Heatmap: Cluster_29 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.06 0.28 0.72 0.78 0.6 0.35 1.0 0.25 0.27 0.14 0.12 0.1 0.28 0.26
0.0 0.53 0.49 1.0 0.5 0.47 0.32 0.32 0.24 0.17 0.15 0.15 0.06 0.09 0.14
0.0 0.38 0.86 0.16 0.76 0.21 0.12 1.0 0.0 0.05 0.03 0.06 0.09 0.01 0.15
0.0 0.11 1.0 0.09 0.25 0.07 0.05 0.41 0.01 0.06 0.01 0.17 0.03 0.0 0.11
0.0 0.01 0.19 0.09 0.62 0.27 0.24 1.0 0.02 0.09 0.01 0.01 0.06 0.0 0.04
0.0 0.29 0.99 0.42 0.59 0.72 0.33 1.0 0.1 0.16 0.09 0.05 0.17 0.02 0.18
0.0 0.04 1.0 0.14 0.46 0.61 0.13 0.78 0.01 0.06 0.03 0.02 0.01 0.01 0.07
0.05 1.0 0.8 0.73 0.44 0.15 0.1 0.28 0.24 0.18 0.11 0.26 0.36 0.0 0.26
0.0 0.44 1.0 0.34 0.4 0.12 0.16 0.38 0.18 0.09 0.04 0.18 0.11 0.03 0.29
0.0 0.13 1.0 0.02 0.24 0.99 0.17 0.28 0.0 0.06 0.01 0.03 0.0 0.0 0.05
0.13 0.06 0.38 0.73 0.52 1.0 0.47 0.76 0.36 0.26 0.08 0.27 0.16 0.04 0.3
0.0 0.0 0.14 0.0 0.42 0.65 0.41 1.0 0.01 0.18 0.07 0.08 0.01 0.0 0.8
0.0 0.13 0.12 0.14 0.4 1.0 0.24 0.66 0.02 0.14 0.06 0.12 0.09 0.0 0.55
0.0 0.04 1.0 0.34 0.21 0.23 0.19 0.15 0.05 0.11 0.02 0.09 0.01 0.0 0.14
0.0 0.07 1.0 0.2 0.31 0.13 0.11 0.36 0.0 0.11 0.01 0.12 0.02 0.0 0.18
0.0 0.06 1.0 0.28 0.49 0.0 0.16 0.71 0.0 0.15 0.01 0.16 0.04 0.0 0.52
0.0 0.4 0.98 0.29 0.88 0.32 0.46 1.0 0.23 0.28 0.27 0.36 0.27 0.3 0.35
0.0 0.18 1.0 0.07 0.3 0.05 0.06 0.31 0.01 0.05 0.01 0.07 0.2 0.0 0.06
0.0 0.78 1.0 0.92 0.29 0.12 0.13 0.83 0.0 0.24 0.02 0.67 0.08 0.0 0.34
0.0 0.82 1.0 0.26 0.21 0.43 0.14 0.25 0.05 0.12 0.09 0.26 0.07 0.02 0.18
0.0 0.59 1.0 0.74 0.24 0.12 0.09 0.83 0.07 0.11 0.04 0.42 0.03 0.03 0.17
0.09 0.61 1.0 0.22 0.28 0.22 0.19 0.48 0.2 0.15 0.05 0.09 0.21 0.04 0.19
0.0 0.03 1.0 0.06 0.35 0.08 0.11 0.35 0.07 0.05 0.01 0.01 0.08 0.0 0.03
0.0 0.11 1.0 0.11 0.64 0.18 0.16 0.94 0.01 0.06 0.01 0.06 0.01 0.01 0.08
0.0 0.3 1.0 0.06 0.49 0.3 0.25 0.43 0.06 0.11 0.03 0.14 0.07 0.0 0.26
0.0 0.24 1.0 0.14 0.24 0.06 0.04 0.38 0.01 0.09 0.02 0.37 0.03 0.0 0.07
0.0 0.8 0.75 0.15 0.34 1.0 0.12 0.16 0.01 0.02 0.02 0.04 0.01 0.0 0.0
0.01 0.21 1.0 0.05 0.14 0.0 0.08 0.15 0.01 0.03 0.01 0.05 0.01 0.0 0.07
0.0 0.52 1.0 0.23 0.41 0.25 0.24 0.96 0.07 0.13 0.01 0.31 0.28 0.0 0.55
0.0 0.78 1.0 0.21 0.32 0.3 0.23 0.19 0.05 0.12 0.02 0.17 0.19 0.0 0.39
0.0 0.75 0.83 0.34 1.0 0.26 0.36 0.81 0.26 0.19 0.19 0.11 0.19 0.28 0.23
