Heatmap: Cluster_200 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.15 0.0 0.02 0.2 0.17 0.1 0.4 0.71 0.03 0.59 0.09 1.0 0.06 0.02 0.52
0.1 0.09 0.0 0.77 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.03 0.01 1.0 0.08 0.0 0.06
0.0 0.03 0.0 0.99 0.03 0.0 0.05 0.01 0.3 0.13 0.04 0.92 0.2 0.03 1.0
0.0 0.11 0.17 0.57 0.08 0.0 0.1 0.48 0.02 0.09 0.01 1.0 0.04 0.0 0.15
0.0 0.52 0.03 1.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.04 0.53 0.01 0.14 0.0
0.21 0.0 0.01 0.33 0.05 0.0 0.01 0.06 0.13 0.16 0.04 1.0 0.01 0.0 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.14 0.64 0.01 1.0 0.0 0.0 0.13
0.04 0.78 0.65 0.22 0.03 0.0 0.06 0.02 0.06 0.12 0.11 1.0 0.08 0.01 0.53
0.0 0.01 0.02 0.2 0.03 0.0 0.2 0.24 0.02 0.29 0.04 1.0 0.15 0.0 0.4
0.0 0.15 0.11 0.54 0.41 0.31 0.33 0.45 0.32 0.52 0.31 1.0 0.21 0.23 0.63
0.29 0.08 0.16 1.0 0.09 0.0 0.03 0.2 0.04 0.06 0.01 0.35 0.02 0.0 0.12
0.0 0.0 0.01 0.07 0.04 0.0 0.04 0.0 0.2 0.17 0.0 0.86 0.0 0.0 1.0
0.2 0.24 0.31 0.27 0.43 0.32 0.53 0.56 0.51 0.46 0.38 0.64 0.37 0.3 1.0
0.0 0.1 0.19 0.27 0.29 0.15 0.21 0.34 0.39 0.39 0.24 1.0 0.3 0.22 0.99
0.0 0.19 0.13 0.0 0.04 0.0 0.01 0.36 0.03 0.15 0.02 1.0 0.01 0.0 0.26
0.0 0.08 0.38 0.56 0.2 0.0 0.25 0.45 0.52 0.27 0.12 1.0 0.21 0.07 0.93
0.0 0.11 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.23 0.04 0.01 1.0 0.06 0.0 0.37
0.0 0.17 0.28 0.5 0.38 0.41 0.44 0.42 0.4 0.45 0.34 0.89 0.4 0.2 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.08 1.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.23 0.0 0.42 0.6 0.06 0.85 0.09 1.0 0.11 0.27 0.39
0.0 0.31 0.33 1.0 0.17 0.0 0.2 0.38 0.06 0.13 0.01 0.66 0.05 0.0 0.01
0.0 0.0 0.03 0.18 0.02 0.0 0.01 0.01 0.12 0.39 0.01 1.0 0.0 0.01 0.4
0.0 0.1 0.15 0.25 0.08 0.0 0.07 0.14 0.15 0.14 0.02 1.0 0.06 0.0 0.67
0.0 0.17 0.06 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.03 1.0 0.03 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.34 0.15 0.12 0.59 0.03 1.0 0.06 0.0 0.59
0.0 0.0 0.0 0.18 0.01 1.0 0.02 0.03 0.0 0.15 0.0 0.23 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.15 0.09 0.05 0.11 0.32 0.11 0.17 0.07 1.0 0.1 0.04 0.42
0.0 0.0 0.0 0.92 0.03 0.0 0.03 0.02 0.0 0.17 0.0 1.0 0.03 0.0 0.07
0.0 0.05 0.07 0.09 0.11 0.02 0.12 0.27 0.12 0.17 0.06 1.0 0.1 0.01 0.23
0.0 1.0 0.72 0.79 0.71 0.57 0.58 0.72 0.89 0.81 0.54 0.84 0.46 0.29 1.0
0.0 0.0 0.01 0.18 0.16 0.18 0.21 0.34 0.01 0.41 0.17 1.0 0.16 0.3 0.39
0.0 0.12 0.01 0.09 0.11 0.0 0.03 0.18 0.02 0.13 0.09 1.0 0.03 0.0 0.17
0.0 0.0 0.02 0.12 0.13 0.0 0.01 0.16 0.45 0.53 0.04 0.72 0.0 0.0 1.0
0.0 0.55 0.48 0.78 0.84 0.56 0.75 0.75 0.47 0.8 0.59 1.0 0.45 0.21 0.53
0.05 0.17 0.19 0.29 0.15 0.08 0.14 0.23 0.19 0.27 0.07 1.0 0.08 0.05 0.33
0.0 0.02 0.03 1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.04 0.08 0.03 0.81 0.08 0.0 0.05
