Heatmap: Cluster_187 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.01 0.46 0.69 0.53 0.93 0.67 0.91 0.61 1.0 0.59 0.51 0.52 0.37 0.17 0.58
0.0 0.39 1.0 0.32 0.89 0.7 0.67 0.63 0.51 0.33 0.21 0.33 0.15 0.25 0.5
0.0 0.21 0.23 0.33 1.0 0.39 0.53 0.45 0.47 0.35 0.44 0.83 0.42 0.42 0.4
0.0 0.24 0.14 0.18 0.77 0.25 0.26 1.0 0.13 0.16 0.19 0.16 0.17 0.23 0.15
0.01 0.47 0.31 0.24 1.0 0.35 0.43 0.54 0.34 0.31 0.15 0.2 0.14 0.11 0.18
0.0 0.21 0.26 0.3 1.0 0.42 0.44 0.84 0.27 0.24 0.3 0.32 0.28 0.21 0.36
0.0 0.05 0.02 0.08 0.65 0.0 1.0 0.05 0.57 0.27 0.16 0.56 0.01 0.05 0.03
0.0 0.39 0.42 0.47 0.84 0.35 0.48 0.75 0.36 0.35 0.48 1.0 0.51 0.43 0.65
0.01 0.1 0.11 0.3 0.76 0.58 0.39 1.0 0.18 0.26 0.24 0.55 0.25 0.14 0.39
1.0 0.14 0.3 0.13 0.68 0.0 0.24 0.36 0.03 0.07 0.02 0.01 0.0 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.07 1.0 0.27 0.13 0.51 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.58 0.52 0.31 1.0 0.65 0.39 0.84 0.25 0.24 0.24 0.2 0.23 0.16 0.27
0.0 0.04 0.04 0.05 1.0 0.04 0.09 0.44 0.05 0.03 0.06 0.05 0.05 0.02 0.02
1.0 0.66 0.36 0.14 0.33 0.1 0.15 0.26 0.07 0.08 0.02 0.14 0.01 0.0 0.14
0.0 0.31 0.38 0.4 1.0 0.5 0.38 0.83 0.14 0.18 0.19 0.31 0.35 0.0 0.23
0.0 0.0 0.0 0.03 0.98 0.05 0.07 1.0 0.03 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.03
0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.14 0.04 0.41 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.28 1.0 0.27 0.79 0.59 0.49 0.54 0.53 0.38 0.28 0.23 0.28 0.23 0.22
0.26 0.35 0.43 0.32 1.0 0.45 0.53 0.65 0.41 0.39 0.49 0.52 0.45 0.26 0.36
0.02 0.03 0.14 0.2 1.0 0.04 0.08 0.49 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.09 0.32 0.41 0.4 1.0 0.31 0.5 0.73 0.4 0.31 0.41 0.29 0.34 0.23 0.35
0.0 0.11 0.24 0.18 1.0 0.31 0.26 0.3 0.04 0.03 0.03 0.0 0.07 0.0 0.07
0.0 0.05 0.09 0.13 1.0 0.28 0.36 0.58 0.18 0.15 0.22 0.22 0.12 0.08 0.28
0.0 0.1 0.19 0.38 1.0 0.19 0.49 0.96 0.24 0.2 0.21 0.16 0.12 0.12 0.1
0.0 0.45 0.31 0.32 1.0 0.26 0.3 0.38 0.21 0.18 0.18 0.19 0.16 0.07 0.21
0.0 0.17 0.19 0.2 1.0 0.43 0.39 0.97 0.2 0.17 0.19 0.26 0.19 0.13 0.27
0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.18 0.05 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.33 0.48 0.34 0.91 0.53 0.51 1.0 0.24 0.28 0.36 0.42 0.23 0.13 0.5
0.0 0.37 0.31 0.3 0.93 0.48 0.45 1.0 0.25 0.18 0.25 0.18 0.27 0.06 0.39
0.0 0.55 0.37 0.17 1.0 0.13 0.16 0.65 0.08 0.03 0.02 0.04 0.04 0.0 0.14
0.02 0.5 0.47 0.52 0.94 0.47 0.51 1.0 0.45 0.45 0.55 0.7 0.4 0.36 0.54
0.01 0.53 0.84 0.52 1.0 0.31 0.84 0.63 0.85 0.5 0.7 0.77 0.51 0.44 0.51
0.01 0.3 0.54 0.71 0.76 0.88 1.0 0.44 0.57 0.66 0.53 0.62 0.41 0.59 0.49
0.0 0.17 0.45 0.68 0.8 0.53 0.41 1.0 0.28 0.27 0.37 0.35 0.51 0.29 0.35
0.0 0.1 0.06 0.07 1.0 0.15 0.09 0.42 0.03 0.02 0.01 0.05 0.01 0.0 0.12
0.0 0.65 0.78 0.74 0.96 0.66 0.96 0.74 1.0 0.85 0.71 0.78 0.69 0.58 0.83
