Heatmap: Cluster_72 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.13 0.32 0.33 0.38 0.41 0.59 0.37 0.39 0.49 0.27 1.0 0.17 0.4 0.78
0.02 0.13 0.23 0.34 0.24 0.68 0.52 0.31 0.35 0.54 0.63 0.84 1.0 0.91 0.96
0.02 0.15 0.18 0.48 0.17 0.3 0.35 0.43 0.22 0.34 0.32 1.0 0.29 0.41 0.85
0.0 0.18 0.21 0.59 0.31 0.62 0.52 0.22 0.39 0.68 0.62 0.82 0.51 0.41 1.0
0.03 0.48 0.4 0.43 0.73 0.66 0.93 0.73 0.65 0.69 0.87 0.73 1.0 0.76 0.9
0.02 0.22 0.15 0.22 0.35 0.32 0.47 0.4 0.51 0.62 0.8 0.9 0.57 0.5 1.0
0.02 0.19 0.36 0.51 0.43 0.35 0.49 0.59 0.48 0.5 0.43 1.0 0.37 0.32 0.7
0.12 0.28 0.66 0.81 0.26 0.29 0.5 0.53 0.42 0.51 0.91 0.98 0.73 0.42 1.0
0.02 0.2 0.2 0.46 0.52 0.66 0.61 0.74 0.52 0.69 0.97 1.0 0.56 0.49 0.85
0.0 0.57 0.61 1.0 0.53 0.71 0.62 0.68 0.44 0.53 0.65 0.84 0.77 0.71 0.91
0.02 0.23 0.38 0.47 0.3 0.4 0.44 0.56 0.28 0.5 0.35 1.0 0.44 0.37 0.69
0.01 0.61 0.52 0.58 0.55 0.42 0.59 0.55 0.65 0.57 0.57 1.0 0.57 0.51 0.86
0.01 0.26 0.63 0.69 0.41 0.68 1.0 0.51 0.63 0.65 0.96 0.6 0.98 0.72 0.73
0.03 0.56 0.66 0.95 0.49 0.51 0.59 0.6 0.44 0.58 0.43 1.0 0.42 0.45 0.75
0.0 0.35 0.47 0.67 0.32 0.72 0.59 0.57 0.41 0.49 0.54 1.0 0.52 0.71 0.79
0.0 0.74 1.0 0.52 0.3 0.86 0.63 0.44 0.26 0.53 0.57 0.54 0.88 0.46 0.71
0.0 0.63 0.64 0.46 0.25 0.7 0.54 0.35 0.36 0.67 0.63 0.73 1.0 0.58 0.84
0.0 0.34 0.34 0.62 0.16 0.57 0.45 0.22 0.42 0.53 0.74 0.9 1.0 0.68 0.48
0.02 0.9 0.87 0.48 0.52 1.0 0.73 0.71 0.55 0.62 0.65 0.62 0.76 0.53 0.91
0.0 0.57 0.39 0.34 0.47 0.59 0.66 0.8 0.57 0.6 0.41 1.0 0.83 0.29 0.87
0.0 0.92 0.99 0.61 0.38 0.67 0.58 0.52 0.66 0.58 0.65 0.75 1.0 0.43 0.67
0.0 0.65 0.6 0.55 0.52 0.71 0.68 0.65 0.68 0.58 0.6 1.0 0.55 0.55 0.73
0.14 0.85 0.64 0.81 0.64 0.73 0.69 0.88 0.6 0.65 0.58 0.87 0.57 0.53 1.0
0.0 0.66 0.69 0.71 0.6 0.63 0.78 0.79 0.63 0.6 0.61 0.88 0.49 0.63 1.0
0.03 0.28 0.36 1.0 0.26 0.32 0.44 0.3 0.33 0.36 0.45 0.72 0.39 0.39 0.65
0.0 0.16 0.47 0.53 0.28 0.59 0.48 0.48 0.56 0.6 0.37 1.0 0.28 0.52 0.92
0.02 0.33 0.53 0.59 0.45 0.47 0.52 0.45 0.42 0.61 0.82 1.0 0.67 0.77 0.88
