Heatmap: Cluster_48 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
1.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.61 0.11 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.1 1.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.31 1.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.53 1.0 0.08 0.06 0.03 0.06 0.05 0.03 0.06 0.04 0.09 0.05 0.01 0.06
0.97 0.01 1.0 0.14 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 1.0 0.04 0.14 0.0 0.02 0.19 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.08 0.89 0.43 0.09 0.17 0.41 0.14 0.0 0.09 0.05 0.1 0.09 0.07 0.0
1.0 0.0 0.74 0.0 0.01 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.33 0.0 0.04 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.18 0.7 1.0 0.04 0.0 0.07 0.0 0.03 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01
0.0 0.35 1.0 0.28 0.09 0.0 0.03 0.23 0.01 0.02 0.02 0.29 0.06 0.0 0.14
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.44 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.86 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.45 0.42 0.05 0.0 0.26 0.0 0.05 0.0 0.01 0.22 0.02 0.08 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.16 0.07 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.33 1.0 0.13 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
1.0 0.03 0.77 0.01 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.37 0.37 0.0 0.0 0.28 0.0 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.0 1.0 0.17 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 0.0 0.75 1.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.46 0.06 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.93 0.01 1.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.11 0.46 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 0.01 1.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 0.88 1.0 0.0 0.04 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.48 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.81 1.0 0.03 0.03 0.04 0.04 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.06
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0
1.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.1 1.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.02 0.03 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.86 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 1.0 0.24 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.11 0.64 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.17 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.65 1.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.45 0.74 1.0 0.01 0.0 0.51 0.0 0.11 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.0 1.0 0.7 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.18 1.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.71 0.2 0.02 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.1 0.26 0.16 0.01 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0
1.0 0.08 0.33 0.27 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.79 1.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.36 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.41 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.45 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)