Heatmap: Cluster_141 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.06 1.0 0.76 0.52 0.58 0.59 0.64 0.86 0.69 0.68 0.49 0.37 0.66 0.38 0.43
0.0 1.0 0.68 0.17 0.2 0.19 0.22 0.16 0.22 0.2 0.15 0.18 0.14 0.1 0.18
0.01 0.8 0.97 1.0 0.4 0.38 0.41 0.4 0.66 0.6 0.4 0.25 0.41 0.21 0.14
0.03 0.9 0.67 0.53 0.76 0.67 0.74 1.0 0.82 0.58 0.51 0.61 0.56 0.48 0.59
0.0 0.06 0.02 0.11 0.17 0.08 0.02 1.0 0.14 0.08 0.24 0.03 0.06 0.13 0.03
0.0 0.84 0.53 0.23 0.11 1.0 0.18 0.44 0.21 0.39 0.38 0.12 0.89 0.18 0.17
0.0 0.86 1.0 0.14 0.29 0.36 0.45 0.37 0.31 0.36 0.1 0.02 0.1 0.03 0.09
0.0 1.0 0.8 0.73 0.55 0.33 0.39 0.54 0.97 0.79 0.54 0.2 0.92 0.38 0.2
0.0 0.72 0.52 0.88 0.62 0.95 0.98 0.47 0.94 0.97 0.49 1.0 0.31 0.31 0.79
0.0 0.73 0.61 0.62 0.58 0.56 0.68 0.65 1.0 0.73 0.46 0.34 0.72 0.14 0.46
0.16 1.0 0.6 0.59 0.49 0.5 0.4 0.79 0.58 0.7 0.5 0.47 0.5 0.3 0.37
0.03 1.0 0.43 0.2 0.21 0.2 0.2 0.21 0.23 0.24 0.12 0.08 0.25 0.11 0.09
0.0 0.04 0.06 0.07 0.44 1.0 0.23 0.42 0.63 0.21 0.03 0.02 0.08 0.04 0.06
0.0 0.01 0.02 0.04 0.39 1.0 0.34 0.4 0.6 0.25 0.02 0.02 0.06 0.05 0.07
0.0 0.68 0.56 0.73 0.73 1.0 0.84 0.79 0.81 0.66 0.6 0.54 0.58 0.54 0.67
0.01 1.0 0.9 0.63 0.66 0.54 0.57 0.6 0.69 0.64 0.56 0.56 0.44 0.43 0.48
0.0 0.09 0.22 0.73 0.28 0.18 0.22 0.07 0.29 0.24 0.39 0.69 0.52 0.08 1.0
0.0 0.13 0.42 0.12 0.46 1.0 0.5 0.49 0.83 0.7 0.24 0.09 0.39 0.11 0.32
0.16 0.6 0.88 0.87 0.93 0.98 0.98 0.71 1.0 0.8 0.68 0.79 0.59 0.55 1.0
0.14 0.93 1.0 0.66 0.47 0.53 0.51 0.58 0.64 0.65 0.37 0.22 0.55 0.27 0.28
0.0 1.0 0.61 0.33 0.15 0.2 0.13 0.21 0.3 0.14 0.15 0.09 0.24 0.06 0.22
0.1 1.0 0.85 0.57 0.57 0.56 0.61 0.49 0.73 0.66 0.61 0.43 0.7 0.64 0.51
0.0 0.22 0.21 0.2 0.53 0.63 0.6 0.34 1.0 0.74 0.16 0.15 0.16 0.1 0.22
0.0 0.05 0.05 0.1 0.36 0.93 0.45 0.45 1.0 0.6 0.14 0.16 0.17 0.22 0.24
0.0 0.08 1.0 0.65 0.28 0.34 0.12 0.59 0.31 0.26 0.44 0.11 0.23 0.03 0.01
0.0 1.0 0.84 0.31 0.5 0.47 0.5 0.4 0.52 0.44 0.47 0.35 0.45 0.27 0.36
0.02 0.92 0.75 1.0 0.7 0.6 0.68 0.97 1.0 0.94 0.72 0.54 0.81 0.45 0.57
0.02 0.01 0.05 0.12 0.27 0.5 0.31 0.33 1.0 0.44 0.15 0.05 0.09 0.21 0.12
0.0 0.99 0.76 0.45 0.56 0.76 0.56 0.3 0.8 1.0 0.28 0.35 0.43 0.06 0.3
0.0 0.41 1.0 0.48 0.52 0.73 0.69 0.58 0.51 0.55 0.27 0.06 0.55 0.12 0.19
