Heatmap: Cluster_235 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.4 1.0 0.93 0.58 0.12 0.41 0.54 0.15 0.42 0.37 0.36 0.13 0.64 0.45 0.49
0.0 0.78 0.77 0.41 0.38 0.93 0.54 0.34 0.52 0.46 0.9 0.49 0.49 1.0 0.52
0.1 1.0 0.59 0.58 0.57 0.58 0.65 0.61 0.59 0.56 0.58 0.49 0.73 0.48 0.5
0.03 0.56 1.0 0.4 0.23 0.69 0.17 0.34 0.12 0.29 0.3 0.09 0.26 0.12 0.16
0.0 0.44 0.42 0.43 0.71 0.22 0.78 0.94 0.9 0.66 0.75 0.99 1.0 0.85 0.58
0.25 1.0 0.87 0.89 0.84 0.82 0.75 0.75 0.91 0.97 0.66 0.8 0.79 0.77 0.69
0.0 0.8 0.72 0.82 0.53 0.82 0.78 0.53 0.56 0.58 0.81 0.54 0.65 1.0 0.44
0.0 1.0 0.46 0.05 0.08 0.0 0.03 0.09 0.02 0.1 0.02 0.18 0.01 0.01 0.1
0.0 0.75 0.76 0.32 0.35 1.0 0.55 0.55 0.57 0.52 0.38 0.3 0.47 0.35 0.31
0.0 0.31 0.61 0.49 0.58 1.0 0.72 0.8 0.59 0.45 0.54 0.44 0.54 0.54 0.39
0.03 0.39 0.42 1.0 0.51 0.88 0.44 0.98 0.26 0.3 0.44 0.41 0.72 0.29 0.23
0.0 0.8 0.61 0.49 0.67 0.88 0.73 0.95 1.0 0.67 0.56 0.99 0.76 0.45 0.51
0.0 0.23 0.0 0.44 0.1 0.9 0.13 1.0 0.07 0.12 0.2 0.2 0.28 0.0 0.0
0.0 0.08 0.04 0.16 0.1 0.25 0.12 0.47 0.08 0.23 0.67 0.58 0.3 0.74 1.0
0.0 0.97 0.7 0.3 0.43 1.0 0.44 0.79 0.45 0.33 0.28 0.21 0.4 0.32 0.23
0.0 1.0 0.95 0.98 0.56 0.98 0.8 0.71 0.79 0.65 0.94 0.65 0.98 0.75 0.71
0.0 0.77 0.79 0.63 0.75 0.99 0.81 1.0 0.59 0.63 0.63 0.62 0.77 0.4 0.52
0.0 0.89 1.0 0.85 0.5 0.96 0.68 0.75 0.41 0.67 0.54 0.37 0.52 0.98 0.35
0.0 1.0 0.77 0.46 0.49 0.65 0.41 0.92 0.46 0.43 0.38 0.44 0.53 0.27 0.28
0.25 1.0 0.91 0.61 0.3 0.67 0.49 0.42 0.43 0.45 0.55 0.37 0.7 0.41 0.36
0.26 1.0 0.2 0.25 0.47 0.25 0.34 0.36 0.37 0.26 0.43 0.52 0.58 0.37 0.34
0.29 0.39 0.18 1.0 0.33 0.24 0.47 0.23 0.37 0.29 0.78 0.44 0.56 0.61 0.32
0.05 0.35 0.3 0.48 0.34 0.26 0.23 0.35 0.28 0.27 1.0 0.39 0.56 0.97 0.19
0.03 0.01 0.05 1.0 0.06 0.01 0.02 0.11 0.09 0.16 0.12 0.26 0.12 0.02 0.03
0.0 0.39 0.84 0.85 0.42 1.0 0.78 0.41 0.55 0.56 0.68 0.41 0.64 0.49 0.67
0.0 1.0 0.58 0.8 0.03 0.05 0.09 0.09 0.22 0.07 0.15 0.12 0.42 0.14 0.06
0.0 0.96 0.57 1.0 0.03 0.13 0.07 0.06 0.36 0.06 0.16 0.1 0.45 0.09 0.07
0.0 0.82 0.38 0.96 0.08 1.0 0.69 0.09 0.12 0.22 0.67 0.13 0.51 0.39 0.59
0.0 0.1 0.07 0.2 0.31 0.23 0.1 0.2 0.07 0.19 0.69 0.78 0.46 0.11 1.0
0.0 0.22 0.1 0.32 0.56 0.45 0.17 0.41 0.15 0.41 0.72 0.7 1.0 0.31 0.19
0.18 0.08 0.14 0.07 0.19 1.0 0.2 0.24 0.22 0.19 0.28 0.23 0.17 0.14 0.17
