Heatmap: Cluster_97 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.92 0.81 0.53 0.85 0.42 0.6 0.83 0.4 0.41 0.82 0.24 0.87 1.0 0.12
0.0 0.64 1.0 0.83 0.74 0.38 0.54 0.79 0.3 0.5 0.87 0.34 0.73 0.44 0.12
0.54 0.61 0.88 0.7 0.66 0.17 0.55 1.0 0.35 0.4 0.74 0.51 0.8 0.43 0.26
0.0 0.07 0.02 0.0 1.0 0.05 0.54 0.46 0.0 0.02 0.08 0.0 0.02 0.11 0.0
0.09 0.99 0.83 0.99 0.69 0.58 0.91 0.59 0.51 0.62 0.77 0.93 0.72 0.75 1.0
0.0 0.36 0.54 0.77 0.92 1.0 0.88 0.92 0.53 0.58 0.56 0.32 0.76 0.3 0.55
0.0 0.39 0.17 0.07 0.35 1.0 0.25 0.74 0.15 0.08 0.37 0.23 0.26 0.17 0.28
0.05 0.79 0.91 0.69 0.92 0.88 0.81 1.0 0.81 0.8 0.84 0.64 0.8 0.78 0.64
0.0 0.63 0.73 0.66 0.6 1.0 0.7 0.82 0.58 0.51 0.6 0.44 0.54 0.45 0.43
0.0 1.0 0.43 0.34 0.26 0.23 0.3 0.37 0.26 0.24 0.3 0.36 0.36 0.26 0.26
0.37 0.76 1.0 0.91 0.48 0.23 0.7 0.77 0.74 0.49 0.56 0.12 0.48 0.51 0.06
0.0 0.6 0.72 0.37 0.66 1.0 0.65 1.0 0.69 0.57 0.55 0.65 0.81 0.52 0.62
0.0 0.28 0.26 0.28 0.61 0.12 0.46 1.0 0.62 0.68 0.72 0.26 0.5 0.46 0.12
0.0 0.08 0.14 0.27 0.87 0.88 0.84 0.7 0.61 0.55 0.68 0.55 1.0 0.37 0.53
0.0 0.22 0.29 0.54 0.85 0.83 0.48 1.0 0.52 0.4 0.3 0.33 0.42 0.05 0.4
0.0 0.54 0.51 0.47 1.0 0.83 0.71 0.99 0.55 0.41 0.9 0.61 0.75 0.36 0.42
0.0 0.3 0.51 0.59 0.63 1.0 0.98 0.57 0.37 0.4 0.37 0.41 0.97 0.19 0.59
0.0 0.18 0.2 0.0 1.0 0.17 0.09 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.58 0.89 0.76 0.58 0.84 0.88 0.7 0.69 0.58 0.57 0.67 0.57 0.66 1.0
0.15 1.0 0.72 0.75 0.49 0.55 0.67 0.63 0.64 0.51 0.58 0.82 0.55 0.49 0.69
0.2 0.96 1.0 0.81 0.95 0.75 0.91 0.92 0.86 0.8 0.89 0.87 0.9 0.71 0.96
0.01 0.88 1.0 0.61 0.74 0.76 0.93 0.8 0.79 0.66 0.74 0.41 0.9 0.56 0.32
0.0 1.0 0.36 0.19 0.28 0.4 0.49 0.3 0.08 0.05 0.15 0.06 0.14 0.01 0.3
0.0 0.84 0.59 0.52 0.76 0.61 0.77 1.0 0.65 0.61 0.64 0.58 0.73 0.59 0.67
0.06 0.14 0.23 0.36 0.31 0.53 0.36 0.3 0.29 0.27 0.71 0.4 0.68 1.0 0.31
0.0 0.13 0.3 0.33 0.58 1.0 0.59 0.14 0.09 0.16 0.35 0.07 0.66 0.21 0.01
0.0 0.42 0.57 0.39 0.36 0.34 0.41 0.41 0.36 0.36 0.42 1.0 0.36 0.37 0.64
0.0 0.96 1.0 0.9 0.72 0.75 0.71 0.57 0.61 0.63 0.59 0.56 0.45 0.25 0.53
0.02 0.31 0.06 0.06 0.6 0.05 0.22 1.0 0.38 0.4 0.24 0.23 0.36 0.11 0.53
0.0 0.29 0.0 0.0 0.36 0.08 0.13 1.0 0.32 0.03 0.06 0.01 0.11 0.05 0.0
0.0 0.47 0.0 0.0 0.78 0.2 0.12 1.0 0.25 0.03 0.11 0.03 0.17 0.03 0.02
