.25 0.16 0.1
0.32 0.89 1.0 0.76 0.71 0.82 0.85 0.45 0.91 1.0 0.92 0.81 0.57 0.45 0.77
0.37 0.63 1.0 0.25 0.22 0.08 0.36 0.31 0.32 0.25 0.13 0.12 0.33 0.17 0.01
0.0 0.63 1.0 0.74 0.48 0.67 0.58 0.52 0.58 0.65 0.63 0.52 0.48 0.26 0.7
0.0 0.68 1.0 0.49 0.36 0.34 0.55 0.56 0.47 0.45 0.32 0.41 0.46 0.24 0.45
0.02 0.66 1.0 0.59 0.37 0.43 0.63 0.77 0.52 0.47 0.36 0.37 0.44 0.35 0.51
0.02 0.96 0.74 0.68 0.47 1.0 0.61 0.41 0.56 0.62 0.58 0.36 0.43 0.52 0.54
0.07 0.48 1.0 0.6 0.18 0.27 0.24 0.16 0.34 0.31 0.24 0.31 0.23 0.18 0.34
0.0 0.62 0.76 0.76 0.45 0.09 1.0 0.92 0.4 0.54 0.16 0.27 0.09 0.06 0.24
0.11 0.91 1.0 0.74 0.63 0.87 1.0 1.0 0.79 0.91 0.62 0.63 0.63 0.29 0.67
0.0 0.55 0.45 0.31 0.36 1.0 0.45 0.23 0.5 0.51 0.44 0.48 0.31 0.26 0.39
0.34 1.0 0.75 0.49 0.36 0.29 0.26 0.39 0.34 0.29 0.39 0.28 0.22 0.12 0.22
0.03 0.74 0.81 0.6 0.35 1.0 0.55 0.59 0.38 0.53 0.51 0.39 0.5 0.37 0.68
0.04 0.58 0.63 0.61 0.36 1.0 0.51 0.3 0.39 0.48 0.54 0.25 0.18 0.1 0.39
0.0 0.42 0.91 0.7 0.37 1.0 0.61 0.36 0.43 0.48 0.45 0.35 0.5 0.32 0.48
0.0 0.68 0.82 0.84 0.19 1.0 0.55 0.03 0.4 0.54 0.48 0.11 0.25 0.17 0.7
0.1 1.0 0.61 0.48 0.13 0.23 0.18 0.09 0.16 0.17 0.17 0.09 0.08 0.06 0.08
0.02 0.99 1.0 0.54 0.23 0.81 0.54 0.17 0.41 0.47 0.29 0.17 0.36 0.2 0.37
0.0 0.47 0.43 0.33 0.19 1.0 0.23 0.09 0.16 0.2 0.24 0.08 0.24 0.07 0.17
0.09 1.0 0.81 0.64 0.22 0.87 0.33 0.05 0.31 0.53 0.35 0.19 0.27 0.18 0.51
0.01 1.0 0.59 0.55 0.24 0.52 0.24 0.06 0.23 0.34 0.3 0.14 0.28 0.27 0.26
0.11 1.0 0.59 0.38 0.12 0.53 0.16 0.03 0.15 0.22 0.18 0.11 0.11 0.08 0.21
0.11 0.84 0.89 0.4 0.24 1.0 0.39 0.03 0.3 0.47 0.57 0.14 0.47 0.42 0.54
0.0 1.0 0.99 0.71 0.58 0.98 0.76 0.06 0.69 0.8 0.7 0.34 0.68 0.53 0.59
0.05 1.0 0.73 0.33 0.31 0.8 0.37 0.11 0.21 0.31 0.36 0.17 0.37 0.14 0.52
0.0 0.31 0.46 0.16 0.62 0.46 0.62 0.07 1.0 0.89 0.75 0.24 0.52 0.37 0.48
0.0 0.54 0.92 1.0 0.37 0.6 0.5 0.27 0.46 0.84 0.59 0.15 0.58 0.11 0.37
0.0 0.82 1.0 0.67 0.32 0.61 0.42 0.3 0.47 0.5 0.36 0.5 0.22 0.14 0.46
0.05 0.33 1.0 0.52 0.23 0.22 0.26 0.28 0.23 0.23 0.21 0.26 0.2 0.15 0.25
0.0 1.0 0.69 0.55 0.2 0.24 0.31 0.14 0.31 0.29 0.16 0.17 0.21 0.16 0.16
0.22 0.47 0.69 0.67 0.19 1.0 0.58 0.02 0.24 0.34 0.4 0.29 0.34 0.37 0.72
0.02 0.41 0.38 0.45 0.34 0.6 0.61 0.24 0.42 0.6 0.62 0.6 0.46 0.6 1.0
0.0 0.79 0.78 0.5 0.49 0.94 0.83 0.32 0.42 0.5 0.65 0.5 0.76 0.64 1.0
0.19 0.28 0.26 0.27 0.35 0.39 0.67 0.14 0.45 0.33 0.52 0.44 0.59 0.83 1.0
0.05 0.41 0.25 0.25 0.48 0.53 0.72 0.59 0.55 0.4 0.76 0.55 1.0 0.72 1.0
0.0 0.73 0.88 0.58 0.52 1.0 0.69 0.5 0.61 0.57 0.78 0.62 0.64 0.39 0.67
0.1 1.0 0.78 0.39 0.35 0.54 0.37 0.45 0.33 0.56 0.45 0.6 0.58 0.47 0.26
0.08 0.42 0.59 1.0 0.36 0.15 0.48 0.26 0.46 0.6 0.63 0.56 0.68 0.64 0.64
0.0 0.84 1.0 0.16 0.15 0.15 0.22 0.16 0.21 0.22 0.19 0.09 0.31 0.09 0.08
0.0 0.1 1.0 0.16 0.01 0.68 0.03 0.0 0.4 0.42 0.41 0.09 0.35 0.15 0.0
0.0 0.52 0.6 0.72 0.32 0.42 0.41 1.0 0.45 0.5 0.38 0.35 0.5 0.23 0.43
0.0 0.42 0.67 0.76 0.55 0.52 0.62 1.0 0.71 0.71 0.49 0.72 0.67 0.45 0.48
0.01 1.0 0.55 0.42 0.5 0.56 0.58 0.52 0.66 0.5 0.56 0.44 0.23 0.16 0.23
0.0 1.0 0.78 0.76 0.41 0.92 0.52 0.73 0.57 0.75 0.47 0.48 0.38 0.29 0.43
0.0 0.55 1.0 0.34 0.23 0.44 0.42 0.21 0.45 0.34 0.35 0.29 0.3 0.09 0.32
0.01 0.86 1.0 0.58 0.4 0.44 0.53 0.41 0.76 0.53 0.38 0.23 0.24 0.08 0.29
0.07 1.0 0.91 0.48 0.21 0.2 0.46 0.1 0.45 0.57 0.37 0.3 0.22 0.17 0.33
0.06 1.0 0.64 0.46 0.16 0.33 0.26 0.11 0.37 0.34 0.36 0.29 0.18 0.21 0.13
0.0 0.36 0.45 0.59 0.17 1.0 0.38 0.03 0.29 0.26 0.31 0.34 0.15 0.12 0.39
0.02 0.8 1.0 0.89 0.51 0.81 0.72 0.84 0.65 0.77 0.36 0.34 0.54 0.37 0.58
0.14 1.0 0.66 0.47 0.29 0.46 0.29 0.27 0.28 0.29 0.22 0.24 0.21 0.25 0.29

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)