Heatmap: Cluster_19 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.2 0.46 0.38 0.34 1.0 0.41 0.36 0.25 0.43 0.33 0.4 0.42 0.29 0.68
0.5 0.38 1.0 0.31 0.23 0.63 0.67 0.32 0.43 0.27 0.24 0.2 0.51 0.14 0.56
0.18 0.14 0.08 0.06 0.34 0.11 0.15 1.0 0.31 0.8 0.18 0.14 0.42 0.28 0.07
0.0 0.04 0.0 0.06 0.21 0.0 0.01 0.61 0.13 1.0 0.07 0.07 0.27 0.04 0.03
0.1 0.3 0.08 0.03 0.35 0.18 0.12 0.96 0.23 1.0 0.24 0.1 0.51 0.03 0.04
0.1 0.45 0.29 0.26 0.32 1.0 0.17 0.34 0.08 0.09 0.14 0.26 0.27 0.08 0.31
0.0 0.3 0.76 0.0 0.5 0.0 1.0 0.0 0.04 0.0 0.26 0.0 0.59 0.36 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.23 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.1 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.3 1.0 0.0 0.04 0.55 0.03 0.0 0.03 0.0 0.13 0.0 0.0
0.12 0.51 0.46 0.2 0.78 1.0 0.47 0.67 0.76 0.42 0.19 0.12 0.19 0.17 0.19
0.0 0.51 0.3 0.29 0.35 1.0 0.37 0.64 0.43 0.59 0.43 0.93 0.57 0.6 0.57
0.0 0.56 0.18 0.35 0.42 0.3 0.26 1.0 0.5 0.33 0.24 0.14 0.38 0.26 0.24
0.0 0.65 0.78 1.0 0.69 0.22 0.57 0.61 0.4 0.39 0.14 0.39 0.15 0.33 0.51
0.54 0.15 0.45 0.46 0.44 0.36 0.46 0.35 1.0 0.47 0.26 0.26 0.23 0.34 0.36
0.06 0.18 0.28 0.42 0.39 0.42 0.53 0.36 0.67 0.62 0.83 0.93 0.87 0.57 1.0
0.05 0.65 0.63 0.65 0.85 0.85 0.66 0.64 0.67 0.66 0.91 0.6 1.0 0.7 1.0
0.04 0.7 0.6 0.4 0.88 0.24 0.65 0.66 0.93 0.95 0.79 0.65 1.0 0.78 0.8
0.01 0.17 0.33 0.24 1.0 0.84 0.6 0.97 0.56 0.56 0.38 0.39 0.5 0.66 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.08 0.32 0.05 0.26 0.08 0.42 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.36 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0
0.51 0.96 1.0 0.54 0.64 0.58 0.48 0.51 0.41 0.47 0.51 0.58 0.5 0.42 0.62
0.01 0.28 0.3 0.06 1.0 0.08 0.17 0.4 0.23 0.05 0.02 0.0 0.01 0.01 0.07
0.12 0.29 0.19 0.5 0.42 0.03 0.17 0.35 0.53 0.39 0.44 0.17 0.79 1.0 0.7
0.0 0.31 1.0 0.19 0.95 0.91 0.89 0.64 0.3 0.38 0.23 0.03 0.09 0.07 0.43
0.0 0.95 0.7 0.77 0.84 0.71 0.76 0.63 0.67 0.61 0.85 0.64 1.0 0.8 0.67
0.0 0.44 0.87 0.39 0.35 1.0 0.58 0.46 0.34 0.36 0.41 0.33 0.34 0.37 0.66
0.0 0.53 0.67 0.48 0.72 0.86 1.0 0.65 0.57 0.62 0.97 0.61 0.84 0.92 0.82
0.0 0.03 0.56 0.29 1.0 0.2 0.69 0.64 0.01 0.59 0.07 0.52 0.04 0.0 0.85
0.0 0.0 0.16 0.27 0.94 0.14 0.39 0.59 0.0 0.53 0.05 0.43 0.02 0.0 1.0
0.0 0.6 0.96 0.21 0.64 0.78 0.49 1.0 0.71 0.73 0.31 0.33 0.42 0.24 0.69