0.0 0.55 1.0 0.37 0.4 0.2 0.15 0.32 0.1 0.08 0.1 0.02 0.2 0.1 0.11
0.0 0.52 1.0 0.27 0.64 0.49 0.17 0.68 0.02 0.26 0.03 0.41 0.17 0.0 0.51
0.0 0.14 1.0 0.07 0.23 0.0 0.04 0.09 0.0 0.02 0.01 0.05 0.01 0.0 0.05
0.0 0.08 0.46 1.0 0.69 0.28 0.41 0.78 0.28 0.32 0.4 0.23 0.38 0.44 0.44
0.0 0.78 0.85 0.0 0.19 1.0 0.46 0.19 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.87 0.55 0.29 0.27 1.0 0.37 0.35 0.05 0.14 0.2 0.05 0.02 0.0 0.03
0.0 1.0 0.81 0.0 0.52 0.89 0.75 0.57 0.01 0.24 0.06 0.0 0.01 0.0 0.05
0.0 0.96 0.6 0.0 0.41 1.0 0.41 0.32 0.0 0.12 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.63 0.03 0.23 0.74 0.16 0.24 0.0 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 1.0 0.15 0.0 0.1 0.0 0.23 0.12 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.9 0.38 0.0 0.33 1.0 0.64 0.54 0.18 0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.14 0.0 0.28 0.24 0.6 0.39 0.18 0.26 0.1 0.79 0.0 0.0 1.0
0.0 0.42 0.97 0.0 0.87 0.64 1.0 0.91 0.07 0.11 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.71 1.0 0.0 0.67 0.59 0.25 0.51 0.01 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.91 0.57 0.15 0.76 1.0 0.51 0.95 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.75 0.0 0.37 0.93 0.35 0.46 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.93 0.93 0.0 0.49 1.0 0.31 0.44 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.54 0.28 0.0 0.24 1.0 0.17 0.2 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.6 0.56 0.0 0.25 1.0 0.12 0.32 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.63 0.36 0.03 0.22 1.0 0.14 0.15 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.13 0.0 0.27 0.19 0.23 0.27 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.09 0.0 0.13 1.0 0.07 0.11 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 1.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.14 0.12 0.03 0.11 1.0 0.18 0.1 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.56 1.0 0.36 0.42 0.39 0.42 0.35 0.17 0.25 0.19 0.06 0.19 0.23 0.3
0.0 0.32 0.43 0.51 0.75 0.36 0.39 1.0 0.66 0.37 0.31 0.41 0.35 0.1 0.38
0.01 0.17 0.4 0.53 1.0 0.71 0.55 0.96 0.22 0.2 0.31 0.23 0.41 0.18 0.5
0.0 0.53 0.23 0.16 0.76 0.05 0.23 1.0 0.07 0.04 0.03 0.0 0.08 0.0 0.05
0.0 1.0 0.91 0.13 0.5 0.52 0.31 0.51 0.12 0.27 0.09 0.24 0.09 0.06 0.38
0.0 0.18 1.0 0.15 0.49 0.64 0.19 0.81 0.01 0.07 0.01 0.15 0.01 0.0 0.16