0.04 0.49 0.81 1.0 0.4 0.6 0.38 0.55 0.39 0.66 0.53 0.24 0.52 0.35 0.31
0.0 0.04 0.04 0.07 0.14 1.0 0.12 0.13 0.31 0.24 0.05 0.01 0.2 0.03 0.02
0.0 0.03 0.02 0.03 0.29 1.0 0.2 0.54 0.56 0.58 0.04 0.0 0.52 0.14 0.01
0.0 0.45 0.14 0.12 0.24 0.0 0.31 0.32 1.0 0.5 0.01 0.06 0.0 0.0 0.2
0.08 0.62 0.78 0.4 0.69 0.18 0.48 0.78 1.0 0.71 0.24 0.4 0.36 0.17 0.39
0.0 1.0 0.96 0.69 0.47 0.58 0.6 0.5 0.78 0.84 0.65 0.5 0.65 0.68 0.6
0.0 1.0 0.28 0.34 0.51 0.77 0.42 0.89 0.38 0.45 0.43 0.34 0.35 0.21 0.23
0.0 0.68 0.77 0.19 0.47 1.0 0.52 0.45 0.28 0.12 0.3 0.08 0.67 0.22 0.38
0.0 0.42 0.37 0.28 0.37 0.44 0.57 0.67 1.0 0.83 0.69 0.08 0.56 0.66 0.17
0.0 0.19 0.81 0.24 0.8 0.42 0.44 0.84 0.93 1.0 0.28 0.23 0.07 0.18 0.24
0.0 0.39 1.0 0.53 0.41 0.27 0.48 0.55 0.68 0.63 0.3 0.27 0.43 0.28 0.24
0.0 0.24 0.33 0.31 0.41 1.0 0.31 0.7 0.2 0.29 0.53 0.29 0.44 0.24 0.27
0.0 1.0 0.32 0.15 0.21 0.25 0.16 0.43 0.23 0.28 0.14 0.1 0.17 0.1 0.13
0.14 1.0 0.61 0.32 0.17 0.38 0.3 0.21 0.21 0.23 0.21 0.2 0.15 0.11 0.25
0.0 1.0 0.76 0.43 0.57 0.66 0.4 0.98 0.96 0.73 0.45 0.29 0.56 0.31 0.43
0.0 0.85 0.8 0.57 0.62 1.0 0.86 0.74 0.88 0.92 0.55 0.54 0.61 0.44 0.75
0.0 0.08 0.04 0.37 0.25 1.0 0.34 0.42 0.48 0.42 0.16 0.17 0.26 0.15 0.28
0.0 1.0 0.16 0.18 0.06 0.17 0.13 0.09 0.12 0.12 0.13 0.24 0.13 0.09 0.14
0.0 0.28 0.1 0.15 0.49 0.61 0.32 1.0 0.98 0.69 0.15 0.23 0.29 0.12 0.32
0.13 0.49 1.0 0.31 0.23 0.46 0.29 0.29 0.37 0.39 0.15 0.13 0.17 0.08 0.1
0.0 1.0 0.89 0.76 0.79 0.96 0.9 0.84 0.93 0.91 0.71 0.86 0.75 0.78 0.6
0.03 0.42 0.4 0.28 0.38 0.38 0.39 0.48 1.0 0.88 0.48 0.38 0.43 0.36 0.24
0.07 1.0 0.69 0.33 0.29 0.4 0.28 0.31 0.32 0.29 0.28 0.2 0.27 0.14 0.31
0.15 0.58 0.85 0.65 0.82 0.94 0.83 0.45 1.0 0.94 0.5 0.24 0.48 0.38 0.53
0.02 0.95 1.0 0.91 0.52 0.6 0.61 0.45 0.77 0.74 0.6 0.31 0.73 0.32 0.49
0.0 0.58 0.21 0.22 0.41 0.29 0.36 0.65 1.0 0.64 0.35 0.36 0.43 0.3 0.29
0.0 0.93 0.87 0.55 0.38 0.74 0.36 0.28 1.0 0.86 0.27 0.07 0.53 0.33 0.4
0.27 0.72 0.32 1.0 0.35 0.09 0.18 0.17 0.7 0.56 0.06 0.03 0.06 0.0 0.01
0.11 0.15 0.27 0.27 0.21 0.27 0.18 0.43 0.5 0.39 0.49 0.1 1.0 0.34 0.12
0.0 0.13 0.13 0.23 0.62 0.38 0.51 0.11 0.46 0.54 0.43 0.48 0.32 0.74 1.0
0.0 0.28 0.43 0.32 0.29 0.44 0.2 1.0 0.28 0.16 0.31 0.17 0.36 0.13 0.1