0.0 0.0 0.0 0.52 1.0 0.0 0.13 0.15 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.95 0.59 0.28 0.47 1.0 0.26 0.78 0.16 0.19 0.27 0.09 0.19 0.16 0.02
0.0 0.91 0.58 0.37 0.54 1.0 0.27 0.75 0.2 0.24 0.26 0.1 0.3 0.18 0.02
0.0 0.0 0.0 0.06 0.49 0.0 0.16 1.0 0.1 0.17 0.01 0.19 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.6 0.77 1.0 0.0 0.42 0.56 0.12 0.4 0.06 0.2 0.03 0.0 0.78
0.9 1.0 0.79 0.31 0.39 0.17 0.23 0.62 0.3 0.33 0.27 0.12 0.38 0.39 0.34
0.03 0.09 0.12 0.1 1.0 0.14 0.18 0.16 0.09 0.14 0.14 0.08 0.2 0.1 0.3
0.42 0.72 0.76 0.86 1.0 0.66 0.66 0.47 0.58 0.66 0.8 0.91 0.97 0.38 0.76
0.0 0.08 0.22 0.13 1.0 0.15 0.21 0.27 0.07 0.07 0.15 0.02 0.36 0.24 0.01
0.0 0.21 0.49 0.17 0.3 0.0 0.05 0.02 0.15 0.18 0.23 0.0 1.0 0.24 0.0
0.0 0.53 0.87 0.95 1.0 0.97 0.59 0.85 0.95 0.48 0.35 0.6 0.15 0.32 0.82
0.0 0.19 0.24 0.25 0.22 0.0 0.24 0.28 0.9 0.59 0.85 0.73 0.95 0.91 1.0
0.02 0.58 0.28 0.5 0.6 0.12 0.24 0.51 0.71 1.0 0.29 0.13 0.46 0.07 0.09
0.17 0.12 0.25 0.26 0.91 0.36 0.71 0.69 0.88 1.0 0.34 0.15 0.33 0.24 0.36
1.0 0.84 0.65 0.4 0.81 0.25 0.38 0.54 0.86 0.57 0.39 0.48 0.78 0.25 0.41
0.05 0.27 0.32 0.27 0.24 0.39 0.44 0.17 0.86 0.44 0.66 0.49 0.91 1.0 0.58
0.0 0.95 0.08 0.04 0.85 0.0 0.85 0.56 0.72 0.81 0.15 1.0 0.73 0.0 0.4
0.14 0.17 0.45 0.1 0.46 1.0 0.33 0.39 0.25 0.15 0.21 0.07 0.23 0.09 0.23
0.0 0.96 0.27 0.18 0.9 0.15 0.33 1.0 0.29 0.59 0.31 0.75 0.42 0.16 0.74
0.0 1.0 0.53 0.33 0.49 0.87 0.37 0.54 0.26 0.23 0.32 0.2 0.56 0.18 0.37
0.22 1.0 0.28 0.11 0.21 0.0 0.05 0.2 0.01 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.73 0.25 0.14 1.0 0.37 0.16 0.13 0.14 0.17 0.01 0.03 0.27 0.13
0.02 0.54 0.46 0.53 0.55 0.21 0.8 1.0 0.91 0.7 0.27 0.29 0.63 0.61 0.19
0.05 0.0 0.07 0.04 0.45 0.0 0.1 0.03 0.26 0.12 0.11 0.16 0.33 0.01 1.0
0.02 0.0 0.03 0.0 0.17 0.0 0.01 0.0 0.05 0.04 0.05 0.13 0.16 0.0 1.0
0.0 0.04 0.02 0.0 0.11 0.0 0.03 0.0 0.3 0.15 0.06 0.27 0.1 0.0 1.0
0.49 0.24 0.29 0.16 0.75 0.44 1.0 0.46 0.41 0.63 0.15 0.39 0.36 0.71 0.69
0.37 0.16 0.23 0.24 1.0 0.44 0.89 0.5 0.44 0.68 0.18 0.3 0.65 0.18 0.49
0.24 0.87 1.0 0.57 0.82 0.5 0.74 0.98 0.72 0.59 0.49 0.59 0.52 0.41 0.55
0.0 1.0 0.68 0.38 0.6 1.0 0.37 0.4 0.45 0.34 0.27 0.03 0.86 0.23 0.54
0.0 1.0 0.69 0.44 0.56 0.82 0.33 0.32 0.41 0.45 0.46 0.05 0.74 0.27 0.68
1.0 0.68 0.76 0.36 0.5 0.69 0.42 0.57 0.45 0.43 0.39 0.47 0.36 0.23 0.46
0.02 0.24 0.1 0.16 1.0 0.0 0.54 0.6 0.3 0.32 0.21 0.15 0.71 0.21 0.36