0.0 0.11 1.0 0.15 0.4 0.8 0.1 0.52 0.01 0.05 0.01 0.07 0.0 0.0 0.05
0.0 0.19 0.7 1.0 0.83 0.58 0.23 0.56 0.02 0.21 0.04 0.76 0.06 0.01 0.31
0.0 0.08 1.0 0.07 0.24 0.01 0.05 0.13 0.06 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01
0.0 0.29 1.0 0.46 0.41 0.25 0.18 0.77 0.07 0.17 0.09 0.23 0.09 0.08 0.41
0.0 0.08 1.0 0.04 0.25 0.21 0.07 0.41 0.0 0.05 0.01 0.32 0.03 0.0 0.18
0.01 0.27 0.08 0.04 0.49 1.0 0.36 0.73 0.22 0.14 0.04 0.06 0.18 0.01 0.1
0.0 0.0 0.03 0.07 0.59 1.0 0.13 0.32 0.0 0.06 0.02 0.05 0.0 0.0 0.19
0.0 0.67 1.0 0.49 0.75 0.59 0.57 0.74 0.32 0.31 0.17 0.21 0.25 0.11 0.45
0.0 1.0 0.71 0.07 0.23 0.07 0.13 0.15 0.05 0.06 0.02 0.1 0.02 0.0 0.11
0.0 0.61 0.65 1.0 0.29 0.21 0.13 0.26 0.12 0.08 0.1 0.11 0.07 0.0 0.33
0.0 0.67 0.43 1.0 0.3 0.12 0.12 0.34 0.01 0.2 0.03 0.17 0.4 0.0 0.33
0.0 0.0 1.0 0.01 0.18 0.0 0.03 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.35 0.53 0.81 0.59 0.56 0.98 0.48 0.42 0.59 0.25 0.57 1.0 0.46
0.0 0.07 1.0 0.14 0.35 0.17 0.08 0.22 0.01 0.03 0.01 0.06 0.0 0.0 0.15
0.0 0.56 1.0 0.33 0.61 1.0 0.27 0.56 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.0 0.15
0.0 0.98 1.0 0.38 0.3 0.4 0.09 0.48 0.0 0.05 0.0 0.32 0.01 0.0 0.03
0.0 0.37 1.0 0.55 0.39 0.17 0.08 0.8 0.01 0.08 0.01 0.26 0.02 0.0 0.22
0.0 0.16 0.74 0.37 0.8 0.39 0.53 1.0 0.24 0.28 0.15 0.29 0.24 0.14 0.37
0.0 0.11 1.0 0.1 0.46 0.16 0.18 0.21 0.12 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04
0.0 0.21 0.29 1.0 0.47 0.5 0.32 0.42 0.06 0.05 0.13 0.08 0.39 0.01 0.22
0.0 0.23 1.0 0.12 0.45 0.25 0.1 0.61 0.01 0.04 0.02 0.06 0.02 0.02 0.08
0.0 0.31 1.0 0.09 0.25 0.27 0.05 0.29 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.0 0.07
0.04 0.33 1.0 0.31 0.23 0.21 0.08 0.15 0.0 0.08 0.01 0.12 0.01 0.0 0.19
0.0 0.21 0.85 0.61 0.64 0.2 0.12 1.0 0.0 0.26 0.03 0.78 0.06 0.0 0.29
0.0 0.16 0.51 1.0 0.44 0.74 0.17 0.43 0.02 0.15 0.05 0.29 0.06 0.01 0.25
0.0 0.26 0.97 0.27 0.37 0.11 0.12 1.0 0.01 0.14 0.01 0.29 0.02 0.0 0.18
0.02 0.22 0.81 0.26 0.59 1.0 0.61 0.65 0.18 0.28 0.31 0.4 0.52 0.28 0.04
0.0 0.32 0.92 0.42 0.95 0.49 0.22 1.0 0.08 0.23 0.15 0.77 0.22 0.26 0.37
0.02 0.09 1.0 0.03 0.41 0.68 0.25 0.47 0.09 0.13 0.05 0.05 0.03 0.06 0.13
0.0 1.0 0.32 0.24 0.29 0.55 0.42 0.31 0.21 0.37 0.23 0.36 0.54 0.21 0.69
0.0 0.11 0.61 0.24 0.53 0.78 0.1 1.0 0.0 0.06 0.01 0.21 0.02 0.0 0.2
