Heatmap: Cluster_59 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.03 0.41 0.17 0.22 1.0 0.27 0.11 0.12 0.55 0.42 0.16 0.99 0.0 0.72
0.1 0.0 1.0 0.47 0.02 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.14 0.68 1.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.42 0.12 0.12 0.19 0.01 0.0 0.0
0.0 0.01 0.85 0.22 0.12 1.0 0.07 0.0 0.2 0.16 0.29 0.09 0.65 0.02 0.22
0.0 0.03 1.0 0.11 0.05 0.9 0.01 0.0 0.03 0.06 0.14 0.01 0.01 0.0 0.01
0.0 0.4 0.81 0.84 0.27 1.0 0.57 0.09 0.58 0.71 0.57 0.43 0.38 0.52 0.83
0.0 0.51 1.0 0.15 0.09 0.81 0.08 0.57 0.08 0.03 0.16 0.0 0.02 0.21 0.0
0.04 0.61 1.0 0.21 0.06 0.69 0.08 0.04 0.15 0.16 0.12 0.14 0.08 0.05 0.06
0.0 0.0 1.0 0.18 0.04 0.16 0.0 0.0 0.06 0.09 0.17 0.01 0.14 0.0 0.0
0.0 0.88 1.0 0.54 0.06 0.0 0.08 0.03 0.09 0.03 0.04 0.0 0.1 0.0 0.0
0.0 0.78 0.8 1.0 0.41 0.0 0.4 0.12 0.31 0.16 0.29 0.19 0.33 0.27 0.19
0.0 0.05 0.61 0.14 0.43 0.77 0.86 0.44 0.66 0.2 1.0 0.96 0.94 0.25 0.09
0.01 0.05 1.0 0.27 0.35 0.32 0.7 0.3 0.41 0.2 0.58 0.59 0.51 0.25 0.53
0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.63 0.14 0.07 0.0 0.06 0.27 0.04 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.64 1.0 0.97 0.22 0.38 0.32 0.9 0.24 0.26 0.18 0.81 0.07 0.04 0.69
0.0 0.0 0.58 1.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.02 0.57 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.38 0.23 0.16 0.57 0.2 0.24 0.3 0.14 0.11 0.17 0.05 0.0 0.11
0.0 0.11 0.03 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.23 1.0 0.22 0.47 0.11 0.42 0.09
0.0 0.07 0.05 0.0 0.04 0.0 0.14 0.0 0.26 1.0 0.3 0.76 0.16 0.33 0.15
0.0 0.0 0.76 0.03 0.03 1.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.18 0.0 0.31 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.9 0.85 0.65 0.08 0.0 0.11 0.04 0.31 0.08 0.15 1.0 0.19 0.0 0.0
0.0 0.13 0.09 0.06 0.13 1.0 0.71 0.14 0.31 0.7 0.23 0.1 0.04 0.35 0.19
0.0 0.25 0.24 0.06 0.11 1.0 0.63 0.1 0.2 0.46 0.22 0.04 0.05 0.18 0.28
0.01 0.14 0.82 1.0 0.25 0.15 0.24 0.25 0.2 0.4 0.27 0.09 0.19 0.07 0.26
0.0 0.34 1.0 0.31 0.06 0.0 0.05 0.01 0.12 0.51 0.32 0.02 0.26 0.15 0.08
0.0 1.0 1.0 0.29 0.15 0.0 0.27 0.07 0.18 0.08 0.17 0.34 0.4 0.0 0.02
0.04 1.0 0.92 0.69 0.23 0.3 0.58 0.11 0.26 0.1 0.27 0.2 0.42 0.0 0.85
0.07 1.0 0.68 0.38 0.16 0.28 0.38 0.16 0.18 0.08 0.22 0.14 0.32 0.0 0.5
0.0 0.44 0.87 1.0 0.3 0.79 0.68 0.19 0.55 0.64 0.65 0.65 0.48 0.33 0.63
0.15 0.47 1.0 0.41 0.29 0.46 0.52 0.17 0.39 0.48 0.38 0.81 0.21 0.15 0.65
0.0 0.65 0.81 1.0 0.29 0.62 0.55 0.27 0.34 0.46 0.61 0.42 0.52 0.34 0.42
0.0 0.04 0.24 0.13 0.27 0.19 0.64 0.09 0.01 0.22 0.4 0.95 1.0 0.37 0.65
0.0 0.11 0.39 0.11 0.06 1.0 0.86 0.0 0.12 0.0 0.15 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.2 0.0 0.4 0.0 0.05 0.0 0.47 0.0 0.69 0.0 0.0
0.0 0.09 0.41 0.1 0.1 1.0 0.55 0.04 0.21 0.27 0.23 0.01 0.06 0.08 0.12
