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Heatmap: Cluster_96 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
1.48 0.29 0.46 -0.28 -0.51 -0.3 -0.29 -0.14 -0.06 0.21 -0.25 -1.28 -0.02 -0.34 -1.25
-3.19 0.16 0.25 0.92 -0.48 0.21 -0.15 -0.28 -0.26 0.3 0.27 0.28 -0.28 -0.62 0.18
- - 0.7 -0.11 -0.35 0.86 1.27 -5.7 0.42 1.31 0.04 -0.72 -0.59 -2.24 0.12
-0.11 -0.26 1.02 -0.34 -0.04 0.75 -0.34 -0.33 -0.09 -0.17 0.13 -0.14 -0.06 -0.39 -0.68
- -0.34 -0.02 -0.12 -0.42 -0.43 -0.47 -0.02 0.23 0.03 0.31 -0.09 0.86 -1.16 1.31
-5.85 0.05 -0.12 -0.05 -0.54 0.83 -0.09 0.05 -0.02 -0.01 0.25 0.62 -0.07 -0.41 0.27
- 0.22 1.04 0.38 -0.52 0.54 -0.14 -0.44 -0.15 0.11 0.33 -0.09 0.07 -0.87 -0.12
-7.12 0.45 0.53 -0.02 -0.29 0.37 -0.09 -0.08 -0.14 -0.03 0.1 0.06 0.28 -0.33 0.26
-3.01 0.39 0.72 -0.15 -0.09 0.28 0.18 -0.3 0.19 0.16 0.1 -0.18 0.17 -0.72 -0.06
- 0.41 0.11 -0.11 -0.21 0.44 0.64 -0.0 0.12 -0.09 -0.09 0.18 -0.03 -0.37 0.05
- 0.82 0.72 0.13 -0.61 0.69 0.34 -0.72 -0.02 -0.04 0.22 -0.64 -0.16 -0.04 -0.48
-7.55 0.46 0.64 0.5 -0.48 0.77 0.38 -0.78 0.35 0.29 0.37 -0.74 -0.81 -0.81 -0.28
-4.14 1.11 -0.08 -0.66 -1.06 0.64 -0.36 -0.56 -0.27 -0.51 0.13 0.53 0.64 -0.05 0.17
-1.93 1.09 1.1 -0.02 -0.46 -0.07 -0.12 -0.01 0.04 -0.12 -0.27 -0.56 -0.52 -0.69 0.14
-5.35 -0.08 0.34 1.07 -1.0 -0.15 -0.21 -4.58 -0.46 -0.42 0.33 0.83 0.21 -0.57 1.01
- 0.04 -0.01 0.88 -0.64 0.74 0.29 -3.49 -0.91 -0.33 -0.03 0.6 -0.01 -1.21 1.18
-2.23 0.82 0.74 0.27 -0.91 0.15 -0.58 0.0 -0.86 -1.0 -0.29 0.72 0.23 -0.2 0.33
-2.3 1.59 1.29 0.16 -0.86 0.35 -0.27 -0.73 0.11 0.13 -0.36 -1.01 -0.42 -1.08 -1.74
-1.2 0.25 0.41 0.03 -0.08 0.13 0.19 -0.72 0.28 0.42 0.29 0.11 -0.4 -0.74 0.04
0.3 1.06 1.72 -0.27 -0.5 -1.85 0.24 0.01 0.07 -0.28 -1.17 -1.32 0.12 -0.86 -5.13
- 0.17 0.83 0.39 -0.24 0.25 0.03 -0.1 0.04 0.21 0.16 -0.12 -0.22 -1.13 0.32
-7.88 0.59 1.14 0.12 -0.33 -0.42 0.27 0.31 0.04 -0.01 -0.49 -0.13 0.04 -0.89 -0.01
-4.82 0.4 1.0 0.24 -0.44 -0.2 0.34 0.62 0.06 -0.09 -0.47 -0.45 -0.19 -0.49 0.03
-5.01 0.77 0.39 0.26 -0.26 0.82 0.12 -0.47 -0.01 0.13 0.04 -0.67 -0.41 -0.13 -0.08
-2.32 0.55 1.6 0.86 -0.91 -0.28 -0.47 -1.03 0.02 -0.07 -0.47 -0.09 -0.53 -0.85 0.06
- 0.54 0.83 0.84 0.07 -2.31 1.24 1.12 -0.08 0.36 -1.37 -0.64 -2.18 -2.92 -0.81
-2.71 0.33 0.47 0.05 -0.19 0.26 0.47 0.47 0.14 0.34 -0.21 -0.2 -0.19 -1.29 -0.1
- 0.4 0.1 -0.45 -0.2 1.26 0.1 -0.83 0.26 0.3 0.1 0.19 -0.41 -0.68 -0.09
-0.19 1.38 0.97 0.37 -0.09 -0.38 -0.57 0.04 -0.15 -0.41 0.02 -0.44 -0.8 -1.72 -0.77
-4.19 0.47 0.6 0.16 -0.63 0.9 0.03 0.15 -0.48 -0.01 -0.08 -0.47 -0.08 -0.54 0.35
-3.53 0.47 0.57 0.53 -0.25 1.24 0.26 -0.49 -0.12 0.17 0.36 -0.79 -1.22 -2.11 -0.11
- -0.21 0.88 0.51 -0.42 1.02 0.3 -0.46 -0.19 -0.03 -0.12 -0.5 0.04 -0.61 -0.04
- 0.61 0.87 0.9 -1.28 1.15 0.28 -4.07 -0.17 0.27 0.1 -2.07 -0.86 -1.37 0.63
-1.27 2.04 1.33 0.98 -0.86 -0.07 -0.46 -1.48 -0.57 -0.49 -0.54 -1.37 -1.63 -1.92 -1.55