0.06 0.32 0.46 0.77 0.38 0.34 0.55 0.47 0.43 0.54 0.62 0.93 0.67 0.69 1.0
0.0 0.26 0.49 0.65 0.18 1.0 0.49 0.32 0.14 0.28 0.45 0.75 0.19 0.07 0.48
0.0 0.4 0.53 0.56 0.4 0.58 0.66 0.56 0.53 0.54 0.65 0.87 1.0 0.43 0.93
0.39 0.51 0.56 0.61 0.38 0.45 0.57 0.41 0.5 0.55 0.42 1.0 0.52 0.46 0.95
0.03 0.87 0.84 0.78 0.58 1.0 0.84 0.87 0.66 0.68 0.6 0.87 0.56 0.4 0.87
0.1 0.65 0.63 0.59 0.48 0.85 0.77 0.67 0.63 0.68 0.64 0.77 0.47 0.33 1.0
0.0 0.61 1.0 0.57 0.42 0.54 0.62 0.61 0.39 0.47 0.53 0.64 0.73 0.48 0.51
0.05 0.58 0.54 1.0 0.54 0.62 0.71 0.63 0.67 0.68 0.71 0.97 0.78 0.65 0.79
0.0 0.48 0.58 1.0 0.4 0.53 0.55 0.61 0.45 0.59 0.42 0.97 0.55 0.54 0.85
0.0 0.14 0.22 0.55 0.34 0.53 0.39 0.5 0.35 0.45 0.41 1.0 0.34 0.56 0.79
0.0 0.25 0.4 0.43 0.16 0.31 0.4 0.25 0.39 0.47 0.35 1.0 0.28 0.24 0.71
0.0 0.28 0.49 0.87 0.43 0.95 0.92 0.51 0.51 0.63 0.65 1.0 0.6 0.57 0.92
0.0 0.31 0.46 0.78 0.33 0.38 0.43 0.57 0.25 0.34 0.54 1.0 0.63 0.8 0.8
0.0 0.51 0.41 0.6 0.43 1.0 0.64 0.51 0.49 0.64 0.55 0.72 0.52 0.51 0.89
0.31 0.38 0.28 0.56 0.05 0.0 0.33 0.1 0.22 0.27 0.63 0.94 0.75 0.54 1.0
0.0 0.1 0.2 0.54 0.26 0.22 0.38 0.4 0.47 0.44 0.64 0.74 0.3 0.16 1.0
0.0 0.47 0.42 0.49 0.39 0.47 0.47 0.54 0.45 0.5 0.54 1.0 0.52 0.4 0.68
0.0 0.19 0.33 0.62 0.33 1.0 0.54 0.41 0.48 0.51 0.46 0.64 0.45 0.5 0.65
0.07 0.39 0.94 0.83 0.26 1.0 0.68 0.32 0.46 0.46 0.68 0.68 0.6 0.49 0.73
0.07 0.43 0.81 0.83 0.28 1.0 0.65 0.37 0.51 0.47 0.73 0.74 0.74 0.59 0.69
0.0 0.4 0.5 0.98 0.46 1.0 0.59 0.78 0.5 0.55 0.83 0.99 0.57 0.63 0.81
0.06 0.27 0.41 0.63 0.56 0.95 0.68 0.55 0.39 0.57 0.91 0.97 0.6 0.7 1.0
0.1 0.39 0.5 0.66 0.68 1.0 0.67 0.57 0.49 0.61 0.9 0.87 0.55 0.9 0.76
0.0 0.38 0.29 0.53 0.27 0.36 0.4 0.6 0.47 0.41 0.4 0.96 0.38 0.42 1.0
0.0 0.16 0.23 0.44 0.23 0.3 0.41 0.28 0.31 0.4 0.45 1.0 0.4 0.51 0.68
0.0 0.55 0.65 0.75 0.47 0.64 0.73 0.59 0.5 0.58 0.56 1.0 0.59 0.44 0.83
0.06 0.51 0.48 0.64 0.59 0.68 0.69 0.69 0.56 0.6 0.55 1.0 0.43 0.52 0.84
0.0 0.41 0.38 0.58 0.31 0.6 0.45 0.54 0.39 0.43 0.52 1.0 0.45 0.43 0.57
0.01 0.52 0.49 0.63 0.45 0.77 0.62 0.71 0.53 0.57 0.51 1.0 0.49 0.36 0.84
