Heatmap: Cluster_2 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
- - - - -1.72 - 2.14 - - 1.45 -2.19 2.87 - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - -3.54 - 3.9 - - - - - - - -
- - - - - - 3.82 - - - -0.2 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 1.37 - - - 1.26 - 0.91 3.03 - - -
- - - - - - 3.12 - 2.65 - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -1.52 - - - - 3.87 - - - - -
- 0.71 -1.28 -1.05 1.92 - 0.74 1.52 -0.56 0.48 -0.63 -1.9 -0.59 - -1.01
- 0.92 - - -1.41 3.27 -0.79 -2.21 -1.46 -0.78 -1.77 -0.5 -3.87 -3.05 -3.08
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
3.78 - - - -4.72 - -1.92 - - -1.65 -2.51 -0.97 - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- - - - 2.22 - - - - - 3.37 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - -1.64 - 3.88 - - - - - - - -
- 1.63 - - -0.04 - 0.53 - 0.01 - 0.81 - 0.65 2.36 -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.79 - - - 0.24 - - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- - - - -5.84 - 2.32 - - -1.05 0.2 2.02 -4.38 - 2.09
- - - - -2.08 - 3.88 - - - - - - - -
- - - - 1.47 - 3.61 - - - - - - - -
- - - - 0.16 - 3.39 - 1.46 - -0.6 - - - -
- - - - 2.13 - 3.41 - - - - - - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- -0.9 -0.37 1.29 0.07 1.11 1.77 -1.62 -0.74 -0.52 -1.34 -0.79 -1.4 -0.96 0.19
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 0.1 - 3.67 - - - 0.25 - - - -
- - - - -3.3 - - - 0.57 3.26 1.94 - - - -
- - - - -1.23 - - - 1.01 2.79 1.41 - 1.58 - -
- - - - 2.83 - 2.61 - - - 0.83 - - - -
- - - - 1.17 - 0.98 - 0.04 2.55 1.97 - - - -
- - - - 1.41 - 3.63 - - - - - - - -
3.89 - - - -2.32 - - - - - - - - - -
- - - - -0.23 - 3.68 - - - 0.41 - - - -
- - - - -0.19 - 3.79 - - - -1.92 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.53 - 2.79 - -2.16 - - - 1.06
- - - - 3.43 - - - - - 2.07 - - - -
- - - - - - 3.86 - - - -1.13 - - - -
- - - - - - 3.86 - -1.44 - -2.72 - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 0.2 - 3.79 - - - - - - - -
- - - 3.38 -2.82 - 2.11 - - - -2.92 - - - -
1.65 - -0.82 2.97 -1.98 - 1.66 - -4.27 - -5.94 - - - -
- - 0.77 3.31 -2.16 - 1.64 - - - - - - - -
- - - - 1.74 - 3.32 - - - 0.74 - - - -
- - -0.02 2.23 1.4 - 2.39 - 0.48 - -4.45 - - - -
- - - 0.02 2.17 2.48 0.86 1.02 -4.16 - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- - - - -0.91 - 3.85 - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - 1.8 -3.13 - 2.99 - - 1.05 -3.05 - - - 0.36
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.92 - - - 1.51 - 2.2 - -
- - - - -2.45 - 3.06 - 0.33 - 0.41 1.96 - - -
- - - - -2.24 - 3.27 - 1.47 - -0.61 - - - 0.76

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.