0.03 0.41 0.14 0.21 1.0 0.0 0.69 0.68 0.38 0.51 0.34 0.18 0.67 0.24 0.4
0.0 0.06 0.07 0.13 0.83 0.0 0.23 0.42 0.25 1.0 0.33 0.13 0.79 0.42 0.95
0.0 0.11 0.03 0.1 0.65 0.0 0.57 0.45 0.25 0.36 0.26 0.08 1.0 0.57 0.24
0.19 0.39 0.45 0.4 1.0 0.06 0.63 0.68 0.42 0.47 0.37 0.43 0.56 0.28 0.4
0.0 1.0 0.27 0.18 0.59 0.35 0.39 0.54 0.45 0.06 0.08 0.14 0.29 0.0 0.02
0.26 0.18 0.18 0.63 0.76 0.0 1.0 0.22 0.58 0.77 0.25 0.04 0.26 0.11 0.0
0.0 0.36 0.86 0.34 1.0 0.23 0.39 0.73 0.31 0.46 0.14 0.03 0.14 0.18 0.09
1.0 0.05 0.31 0.44 0.62 0.08 0.12 0.28 0.15 0.2 0.12 0.12 0.08 0.15 0.08
0.0 0.69 0.47 0.26 0.71 0.21 0.49 0.61 0.69 0.86 0.22 0.52 0.65 0.28 1.0
0.13 0.4 0.42 0.92 1.0 0.1 0.7 0.58 0.64 0.84 0.35 0.2 0.79 0.55 0.32
0.02 0.32 0.27 0.37 0.77 0.12 0.48 0.25 0.27 0.68 0.27 0.32 1.0 0.49 0.38
0.1 0.8 1.0 0.41 0.58 0.57 0.49 0.42 0.51 0.37 0.36 0.25 0.56 0.22 0.46
0.1 0.31 0.75 0.31 1.0 0.26 0.5 0.72 0.58 0.78 0.35 0.6 0.61 0.22 0.19
0.0 0.63 0.45 0.5 1.0 0.44 0.52 0.44 0.7 0.75 0.43 0.15 0.31 0.6 0.43
0.0 1.0 0.15 0.41 0.97 0.0 0.0 0.29 0.19 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.82 0.94 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.13 0.26 0.21 0.32 0.4 0.27 0.57 0.24 0.25 0.15 1.0 0.12 0.06 0.75
1.0 0.25 0.86 0.06 0.5 0.11 0.18 0.74 0.28 0.07 0.02 0.12 0.0 0.0 0.15
0.0 0.13 0.11 0.22 0.78 0.0 0.54 0.77 0.22 0.32 0.64 0.48 1.0 0.11 0.05
0.0 0.13 0.15 0.34 0.45 0.0 0.8 0.44 0.09 0.08 0.18 0.01 1.0 0.24 0.04
0.0 0.6 0.83 1.0 0.91 0.15 0.52 0.56 0.7 0.77 0.06 0.02 0.15 0.0 0.34
0.19 0.11 1.0 0.19 0.45 0.15 0.7 0.29 0.36 0.48 0.12 0.21 0.42 0.35 0.24
0.77 0.43 0.49 0.2 0.45 0.25 0.32 0.48 0.5 0.43 0.33 1.0 0.43 0.24 0.62
1.0 0.0 0.17 0.56 0.19 0.0 0.15 0.0 0.05 0.08 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0
0.01 0.41 0.41 0.46 0.56 1.0 0.57 0.31 0.32 0.38 0.47 0.52 0.69 0.34 0.61
1.0 0.0 0.2 0.33 0.2 0.0 0.15 0.0 0.06 0.17 0.01 0.08 0.02 0.09 0.07
0.0 0.4 0.45 0.42 0.7 0.73 0.44 1.0 0.49 0.63 0.56 0.8 0.58 0.32 0.99
0.0 0.36 0.51 0.62 0.51 0.28 0.43 0.53 0.64 0.56 0.43 0.68 0.3 0.12 1.0
0.0 0.2 0.27 0.41 0.56 0.39 0.49 0.57 0.45 0.65 0.44 0.66 0.27 0.25 1.0
0.0 0.31 0.34 0.52 0.9 0.66 0.67 0.85 0.81 0.89 0.71 0.96 0.58 0.35 1.0
0.02 0.22 0.51 0.66 0.51 1.0 0.87 0.52 0.59 0.75 0.56 0.43 0.48 0.64 1.0
0.0 0.81 1.0 0.51 0.5 0.53 0.51 0.46 0.81 0.58 0.53 0.66 0.94 0.43 0.99