0.0 0.25 0.38 0.5 0.49 0.93 0.9 0.53 0.73 0.65 0.68 0.79 0.53 0.69 1.0
0.02 0.35 0.46 0.51 0.42 0.57 0.48 0.7 0.52 0.51 0.49 1.0 0.45 0.31 0.78
0.0 0.56 0.38 0.6 0.4 0.64 0.53 0.57 0.44 0.54 0.39 1.0 0.45 0.45 0.68
0.0 0.1 0.24 0.4 0.32 0.15 0.41 0.62 0.46 0.45 0.43 1.0 0.65 0.45 0.98
0.03 0.45 0.54 0.54 0.33 1.0 0.69 0.35 0.45 0.42 0.67 0.68 0.56 0.48 0.77
0.0 0.2 0.36 0.79 0.22 0.65 0.63 0.27 0.41 0.66 0.6 0.93 0.62 0.76 1.0
0.0 0.55 0.6 0.71 0.58 0.64 0.59 0.68 0.55 0.56 0.6 1.0 0.64 0.46 0.64
0.0 0.14 0.21 0.45 0.19 0.47 0.41 0.35 0.29 0.4 0.44 1.0 0.41 0.4 0.75
0.04 0.87 0.74 0.85 0.56 1.0 0.85 0.67 0.55 0.66 0.78 0.7 0.83 0.69 0.76
0.13 0.44 0.42 0.57 0.47 0.31 0.45 0.67 0.6 0.55 0.41 1.0 0.45 0.25 0.85
0.0 0.08 0.2 0.16 0.3 0.28 0.47 0.43 0.39 0.35 0.21 1.0 0.24 0.29 0.74
0.0 0.11 0.24 0.26 0.4 0.39 0.5 0.67 0.53 0.47 0.27 0.93 0.58 0.24 1.0
0.0 0.27 0.61 1.0 0.51 0.45 0.56 0.44 0.53 0.57 0.44 0.81 0.61 0.34 0.73
0.0 0.59 0.55 0.54 0.22 1.0 0.63 0.35 0.35 0.63 0.49 0.53 0.56 0.52 0.71
0.0 0.38 0.55 0.86 0.55 0.8 0.66 0.66 0.52 0.6 0.68 0.84 0.65 0.65 1.0
0.0 0.15 0.33 0.61 0.47 0.54 0.68 0.58 0.57 0.69 0.69 0.67 0.57 0.58 1.0
0.0 0.51 0.65 1.0 0.59 0.7 0.9 0.89 0.58 0.74 0.77 0.97 0.71 0.67 0.83
0.0 0.38 0.29 0.54 0.23 0.33 0.32 0.37 0.28 0.33 0.37 1.0 0.42 0.35 0.59
0.0 1.0 0.93 0.41 0.41 0.78 0.64 0.59 0.44 0.44 0.49 0.53 0.6 0.29 0.64
0.34 0.36 0.47 0.94 0.24 0.5 0.49 0.44 0.32 0.36 0.44 1.0 0.39 0.56 0.86
0.0 0.49 0.59 0.74 0.54 0.91 0.8 0.76 0.68 0.67 0.63 1.0 0.6 0.61 0.88
0.05 0.88 0.3 0.56 0.39 0.56 0.52 0.7 0.69 0.46 0.46 1.0 0.53 0.33 0.92
0.0 0.18 0.14 0.39 0.21 0.25 0.32 0.43 0.15 0.27 0.2 1.0 0.16 0.2 0.53
0.0 0.45 0.45 0.69 0.62 0.77 0.85 0.98 0.79 0.67 0.66 1.0 0.57 0.85 0.86
0.21 0.36 0.52 0.71 0.42 0.46 0.52 0.48 0.44 0.5 0.54 1.0 0.45 0.46 0.83
0.0 0.45 0.48 0.49 0.36 0.65 0.49 0.55 0.34 0.44 0.38 1.0 0.48 0.48 0.76
0.01 0.45 0.47 0.6 0.4 0.61 0.66 0.7 0.67 0.72 0.56 0.95 0.7 0.66 1.0
0.1 0.24 0.2 0.42 0.14 0.0 0.19 0.25 0.36 0.23 0.29 1.0 0.43 0.23 0.34