0.0 0.54 1.0 0.77 0.18 0.26 0.2 0.53 0.07 0.12 0.25 0.43 0.19 0.12 0.25
0.06 0.69 0.59 0.39 0.38 0.67 0.41 0.38 0.53 0.47 0.71 0.5 0.72 1.0 0.41
0.0 0.76 0.92 0.17 0.35 1.0 0.28 0.79 0.21 0.64 0.21 0.34 0.27 0.12 0.11
0.0 1.0 0.08 0.08 0.18 0.21 0.03 0.46 0.0 0.02 0.08 0.01 0.05 0.0 0.08
0.49 0.72 1.0 0.48 0.37 0.6 0.48 0.39 0.38 0.36 0.38 0.47 0.63 0.31 0.47
0.0 0.61 0.52 0.58 0.42 0.91 0.36 1.0 0.59 0.59 0.34 0.25 0.64 0.4 0.3
0.01 0.39 0.79 0.21 0.22 1.0 0.2 0.69 0.23 0.2 0.25 0.33 0.28 0.21 0.31
0.8 0.52 0.9 0.83 0.36 1.0 0.97 0.49 0.68 0.66 0.92 0.39 0.8 0.69 0.91
0.01 0.41 0.91 0.74 0.68 0.45 0.98 0.85 0.76 0.77 0.85 0.99 0.95 1.0 0.88
0.0 0.15 1.0 0.13 0.05 0.02 0.08 0.34 0.1 0.06 0.09 0.12 0.08 0.18 0.04
0.0 0.95 0.92 1.0 0.08 0.02 0.1 0.13 0.1 0.16 0.14 0.19 0.13 0.02 0.08
0.0 0.43 0.46 0.26 0.22 1.0 0.16 0.91 0.19 0.17 0.35 0.32 0.63 0.3 0.55
0.05 0.53 0.58 1.0 0.3 0.64 0.39 0.52 0.48 0.46 0.77 0.56 0.74 0.8 0.49
0.0 0.6 0.02 0.14 0.06 1.0 0.02 0.09 0.05 0.05 0.11 0.17 0.14 0.08 0.02
0.1 1.0 0.61 0.58 0.09 0.05 0.06 0.46 0.06 0.15 0.07 0.18 0.11 0.06 0.17
0.05 0.24 0.33 0.31 0.31 1.0 0.43 0.54 0.27 0.32 0.38 0.34 0.4 0.37 0.38
0.15 0.2 0.22 0.25 0.18 0.2 0.22 0.43 0.35 0.31 0.63 0.24 0.42 1.0 0.25
0.06 1.0 0.62 0.44 0.45 0.62 0.53 0.73 0.46 0.37 0.32 0.37 0.46 0.22 0.32
0.04 0.14 0.93 0.64 0.19 1.0 0.26 0.34 0.11 0.21 0.29 0.35 0.32 0.09 0.29
0.0 1.0 0.69 0.26 0.24 0.36 0.45 0.2 0.3 0.33 0.26 0.18 0.17 0.17 0.2
0.0 0.44 0.57 0.27 0.22 1.0 0.15 0.35 0.1 0.21 0.31 0.09 0.19 0.05 0.26
0.0 1.0 0.52 0.64 0.12 0.64 0.33 0.35 0.14 0.17 0.29 0.57 0.49 0.18 0.62
0.0 0.49 0.68 0.35 0.41 1.0 0.92 0.46 0.72 0.73 0.59 0.38 0.65 0.53 0.61
0.0 0.01 0.02 0.01 0.19 1.0 0.22 0.8 0.05 0.15 0.77 0.62 0.99 0.69 0.43
0.0 0.77 0.77 0.77 0.49 1.0 0.51 0.52 0.4 0.41 0.47 0.38 0.58 0.43 0.42
0.0 0.59 0.77 0.6 0.59 0.67 0.64 1.0 0.7 0.59 0.6 0.99 0.76 0.53 0.74
0.08 1.0 0.93 0.39 0.11 0.26 0.22 0.22 0.38 0.24 0.26 0.26 0.53 0.2 0.2
0.04 1.0 0.6 0.75 0.19 0.44 0.31 0.36 0.23 0.27 0.35 0.34 0.61 0.28 0.28
0.0 0.34 1.0 0.26 0.43 0.6 0.26 0.71 0.21 0.23 0.26 0.35 0.51 0.17 0.37
0.09 1.0 0.63 0.02 0.07 0.15 0.04 0.36 0.06 0.03 0.03 0.08 0.02 0.01 0.06
0.0 1.0 0.66 0.35 0.3 0.74 0.26 0.54 0.44 0.36 0.33 0.22 0.52 0.2 0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)