Heatmap: Cluster_5 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.1 0.28 0.17 0.14 0.24 0.23 0.17 0.22 0.28 1.0 0.26 0.33 0.56
0.0 0.01 0.21 0.07 0.4 0.2 0.7 0.19 0.1 0.31 0.07 1.0 0.36 0.06 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.26 0.22 0.3 0.15 0.13 0.22 0.27 0.16 0.23 0.29 1.0 0.38 0.51 0.43
0.02 0.07 0.04 0.11 0.06 0.07 0.1 0.08 0.07 0.22 0.24 1.0 0.22 0.25 0.83
0.0 0.71 0.63 0.07 0.01 0.0 0.06 0.07 0.02 0.04 0.02 1.0 0.14 0.0 0.17
0.0 0.37 1.0 0.12 0.03 0.0 0.07 0.49 0.0 0.09 0.01 1.0 0.19 0.0 0.14
0.0 0.22 0.77 0.31 0.03 0.0 0.11 0.15 0.0 0.08 0.01 1.0 0.13 0.01 0.18
0.0 0.05 0.08 0.13 0.08 0.12 0.05 0.08 0.02 0.14 0.02 1.0 0.03 0.0 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.14 0.18 0.25 0.09 0.38 0.24 0.22 0.08 0.34 0.15 1.0 0.49 0.13 0.36
0.0 0.37 0.05 0.06 0.02 0.0 0.21 0.0 0.07 0.11 0.07 1.0 0.02 0.0 0.48
0.07 0.5 0.43 0.35 0.01 0.0 0.07 0.0 0.03 0.04 0.04 1.0 0.02 0.0 0.32
0.25 0.41 0.72 0.55 0.02 0.0 0.12 0.0 0.09 0.11 0.06 1.0 0.02 0.05 0.27
0.0 1.0 0.47 0.08 0.24 0.57 0.44 0.18 0.52 0.31 0.45 0.75 0.26 0.16 0.31
0.0 0.29 0.16 0.31 0.14 0.12 0.38 0.39 0.41 0.25 0.32 1.0 0.38 0.31 0.6
0.0 0.2 0.01 0.05 0.03 0.04 0.18 0.05 0.58 0.24 0.19 1.0 0.38 0.06 0.26
0.0 0.02 0.0 0.04 0.01 0.02 0.07 0.01 0.4 0.12 0.08 1.0 0.25 0.03 0.1
0.01 0.24 0.21 0.23 0.33 0.26 0.44 0.23 0.38 0.41 0.32 1.0 0.35 0.14 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.07 0.01 0.01 0.05 1.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.3 0.01 0.01 0.25 0.03 1.0 0.01 0.02 0.52
0.0 0.13 0.23 0.36 0.22 0.29 0.3 0.26 0.35 0.34 0.48 1.0 0.32 0.4 0.48
0.0 1.0 0.26 0.17 0.05 0.02 0.22 0.03 0.17 0.15 0.02 0.59 0.03 0.02 0.56
0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.02 0.16 0.03 0.12 0.19 0.01 1.0 0.02 0.0 0.44
0.0 0.0 0.01 0.05 0.01 0.0 0.05 0.02 0.0 0.08 0.01 1.0 0.04 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 1.0 0.01 0.0 0.14
0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.2 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.01 1.0 0.04 0.0 0.24
0.0 1.0 0.92 0.35 0.07 0.0 0.13 0.11 0.04 0.25 0.12 0.72 0.13 0.04 0.18
0.0 0.14 0.03 0.12 0.03 0.0 0.04 0.14 0.02 0.11 0.05 1.0 0.06 0.05 0.12
0.0 0.02 0.16 1.0 0.09 0.0 0.17 0.37 0.1 0.34 0.46 0.83 0.28 0.43 0.67
0.0 0.01 0.01 0.07 0.03 0.0 0.1 0.34 0.04 0.21 0.21 1.0 0.06 0.21 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.15 0.04 1.0 0.09 0.0 0.77
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 1.0 0.01 0.0 0.01
0.0 0.08 0.09 0.52 0.02 0.08 0.06 0.06 0.05 0.09 0.05 1.0 0.15 0.03 0.13
0.0 0.01 0.08 0.11 0.14 0.0 0.05 0.07 0.2 0.11 0.02 1.0 0.12 0.02 0.03
0.0 0.09 0.06 0.27 0.03 0.0 0.07 0.27 0.04 0.11 0.02 1.0 0.06 0.0 0.15
0.0 0.0 0.12 0.0 0.06 0.0 0.01 0.21 0.01 0.02 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.05 0.03 0.08 0.01 0.03 1.0 0.22 0.07 0.86
0.0 0.03 0.08 0.05 0.0 0.0 0.06 0.01 0.05 0.08 0.04 1.0 0.09 0.01 0.49
0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.02 0.02 0.03 0.01 0.07 0.01 1.0 0.06 0.02 0.1