0.0 0.86 1.0 0.32 0.48 0.23 0.14 0.72 0.0 0.19 0.02 0.27 0.03 0.0 0.26
0.0 0.88 1.0 0.0 0.74 0.18 0.15 0.39 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.58 0.6 0.01 0.55 1.0 0.08 0.53 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.55 0.02 0.34 1.0 0.09 0.33 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.06 0.2 0.54 0.08 0.04 1.0 0.01 0.02 0.01 0.15 0.0 0.0 0.05
0.0 0.05 0.29 0.32 0.78 0.38 0.28 0.61 0.27 0.35 0.66 0.61 0.52 1.0 0.52
0.0 0.07 0.25 0.16 0.55 0.56 0.21 1.0 0.02 0.24 0.04 0.26 0.03 0.02 0.85
0.0 0.35 0.29 0.4 0.84 1.0 0.74 0.89 0.23 0.3 0.3 0.27 0.3 0.22 0.48
0.0 0.22 0.29 0.0 0.47 1.0 0.4 0.3 0.08 0.08 0.15 0.1 0.0 0.0 0.05
0.0 0.38 0.12 0.0 0.14 1.0 0.1 0.17 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01
0.0 1.0 0.44 0.0 0.31 0.76 0.22 0.23 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.33 0.2 0.0 0.24 1.0 0.11 0.17 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 1.0 0.66 0.02 0.29 0.81 0.21 0.24 0.02 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.57 0.0 0.0 0.18 1.0 0.19 0.44 0.01 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.37 0.42 0.0 0.42 1.0 0.49 0.46 0.01 0.08 0.03 0.02 0.0 0.0 0.02
0.0 0.16 0.18 0.0 0.32 1.0 0.21 0.3 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.79 0.02 0.4 0.94 0.25 0.31 0.01 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.62 0.28 0.0 0.13 1.0 0.18 0.15 0.01 0.09 0.07 0.02 0.11 0.14 0.0
0.0 0.0 0.21 0.0 0.11 1.0 0.07 0.06 0.0 0.11 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 1.0 0.07 0.42 0.11 0.11 0.3 0.01 0.11 0.02 0.26 0.03 0.02 0.16
0.03 0.22 1.0 0.87 0.92 0.59 0.32 0.74 0.16 0.22 0.16 0.44 0.14 0.02 0.32
0.0 0.63 1.0 0.27 0.38 0.45 0.12 0.35 0.03 0.13 0.03 0.15 0.21 0.0 0.39
0.0 0.01 0.29 0.06 0.18 1.0 0.08 0.15 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05
0.0 0.22 1.0 0.04 0.19 0.21 0.05 0.22 0.02 0.07 0.02 0.03 0.0 0.01 0.01
0.01 0.78 0.66 1.0 0.38 0.8 0.19 0.44 0.17 0.09 0.06 0.07 0.06 0.04 0.13
0.0 0.04 0.45 0.11 0.77 1.0 0.18 0.85 0.04 0.26 0.03 0.38 0.01 0.0 0.96
0.0 0.02 1.0 0.14 0.22 0.0 0.05 0.09 0.0 0.02 0.0 0.09 0.0 0.0 0.09
0.0 1.0 0.33 0.27 0.27 0.51 0.41 0.33 0.24 0.44 0.24 0.34 0.56 0.24 0.57
0.0 0.26 1.0 0.15 0.19 0.0 0.06 0.45 0.0 0.09 0.01 0.41 0.02 0.0 0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)