0.0 1.0 0.34 0.02 0.13 0.03 0.06 0.32 0.16 0.07 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 1.0 0.18 0.01 0.14 0.07 0.06 0.07 0.08 0.06 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 1.0 0.05 0.01 0.41 0.24 0.08 0.15 0.11 0.08 0.04 0.0 0.16 0.01 0.0
0.3 0.73 0.71 0.55 0.51 0.78 0.65 0.52 0.5 0.67 0.69 1.0 0.68 0.62 0.69
0.14 0.77 1.0 0.67 0.62 0.66 0.68 0.52 0.2 0.22 0.29 0.1 0.59 0.31 0.09
0.0 0.76 1.0 0.47 0.68 0.85 0.53 0.74 0.33 0.45 0.41 0.09 0.61 0.65 0.1
0.04 1.0 0.17 0.06 0.18 0.02 0.06 0.11 0.08 0.09 0.05 0.21 0.03 0.04 0.13
0.0 0.65 0.31 0.15 1.0 0.07 0.31 0.98 0.4 0.32 0.14 0.57 0.13 0.1 0.44
0.0 0.59 0.82 0.38 1.0 0.38 0.59 0.82 0.48 0.53 0.6 0.22 0.76 0.48 0.16
0.69 0.58 0.54 0.56 0.83 0.59 0.59 1.0 0.44 0.48 0.72 0.73 0.65 0.54 0.74
0.0 0.25 0.14 0.06 0.45 1.0 0.32 0.38 0.09 0.08 0.33 0.06 0.47 0.19 0.35
0.0 0.2 1.0 0.94 0.04 0.01 0.12 0.01 0.05 0.34 0.04 0.03 0.01 0.14 0.01
0.0 0.58 0.9 0.32 0.5 0.0 0.62 0.63 0.59 0.44 0.94 0.46 1.0 0.61 0.41
0.02 0.57 0.7 0.73 0.97 0.77 0.85 1.0 0.69 0.67 0.85 0.65 0.74 0.76 0.72
0.0 0.8 1.0 0.29 0.53 0.08 0.35 0.18 0.11 0.24 0.12 0.12 0.03 0.05 0.19
0.0 0.1 0.5 0.31 1.0 0.29 0.51 0.91 0.39 0.4 0.26 0.28 0.47 0.05 0.06
0.0 0.0 0.03 0.0 0.77 0.0 0.1 1.0 0.01 0.0 0.22 0.04 0.16 0.11 0.0
0.0 0.06 0.24 0.13 0.33 1.0 0.37 0.23 0.02 0.03 0.08 0.04 0.29 0.02 0.04
0.0 0.06 0.05 0.04 1.0 0.13 0.2 0.89 0.15 0.13 0.16 0.05 0.06 0.07 0.09
0.01 0.72 1.0 0.39 0.6 0.58 0.63 0.54 0.32 0.3 0.37 0.2 0.31 0.27 0.23
0.08 0.81 0.82 0.42 0.53 1.0 0.62 0.44 0.3 0.5 0.58 0.37 0.63 0.6 0.54
0.01 0.71 1.0 0.38 0.62 0.7 0.62 0.83 0.44 0.33 0.3 0.06 0.34 0.15 0.14
0.0 0.68 0.87 0.72 1.0 0.72 0.89 0.86 0.65 0.6 0.56 0.38 0.84 0.48 0.45
0.0 0.44 0.59 0.86 0.74 0.89 0.88 0.81 0.71 0.77 0.84 0.89 0.78 1.0 0.94
0.0 0.12 0.15 0.17 0.65 0.1 0.7 1.0 0.36 0.7 0.26 0.36 0.22 0.2 0.79
0.0 0.1 0.14 0.1 0.57 0.04 0.86 0.84 0.42 0.77 0.34 0.65 0.47 0.36 1.0
0.0 0.23 0.52 0.19 0.44 0.38 0.68 0.36 0.36 0.77 0.33 1.0 0.66 0.34 0.96
0.25 0.45 0.98 0.38 0.58 1.0 0.72 0.61 0.5 0.5 0.34 0.17 0.45 0.21 0.33
0.03 0.52 0.43 0.31 0.73 1.0 0.69 0.54 0.57 0.52 0.36 0.61 0.52 0.09 0.3
0.0 0.1 0.1 0.28 0.57 0.55 0.35 1.0 0.26 0.34 0.53 0.48 0.48 0.55 0.29
0.0 1.0 0.48 0.17 0.2 0.12 0.1 0.12 0.14 0.08 0.06 0.03 0.12 0.05 0.16
0.01 1.0 0.87 0.58 0.79 0.16 0.69 1.0 0.36 0.42 0.65 0.63 0.68 0.47 0.37
0.0 0.25 0.5 0.55 0.74 0.77 0.82 0.34 0.57 0.64 0.63 0.25 0.8 1.0 0.63
