Heatmap: Cluster_28 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.09 0.22 0.18 0.0 0.1 0.0 1.0 0.1 0.11
1.0 0.27 0.0 0.0 0.05 0.0 0.18 0.0 0.28 0.17 0.14 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.23 0.11 0.0 0.07 0.0 0.09 0.0 0.27 0.25 0.19 0.0 0.05 0.18 0.04
1.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.3 0.0 0.81 0.42 0.67 0.29 0.0 0.82 0.0
1.0 0.45 0.45 0.22 0.09 0.0 0.26 0.0 0.23 0.17 0.33 0.0 0.06 0.41 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.0 0.16 0.0 0.03 0.0 0.25 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.45 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.15 0.08 0.05 0.15 0.46 0.15 0.27 0.32 0.15 0.08 0.49 0.41 0.04 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.63 0.46 0.29 0.0 0.02 0.26 0.11 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.86 0.0 0.44 0.0 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.37 0.0 1.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.09 0.0 0.25 0.0 0.05 0.16 1.0 0.39 0.0
0.0 1.0 0.43 0.0 0.04 0.31 0.13 0.03 0.14 0.11 0.04 0.05 0.33 0.05 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0 1.0 0.26 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.62 0.0 0.67 0.2 0.41 0.05 1.0 0.7 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.62 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.44 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.63 0.0 1.0 0.0 0.06 0.05 0.52 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.79 0.0 1.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.11 0.05 0.0 0.47 0.0 0.08 0.1 0.12 0.0 1.0 0.53 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.52 1.0 0.0 0.02 0.0 0.16 0.0 0.15 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 1.0 0.0 0.78 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.6 0.24 1.0 0.24 0.05 0.72 0.04 0.0 0.15 0.33 0.14 0.05 0.01 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.56 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.74 0.0 1.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.4 0.0 0.3 0.0 0.07 0.0 1.0 0.55 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 1.0 0.0 0.72 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.13 0.0 1.0 0.61 0.13 0.12 0.29 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.82 0.0 1.0 0.99 0.16 0.5 0.83 0.16 0.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.14 0.0 0.24 0.0 0.02 0.0 0.14 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.39 0.48 0.59 0.39 0.5 0.63 0.43 0.63 1.0 0.5 0.76 0.97 0.64 0.74
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 0.0 0.37 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 1.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 1.0 0.0 0.14 0.1 0.05 0.06 0.0 0.09 0.48
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.62 0.0 0.08 0.12 0.08 0.13 0.01 0.06 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.27 0.0 0.33 0.0 0.08 0.0 1.0 0.98 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.43 0.0 1.0 0.26 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
0.66 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.45 0.0 1.0 0.0 0.02 0.55 0.0 0.93 0.35
0.0 1.0 0.8 0.0 0.44 0.0 0.8 0.0 0.13 0.0 0.12 0.0 0.37 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 1.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.55 0.0 0.88 0.0 0.06 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.4 0.0 0.3 0.9 0.75 0.1 0.25 0.24 1.0 0.24 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.64 0.1 0.0 0.17 0.0 1.0 0.0 0.03 0.18 0.04 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.07 0.9 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)