Heatmap: Cluster_40 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.0 0.12 0.12 1.0 0.0 0.3 0.37 0.61 0.83 0.17 0.42 0.79 0.0 0.07
0.0 0.01 0.08 0.04 0.61 0.0 0.38 0.35 0.29 0.36 0.13 0.22 1.0 0.02 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 1.0 0.0 0.04 0.06 0.04 0.2 0.56 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.44 0.57 0.0 0.96 0.16 0.09 0.19 0.55 0.9 1.0 0.15 0.03
0.0 0.41 0.22 0.57 0.52 0.36 1.0 0.32 0.3 0.27 0.5 0.54 0.43 0.29 0.02
0.0 0.13 0.13 0.36 0.74 0.22 1.0 0.32 0.2 0.19 0.55 0.99 0.95 0.16 0.01
0.0 0.0 0.56 0.0 0.36 1.0 0.3 0.15 0.18 0.28 0.73 0.28 0.59 0.18 0.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 1.0 0.0 0.24 0.0 0.26 0.11 0.11 0.0 0.0
0.0 0.08 0.05 0.04 1.0 0.03 0.64 0.11 0.35 0.14 0.13 0.03 0.18 0.0 0.08
0.0 0.07 0.0 0.0 1.0 0.0 0.73 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.15 0.0 0.01
0.0 0.17 0.03 0.0 1.0 0.0 0.78 0.04 0.17 0.13 0.12 0.01 0.45 0.0 0.05
0.0 0.02 0.03 0.02 0.86 0.0 1.0 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.23 0.0 0.01
0.0 0.11 0.08 0.05 1.0 0.0 0.88 0.14 0.2 0.26 0.65 0.2 0.92 0.04 0.32
0.2 0.01 0.04 0.17 0.32 0.0 0.27 0.1 0.35 0.22 0.12 1.0 0.01 0.01 0.77
0.34 0.0 0.03 0.21 0.35 0.0 0.26 0.18 0.28 0.39 0.1 0.9 0.0 0.0 1.0
1.0 0.01 0.18 0.31 0.22 0.0 0.14 0.05 0.13 0.02 0.08 0.04 0.09 0.0 0.1
0.36 0.0 0.14 1.0 0.05 0.46 0.39 0.01 0.05 0.15 0.07 0.03 0.01 0.0 0.22
0.23 0.0 0.0 0.65 0.14 1.0 0.97 0.11 0.03 0.06 0.15 0.11 0.15 0.0 0.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 1.0 0.02 0.0 0.29 0.08 0.34 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.02 0.44 0.0 1.0 0.07 0.01 0.17 0.12 0.31 0.29 0.02 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 1.0 0.07 0.03 0.04 0.17 0.07 0.18 0.0 0.34
0.01 0.01 0.07 0.03 0.76 0.1 1.0 0.18 0.09 0.23 0.14 0.24 0.57 0.06 0.17
0.0 0.06 0.28 0.03 0.63 0.04 0.52 0.12 0.21 0.15 1.0 0.74 0.61 0.0 0.21
0.0 0.0 0.14 0.0 0.48 0.0 0.22 1.0 0.42 0.04 0.53 0.44 0.16 0.0 0.49
0.07 0.67 0.0 0.0 0.15 0.0 1.0 0.03 0.39 0.0 0.24 0.35 0.06 0.13 0.17
0.0 0.72 0.77 0.05 0.35 0.17 0.56 0.67 1.0 0.14 0.09 0.35 0.02 0.0 0.16
0.0 0.05 0.27 0.43 0.31 0.0 0.18 0.38 1.0 0.38 0.12 0.16 0.51 0.0 0.13
0.0 0.1 0.09 0.0 0.38 1.0 0.51 0.12 0.1 0.18 0.16 0.2 0.67 0.02 0.29
0.0 0.04 0.0 0.0 1.0 0.0 0.33 0.27 0.24 0.02 0.03 0.09 0.41 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.88 1.0 0.0 0.0 0.25 0.06 0.02 0.03 0.16 0.21
0.0 0.12 0.0 0.0 0.66 0.0 1.0 0.13 0.01 0.25 0.04 0.03 0.03 0.0 0.0
0.0 0.36 0.28 1.0 0.32 0.22 0.32 0.46 0.47 0.33 0.26 0.35 0.4 0.24 0.23
0.0 0.01 0.0 0.1 0.39 0.36 0.36 0.16 0.28 0.09 0.07 1.0 0.09 0.16 0.08
0.0 0.0 0.04 0.0 0.9 0.22 1.0 0.53 0.86 0.17 0.15 0.73 0.88 0.13 0.02
1.0 0.17 0.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 1.0 0.0 0.42 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.0 0.03
0.18 0.12 0.66 0.78 0.83 1.0 0.91 0.02 0.0 0.76 0.03 0.0 0.03 0.13 0.0
0.81 1.0 0.05 0.2 0.15 0.0 0.64 0.31 0.03 0.35 0.14 0.0 0.54 0.0 0.0
0.0 0.77 0.0 0.0 0.42 0.0 1.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.19 0.0 0.0 1.0 0.0 0.62 0.0 0.06 0.11 0.09 0.0 0.07 0.16 0.0
0.2 0.65 0.0 0.0 1.0 0.0 0.67 0.0 0.07 0.16 0.09 0.0 0.04 0.15 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.57 0.0 0.54 0.38 0.32 0.83 0.18 0.67 0.0
0.0 0.02 0.02 0.03 0.33 0.54 1.0 0.07 0.0 0.08 0.04 0.0 0.01 0.0 0.02
0.0 0.15 0.36 0.22 0.71 0.29 0.83 0.18 0.49 0.57 0.35 0.15 1.0 0.54 0.16
1.0 0.29 0.0 0.31 0.05 0.0 0.18 0.07 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.33 0.44 0.0 1.0 0.21 0.1 0.04 0.24 0.03 0.06 0.04 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.0 0.01 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.02 0.0 1.0 0.0 0.03 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 1.0 0.14 0.0 0.0 0.16 0.32 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 1.0 0.03 0.0 0.0 0.14 0.04 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 1.0 0.07 0.0 0.02 0.24 0.09 0.09 0.0 0.0
0.0 0.1 0.32 0.4 1.0 0.0 0.4 0.16 0.1 0.3 0.22 0.26 0.26 0.0 0.04
0.0 0.6 0.63 0.52 0.69 0.27 0.65 0.55 1.0 0.33 0.22 0.26 0.73 0.02 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.08 0.03 0.02 0.06 0.02 0.06 0.0 0.0 0.03
0.2 1.0 0.0 0.43 0.15 0.0 0.58 0.23 0.03 0.0 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.22 0.5 0.0 0.17 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 1.0 0.25 0.01 0.02 0.07 0.07 0.1 0.62 0.0 0.01
0.0 0.0 0.14 0.12 0.77 0.99 0.96 0.17 0.59 0.33 0.28 0.18 0.64 0.0 1.0
0.0 0.09 0.15 0.0 0.37 0.0 0.54 0.07 1.0 0.67 0.44 0.31 0.42 0.04 0.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 1.0 0.0 0.1 0.0 0.12 0.18 0.0 0.0 0.0
0.12 1.0 0.0 0.26 0.11 0.0 0.47 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 1.0 0.12 0.02 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.1 0.04 1.0 0.01 0.16 0.15 0.03 0.15 0.37 0.23 0.26 0.0 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)