0.06 0.49 0.65 0.48 0.82 1.0 0.78 0.62 0.41 0.42 0.6 0.32 0.67 0.53 0.36
0.06 1.0 0.87 0.57 0.67 0.81 0.91 0.54 0.51 0.55 0.51 0.4 0.55 0.43 0.52
0.0 1.0 0.5 0.48 0.36 0.47 0.55 0.41 0.41 0.4 0.52 0.57 0.5 0.52 0.48
0.0 0.0 0.01 0.08 0.71 0.0 0.17 0.46 0.04 1.0 0.04 0.08 0.0 0.08 0.0
0.0 0.09 0.37 0.17 0.4 1.0 0.39 0.43 0.05 0.1 0.29 0.06 0.44 0.19 0.1
0.24 0.83 0.66 0.43 0.73 0.79 0.71 1.0 0.76 0.61 0.62 0.67 0.62 0.46 0.62
0.0 0.18 0.58 0.3 0.33 1.0 0.8 0.46 0.11 0.41 0.42 0.01 0.2 0.08 0.01
0.0 0.34 0.95 0.17 0.6 1.0 0.46 0.52 0.46 0.42 0.28 0.12 0.63 0.25 0.19
0.0 0.74 1.0 0.81 0.62 0.96 0.66 0.61 0.43 0.56 0.51 0.33 0.76 0.54 0.51
0.27 1.0 0.54 0.29 0.35 0.57 0.46 0.37 0.38 0.35 0.5 0.36 0.42 0.42 0.31
0.04 0.26 0.68 0.36 0.51 0.12 0.33 0.25 0.33 1.0 0.32 0.08 0.26 0.24 0.05
0.0 0.05 0.07 0.11 0.2 1.0 0.27 0.26 0.11 0.09 0.17 0.05 0.18 0.1 0.07
0.12 0.71 1.0 0.62 0.59 0.49 0.63 0.48 0.49 0.44 0.38 0.35 0.61 0.35 0.4
0.0 0.61 0.47 0.31 0.29 1.0 0.41 0.32 0.25 0.21 0.24 0.36 0.32 0.19 0.24
0.08 0.65 0.48 0.78 0.53 0.07 0.65 0.66 0.92 0.61 0.9 0.53 1.0 0.66 0.46
0.03 0.05 0.66 1.0 0.69 0.0 0.16 0.96 0.82 0.14 0.39 0.45 0.07 0.22 0.4
0.04 0.5 0.66 0.55 1.0 0.87 0.68 0.82 0.63 0.61 0.73 0.5 0.55 0.52 0.54
0.0 0.04 0.01 0.54 0.29 1.0 0.1 0.3 0.01 0.03 0.05 0.2 0.03 0.0 0.02
0.02 0.48 0.79 0.55 0.59 1.0 0.56 0.5 0.42 0.51 0.38 0.24 0.4 0.2 0.24
0.06 1.0 0.91 0.9 0.88 0.69 0.86 0.67 0.79 0.84 0.86 0.76 0.78 0.76 0.67
0.0 0.47 0.8 0.31 0.42 1.0 0.42 0.42 0.39 0.45 0.29 0.3 0.31 0.17 0.31
0.08 0.69 1.0 0.87 0.51 0.83 0.65 0.6 0.49 0.52 0.54 0.72 0.54 0.53 0.7
0.04 0.57 0.78 1.0 0.06 0.03 0.14 0.02 0.08 0.39 0.05 0.0 0.01 0.05 0.0
0.0 0.01 0.03 0.09 0.26 1.0 0.34 0.17 0.02 0.07 0.03 0.01 0.04 0.03 0.03
0.0 0.01 0.0 0.34 1.0 0.0 0.13 0.43 0.0 0.07 0.08 0.03 0.0 0.04 0.01
0.0 0.15 0.14 0.17 0.75 0.62 0.75 1.0 0.64 0.38 0.8 0.68 0.7 0.6 0.38
0.22 0.21 0.16 0.26 0.53 0.62 1.0 0.86 0.77 0.56 0.63 0.51 0.6 0.6 0.48
0.0 0.07 0.36 0.66 1.0 0.2 0.4 0.69 0.01 0.17 0.15 0.22 0.11 0.11 0.17
0.11 1.0 0.96 0.41 0.44 0.61 0.43 0.34 0.23 0.23 0.21 0.25 0.24 0.13 0.26
0.12 1.0 0.83 0.44 0.36 0.38 0.41 0.28 0.19 0.23 0.16 0.31 0.32 0.11 0.61
0.25 0.68 0.74 0.68 0.46 0.67 0.71 0.56 0.62 0.61 0.67 1.0 0.82 0.5 0.77
0.0 0.6 0.59 0.6 0.65 0.48 0.67 0.65 0.48 0.52 0.79 0.52 0.95 1.0 0.56
