Heatmap: Cluster_60 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.38 0.0 1.0 0.02 0.86 0.3 0.06 0.02 0.24 0.03 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 1.0 0.04 0.66 0.29 0.05 0.02 0.41 0.05 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.15 1.0 0.31 0.39 0.0 0.08 0.26 0.14 0.27 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.59 0.11 0.12 1.0 0.0 0.8 0.65 0.87 0.21 0.34 0.12 0.53 0.06 0.31
0.21 1.0 0.13 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.14 0.62 1.0 0.98 0.13 0.75 0.94 0.78 0.74 0.26 0.19 0.07 0.13 0.54
0.0 0.37 0.34 0.28 0.94 0.43 0.49 0.96 0.57 0.56 0.61 0.38 0.84 1.0 0.37
0.02 0.27 0.77 0.2 0.47 1.0 0.74 0.57 0.74 0.78 0.44 0.57 0.51 0.63 0.73
0.0 0.55 0.51 0.14 0.69 0.0 0.38 0.29 1.0 0.12 0.19 0.02 0.13 0.51 0.0
0.0 0.03 0.02 0.0 0.12 0.0 0.2 0.02 1.0 0.34 0.07 0.0 0.01 0.07 0.04
0.0 0.11 0.84 0.25 0.59 0.0 0.58 0.29 0.87 0.25 0.18 0.01 0.35 1.0 0.01
0.0 0.21 0.2 0.09 0.73 0.0 0.46 0.27 1.0 0.65 0.18 0.0 0.03 0.23 0.02
0.0 0.24 0.12 0.08 0.8 0.05 0.78 0.38 1.0 0.41 0.05 0.01 0.0 0.22 0.11
0.0 0.01 0.03 0.0 0.15 0.0 0.11 0.01 1.0 0.13 0.01 0.0 0.0 0.09 0.15
0.0 1.0 0.19 0.04 0.31 0.03 0.16 0.13 0.1 0.07 0.03 0.03 0.05 0.0 0.05
0.0 1.0 0.16 0.03 0.5 0.13 0.26 0.17 0.15 0.14 0.07 0.04 0.12 0.03 0.1
0.09 0.03 0.15 0.24 1.0 0.16 0.52 0.53 0.65 0.63 0.21 0.33 0.16 0.25 0.19
0.01 0.07 0.43 0.23 0.57 0.43 0.24 0.55 0.86 1.0 0.1 0.01 0.0 0.09 0.05
0.0 1.0 0.54 0.3 0.52 0.11 0.27 0.25 0.22 0.26 0.13 0.17 0.33 0.04 0.13
0.0 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.17 0.35 0.0 0.43 0.0 0.35 0.29 0.17 0.04 1.0 0.21 0.0
0.5 0.0 0.48 0.28 0.32 0.0 0.48 0.0 1.0 0.17 0.08 0.28 0.36 0.05 0.26
0.0 0.03 0.01 0.04 1.0 0.0 0.18 0.3 0.58 0.19 0.08 0.01 0.19 0.32 0.0
0.17 0.46 0.49 0.68 0.82 0.22 0.62 0.44 1.0 0.5 0.41 0.26 0.43 0.4 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.22 0.25 0.18 0.69 0.05 0.19 0.19 0.25 1.0 0.17 0.03 0.8 0.0 0.06
0.0 0.87 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 1.0 0.18 0.0 0.16 0.0 0.36 0.0 0.0
0.3 0.32 1.0 0.26 0.92 0.79 0.76 0.64 0.49 0.46 0.22 0.11 0.25 0.07 0.23
0.61 0.62 1.0 0.58 0.88 0.88 0.56 0.62 0.46 0.51 0.5 0.5 0.51 0.17 0.48
0.7 0.0 0.34 0.93 0.15 0.0 0.1 0.0 0.27 0.0 0.1 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.06 0.17 0.52 0.0 0.47 1.0 0.78 0.75 0.16 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.69 0.29 1.0 0.05 0.61 0.01 0.21 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.18 0.14 1.0 0.03 0.31 0.03 0.25 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 1.0 0.04 0.42 0.05 0.55 0.07 0.0 0.04 0.25 0.0
0.0 0.01 0.02 0.19 0.27 0.85 0.07 0.3 0.05 1.0 0.12 0.0 0.01 0.62 0.0
0.0 0.0 0.0 0.41 0.16 1.0 0.05 0.23 0.03 0.55 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.01 0.09 0.33 1.0 0.09 0.75 0.08 0.82 0.12 0.01 0.02 0.03 0.0
0.0 0.0 0.01 0.24 0.59 1.0 0.16 0.8 0.05 0.58 0.16 0.0 0.0 0.14 0.0
0.0 0.0 0.01 0.03 0.51 0.99 0.07 1.0 0.17 0.31 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.17 0.31 0.0 0.01 1.0 0.01 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.11 0.63 0.99 0.13 1.0 0.03 0.82 0.18 0.01 0.05 0.18 0.0
0.0 0.0 0.01 0.03 0.33 1.0 0.06 0.42 0.04 0.09 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 1.0 0.13 0.94 0.01 0.25 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.04 0.13 0.38 0.0 0.1 1.0 0.03 0.28 0.02 0.25 0.05 0.0 0.08
0.06 0.03 0.09 0.23 1.0 0.13 0.19 0.37 0.21 0.07 0.03 0.02 0.03 0.0 0.05
0.1 0.9 0.29 0.26 1.0 0.17 0.52 0.69 0.31 0.5 0.19 0.29 0.41 0.41 0.37
0.0 0.03 0.36 0.17 0.86 0.67 0.93 1.0 0.31 1.0 0.34 0.8 0.08 0.38 0.7
0.0 0.12 0.32 0.13 0.99 0.09 0.25 0.36 1.0 0.37 0.32 0.28 0.08 0.22 0.48
0.0 0.06 0.15 0.07 0.76 0.0 0.27 0.53 1.0 0.18 0.16 0.41 0.02 0.06 0.01
