Heatmap: Cluster_237 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 1.0 0.84 0.41 0.38 0.71 0.3 0.72 0.41 0.42 0.36 0.41 0.81 0.19 0.94
0.01 0.39 0.61 0.66 0.34 1.0 0.49 0.61 0.43 0.43 0.34 0.83 0.48 0.39 0.72
0.11 1.0 0.81 0.62 0.5 0.81 0.88 0.62 0.59 0.56 0.65 0.5 0.62 0.54 0.71
0.61 1.0 0.97 0.53 0.43 0.93 0.67 0.57 0.54 0.47 0.39 0.49 0.59 0.29 0.61
0.01 0.64 0.67 0.73 0.58 0.99 0.89 0.78 0.64 0.67 0.75 0.84 0.75 0.82 1.0
0.19 0.53 0.75 0.57 0.46 1.0 0.84 0.53 0.63 0.63 0.59 0.62 0.57 0.53 0.95
0.0 0.79 0.69 0.6 0.64 0.78 0.85 0.84 0.75 0.71 0.81 0.86 0.72 0.64 1.0
0.0 0.71 0.81 0.65 0.47 1.0 0.65 0.6 0.58 0.64 0.54 0.59 0.7 0.38 0.79
0.0 0.74 0.93 0.76 0.41 1.0 0.42 0.57 0.45 0.6 0.5 0.55 0.82 0.29 0.47
0.0 0.62 0.66 0.62 0.36 0.68 0.46 0.59 0.57 0.78 0.56 0.88 1.0 0.35 0.67
0.56 0.91 1.0 0.68 0.52 0.81 0.59 0.47 0.65 0.87 0.46 0.43 0.52 0.29 0.4
0.1 0.46 1.0 0.58 0.39 0.58 0.43 0.43 0.51 0.74 0.5 0.28 0.68 0.27 0.46
0.01 0.72 0.84 0.44 0.51 1.0 0.54 0.61 0.49 0.48 0.44 0.45 0.68 0.25 0.52
0.0 0.24 0.31 0.33 0.25 0.65 0.28 0.45 0.24 0.3 0.26 1.0 0.46 0.11 0.37
0.08 1.0 0.96 0.75 0.41 0.81 0.43 0.63 0.46 0.59 0.38 0.71 0.54 0.22 0.48
0.11 0.41 0.71 0.8 0.29 0.98 0.46 0.71 0.32 0.48 0.3 0.16 1.0 0.14 0.38
0.05 0.33 0.58 0.55 0.36 0.98 0.4 0.45 0.34 0.46 0.39 0.34 1.0 0.24 0.49
0.02 0.77 1.0 0.41 0.31 0.51 0.28 0.33 0.37 0.42 0.42 0.38 0.59 0.25 0.3
0.0 0.73 0.79 0.51 0.38 1.0 0.51 0.51 0.41 0.51 0.38 0.47 0.6 0.21 0.64
0.01 0.98 0.92 1.0 0.27 0.59 0.37 0.27 0.5 0.56 0.61 0.64 0.55 0.22 0.44
0.0 0.5 0.66 0.81 0.53 0.86 0.9 0.64 0.59 0.59 0.58 0.83 0.55 0.55 1.0
0.52 0.69 0.88 0.71 0.51 1.0 0.77 0.76 0.68 0.56 0.52 0.83 0.47 0.41 0.95
0.58 1.0 0.8 0.73 0.55 0.98 0.73 0.72 0.64 0.54 0.66 0.76 0.89 0.5 0.89
0.04 0.59 0.7 0.5 0.41 1.0 0.72 0.56 0.47 0.45 0.4 0.54 0.5 0.31 0.85
0.1 0.7 0.71 0.59 0.52 1.0 0.83 0.61 0.6 0.66 0.59 0.48 0.63 0.54 0.72
0.3 1.0 0.83 0.65 0.52 0.69 0.57 0.81 0.65 0.52 0.45 0.95 0.54 0.33 0.79
0.04 0.54 0.73 0.6 0.6 0.98 0.78 0.79 0.65 0.67 0.65 0.95 0.73 0.53 1.0
0.07 0.74 0.8 0.66 0.57 1.0 0.81 0.87 0.82 0.74 0.67 0.85 0.62 0.4 0.86
1.0 0.41 1.0 0.62 0.17 0.54 0.35 0.19 0.3 0.39 0.28 0.21 0.56 0.18 0.62
0.1 0.77 1.0 0.75 0.2 0.0 0.18 0.24 0.29 0.3 0.17 0.18 0.32 0.05 0.14
1.0 0.48 0.68 0.42 0.41 0.6 0.57 0.6 0.36 0.31 0.32 0.43 0.48 0.44 0.64
0.0 0.6 0.7 0.61 0.55 1.0 0.72 0.77 0.74 0.66 0.79 0.67 0.7 0.55 0.95
0.0 0.6 0.64 0.83 0.61 0.74 0.82 0.83 0.65 0.72 0.74 1.0 0.73 0.62 0.92
0.96 0.86 1.0 0.82 0.56 0.75 0.72 0.81 0.52 0.62 0.36 0.74 0.43 0.36 0.76
0.0 0.57 0.61 0.22 0.15 1.0 0.34 0.07 0.17 0.31 0.19 0.08 0.44 0.1 0.12
0.0 0.36 0.28 0.42 0.53 0.42 0.67 1.0 0.75 0.7 0.75 0.65 0.64 0.57 0.96