-4.77 1.17 1.19 0.29 -0.94 0.89 0.3 -1.4 -0.1 0.11 -0.59 -1.37 -0.28 -1.1 -0.23
- 0.86 0.73 0.35 -0.47 1.95 -0.2 -1.53 -0.68 -0.4 -0.09 -1.66 -0.13 -1.87 -0.63
-2.26 1.24 0.95 0.59 -0.96 1.05 -0.35 -3.06 -0.47 0.33 -0.29 -1.16 -0.65 -1.2 0.26
-5.02 1.58 0.82 0.7 -0.5 0.64 -0.48 -2.38 -0.52 0.0 -0.18 -1.22 -0.27 -0.33 -0.36
-1.32 1.91 1.16 0.53 -1.16 1.0 -0.73 -3.17 -0.79 -0.26 -0.55 -1.24 -1.26 -1.8 -0.37
-2.03 0.89 0.98 -0.2 -0.94 1.14 -0.23 -3.95 -0.61 0.05 0.34 -1.71 0.07 -0.12 0.25
- 0.67 0.66 0.17 -0.11 0.64 0.27 -3.48 0.15 0.35 0.16 -0.87 0.12 -0.24 -0.09
-2.95 1.38 0.92 -0.24 -0.32 1.06 -0.05 -1.86 -0.86 -0.32 -0.11 -1.16 -0.06 -1.43 0.44
- -0.56 -0.01 -1.53 0.41 -0.0 0.41 -2.75 1.11 0.95 0.7 -0.96 0.16 -0.32 0.06
-8.62 0.15 0.92 1.04 -0.4 0.31 0.05 -0.86 -0.08 0.79 0.28 -1.71 0.25 -2.21 -0.41
- 0.85 1.15 0.57 -0.51 0.43 -0.09 -0.59 0.05 0.14 -0.34 0.15 -1.05 -1.66 0.03
-2.61 0.15 1.76 0.83 -0.38 -0.45 -0.17 -0.08 -0.33 -0.37 -0.48 -0.17 -0.54 -0.97 -0.23
- 1.71 1.18 0.84 -0.64 -0.33 0.02 -1.12 0.01 -0.09 -0.94 -0.81 -0.54 -0.95 -0.92
-0.96 0.11 0.67 0.63 -1.22 1.2 0.4 -4.72 -0.87 -0.36 -0.12 -0.56 -0.37 -0.24 0.72
-4.45 -0.27 -0.39 -0.13 -0.52 0.3 0.32 -1.01 -0.21 0.3 0.35 0.3 -0.11 0.29 1.03
- 0.37 0.36 -0.28 -0.3 0.62 0.45 -0.92 -0.53 -0.27 0.09 -0.28 0.32 0.07 0.72
-1.23 -0.7 -0.75 -0.73 -0.35 -0.19 0.59 -1.72 -0.0 -0.44 0.21 -0.03 0.39 0.89 1.17
-3.6 -0.42 -1.12 -1.11 -0.2 -0.07 0.38 0.09 -0.0 -0.45 0.47 0.0 0.86 0.39 0.86
- 0.25 0.53 -0.08 -0.24 0.71 0.17 -0.3 0.0 -0.1 0.36 0.01 0.07 -0.63 0.12
-2.29 1.05 0.7 -0.31 -0.44 0.16 -0.39 -0.11 -0.57 0.22 -0.1 0.32 0.27 -0.02 -0.9
-2.58 -0.27 0.24 0.99 -0.48 -1.75 -0.08 -0.97 -0.14 0.26 0.32 0.15 0.44 0.35 0.35
-7.22 1.71 1.96 -0.67 -0.78 -0.75 -0.24 -0.73 -0.33 -0.25 -0.45 -1.5 0.27 -1.56 -1.68
- -1.3 1.98 -0.64 -5.24 1.42 -3.33 - 0.66 0.74 0.71 -1.52 0.48 -0.77 -
- 0.19 0.4 0.66 -0.5 -0.1 -0.14 1.13 -0.03 0.14 -0.28 -0.36 0.13 -0.98 -0.1
- -0.48 0.19 0.38 -0.09 -0.16 0.09 0.77 0.28 0.28 -0.24 0.3 0.19 -0.38 -0.29
-4.98 1.12 0.26 -0.13 0.11 0.27 0.33 0.18 0.51 0.11 0.28 -0.06 -1.0 -1.51 -1.02
- 0.82 0.46 0.42 -0.47 0.7 -0.12 0.37 0.02 0.41 -0.27 -0.23 -0.58 -0.98 -0.39
-7.08 0.63 1.49 -0.07 -0.61 0.32 0.25 -0.77 0.34 -0.05 -0.03 -0.3 -0.27 -2.03 -0.15
-5.55 0.94 1.16 0.37 -0.18 -0.04 0.24 -0.14 0.76 0.25 -0.24 -0.97 -0.91 -2.57 -0.62
-2.41 1.36 1.23 0.32 -0.92 -0.98 0.24 -1.94 0.21 0.56 -0.07 -0.39 -0.82 -1.24 -0.25
-2.54 1.62 0.98 0.48 -1.03 0.01 -0.35 -1.51 0.18 0.08 0.13 -0.15 -0.88 -0.64 -1.36
- 0.14 0.49 0.88 -0.91 1.63 0.25 -3.52 -0.16 -0.31 -0.08 0.09 -1.13 -1.46 0.28
-4.74 0.38 0.71 0.54 -0.27 0.41 0.23 0.45 0.09 0.33 -0.78 -0.87 -0.19 -0.74 -0.08
-1.32 1.49 0.88 0.39 -0.27 0.36 -0.28 -0.41 -0.34 -0.28 -0.73 -0.58 -0.79 -0.54 -0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.