0.0 0.4 0.41 0.87 0.39 0.93 0.75 0.51 0.39 0.58 0.7 1.0 0.74 0.74 0.84
0.18 0.28 0.33 0.61 0.29 0.55 0.65 0.42 0.54 0.55 0.56 0.79 0.32 0.17 1.0
0.06 0.68 0.54 0.64 0.39 1.0 0.61 0.54 0.44 0.57 0.65 0.73 0.6 0.62 0.64
0.0 0.4 0.38 0.48 0.3 0.45 0.45 0.52 0.31 0.5 0.39 1.0 0.33 0.35 0.69
0.0 0.45 0.49 0.58 0.29 0.53 0.45 0.43 0.31 0.47 0.38 1.0 0.31 0.33 0.64
0.0 1.0 0.54 0.66 0.54 0.87 0.69 0.86 0.55 0.58 0.6 0.86 0.69 0.51 0.69
0.0 0.38 0.42 0.47 0.31 0.35 0.48 0.39 0.32 0.34 0.53 0.83 0.6 0.39 1.0
0.0 0.19 0.32 0.41 0.2 0.16 0.4 0.43 0.26 0.34 0.31 1.0 0.1 0.15 0.64
0.0 0.51 0.52 0.74 0.33 0.33 0.46 0.35 0.42 0.36 0.47 1.0 0.43 0.37 0.95
0.0 0.41 0.47 0.62 0.57 0.6 0.64 0.74 0.7 0.64 0.63 0.95 0.62 0.53 1.0
0.01 0.47 0.41 0.73 0.49 0.61 0.66 0.68 0.53 0.57 0.62 1.0 0.57 0.73 0.93
0.89 0.48 0.9 1.0 0.55 0.83 0.73 0.65 0.54 0.57 0.76 0.74 0.62 0.78 0.74
0.08 0.24 0.34 0.4 0.42 0.42 0.52 0.49 0.46 0.44 0.45 1.0 0.6 0.42 0.55
0.0 0.51 0.74 1.0 0.39 0.92 0.97 0.42 0.47 0.6 0.96 0.53 0.9 0.86 0.82
0.05 0.25 0.48 0.79 0.24 0.83 0.69 0.34 0.51 0.53 0.75 0.86 1.0 0.48 0.69
0.0 0.62 0.74 0.9 0.42 0.54 0.74 0.56 0.68 0.65 0.62 0.9 0.46 0.36 1.0
0.0 0.09 0.24 0.31 0.28 0.76 0.44 0.48 0.26 0.53 0.34 1.0 0.29 0.28 0.75
0.01 0.09 0.11 0.19 0.22 0.25 0.35 0.17 0.46 0.45 0.75 1.0 0.44 0.54 0.67
0.04 0.49 0.5 0.57 0.34 0.44 0.74 0.46 0.56 0.5 0.79 0.87 1.0 0.55 0.93
0.04 1.0 0.88 0.57 0.44 0.95 0.71 0.66 0.59 0.57 0.6 0.6 0.61 0.51 0.72
0.0 0.17 0.22 0.29 0.24 0.32 0.36 0.55 0.46 0.37 0.34 0.42 0.48 0.42 1.0
0.51 0.05 0.03 1.0 0.04 0.0 0.11 0.02 0.17 0.4 0.65 0.77 0.1 0.3 0.23
0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.0 0.13 0.03 0.22 0.33 0.4 0.52 0.03 0.1 0.42
0.03 0.2 0.37 0.56 0.33 0.76 0.58 0.85 0.5 0.49 0.65 0.82 0.84 0.83 1.0
0.01 0.76 0.7 0.61 0.49 0.55 0.71 0.53 0.57 0.61 0.72 0.96 0.76 0.68 1.0
0.17 0.05 0.27 0.45 0.22 0.17 0.42 0.35 0.51 0.42 0.52 0.59 0.19 0.01 1.0
0.02 0.29 0.39 0.47 0.19 0.19 0.62 0.31 0.5 0.49 0.45 1.0 0.2 0.36 0.81

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)