0.0 0.4 0.38 0.42 0.59 0.56 0.7 0.77 0.71 0.59 0.67 1.0 0.6 0.48 0.96
0.0 0.83 0.91 0.62 0.73 0.91 1.0 0.92 0.74 0.68 0.67 0.91 0.59 0.4 0.89
0.0 0.59 0.92 0.57 0.39 0.54 0.36 0.79 0.37 0.51 0.44 0.6 0.91 0.25 1.0
0.0 0.33 0.33 0.42 0.41 0.49 0.67 0.61 0.44 0.54 0.51 1.0 0.5 0.46 0.91
0.0 0.62 0.64 0.56 0.53 1.0 0.74 0.59 0.58 0.56 0.72 0.66 0.63 0.56 0.81
0.01 0.63 0.78 0.83 0.61 0.97 0.76 0.85 0.72 0.7 0.8 0.76 0.99 0.7 1.0
0.08 0.46 0.74 0.55 0.52 1.0 0.82 0.6 0.71 0.68 0.64 0.61 0.64 0.61 0.89
0.0 0.9 1.0 0.72 0.45 0.86 0.63 0.62 0.5 0.46 0.54 0.7 0.64 0.53 0.88
0.13 0.66 1.0 0.49 0.31 0.46 0.36 0.45 0.22 0.3 0.29 0.18 0.8 0.28 0.31
0.0 0.26 0.12 0.16 0.4 0.45 0.35 0.71 0.37 0.34 0.4 1.0 0.35 0.28 0.88
0.02 0.7 0.56 0.54 0.52 1.0 0.62 0.66 0.56 0.6 0.68 0.86 0.75 0.44 0.68
0.37 1.0 0.81 0.56 0.49 0.86 0.75 0.62 0.63 0.56 0.65 0.45 0.76 0.56 0.59
0.17 1.0 0.49 0.41 0.2 0.49 0.26 0.39 0.38 0.34 0.17 0.47 0.24 0.1 0.46
0.0 0.71 1.0 0.53 0.37 0.83 0.7 0.46 0.5 0.55 0.47 0.5 0.51 0.38 0.77
0.03 0.5 0.86 0.97 0.5 1.0 0.83 0.52 0.7 0.95 0.51 0.7 0.37 0.29 0.8
0.12 0.89 1.0 0.71 0.7 0.94 0.95 0.92 0.67 0.55 0.7 0.58 0.8 0.5 0.93
0.02 0.72 1.0 0.58 0.45 0.82 0.71 0.55 0.56 0.56 0.32 0.48 0.47 0.36 0.71
0.0 0.78 0.89 0.65 0.44 1.0 0.83 0.63 0.68 0.58 0.37 0.5 0.61 0.36 0.87
0.01 0.84 0.79 0.65 0.6 0.95 0.78 0.88 0.8 0.73 0.82 0.82 0.73 0.63 1.0
0.04 0.6 0.82 0.9 0.2 1.0 0.48 0.11 0.65 0.59 0.68 0.18 0.31 0.17 0.49
0.0 0.58 1.0 0.86 0.57 0.82 0.56 0.68 0.44 0.72 0.61 0.7 0.81 0.53 0.77
0.13 0.5 0.91 0.98 0.27 1.0 0.49 0.1 0.51 0.72 0.36 0.23 0.4 0.14 0.54
0.0 0.46 0.23 0.36 0.34 0.27 0.28 0.57 0.19 0.29 0.22 1.0 0.28 0.08 0.55
0.0 1.0 0.89 0.8 0.65 0.94 0.84 0.87 0.8 0.77 0.56 0.79 0.64 0.43 0.97
0.02 0.61 0.77 0.61 0.57 1.0 0.7 0.77 0.63 0.68 0.55 0.61 0.55 0.47 0.85
0.02 0.86 0.76 0.7 0.67 0.9 0.91 1.0 0.83 0.73 0.55 0.77 0.82 0.55 0.99
1.0 0.64 0.95 0.69 0.49 0.64 0.69 0.68 0.51 0.55 0.59 0.75 0.53 0.55 0.88
0.09 1.0 0.78 0.41 0.48 0.75 0.53 0.5 0.59 0.49 0.85 0.37 0.95 0.23 0.51
0.0 0.89 0.54 0.61 0.32 0.74 0.46 0.43 0.55 0.52 0.62 0.46 1.0 0.27 0.32
0.0 0.92 0.62 0.68 0.42 0.78 0.41 0.65 0.7 0.62 0.58 0.77 1.0 0.39 0.91
0.04 0.64 0.68 0.81 0.51 0.59 0.58 0.5 0.79 0.65 0.6 0.58 0.94 0.47 1.0
0.03 0.96 0.87 0.82 0.7 1.0 0.93 0.85 0.75 0.69 0.65 0.69 0.65 0.57 0.89
0.0 0.85 0.86 0.46 0.53 0.47 0.44 0.81 0.47 0.45 0.47 0.64 1.0 0.46 0.74
0.0 0.52 0.72 0.89 0.45 1.0 0.61 0.53 0.52 0.69 0.45 0.73 0.59 0.23 0.46
0.1 0.78 1.0 0.91 0.39 0.81 0.39 0.56 0.42 0.61 0.42 0.65 0.67 0.14 0.36
0.0 0.85 0.96 1.0 0.25 0.71 0.49 0.74 0.31 0.3 0.2 0.57 0.39 0.18 0.49

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)