0.01 0.18 0.22 0.17 0.28 0.4 0.47 0.29 0.47 0.45 1.0 0.48 0.43 0.65 0.32
0.07 0.16 0.24 0.66 0.01 0.0 0.05 0.0 0.43 0.26 1.0 0.16 0.38 0.69 0.0
0.07 0.45 0.28 0.16 0.36 0.13 0.06 1.0 0.32 0.35 0.15 0.29 0.37 0.16 0.31
0.0 0.2 0.05 0.22 0.53 1.0 0.26 0.27 0.51 0.45 0.44 0.09 0.26 0.17 0.25
0.0 0.69 0.93 0.67 0.73 0.82 0.92 0.82 1.0 0.71 0.64 0.47 0.72 0.54 0.37
0.13 0.74 0.89 0.83 0.61 0.56 0.71 0.76 0.8 1.0 0.6 0.5 0.86 0.39 0.46
0.0 0.21 0.82 0.17 0.39 0.11 0.6 0.29 0.59 0.49 0.9 1.0 0.16 0.35 0.7
0.16 0.4 0.32 0.46 0.54 0.68 0.41 0.23 0.35 0.48 0.6 0.28 0.25 0.16 1.0
0.06 0.28 1.0 0.79 0.28 0.0 0.08 0.57 0.33 0.52 0.13 0.08 0.14 0.01 0.0
0.0 1.0 0.59 0.57 0.76 0.7 0.66 0.69 0.59 0.74 0.44 0.28 0.5 0.29 0.37
0.62 0.7 0.24 0.94 0.21 0.48 0.12 1.0 0.11 0.16 0.58 0.34 0.26 0.66 0.13
0.0 0.53 0.94 0.6 0.69 1.0 0.77 0.59 0.63 0.68 0.81 0.44 0.65 0.47 0.58
0.0 1.0 0.85 0.73 0.62 0.64 0.77 0.61 0.69 0.66 0.47 0.5 0.66 0.46 0.59
0.11 0.9 0.72 0.62 0.76 0.95 0.96 0.69 0.69 0.76 0.87 0.54 0.9 1.0 0.64
0.0 0.0 0.1 1.0 0.12 0.1 0.2 0.01 0.13 0.14 0.36 0.14 0.66 0.05 0.16
0.14 0.98 0.91 0.83 0.81 0.57 0.79 0.77 0.83 1.0 0.67 0.63 0.83 0.69 0.56
0.19 0.99 1.0 0.66 0.66 0.8 0.54 0.63 0.72 0.64 0.69 0.4 0.71 0.45 0.23
0.0 0.21 0.38 1.0 0.2 0.23 0.16 0.27 0.28 0.17 0.44 0.26 0.57 0.27 0.18
0.0 0.21 0.11 0.09 0.58 0.66 0.53 0.89 0.78 0.49 0.84 0.64 1.0 0.5 0.71
0.13 0.83 0.7 0.74 0.84 0.62 0.65 0.72 1.0 0.69 0.7 0.59 0.63 0.41 0.62
0.11 0.68 0.79 0.62 0.68 1.0 0.73 0.6 0.69 0.63 0.6 0.5 0.55 0.64 0.56
0.09 1.0 0.91 0.87 0.6 0.71 0.6 0.78 0.69 0.92 0.62 0.51 0.75 0.49 0.6
0.33 1.0 0.75 0.13 0.32 0.23 0.2 0.11 0.28 0.22 0.69 0.42 0.32 0.26 0.09
0.0 0.01 0.16 0.57 0.33 0.64 0.37 0.16 0.65 1.0 0.65 0.07 0.58 0.09 0.23
0.25 0.88 1.0 0.63 0.63 0.7 0.48 0.7 0.65 0.85 0.66 0.47 0.44 0.29 0.46
0.0 0.33 0.51 0.56 0.46 0.89 0.53 0.55 0.79 1.0 0.64 0.26 0.67 0.32 0.44
0.0 0.24 0.31 0.15 0.21 1.0 0.18 0.11 0.34 0.52 0.32 0.25 0.86 0.07 0.22
0.0 0.9 1.0 0.44 0.36 0.79 0.38 0.44 0.41 0.64 0.38 0.24 0.78 0.2 0.5
0.05 0.66 0.63 0.6 0.55 1.0 0.62 0.56 0.58 0.64 0.73 0.65 0.84 0.62 0.45
0.0 1.0 0.89 0.51 0.49 0.35 0.4 0.5 0.63 0.66 0.34 0.18 0.36 0.14 0.26
0.0 0.28 0.59 0.46 0.5 0.48 0.59 0.58 0.47 0.58 1.0 0.97 0.64 0.5 0.41