0.0 0.25 0.4 0.18 0.63 0.32 0.42 1.0 0.03 0.03 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.01 0.25 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.34 0.21 0.19 1.0 0.5 0.35 0.64 0.28 0.26 0.15 0.53 0.14 0.1 0.34
0.0 0.13 0.12 0.2 0.89 0.29 0.23 1.0 0.11 0.13 0.13 0.15 0.1 0.09 0.17
0.0 0.39 0.5 0.39 1.0 0.31 0.54 0.88 0.4 0.39 0.4 0.5 0.31 0.17 0.42
0.0 0.54 0.4 0.34 1.0 0.68 0.46 0.94 0.31 0.32 0.41 0.43 0.22 0.18 0.26
0.0 0.23 0.35 0.32 1.0 0.74 0.47 0.87 0.23 0.29 0.35 0.4 0.53 0.39 0.31
0.0 0.22 0.35 0.37 1.0 0.38 0.45 0.92 0.38 0.38 0.54 0.6 0.26 0.28 0.7
0.0 0.31 0.58 0.47 1.0 0.27 0.38 0.92 0.24 0.22 0.15 0.12 0.17 0.09 0.2
0.0 0.1 0.23 0.23 1.0 0.32 0.34 0.87 0.14 0.16 0.16 0.16 0.18 0.09 0.22
0.0 0.42 0.59 0.73 0.82 0.82 0.87 0.66 0.58 0.77 0.65 0.95 0.44 0.64 1.0
0.0 0.7 1.0 0.39 0.69 0.54 0.65 0.55 0.58 0.5 0.37 0.48 0.34 0.32 0.47
0.0 0.47 0.2 0.42 1.0 0.14 0.34 0.46 0.15 0.24 0.18 0.97 0.29 0.14 0.17
0.0 0.47 0.55 0.34 1.0 0.33 0.47 0.85 0.21 0.13 0.22 0.21 0.36 0.08 0.24
0.03 0.3 0.33 0.48 0.9 0.36 0.52 1.0 0.46 0.5 0.42 0.93 0.3 0.38 0.68
0.0 0.52 0.31 0.13 1.0 0.65 0.44 0.54 0.1 0.17 0.22 0.39 0.18 0.03 0.36
0.0 0.12 0.18 0.28 0.89 0.33 0.39 1.0 0.23 0.24 0.27 0.38 0.25 0.15 0.48
0.0 0.01 0.14 0.18 1.0 0.12 0.22 0.41 0.09 0.07 0.04 0.01 0.0 0.01 0.12
0.0 0.16 0.22 0.17 1.0 0.37 0.25 0.82 0.17 0.14 0.09 0.12 0.1 0.07 0.17
0.01 0.33 0.56 0.64 0.72 0.17 0.56 0.44 0.34 0.45 0.3 1.0 0.24 0.24 0.83
0.01 1.0 0.37 0.11 0.44 0.27 0.29 0.26 0.1 0.04 0.06 0.03 0.08 0.0 0.35
0.0 0.16 0.16 0.19 1.0 0.46 0.23 0.95 0.09 0.09 0.15 0.09 0.2 0.09 0.15
0.0 0.13 0.15 0.67 1.0 0.38 0.36 0.5 0.11 0.11 0.18 0.16 0.13 0.19 0.16
0.0 0.58 0.71 0.41 0.88 1.0 0.72 0.64 0.71 0.53 0.44 0.74 0.34 0.27 0.8
0.04 0.13 0.16 0.34 0.97 0.39 0.45 1.0 0.29 0.33 0.24 0.46 0.17 0.18 0.48
0.04 0.06 0.11 0.29 0.39 0.05 0.26 0.17 0.35 0.54 0.19 1.0 0.08 0.01 0.43
0.0 0.07 0.11 0.33 0.98 0.28 0.35 1.0 0.16 0.18 0.24 0.35 0.23 0.12 0.23
0.0 0.2 0.2 0.49 1.0 0.31 0.47 0.89 0.33 0.35 0.5 0.33 0.33 0.3 0.33
0.0 0.14 0.3 0.26 1.0 0.22 0.31 0.76 0.17 0.22 0.16 0.08 0.15 0.08 0.1
0.42 0.57 1.0 0.38 0.51 0.28 0.49 0.41 0.42 0.4 0.19 0.44 0.15 0.09 0.31
0.0 0.46 0.74 0.19 1.0 0.0 0.19 0.05 0.19 0.36 0.3 0.5 0.06 0.07 0.39
0.22 0.39 0.63 1.0 0.74 0.25 0.66 0.46 0.67 0.91 0.4 0.73 0.27 0.14 0.77
0.0 0.27 0.43 0.48 1.0 0.96 0.7 0.75 0.63 0.65 0.78 0.62 0.61 0.52 0.62
0.0 0.14 1.0 0.18 0.54 0.22 0.17 0.45 0.1 0.07 0.06 0.09 0.03 0.02 0.1
0.01 0.04 0.08 0.4 0.57 0.18 0.33 0.29 0.19 0.32 0.2 1.0 0.16 0.06 0.59
0.03 0.08 0.13 0.34 0.58 0.66 0.64 0.84 0.33 0.58 0.24 0.8 0.24 0.21 1.0
0.0 0.59 0.13 0.16 1.0 0.84 0.39 0.91 0.05 0.07 0.14 0.09 0.16 0.02 0.27
0.08 0.68 0.66 0.69 0.83 1.0 0.57 0.6 0.59 0.43 0.29 0.85 0.24 0.2 0.71
0.02 0.31 0.34 0.35 1.0 0.35 0.39 0.77 0.29 0.23 0.34 0.36 0.34 0.3 0.39
0.03 1.0 0.5 0.12 0.51 0.19 0.2 0.41 0.12 0.05 0.07 0.04 0.09 0.0 0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)