Heatmap: Cluster_222 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.24 0.36 0.39 0.15 0.0 0.57 0.07 0.17 0.44 0.42 0.32 1.0 0.0 0.16
0.0 0.76 0.78 0.59 0.41 0.25 0.72 0.58 0.48 0.76 0.57 0.61 1.0 0.65 0.8
0.07 0.61 0.6 0.49 0.48 0.51 0.6 0.67 0.46 0.42 0.55 0.59 1.0 0.48 0.61
0.0 0.06 1.0 0.54 0.08 0.0 0.27 0.24 0.05 0.37 0.25 0.16 0.87 0.0 0.0
0.0 0.67 0.49 0.45 0.44 0.49 0.61 0.59 0.43 0.44 0.52 0.47 1.0 0.52
0.58
SOLTUB.AGRIA.G00000019740
0.0 0.23 0.24 0.42 0.36 1.0 0.43 0.08 0.47 0.48 0.42 0.73 0.46 0.05 0.73
SOLTUB.AGRIA.G00000024927
0.0 0.43 0.62 0.59 0.64 0.5 0.64 0.67 0.61 0.45 0.49 1.0 0.72 0.38 0.59
SOLTUB.AGRIA.G00000027154
0.0 0.11 0.82 0.55 0.15 0.0 0.32 1.0 0.12 0.53 0.81 0.79 0.95 0.0 0.0
SOLTUB.AGRIA.G00000030532
0.07 0.08 0.07 0.15 0.32 0.23 0.4 1.0 0.23 0.32 0.73 0.67 0.55 0.73 0.7
SOLTUB.AGRIA.G00000030671
0.0 0.12 0.0 0.0 0.2 0.0 0.38 0.84 0.3 0.49 1.0 0.5 0.72 0.15 0.0
SOLTUB.AGRIA.G00000030703
0.27 0.0 0.01 0.05 0.14 0.16 0.54 0.98 0.18 0.33 1.0 0.21 0.8 0.14 0.0
SOLTUB.AGRIA.G00000030805
0.0 0.11 0.05 0.14 0.27 0.14 0.25 1.0 0.19 0.44 0.45 0.48 0.34 0.33 0.88
SOLTUB.AGRIA.G00000030912
0.0 0.08 0.05 0.13 0.14 0.19 0.27 0.54 0.15 0.28 0.41 0.8 0.92 0.17 1.0
SOLTUB.AGRIA.G00000030986
0.49 0.47 0.27 0.18 0.36 0.36 0.47 1.0 0.42 0.38 0.64 0.68 0.65 0.27 0.72
SOLTUB.AGRIA.G00000031252
0.0 0.09 0.04 0.23 0.12 0.0 0.28 0.78 0.2 0.44 0.32 0.68 0.24 0.12 1.0
SOLTUB.AGRIA.G00000031294
0.77 0.11 0.11 0.38 0.35 0.13 0.43 0.68 0.63 0.65 0.62 0.78 0.43 0.13 1.0
SOLTUB.AGRIA.G00000031296
0.0 0.06 0.42 0.38 0.35 0.59 0.8 0.83 0.42 0.66 0.48 0.67 0.43 0.24 1.0
SOLTUB.AGRIA.G00000031298
0.0 0.07 0.09 0.11 0.21 0.79 0.28 1.0 0.3 0.45 0.3 0.17 0.29 0.38 0.63
SOLTUB.AGRIA.G00000031319
0.17 0.24 0.05 0.28 0.17 0.0 0.47 1.0 0.46 0.23 0.2 0.26 0.35 0.74 0.73
SOLTUB.AGRIA.G00000031325
0.0 0.0 0.05 0.43 0.08 0.0 0.24 0.68 0.24 0.73 0.35 1.0 0.15 0.06 0.59
SOLTUB.AGRIA.G00000031331
0.0 0.16 1.0 0.48 0.42 0.71 0.8 0.4 0.52 0.79 0.41 0.79 0.29 0.4 0.9
SOLTUB.AGRIA.G00000031405
1.0 0.09 0.0 0.0 0.04 0.0 0.12 0.34 0.09 0.03 0.08 0.0 0.02 0.12 0.0
SOLTUB.AGRIA.G00000031467
0.0 0.07 0.02 0.1 0.2 0.0 0.45 1.0 0.15 0.36 0.74 0.66 0.53 0.19 0.52
SOLTUB.AGRIA.G00000033979
0.0 0.23 0.23 0.22 0.24 0.0 0.43 0.85 0.41 0.44 0.45 0.62 0.71 0.07 1.0
SOLTUB.AGRIA.G00000036091
0.02 0.22 0.33 0.25 0.27 0.22 0.42 0.21 0.21 0.46 0.32 0.31 1.0 0.17 0.65
SOLTUB.AGRIA.G00000036092
0.0 0.28 0.32 0.26 0.17 1.0 0.2 0.0 0.13 0.26 0.18 0.2 0.47 0.11 0.72
SOLTUB.AGRIA.G00000036094
0.0 0.15 0.14 0.22 0.23 0.32 0.3 0.12 0.17 0.43 0.25 0.59 0.89 0.05 1.0
SOLTUB.AGRIA.G00000037195
0.0 0.16 0.67 0.78 0.93 0.97 0.93 0.75 0.68 0.45 0.47 1.0 0.75 0.22 0.73
SOLTUB.AGRIA.G00000037306
0.02 0.09 0.16 0.35 0.48 0.34 0.54 0.26 0.34 0.49 0.58 0.8 1.0 0.57 0.92
SOLTUB.AGRIA.G00000037422
0.0 0.05 0.19 0.49 0.36 0.44 0.53 0.24 0.48 0.51 0.45 1.0 0.42 0.27 0.9