0.01 0.56 0.16 0.25 0.76 0.45 0.35 1.0 0.39 0.64 0.14 0.06 0.02 0.05 0.12
0.0 1.0 0.49 0.2 0.29 0.21 0.24 0.33 0.25 0.24 0.18 0.15 0.24 0.09 0.25
0.0 0.41 0.66 0.54 0.53 0.72 0.68 0.57 0.7 0.7 0.72 0.59 0.7 1.0 0.93
0.0 0.03 0.04 0.05 0.34 0.36 0.18 1.0 0.34 0.29 0.19 0.25 0.35 0.11 0.09
0.0 0.0 0.0 0.06 1.0 0.0 0.11 0.58 0.81 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.07 0.13 1.0 0.0 0.13 0.55 0.56 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 1.0 0.73 0.44 0.34 0.17 0.22 0.32 0.21 0.31 0.16 0.32 0.12 0.12 0.2
0.0 0.19 0.73 0.19 1.0 0.91 0.71 0.71 0.36 0.23 0.15 0.0 0.36 0.07 0.74
0.0 0.1 0.36 0.11 0.31 1.0 0.32 0.22 0.1 0.11 0.1 0.01 0.02 0.02 0.19
0.16 0.0 0.0 1.0 0.91 0.0 0.28 0.04 0.43 0.0 0.11 0.04 0.41 0.49 0.0
0.48 0.28 0.0 0.32 1.0 0.0 0.79 0.25 0.26 0.22 0.0 0.2 0.06 0.0 0.0
1.0 0.0 0.07 0.3 0.15 0.0 0.06 0.07 0.04 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0
0.16 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 1.0 0.75 0.3 0.0 0.04 0.95 0.09 0.23 0.02
0.0 0.32 0.27 0.46 0.63 0.37 0.33 0.33 0.54 0.52 0.37 0.35 1.0 0.94 0.55
0.0 0.31 0.16 1.0 0.6 0.53 0.15 0.44 0.06 0.06 0.09 0.27 0.03 0.0 0.31
0.18 0.05 0.2 0.15 1.0 0.13 0.74 0.72 0.45 0.78 0.17 0.13 0.18 0.2 0.06
0.16 0.1 0.23 0.06 0.74 0.23 0.4 1.0 0.2 0.61 0.14 0.1 0.14 0.18 0.07
0.0 1.0 0.13 0.1 0.2 0.07 0.08 0.11 0.22 0.08 0.03 0.06 0.03 0.03 0.04
0.0 0.01 0.19 0.24 1.0 0.05 0.3 0.34 0.03 0.1 0.05 0.0 0.05 0.09 0.04
0.0 0.43 1.0 0.08 0.2 0.14 0.14 0.01 0.0 0.03 0.02 0.19 0.01 0.0 0.04
0.0 1.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.26 0.0 0.0 0.23 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0
0.0 0.81 0.44 0.75 0.66 1.0 0.48 0.75 0.62 0.44 0.23 0.16 0.29 0.21 0.22
0.0 0.38 0.58 0.52 0.63 0.29 0.39 1.0 0.57 0.42 0.35 0.44 0.92 0.18 0.38
0.0 0.22 0.33 0.34 0.46 0.33 0.25 0.27 0.3 0.22 0.55 0.33 1.0 0.17 0.87
0.02 0.29 0.6 0.5 1.0 0.69 0.64 0.56 0.46 0.38 0.18 0.25 0.16 0.34 0.31
0.0 0.51 0.88 1.0 0.71 0.44 0.61 0.78 0.49 0.42 0.34 0.99 0.33 0.39 0.71
0.04 0.7 0.7 0.31 0.56 1.0 0.47 0.58 0.65 0.47 0.12 0.31 0.21 0.03 0.37
0.0 0.25 0.31 0.19 0.55 0.47 0.41 0.52 0.44 0.36 0.53 0.4 0.52 0.2 1.0
0.0 1.0 0.15 0.01 0.14 0.04 0.11 0.29 0.18 0.22 0.06 0.1 0.18 0.03 0.17
0.0 1.0 0.5 0.42 0.49 0.5 0.4 0.64 0.45 0.36 0.21 0.36 0.21 0.21 0.42
0.0 0.0 0.22 1.0 0.33 0.0 0.1 0.25 0.31 0.1 0.05 0.23 0.04 0.0 0.93