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.73 1.0 0.04 0.02 0.0 0.11 0.02 0.0 0.08 0.01 0.67 0.01 0.01 0.22
0.0 0.28 0.54 0.05 0.01 0.01 0.08 0.03 0.0 0.05 0.01 1.0 0.02 0.01 0.13
0.0 0.35 0.62 0.76 0.49 1.0 0.73 0.37 0.74 0.7 0.69 0.5 0.6 0.79 0.54
0.0 0.01 0.01 0.11 0.03 0.0 0.04 0.16 0.01 0.14 0.03 1.0 0.04 0.04 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.08 0.04 0.55 0.24 0.08 0.06 0.26 0.1 1.0 0.39 0.21 0.28
0.26 0.15 0.1 0.23 0.15 0.28 0.19 0.15 0.13 0.18 0.18 1.0 0.16 0.17 0.39
0.0 0.46 0.51 0.33 0.05 0.0 0.08 0.35 0.03 0.05 0.02 1.0 0.08 0.0 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.12 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.4 0.31 0.49 0.16 0.14 0.25 0.25 0.24 0.34 0.2 1.0 0.2 0.18 0.39
0.01 0.15 0.12 0.12 0.12 0.28 0.19 0.22 0.2 0.26 0.26 1.0 0.36 0.14 0.26
0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.05 0.07 0.0 0.1 0.04 1.0 0.12 0.09 0.37
0.0 0.0 0.14 0.05 0.05 0.0 0.05 0.03 0.04 0.05 0.03 1.0 0.09 0.0 0.17
0.0 0.19 0.2 0.12 0.24 0.26 0.35 0.69 0.34 0.45 0.38 1.0 0.28 0.33 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.04 0.27 0.0 0.52 0.04 0.07 0.24 0.03 1.0 0.07 0.01 0.03
0.0 0.03 0.07 0.12 0.25 0.37 0.43 0.39 0.1 0.19 0.15 1.0 0.14 0.02 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.3 0.09 1.0 0.08 0.04 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.05 0.02 0.09 0.01 0.01 1.0 0.02 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.31 0.09 1.0 0.08 0.01 0.93
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 1.0 0.06 0.0 0.03
0.0 0.03 0.1 0.05 0.06 0.0 0.02 0.06 0.11 0.2 0.04 1.0 0.08 0.03 0.59
0.0 0.0 0.01 0.14 0.08 0.0 0.15 0.09 0.12 0.08 0.16 1.0 0.29 0.15 0.37
0.0 0.55 0.61 0.1 0.15 0.19 0.3 0.07 0.01 0.25 0.08 1.0 0.1 0.17 0.35
0.0 0.2 0.21 1.0 0.05 0.02 0.14 0.05 0.03 0.13 0.06 0.52 0.07 0.03 0.14
0.0 0.01 0.02 0.1 0.02 0.0 0.06 0.08 0.05 0.09 0.04 1.0 0.07 0.01 0.34
0.0 0.11 0.1 0.22 0.03 0.01 0.07 0.05 0.06 0.14 0.07 1.0 0.1 0.04 0.35
0.0 0.0 0.0 0.11 0.01 0.0 0.03 0.06 0.0 0.05 0.02 1.0 0.07 0.07 0.51
0.0 0.05 0.45 1.0 0.12 0.0 0.06 0.04 0.0 0.01 0.02 0.69 0.0 0.0 0.0
0.57 0.08 0.05 0.12 0.07 0.0 0.27 0.07 0.07 0.07 0.13 1.0 0.06 0.1 0.0
0.0 0.0 0.03 0.08 0.02 0.0 0.02 0.07 0.0 0.07 0.02 1.0 0.05 0.03 0.19
0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.09 0.07 0.09 0.11 0.02 1.0 0.06 0.02 0.48
0.31 0.09 0.15 1.0 0.08 0.2 0.07 0.11 0.05 0.05 0.12 0.51 0.1 0.04 0.03
0.0 0.09 0.03 0.0 0.11 0.06 0.34 0.28 0.19 0.3 0.11 1.0 0.11 0.17 0.42
0.0 0.07 0.1 0.59 0.06 0.11 0.16 0.25 0.04 0.24 0.24 1.0 0.37 0.35 0.34
0.16 0.49 0.33 0.25 0.02 0.0 0.07 0.0 0.01 0.11 0.01 1.0 0.03 0.0 0.17
0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.07 0.05 0.13 0.07 0.06 1.0 0.11 0.0 0.29
0.0 0.02 0.01 0.0 0.05 0.0 0.05 0.02 0.15 0.42 0.26 1.0 0.25 0.01 0.04
0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.07 0.03 0.11 0.29 0.1 1.0 0.12 0.02 0.89
0.0 0.55 0.48 0.2 0.18 0.13 0.28 0.54 0.21 0.37 0.28 1.0 0.14 0.19 0.27
0.03 0.27 0.29 0.45 0.49 0.7 0.73 0.34 0.64 0.55 0.78 1.0 0.84 0.48 0.53
0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.34 0.0 0.18 0.05 1.0 0.04 0.0 0.42
