Heatmap: Cluster_225 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.41 1.0 0.22 0.08 0.12 0.12 0.36 0.17 0.18 0.3 0.11 0.26 0.15 0.04
0.0 0.26 0.75 1.0 0.11 0.07 0.24 0.32 0.34 0.36 0.55 0.53 0.6 0.2 0.23
0.44 0.39 1.0 0.21 0.29 0.55 0.46 0.56 0.2 0.62 0.63 0.24 0.4 0.3 0.25
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.01 0.02 0.04 0.05 0.01 0.03 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.04
0.0 0.96 1.0 0.5 0.24 0.61 0.51 0.38 0.75 0.78 0.62 0.27 0.67 0.28 0.49
0.0 0.39 1.0 0.62 0.49 0.55 0.42 0.61 0.39 0.52 0.51 0.11 0.44 0.41 0.25
0.05 1.0 0.42 0.13 0.09 0.07 0.18 0.19 0.08 0.07 0.22 0.13 0.18 0.07 0.08
0.15 1.0 0.77 0.36 0.33 0.52 0.41 0.52 0.43 0.33 0.44 0.36 0.35 0.26 0.46
0.8 1.0 0.51 0.5 0.09 0.09 0.17 0.15 0.03 0.53 0.3 0.12 0.23 0.24 0.05
0.0 0.2 0.35 0.44 0.62 0.23 0.51 1.0 0.5 0.5 0.81 0.14 0.41 0.36 0.2
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.2 1.0 0.25 0.12 0.22 0.16 0.14 0.33 0.29 0.38 0.16 0.49 0.15 0.08
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.01 0.4 0.42 0.44 0.34 0.66 0.41 0.61 0.38 0.46 1.0 0.87 0.7 0.58 0.57
0.0 0.27 0.01 0.08 0.42 0.0 0.22 0.57 0.39 0.25 1.0 0.05 0.79 0.34 0.03
0.07 0.6 1.0 0.11 0.12 0.06 0.13 0.24 0.22 0.14 0.3 0.04 0.14 0.04 0.04
0.0 0.29 0.65 0.06 0.41 0.0 0.29 0.51 1.0 0.19 0.96 0.15 0.31 0.03 0.18
0.26 0.47 1.0 0.13 0.26 0.07 0.27 0.26 0.64 0.19 0.76 0.11 0.16 0.04 0.15
0.22 0.62 0.61 0.42 0.47 1.0 0.69 0.68 0.6 0.42 0.64 0.31 0.62 0.47 0.29
0.44 1.0 0.72 0.3 0.28 0.32 0.28 0.42 0.27 0.33 0.48 0.21 0.3 0.25 0.23
0.0 0.7 0.92 0.63 0.24 1.0 0.35 0.26 0.08 0.19 0.23 0.14 0.28 0.1 0.15
0.0 0.4 0.45 0.31 0.37 1.0 0.51 0.45 0.13 0.24 0.42 0.27 0.24 0.17 0.19
0.2 0.47 0.74 0.53 0.8 0.58 0.74 1.0 0.88 0.6 0.79 0.67 0.82 0.39 0.73
0.03 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.88 0.81 0.61 0.37 0.28 0.35 0.71 0.55 0.56 1.0 0.49 0.48 0.74 0.33
0.0 0.18 1.0 0.14 0.29 0.11 0.35 0.29 0.4 0.57 0.31 0.06 0.13 0.07 0.02
0.0 0.13 1.0 0.25 0.09 0.03 0.05 0.03 0.05 0.05 0.07 0.11 0.02 0.16 0.02
0.38 0.99 1.0 0.81 0.77 0.64 0.91 0.68 0.84 0.79 0.92 0.69 0.87 0.72 0.87
0.13 1.0 0.73 0.8 0.38 0.68 0.39 0.98 0.5 0.44 0.78 0.62 0.65 0.39 0.45
0.0 0.0 1.0 0.32 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01
0.0 0.0 1.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.32 0.0 0.51 1.0 0.93 0.0 0.08 0.17 0.0
0.0 0.0 0.04 0.28 0.04 0.33 0.44 0.04 0.67 0.79 1.0 0.03 0.29 0.31 0.16
0.0 0.15 1.0 0.32 0.02 0.15 0.15 0.06 0.13 0.23 0.22 0.1 0.17 0.22 0.08