0.0 0.03 0.13 1.0 0.13 0.0 0.08 0.36 0.0 0.17 0.02 1.0 0.07 0.0 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.4 0.35 0.54 0.75 0.61 0.59 0.91 0.59 0.45 0.6 1.0 0.59 0.36 0.94
0.45 1.0 0.53 0.49 0.48 0.64 0.66 0.61 0.53 0.68 0.44 0.93 0.36 0.37 0.75
0.0 0.14 0.07 0.18 0.12 0.02 0.15 0.17 0.02 0.28 0.07 1.0 0.09 0.03 0.26
0.0 0.0 0.01 0.02 0.06 0.0 0.18 0.07 0.01 0.22 0.04 1.0 0.03 0.01 0.4
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.04 0.04 0.01 0.81 0.0 0.0 1.0
0.0 0.12 0.17 0.27 0.14 0.39 0.39 0.32 0.12 0.39 0.16 1.0 0.25 0.16 0.87
0.01 0.1 0.06 0.4 0.13 0.31 0.14 0.43 0.01 0.4 0.08 1.0 0.07 0.0 0.97
0.0 0.0 0.0 0.34 0.06 0.0 0.06 0.54 0.22 0.18 0.08 1.0 0.05 0.0 0.41
0.0 0.59 0.59 0.94 0.7 0.51 0.64 0.69 0.52 0.59 0.46 1.0 0.47 0.33 0.65
0.0 0.46 0.17 0.25 0.26 0.23 0.3 0.43 0.23 0.34 0.28 1.0 0.23 0.22 0.46
0.0 0.11 0.15 0.29 0.2 0.16 0.2 0.48 0.22 0.22 0.15 1.0 0.14 0.11 0.53
0.0 0.08 0.22 0.42 0.27 0.3 0.28 0.19 0.26 0.42 0.23 1.0 0.41 0.03 1.0
0.0 0.27 0.59 1.0 0.03 0.0 0.03 0.15 0.11 0.36 0.03 0.81 0.1 0.0 0.71
0.0 0.0 0.02 1.0 0.09 0.0 0.08 0.2 0.1 0.13 0.06 0.83 0.13 0.1 0.36
0.0 0.0 0.02 1.0 0.06 0.0 0.05 0.17 0.07 0.08 0.03 0.59 0.06 0.02 0.33
0.0 0.0 0.01 0.02 0.11 0.0 0.16 0.26 0.11 0.24 0.03 1.0 0.05 0.02 0.36
0.0 0.12 0.12 1.0 0.2 0.22 0.1 0.47 0.1 0.16 0.07 0.74 0.05 0.0 0.37
0.0 0.21 0.03 0.24 0.08 0.0 0.05 0.07 0.17 0.27 0.03 1.0 0.01 0.01 0.56
0.0 0.0 0.0 0.48 0.02 0.0 0.06 0.09 0.1 0.16 0.01 1.0 0.04 0.0 0.22
0.0 0.05 0.02 0.06 0.01 0.0 0.0 0.15 0.05 0.22 0.02 1.0 0.07 0.0 0.07
0.0 0.0 0.04 0.13 0.09 0.0 0.06 0.07 0.18 0.47 0.07 1.0 0.0 0.0 0.88
0.0 0.0 0.08 0.91 0.09 0.0 0.32 0.11 0.2 0.96 0.03 1.0 0.22 0.0 0.27
0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.41 0.01 0.0 0.01
0.0 0.02 0.04 0.16 0.04 0.09 0.14 0.06 0.02 0.48 0.12 1.0 0.02 0.05 0.87
0.0 0.03 0.02 0.03 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02 1.0 0.06 0.0 0.21
0.0 0.0 0.03 0.97 0.13 0.0 0.03 0.03 0.11 0.37 0.07 1.0 0.01 0.01 0.38
0.0 0.65 0.2 0.05 0.06 0.0 0.04 0.35 0.01 0.16 0.06 1.0 0.06 0.02 0.28
0.0 0.4 0.42 0.1 0.17 0.0 0.14 0.34 0.04 0.12 0.05 1.0 0.16 0.01 0.34
0.0 0.02 0.04 0.35 0.16 0.04 0.09 0.41 0.29 0.13 0.04 1.0 0.07 0.02 0.56
0.0 0.18 0.29 0.4 0.52 0.21 0.45 0.64 0.46 0.58 0.3 1.0 0.27 0.17 0.51
0.0 0.09 0.15 0.31 0.61 0.81 0.46 1.0 0.27 0.32 0.37 0.94 0.23 0.15 0.42
0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.01 0.51 0.06 0.0 0.02
0.09 0.49 0.37 0.76 0.45 0.47 0.77 0.4 0.49 0.69 0.52 1.0 0.34 0.27 0.63
0.0 0.03 0.06 0.29 0.23 0.13 0.13 0.54 0.17 0.21 0.11 1.0 0.17 0.15 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.21 0.06 1.0 0.06 0.02 0.5
0.0 0.38 0.19 0.37 0.13 0.09 0.16 0.2 0.22 0.24 0.18 1.0 0.19 0.13 0.54
0.0 0.11 0.18 0.28 0.16 0.0 0.2 0.17 0.25 0.27 0.17 1.0 0.2 0.07 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.19 0.02 0.08 0.56 0.02 1.0 0.05 0.02 0.26

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)