0.0 0.01 0.04 0.3 0.16 1.0 0.12 0.28 0.17 0.14 0.12 0.01 0.07 0.05 0.05
0.25 1.0 0.81 0.34 0.39 0.91 0.59 0.45 0.57 0.52 0.34 0.22 0.6 0.46 0.33
0.32 1.0 0.85 0.72 0.5 0.65 0.59 0.47 0.95 0.86 0.62 0.45 0.62 0.5 0.52
0.0 0.02 0.08 0.02 0.1 0.07 0.23 0.1 1.0 0.39 0.82 0.08 0.12 0.2 0.2
0.0 0.75 1.0 0.39 0.5 0.44 0.43 0.33 0.98 0.73 0.31 0.13 0.41 0.12 0.22
0.13 0.89 0.74 0.52 0.47 1.0 0.55 0.46 0.54 0.49 0.47 0.35 0.6 0.35 0.34
0.0 0.31 0.38 0.19 0.32 0.53 0.32 0.16 0.29 0.21 0.22 0.12 1.0 0.27 0.18
0.08 0.14 1.0 0.38 0.34 0.13 0.09 0.81 0.18 0.71 0.11 0.38 0.17 0.0 0.22
0.0 0.34 0.0 0.51 0.02 0.0 0.39 0.0 0.52 1.0 0.75 0.43 0.31 0.02 0.0
0.0 1.0 0.64 0.24 0.63 0.43 0.69 0.86 0.98 0.72 0.8 0.49 0.75 0.62 0.63
0.1 1.0 0.79 0.43 0.49 0.71 0.63 0.57 0.51 0.5 0.39 0.34 0.53 0.31 0.39
0.0 0.18 0.48 1.0 0.28 0.95 0.3 0.29 0.36 0.66 0.51 0.07 0.27 0.23 0.13
0.0 0.78 1.0 0.37 0.5 0.61 0.53 0.57 0.63 0.68 0.36 0.22 0.55 0.24 0.4
0.0 1.0 0.07 0.08 0.08 0.11 0.1 0.06 0.08 0.09 0.07 0.07 0.06 0.05 0.09
0.0 0.01 0.03 0.06 0.28 1.0 0.24 0.26 0.4 0.57 0.08 0.01 0.28 0.12 0.06
0.0 0.82 0.79 0.6 0.75 0.68 1.0 0.69 0.93 0.93 0.69 0.83 0.76 0.61 0.79
0.0 1.0 0.76 0.51 0.63 0.76 0.69 0.85 0.8 0.63 0.5 0.6 0.65 0.54 0.29
0.03 1.0 0.82 0.15 0.22 0.64 0.22 0.29 0.28 0.22 0.13 0.1 0.12 0.05 0.18
0.0 0.02 0.12 0.07 0.29 1.0 0.55 0.24 0.61 0.69 0.31 0.06 0.12 0.27 0.07
0.4 0.41 0.51 0.39 0.35 1.0 0.46 0.38 0.43 0.44 0.53 0.42 0.4 0.53 0.41
0.05 0.05 0.09 1.0 0.12 0.28 0.27 0.23 0.11 0.18 0.08 0.05 0.04 0.07 0.01
0.0 0.26 0.51 0.18 0.32 1.0 0.39 0.67 0.39 0.39 0.47 0.41 0.29 0.23 0.63
0.23 0.61 0.66 0.7 0.82 0.81 0.91 1.0 0.72 0.73 0.73 0.78 0.62 0.5 0.8
0.01 1.0 0.56 0.24 0.08 0.17 0.16 0.08 0.1 0.14 0.15 0.15 0.07 0.1 0.13
0.47 1.0 0.94 0.43 0.52 0.54 0.63 0.51 0.6 0.49 0.57 0.4 0.86 0.66 0.41
0.08 0.33 0.29 0.14 0.28 1.0 0.23 0.28 0.2 0.22 0.3 0.08 0.23 0.1 0.16
0.0 0.29 0.07 0.21 0.14 0.52 0.36 0.33 0.33 0.3 1.0 0.36 0.42 0.37 0.32
0.0 0.22 0.14 0.36 0.23 0.79 0.61 0.48 0.77 0.42 1.0 0.47 0.7 0.25 0.35
0.0 0.05 0.23 0.58 0.55 0.12 0.43 0.48 0.67 0.6 0.98 0.43 0.29 1.0 0.17
0.0 1.0 0.41 0.22 0.24 0.29 0.26 0.21 0.31 0.34 0.21 0.26 0.25 0.15 0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)