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.77 0.68 0.71 0.52 0.9 0.59 1.0 0.45 0.66 0.8 0.39 0.57 0.45 0.34
0.03 0.04 1.0 0.29 0.7 0.38 0.59 0.25 0.12 0.09 0.31 0.12 0.54 0.15 0.09
0.0 0.01 0.27 0.07 0.5 0.24 0.47 0.16 0.18 0.12 0.66 0.23 1.0 0.42 0.17
0.0 1.0 0.43 0.22 0.24 0.47 0.49 0.37 0.2 0.41 0.25 0.1 0.25 0.09 0.18
0.05 0.74 0.83 0.52 0.25 0.67 0.63 0.39 0.8 0.78 0.59 0.51 0.55 0.53 1.0
0.51 0.84 1.0 0.55 0.46 0.78 0.62 0.59 0.71 0.65 0.77 0.48 0.8 0.5 0.7
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.55 0.27 0.33 0.45 0.41 0.31 0.38 0.33 0.47 0.3 0.42 0.34 0.3
0.02 0.73 0.43 1.0 0.31 0.14 0.23 0.64 0.16 0.58 0.41 0.15 0.2 0.2 0.13
0.01 0.6 0.46 1.0 0.38 0.24 0.26 0.25 0.19 0.33 0.52 0.12 0.26 0.12 0.1
0.02 0.09 1.0 0.13 0.13 0.04 0.06 0.16 0.04 0.03 0.02 0.05 0.02 0.01 0.04
0.0 0.71 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0
0.1 0.73 0.56 1.0 0.05 0.05 0.07 0.25 0.08 0.1 0.2 0.07 0.28 0.08 0.07
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 1.0 0.14 0.18 0.11 0.18 0.61 0.19 0.33 0.73 0.16 0.36 0.13 0.11
0.02 1.0 0.42 0.34 0.35 0.32 0.29 0.27 0.35 0.47 0.64 0.37 0.35 0.3 0.3
0.16 1.0 0.86 0.57 0.37 0.74 0.55 0.45 0.57 0.47 0.77 0.78 0.57 0.81 0.77
0.07 1.0 0.87 0.3 0.41 0.35 0.41 0.45 0.42 0.43 0.38 0.33 0.53 0.19 0.42
0.01 0.78 1.0 0.54 0.5 0.6 0.63 0.37 0.52 0.75 0.68 0.63 0.8 0.31 0.99
0.02 0.25 1.0 0.3 0.34 0.06 0.15 0.1 0.23 0.11 0.22 0.23 0.1 0.41 0.12
0.0 0.17 1.0 0.06 0.04 0.0 0.07 0.03 0.06 0.05 0.02 0.24 0.01 0.0 0.0
0.05 0.91 1.0 0.42 0.29 0.52 0.31 0.69 0.31 0.35 0.49 0.29 0.41 0.27 0.26
0.02 0.82 0.57 0.59 0.67 1.0 0.8 0.85 0.71 0.62 0.69 0.48 0.76 0.72 0.5
0.0 0.02 1.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.06 0.05 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.01 0.02 0.12 0.03 0.0 0.03 0.0 0.21 0.0 0.04 0.08 0.0
0.39 1.0 0.92 0.59 0.61 0.7 0.73 0.74 0.71 0.73 0.65 0.37 0.6 0.38 0.37
0.0 0.07 1.0 0.55 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.85 0.45 0.33 0.75 0.56 0.57 0.51 0.47 0.71 0.18 0.43 0.25 0.32
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.46 0.59 1.0 0.58 0.6 0.66 0.69 0.49 0.65 0.74 0.61 0.49 0.59 0.4
0.0 0.4 0.69 0.29 0.38 0.38 0.29 0.73 0.39 1.0 0.73 0.21 0.69 0.13 0.25
0.0 0.28 1.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.12 1.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.99 1.0 0.39 0.47 0.41 0.47 0.57 0.45 0.37 0.38 0.31 0.52 0.17 0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)