0.0 0.08 0.16 0.05 1.0 0.09 0.24 0.64 0.86 0.31 0.25 0.21 0.03 0.04 0.46
0.0 0.14 0.37 0.11 1.0 0.18 0.54 0.86 0.94 0.33 0.22 0.09 0.06 0.11 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 1.0 0.0 0.88 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 1.0 0.17 0.02 0.0 0.38 0.19 0.0
0.0 1.0 0.75 0.07 0.49 0.26 0.24 0.46 0.16 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.27 0.14 0.25 1.0 0.0 0.29 0.41 0.3 0.12 0.1 0.33 0.2 0.02 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 1.0 0.31 0.58 0.45 0.05 0.0 0.3 0.0 0.03
0.0 0.11 0.01 0.04 0.22 1.0 0.24 0.2 0.13 0.45 0.04 0.89 0.1 0.14 0.08
0.0 1.0 0.12 0.08 1.0 0.14 0.52 0.48 0.1 0.16 0.13 0.12 0.26 0.11 0.12
0.0 0.64 0.12 0.05 1.0 0.12 0.55 0.88 0.06 0.15 0.07 0.04 0.13 0.06 0.08
0.0 0.53 0.06 0.05 1.0 0.0 0.51 0.5 0.09 0.14 0.06 0.03 0.09 0.07 0.11
0.0 0.14 0.31 0.18 1.0 0.7 0.53 0.47 0.01 0.02 0.07 0.01 0.02 0.03 0.04
0.0 0.01 0.03 0.04 1.0 0.41 0.45 0.62 0.03 0.52 0.15 0.12 0.01 0.75 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.75 0.0 0.13 0.32 0.25 0.44 0.17 0.19 1.0 0.08 0.39
0.14 0.79 0.88 0.37 0.63 0.89 0.87 0.54 0.85 0.59 0.45 0.58 1.0 0.43 0.93
0.17 0.28 0.62 0.57 1.0 0.38 0.84 0.85 0.78 0.83 0.31 0.28 0.42 0.44 0.57
0.0 0.0 0.0 0.24 1.0 0.0 0.38 0.23 0.19 0.26 0.08 0.06 0.1 0.0 0.16
0.0 0.0 0.29 0.24 1.0 0.0 0.42 0.57 0.95 0.22 0.02 0.0 0.11 0.14 0.0
0.0 0.0 0.21 0.23 1.0 0.0 0.33 0.69 0.63 0.16 0.02 0.0 0.18 0.17 0.0
0.0 0.03 0.31 0.15 1.0 0.0 0.38 0.89 0.27 0.19 0.07 0.0 0.01 0.17 0.03
0.0 0.02 0.0 0.01 0.35 0.0 0.4 0.09 1.0 0.14 0.04 0.01 0.45 0.24 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.64 0.0 0.92 1.0 0.57 0.1 0.17 0.02 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.33 0.0 0.75 0.26 1.0 0.46 0.23 0.12 0.17 0.15 0.13
0.0 1.0 0.82 0.67 0.3 0.58 0.45 0.05 0.65 0.69 0.27 0.48 0.46 0.12 0.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.14 0.41 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.22 0.07 0.57 0.77 1.0 0.36 0.4 0.76 0.08 0.01 0.02 0.09 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.26 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0
0.0 1.0 0.26 0.0 0.07 0.0 0.09 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.01 0.0 0.45 0.0 0.44 0.34 0.58 0.28 0.13 0.02 0.03 0.4 0.02
0.0 0.19 0.0 0.0 0.4 0.0 0.49 0.06 1.0 0.47 0.06 0.02 0.04 0.17 0.04
0.0 0.94 0.0 0.0 0.68 0.0 0.51 0.04 1.0 0.73 0.08 0.02 0.01 0.17 0.11
0.0 0.24 0.0 0.0 0.41 0.0 0.48 0.06 1.0 0.55 0.06 0.02 0.04 0.11 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.56 0.07 1.0 0.65 0.06 0.0 0.69 0.37 0.0
0.0 0.11 0.0 0.0 0.35 0.0 0.43 0.04 1.0 0.48 0.05 0.02 0.08 0.28 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.12 0.38 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.05 0.13 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.26 1.0 0.0 0.05 0.21 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.98 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.6 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.18 0.0 0.34 0.0 0.1 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.43 0.16 0.83 0.16 1.0 0.74 0.61 0.3 0.32 0.1 0.06 0.45 0.21
0.05 0.25 0.38 0.17 1.0 0.58 0.66 1.0 0.44 0.24 0.06 0.17 0.29 0.01 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.35 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.04 0.45 0.6 1.0 0.02 0.11 0.06 0.06 0.0 0.19 0.02 0.05
0.25 0.0 0.15 0.37 0.16 0.0 0.53 0.0 0.1 0.05 0.15 0.04 1.0 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.25 1.0 0.0 0.92 0.06 0.25 0.25 0.21 0.26 0.04 0.0 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.59 0.0 0.62 0.21 0.25 0.3 0.26 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)