Heatmap: Cluster_38 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.6 0.0 0.14 1.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.04 0.02 0.0 0.03 1.0 0.03 0.01 0.06 0.1 0.07 0.21 0.05 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.05 0.0 0.0 0.18 0.11 0.0 0.01 0.15 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.04 0.54 0.84 0.3 0.27 0.52 0.29 0.26 0.44 1.0 0.03 0.51
0.0 0.0 0.05 0.03 0.13 0.41 0.15 0.09 0.28 0.24 0.11 0.1 0.18 0.0 1.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 1.0 0.16 0.0 0.04 0.04 0.01 0.08 0.02 0.0 0.01
0.0 0.06 0.06 0.03 0.06 1.0 0.29 0.06 0.32 0.16 0.09 0.25 0.18 0.0 0.23
0.0 0.04 0.06 0.1 0.35 0.29 0.29 0.29 0.4 0.25 0.29 0.64 1.0 0.12 0.55
0.01 0.1 0.01 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.02 0.04 0.01 0.0 0.06 0.02 0.0
0.91 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.01 0.0 0.0 0.16 0.09 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.13 0.13 0.15 0.02 1.0 0.08 0.06 0.05 0.1 0.09 0.03 0.17 0.01 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 1.0 0.14 0.08 0.02 0.04 0.01 0.05 0.03 0.0 0.02
0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.09 0.33 0.11 0.13 0.54 0.0 1.0
0.0 0.03 0.07 0.05 0.0 1.0 0.03 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.23 0.38 0.05 1.0 0.56 0.0 0.02 0.69 0.15 0.0 0.0 0.02 0.09
0.0 0.0 0.25 0.25 0.06 1.0 0.7 0.0 0.02 0.7 0.19 0.01 0.0 0.02 0.32
0.01 0.02 0.01 0.04 0.02 1.0 0.16 0.0 0.01 0.06 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 1.0 0.1 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.68 0.0 0.0 0.02 0.22 0.06 0.0 0.0 0.0 0.82
0.0 0.02 0.06 0.03 0.04 1.0 0.12 0.02 0.03 0.06 0.06 0.02 0.13 0.02 0.01
0.0 0.12 0.08 0.04 0.06 1.0 0.1 0.04 0.1 0.18 0.1 0.06 0.09 0.12 0.01
0.0 0.06 0.08 0.05 0.1 1.0 0.23 0.06 0.12 0.15 0.11 0.04 0.16 0.03 0.04
0.0 0.15 0.12 0.0 0.03 1.0 0.05 0.0 0.01 0.13 0.05 0.05 0.01 0.0 0.02
0.0 0.01 0.07 0.07 0.04 1.0 0.15 0.0 0.04 0.11 0.07 0.02 0.12 0.0 0.01
0.01 0.1 0.12 0.06 0.14 1.0 0.23 0.03 0.09 0.22 0.12 0.06 0.42 0.05 0.06
0.0 0.12 0.13 0.08 0.17 1.0 0.24 0.37 0.08 0.11 0.14 0.06 0.13 0.08 0.06
0.0 0.04 0.08 0.06 0.11 1.0 0.2 0.15 0.09 0.11 0.12 0.05 0.19 0.07 0.05
0.0 0.56 0.51 0.0 0.06 1.0 0.24 0.0 0.04 0.02 0.1 0.09 0.06 0.42 0.03
0.0 0.1 0.08 0.0 0.3 0.96 0.87 0.01 0.63 0.66 0.52 0.22 1.0 0.12 0.21
0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 1.0 0.09 0.0 0.02 0.06 0.04 0.01 0.21 0.03 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.09 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.0 0.0 0.2 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.57 1.0 0.26 0.76 0.01 0.0 0.05 0.3 0.15 0.13 0.05 0.0 0.01
0.0 0.0 0.15 0.03 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.2 0.0 0.0
0.0 0.15 0.43 0.33 0.02 1.0 0.05 0.02 0.06 0.13 0.11 0.03 0.07 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.01 0.02 0.02 1.0 0.14 0.0 0.01 0.08 0.03 0.04 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 1.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.54 0.0 0.0 0.02 1.0 0.2 0.01 0.02 0.12 0.04 0.1 0.01 0.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.04 0.0 0.01
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 1.0 0.0 0.0 0.01 0.25 0.27 0.81 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.0 0.0 0.14 0.0 1.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.14 0.07 0.04 1.0 0.13 0.04 0.02 0.04 0.02 0.02 0.0 0.01 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.27 0.09 0.05 0.1 1.0 0.07 0.05 0.18 0.19 0.11 0.07 0.08 0.02 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.16 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)