0.0 1.0 0.37 0.35 0.35 0.32 0.41 0.33 0.42 0.19 0.47 0.23 0.41 0.26 0.2
0.87 0.8 0.5 0.47 0.76 0.51 0.73 1.0 0.66 0.52 0.68 0.89 0.53 0.34 0.81
0.0 0.21 0.42 0.74 0.72 0.79 0.7 1.0 0.54 0.61 0.72 0.43 0.58 0.44 0.63
0.02 0.42 0.7 1.0 0.94 0.82 0.82 0.89 0.75 0.69 0.81 0.39 0.71 0.62 0.48
0.0 0.37 0.49 0.33 0.49 1.0 0.4 0.42 0.4 0.25 0.19 0.25 0.42 0.19 0.14
0.0 0.69 1.0 0.38 0.76 0.62 0.57 0.74 0.28 0.37 0.31 0.22 0.53 0.29 0.32
0.0 0.76 1.0 0.34 0.76 0.67 0.59 0.73 0.3 0.4 0.31 0.2 0.53 0.24 0.3
0.0 1.0 0.25 0.06 0.22 0.11 0.11 0.17 0.09 0.04 0.08 0.05 0.04 0.06 0.04
0.0 0.08 0.07 0.06 0.56 0.12 0.47 1.0 0.12 0.26 0.11 0.27 0.24 0.0 0.69
0.0 0.11 0.05 0.04 0.66 0.0 0.4 1.0 0.04 0.25 0.28 0.01 0.12 0.0 0.28
0.0 0.06 0.06 0.11 1.0 0.12 0.62 0.84 0.7 0.49 0.27 0.05 0.63 0.0 0.68
0.0 1.0 0.55 0.59 0.49 0.57 0.58 0.42 0.43 0.37 0.29 0.33 0.45 0.2 0.49
0.0 0.46 0.39 0.24 0.56 1.0 0.64 0.52 0.15 0.33 0.26 0.33 0.39 0.09 0.26
0.0 0.59 0.65 0.17 0.28 1.0 0.44 0.31 0.3 0.29 0.36 0.17 0.37 0.31 0.31
0.02 0.98 1.0 0.25 0.57 0.49 0.52 0.59 0.27 0.32 0.23 0.07 0.36 0.2 0.1
0.2 1.0 0.77 0.74 0.73 0.98 0.75 0.83 0.59 0.68 0.95 0.48 0.65 0.92 0.77
0.08 0.93 0.65 1.0 0.4 0.38 0.57 0.39 0.2 0.26 0.48 0.42 0.66 0.22 0.33
0.0 0.71 0.63 0.67 0.75 1.0 0.73 0.64 0.51 0.61 0.46 0.48 0.28 0.34 0.64
0.0 0.15 0.22 0.95 0.82 1.0 1.0 0.93 0.58 0.72 0.5 0.64 0.53 0.64 0.59
0.0 0.04 0.06 0.54 0.72 0.29 0.87 0.64 0.53 0.53 0.37 0.98 1.0 0.43 0.59
0.0 0.57 1.0 0.5 0.64 0.9 0.55 0.68 0.53 0.46 0.36 0.29 0.75 0.28 0.38
0.0 0.23 1.0 0.4 0.73 0.29 0.91 0.41 0.37 0.54 0.49 0.37 0.6 0.16 0.38
0.15 0.94 0.51 0.53 0.53 0.92 0.56 1.0 0.45 0.48 0.62 0.59 0.67 0.4 0.51
0.0 0.12 0.35 0.25 0.97 0.41 0.46 1.0 0.36 0.26 0.5 0.21 0.32 0.16 0.25
0.0 0.4 0.45 0.19 0.45 1.0 0.56 0.47 0.37 0.46 0.35 0.47 0.45 0.21 0.54
0.0 0.55 0.61 0.51 0.33 0.6 0.48 0.32 0.58 0.38 0.45 1.0 0.62 0.37 0.57
0.01 0.77 0.65 0.46 1.0 0.09 0.83 0.84 0.78 0.65 0.41 0.29 0.66 0.23 0.43
0.0 0.62 1.0 0.11 0.54 0.13 0.3 0.62 0.24 0.18 0.25 0.15 0.31 0.17 0.07
0.0 0.78 1.0 0.36 0.62 0.69 0.44 0.71 0.38 0.24 0.36 0.07 0.37 0.34 0.13
0.0 1.0 0.2 0.3 0.49 0.97 0.29 0.42 0.06 0.09 0.32 0.25 0.22 0.08 0.29
0.99 1.0 0.98 0.45 0.77 0.0 0.56 0.77 0.17 0.13 0.5 0.21 0.15 0.04 0.03
0.13 0.78 1.0 0.23 0.63 0.22 0.31 0.64 0.25 0.13 0.49 0.14 0.21 0.12 0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)