0.0 0.01 0.65 0.0 0.03 0.0 0.03 0.08 0.0 0.18 0.03 1.0 0.04 0.0 0.52
0.0 0.01 0.04 0.18 0.01 0.0 0.04 0.0 0.01 0.18 0.03 1.0 0.01 0.17 0.06
0.25 0.0 0.14 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.32 1.0 0.09 0.24 0.33
0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.11 1.0 0.0 0.0 0.2
0.46 0.26 0.2 0.18 0.04 0.0 0.05 0.08 0.27 0.36 0.34 1.0 0.33 0.28 0.84
0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.04 0.01 0.03 0.01 1.0 0.09 0.0 0.08
0.0 1.0 0.71 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.08 0.08 0.02 0.36 0.12 0.0 0.1
0.0 0.39 0.05 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.16 0.05 1.0 0.04 0.0 0.49
0.31 0.13 0.49 0.22 0.05 0.53 0.09 0.03 0.08 0.15 0.1 1.0 0.05 0.01 0.28
0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.09 0.22 0.23 1.0 0.09 0.0 0.12
0.0 0.11 0.1 0.01 0.06 0.0 0.07 0.05 0.16 0.09 0.13 1.0 0.1 0.01 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.26 1.0 0.1 0.0 0.08
0.0 0.05 0.0 0.03 0.02 0.0 0.05 0.01 0.19 0.13 0.29 1.0 0.19 0.0 0.09
0.0 0.54 0.52 0.42 0.23 0.29 0.45 0.56 0.28 0.32 0.33 1.0 0.35 0.13 0.4
0.0 0.05 0.04 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.21 0.06 1.0 0.06 0.0 0.4
0.0 0.06 0.07 0.05 0.06 0.11 0.28 0.11 0.42 0.37 0.2 1.0 0.35 0.1 0.26
0.0 0.01 0.0 0.01 0.07 0.0 0.19 0.09 0.2 0.08 0.26 1.0 0.08 0.02 0.01
0.0 0.04 0.0 0.0 0.15 0.0 0.14 0.12 0.11 0.04 0.18 1.0 0.07 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.08 0.17 0.02 0.86 0.01 0.0 1.0
0.0 0.32 0.03 0.08 0.04 0.15 0.08 0.27 0.19 0.2 0.02 1.0 0.04 0.02 0.43
0.0 0.03 0.06 0.09 0.14 0.32 0.28 0.22 0.07 0.34 0.15 1.0 0.24 0.15 0.37
0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.0 0.04 0.03 0.14 0.07 0.06 1.0 0.11 0.16 0.02
0.0 0.25 0.2 0.13 0.18 0.0 0.15 0.23 0.36 0.31 0.12 1.0 0.15 0.06 0.58
0.01 0.0 0.04 0.38 0.19 0.0 0.02 0.03 0.1 0.0 0.02 1.0 0.02 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.02 1.0 0.0 0.0 0.01
0.0 1.0 0.03 0.0 0.06 0.2 0.02 0.42 0.0 0.17 0.04 0.84 0.08 0.0 0.27
0.0 1.0 0.31 0.3 0.05 0.0 0.09 0.13 0.21 0.12 0.02 0.54 0.02 0.01 0.21
0.0 0.1 1.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.11 0.0 0.02 0.0 0.47 0.5 0.44 1.0 0.19 0.0 0.0
0.0 0.04 0.01 0.1 0.02 0.07 0.36 0.06 0.13 0.19 0.2 1.0 0.06 0.1 0.35
0.0 0.01 0.1 0.08 0.06 0.83 0.11 0.06 0.07 0.15 0.04 1.0 0.03 0.06 0.24
0.0 0.11 0.01 0.05 0.15 0.09 0.15 0.18 0.15 0.27 0.13 1.0 0.2 0.19 0.31
0.0 0.01 0.01 0.17 0.15 0.18 0.42 0.16 0.14 0.24 0.41 1.0 0.52 0.36 0.94
0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 1.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.04 1.0 0.05 0.03 0.0 0.05 0.2 0.0 0.07 0.01 0.42 0.04 0.0 0.2
0.0 0.46 0.61 0.57 0.1 0.15 0.22 0.18 0.22 0.24 0.22 1.0 0.14 0.29 0.18
0.0 0.14 0.31 0.39 0.46 1.0 0.69 0.33 0.62 0.66 0.57 0.58 0.55 0.48 0.64
0.0 0.89 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.55 0.5 0.43 0.26 0.94 0.25 0.91 0.39 0.22 0.41 1.0 0.26 0.21 0.59
0.0 0.15 0.06 0.23 0.03 0.0 0.08 0.26 0.11 0.24 0.03 1.0 0.06 0.03 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)