0.0 0.01 0.01 0.08 0.59 0.0 0.25 1.0 0.32 0.58 0.21 0.5 0.03 0.24 0.56
0.0 0.49 0.52 0.49 0.45 0.29 1.0 0.46 0.5 0.58 0.15 0.44 0.4 0.64 0.45
0.17 0.68 0.69 0.69 0.81 0.75 0.69 0.71 0.8 0.64 0.53 0.57 0.92 0.44 1.0
0.0 0.27 0.85 0.08 0.63 1.0 0.58 0.55 0.55 0.27 0.2 0.1 0.27 0.02 0.4
0.0 1.0 0.05 0.07 0.19 0.09 0.18 0.07 0.06 0.32 0.07 0.0 0.24 0.09 0.05
0.0 0.0 0.05 0.38 0.88 0.4 1.0 0.14 0.34 0.48 0.15 0.09 0.24 0.15 0.09
0.0 0.0 0.04 0.23 1.0 0.28 0.37 0.33 0.47 0.47 0.06 0.03 0.09 0.05 0.14
0.0 0.0 0.06 0.53 1.0 0.0 0.72 0.09 0.16 0.63 0.14 0.0 0.1 0.0 0.12
0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 1.0 0.32 0.74 0.22 0.81 0.21 0.27
0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.04 0.0 0.9 0.12 0.4 0.07 1.0 0.96 0.1
0.06 0.54 0.8 0.7 0.57 0.86 0.79 0.48 0.6 0.59 0.94 0.57 1.0 0.74 0.65
0.0 0.04 0.13 0.15 0.94 0.03 0.27 0.48 0.04 0.32 0.04 0.23 0.02 0.0 1.0
0.14 0.43 0.56 0.49 0.31 0.32 1.0 0.22 0.56 0.72 0.35 0.24 0.71 0.27 0.74
0.0 0.29 0.6 0.14 0.56 0.17 0.25 1.0 0.32 0.19 0.18 0.38 0.09 0.24 0.17
0.0 0.15 0.17 0.08 0.44 0.05 0.22 1.0 0.15 0.16 0.22 0.11 0.35 0.07 0.03
0.0 0.36 0.47 0.47 0.8 0.92 0.63 1.0 0.68 0.76 0.3 0.36 0.25 0.29 0.34
0.02 0.41 0.54 0.75 0.74 0.61 0.76 0.87 0.86 0.78 0.79 0.69 0.73 0.84 1.0
0.0 0.6 0.21 0.03 0.52 0.0 0.16 0.11 0.16 0.23 0.33 1.0 0.14 0.13 0.2
0.01 1.0 0.7 0.33 0.45 0.48 0.3 0.43 0.33 0.36 0.28 0.58 0.4 0.15 0.62
0.0 0.16 0.5 0.5 0.6 0.35 0.56 0.91 0.54 0.61 0.39 1.0 0.5 0.23 0.5
0.0 0.08 0.19 1.0 0.38 0.03 0.16 0.35 0.8 0.3 0.05 0.42 0.07 0.02 0.46
0.01 0.26 0.76 0.55 1.0 0.69 0.92 0.48 0.68 0.77 0.68 0.66 0.95 0.63 0.77
0.0 0.24 1.0 0.32 0.46 0.41 0.41 0.5 0.22 0.27 0.21 0.18 0.2 0.37 0.44
0.0 0.0 0.16 0.08 0.77 0.11 0.28 0.25 0.27 1.0 0.04 0.0 0.59 0.01 0.11
0.0 1.0 0.27 0.02 0.29 0.26 0.12 0.22 0.13 0.16 0.18 0.12 0.05 0.03 0.23
0.0 0.79 0.26 0.15 0.21 1.0 0.29 0.33 0.14 0.16 0.12 0.22 0.21 0.09 0.41
0.11 0.17 0.32 0.18 0.93 0.18 0.56 1.0 0.31 0.87 0.76 0.33 0.49 0.99 0.17
0.0 0.32 0.7 0.49 0.43 0.83 0.65 0.21 0.62 1.0 0.18 0.03 0.01 0.45 0.46
0.0 0.04 0.0 0.22 0.77 0.0 0.12 1.0 0.1 0.16 0.08 0.85 0.04 0.0 0.12
0.0 0.4 0.98 0.36 0.91 0.0 0.34 0.44 0.87 0.88 0.3 0.36 0.73 0.19 1.0
0.0 0.69 0.17 0.42 0.38 1.0 0.08 0.7 0.17 0.06 0.07 0.6 0.39 0.3 0.02
0.0 0.5 0.68 0.6 0.45 0.89 0.64 0.49 0.34 0.67 0.43 1.0 0.25 0.78 0.62

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)