1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_17 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
3.4 -3.02 1.3 -0.3 - - -1.14 - -7.36 - -3.7 - -1.15 - -4.0
3.37 - 1.69 -0.29 - - -0.7 - - - -5.52 - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.44 - 0.56 1.27 - - -1.88 - - - -9.18 - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.87 - -2.16 - -7.36 - - - - -3.48 -3.55 - - - -
3.86 - - - - - -0.97 - - - - - - - -
- - - - 1.63 - 2.02 2.13 0.73 - 0.84 - - - -
3.41 - - 1.45 -0.6 - - - -0.32 - -2.2 - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.89 - -2.64 - -8.36 - - - -7.11 - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.78 - 0.33 - - - - - - - - - - - -
3.86 - - - - - - - - - -1.0 - - - -
3.76 -2.77 0.02 -1.95 -12.28 - -3.83 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
- -3.74 -0.42 -6.27 0.57 - -2.13 -0.96 1.38 0.65 2.24 -0.34 0.37 -0.51 -1.88
3.69 -1.38 0.61 - - - - - - - -3.59 - -3.78 - -
3.89 -2.57 - - - - - - - - - - - - -
3.74 -4.03 0.58 -5.97 -6.2 - -8.32 - -7.67 - -8.57 - -6.79 - -7.65
3.68 -1.6 0.82 -5.84 -7.05 - -6.72 - -8.13 -7.79 -6.3 - -9.02 - -8.15
3.87 - - - - - - - - - -1.25 - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.74 -0.16 -0.91 - -4.93 - - - -2.85 - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.61 - - - - - 3.09 - 2.55 - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.82 -2.84 -5.57 -0.46 - - -6.05 - - - - - - - -
- - - 3.87 -4.46 - - - - - -1.5 - - - -
3.8 -3.75 -1.1 -1.15 - - -4.88 - - - -10.18 - - - -
3.78 -4.48 -0.8 -0.76 - - -3.63 - - - -10.64 - - - -
- - - - 0.96 - - - 2.07 - 3.14 - - - -
3.86 - - - -6.64 - -1.57 - -4.36 -3.89 -7.26 - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.88 -2.09 - - - - - - - - - - - - -
3.89 -2.61 - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.89 -2.66 - - -5.65 - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 3.91 - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
- 1.98 1.35 0.79 -0.67 - -0.74 -1.04 -0.79 -0.7 0.89 -0.4 0.35 - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.9 - - - - - - - - - -5.66 - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.89 - - - -3.01 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - - -
- 2.13 - - -2.5 - - - 1.29 - -0.58 2.87 - - -
3.82 -2.21 -0.68 - -10.54 - -7.78 - -5.01 - -9.76 -5.36 - - -
3.85 - - - - - - - - - -1.38 - -2.69 - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.9 - - - -6.5 - - - - - -5.87 - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.76 - - - - - - 0.1 -1.34 - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.7 -1.83 0.38 -1.78 -3.9 - -3.85 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.75 -1.15 0.07 -4.5 - - -6.0 - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.3 - - - - - - - - - - 2.36 - - -
3.77 - 0.43 - - - - - - - - - - - -
3.88 - -2.51 - - - -3.29 - - - - - - - -
3.89 -2.55 - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.89 -3.24 - - -8.19 - - - - - - -5.12 - - -
3.65 - 1.2 - - - -2.99 - - - - - - - -
3.8 -2.73 -0.67 -2.01 - - -4.94 - - - - - - - -
3.77 - 0.41 - - - - - - - - - - - -
2.91 2.91 - - - - - - - - - - - - -
3.9 -3.39 - - - - - - - - - - - - -
3.88 -1.99 -4.07 - - - - - - - -8.83 - -9.18 - -
3.65 - 1.29 - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.9 -3.79 -5.06 - - - - - - - - - - - -
3.88 - -2.07 - -8.6 - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - -8.07 - - - - - - - - - -
3.02 -0.74 1.9 -1.45 -2.34 - -2.42 -2.76 -1.13 -2.65 -2.79 -2.77 -1.28 -1.89 -3.56
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.51 - 1.85 - - - - - - - - - - - -
3.91 - - - - - - - - - - - - - -
3.7 - 0.91 - -3.21 - - - - - - - - - -
3.55 - -4.7 -1.97 -3.23 - - -1.8 -1.7 -1.1 -1.13 -0.16 -1.75 - -2.55
3.88 - - - -2.06 - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.