0.0 0.24 0.62 0.26 0.04 1.0 0.05 0.03 0.02 0.07 0.08 0.0 0.54 0.0 0.03
0.0 0.03 1.0 0.15 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 1.0 0.2 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.66 1.0 0.15 0.06 0.93 0.07 0.0 0.06 0.02 0.22 0.0 0.01 0.08 0.0
0.0 0.21 1.0 0.58 0.12 0.1 0.18 0.24 0.29 0.16 0.19 0.44 0.23 0.05 0.26
0.02 1.0 0.99 0.83 0.4 0.93 0.52 0.54 0.51 0.63 0.94 0.55 0.48 0.9 0.97
0.0 0.98 1.0 0.91 0.67 0.7 0.71 0.66 0.46 0.56 0.66 0.45 0.35 0.45 0.78
0.02 0.46 0.69 0.84 0.48 0.76 0.55 0.68 0.48 0.54 0.67 0.57 0.46 0.43 1.0
0.0 0.0 0.12 0.0 0.14 1.0 0.23 0.02 0.02 0.32 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 1.0 0.6 0.2 0.0 0.24 0.0 0.25 0.19 0.27 0.12 0.16 0.04 0.52
0.0 0.08 1.0 0.37 0.03 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.53 1.0 0.27 0.3 0.0 0.17 0.04 0.33 0.25 0.22 0.07 0.76 0.06 0.38
0.0 0.49 1.0 0.36 0.32 0.66 0.55 0.71 0.31 0.13 0.28 0.51 0.4 0.18 0.29
0.0 0.08 1.0 0.0 0.09 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.33 0.37 0.13 0.04 0.0 0.49 0.34 0.12 0.12 0.21 0.22 0.82 1.0 0.06
0.0 0.32 1.0 0.69 0.18 0.0 0.08 0.02 0.08 0.15 0.2 0.07 0.09 0.0 0.13
0.0 0.76 1.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.0 0.11 0.0 0.35 0.18 0.17 0.0 0.0
0.0 0.23 0.71 0.91 0.03 1.0 0.11 0.0 0.03 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 1.0 0.76 0.41 0.16 0.63 0.3 0.15 0.33 0.36 0.34 0.12 0.2 0.11 0.34
0.0 0.4 0.0 1.0 0.05 0.0 0.22 0.07 0.27 0.35 0.65 0.61 0.24 0.48 0.03
0.05 1.0 0.72 0.74 0.6 0.91 0.59 0.2 0.5 0.38 0.43 0.42 0.47 0.3 0.73
0.0 0.44 1.0 0.14 0.13 0.67 0.38 0.01 0.07 0.13 0.14 0.08 0.87 0.04 0.23
0.01 0.3 1.0 0.49 0.08 0.78 0.48 0.05 0.43 0.34 0.3 0.22 0.32 0.41 0.23
0.02 0.74 1.0 0.27 0.07 0.54 0.17 0.02 0.07 0.14 0.11 0.03 0.13 0.0 0.06
0.02 0.07 0.32 0.11 0.11 0.58 0.3 0.09 0.8 0.48 0.43 0.4 0.53 1.0 0.28
0.42 0.68 0.84 1.0 0.32 0.8 0.41 0.37 0.36 0.36 0.42 0.46 0.39 0.3 0.58
0.0 0.76 1.0 0.31 0.38 0.79 0.52 0.33 0.29 0.32 0.25 0.26 0.25 0.24 0.56
0.0 0.58 0.64 0.38 0.22 1.0 0.38 0.26 0.33 0.34 0.36 0.25 0.36 0.17 0.52
0.11 0.7 1.0 0.42 0.31 0.74 0.41 0.29 0.27 0.35 0.37 0.39 0.32 0.27 0.63
0.0 0.35 1.0 0.95 0.2 0.62 0.61 0.14 0.33 0.38 0.63 0.18 0.25 0.26 0.71
0.05 0.35 0.96 1.0 0.11 0.38 0.37 0.05 0.18 0.24 0.22 0.04 0.02 0.0 0.0
0.0 0.07 1.0 0.26 0.03 0.95 0.01 0.0 0.03 0.12 0.09 0.0 0.05 0.02 0.0
0.0 0.18 0.34 0.31 0.39 0.85 0.99 1.0 0.79 0.89 0.74 0.25 0.47 0.6 0.33
0.01 0.38 0.34 0.28 0.25 1.0 0.53 0.58 0.36 0.37 0.29 0.11 0.27 0.24 0.17
0.0 0.41 0.43 0.24 0.2 1.0 0.41 0.42 0.29 0.39 0.29 0.09 0.21 0.16 0.15
0.14 0.7 1.0 0.73 0.09 0.96 0.1 0.04 0.16 0.46 0.2 0.0 0.02 0.0 0.05
0.04 0.26 1.0 0.44 0.2 0.0 0.28 0.47 0.45 0.23 0.5 0.54 0.7 0.18 0.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)