SOLTUB.AGRIA.G00000037423
0.0 0.25 0.39 0.86 0.44 0.0 0.6 0.2 0.83 0.44 0.41 1.0 0.56 0.2 0.12
SOLTUB.AGRIA.G00000037425
0.02 0.05 0.03 0.08 0.19 0.0 0.37 0.31 0.14 0.07 0.19 1.0 0.3 0.0 0.43
SOLTUB.AGRIA.G00000037431
0.0 0.45 0.68 0.55 0.36 0.41 0.66 0.58 0.76 0.31 0.57 1.0 0.84 0.12 0.62
SOLTUB.AGRIA.G00000037432
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 1.0 0.0 0.33 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0
SOLTUB.AGRIA.G00000037445
0.0 0.0 0.01 0.03 0.42 0.11 0.61 0.03 1.0 0.75 0.37 0.82 0.23 0.0 0.82
SOLTUB.AGRIA.G00000037522
0.0 0.26 0.3 0.38 0.33 0.51 0.53 0.29 0.44 0.51 0.7 0.84 1.0 0.51 0.81
SOLTUB.AGRIA.G00000037578
0.0 0.72 0.45 0.57 0.69 0.4 0.84 0.58 0.83 0.62 0.68 1.0 0.99 0.49 0.89
SOLTUB.AGRIA.G00000037581
0.0 0.02 0.04 0.27 0.24 0.28 0.51 0.03 0.47 0.21 0.16 1.0 0.38 0.06 0.13
SOLTUB.AGRIA.G00000037688
0.0 0.65 0.6 0.5 0.55 1.0 0.7 0.88 0.61 0.54 0.67 0.71 0.95 0.69 0.85
SOLTUB.AGRIA.G00000037791
0.03 0.07 0.06 0.28 0.42 0.11 0.54 0.33 0.39 0.16 0.52 1.0 0.88 0.41 0.72
SOLTUB.AGRIA.G00000037796
0.0 0.08 0.2 0.29 0.31 0.42 0.39 0.23 0.39 0.31 0.44 1.0 0.93 0.18 0.77
SOLTUB.AGRIA.G00000037833
1.0 0.05 0.41 0.16 0.86 0.44 0.31 0.74 0.19 0.29 0.18 0.97 0.71 0.05 0.82
SOLTUB.AGRIA.G00000037837
0.0 0.07 0.04 0.16 0.38 0.0 0.32 0.02 0.2 0.23 0.29 0.94 0.55 0.01 1.0
SOLTUB.AGRIA.G00000037840
0.0 0.02 0.15 0.22 0.58 0.26 0.4 0.58 0.45 0.29 0.24 1.0 0.36 0.2 0.7
SOLTUB.AGRIA.G00000037923
0.0 0.3 0.3 0.35 0.38 0.67 0.55 0.46 0.46 0.38 0.5 0.69 1.0 0.44 0.6
SOLTUB.AGRIA.G00000037957
0.05 0.57 0.43 0.31 0.74 1.0 0.51 0.43 0.34 0.29 0.3 0.52 0.51 0.22 0.58
SOLTUB.AGRIA.G00000037966
0.03 0.31 0.19 0.29 0.57 0.39 0.61 0.45 0.56 0.49 0.72 1.0 0.75 0.51 0.71
SOLTUB.AGRIA.G00000038009
0.0 0.0 0.01 0.07 0.14 0.0 0.22 0.0 0.44 0.1 0.37 1.0 0.92 0.0 0.39
SOLTUB.AGRIA.G00000038011
0.0 0.03 0.17 0.21 0.39 0.0 0.04 0.19 0.05 0.2 0.03 1.0 0.05 0.0 0.75
SOLTUB.AGRIA.G00000038019
0.0 0.1 0.05 0.26 0.39 0.78 0.59 0.65 0.29 0.35 0.45 0.7 0.98 0.3 1.0
SOLTUB.AGRIA.G00000038029
0.0 0.02 0.04 0.15 0.22 0.17 0.29 0.14 0.22 0.2 0.27 1.0 0.55 0.07 0.71
SOLTUB.AGRIA.G00000038033
0.0 0.0 0.08 0.24 0.75 0.37 0.39 0.56 0.29 0.36 0.38 1.0 0.94 0.09 0.62
SOLTUB.AGRIA.G00000038037
0.44 0.12 0.11 0.23 0.33 0.48 0.45 0.24 0.26 0.28 0.4 0.83 1.0 0.21 0.72
SOLTUB.AGRIA.G00000038123
0.0 0.1 0.11 0.2 0.34 0.38 0.46 0.3 0.33 0.41 0.58 0.82 1.0 0.39 0.72
SOLTUB.AGRIA.G00000038129
0.0 0.1 0.03 0.3 0.77 0.5 0.94 0.65 0.48 0.38 0.28 1.0 0.6 0.06 0.59
SOLTUB.AGRIA.G00000038136
0.0 0.07 0.07 0.2 1.0 0.25 0.52 0.84 0.27 0.3 0.28 0.56 0.66 0.03 0.49
SOLTUB.AGRIA.G00000038141
0.0 0.37 0.41 0.29 0.43 0.86 0.49 0.32 0.33 0.42 0.46 0.85 1.0 0.21 0.97
SOLTUB.AGRIA.G00000044061
0.0 0.4 0.38 0.27 0.34 0.46 0.51 0.4 0.3 0.33 0.43 0.44 1.0 0.43 0.62

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)