Heatmap: Cluster_239 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
1.0 0.57 0.93 0.53 0.66 0.44 0.89 0.49 0.84 0.67 0.45 0.3 0.91 0.58 0.37
0.27 1.0 0.58 0.35 0.84 0.51 0.94 1.0 0.71 0.63 0.62 0.38 0.76 0.47 0.49
0.0 0.31 0.26 0.1 0.45 0.31 0.65 0.46 1.0 0.64 0.36 0.44 0.65 0.38 0.38
0.0 0.91 0.68 0.33 0.46 0.27 0.44 0.71 1.0 0.76 0.33 0.37 0.77 0.36 0.27
0.0 0.11 0.12 0.11 0.65 0.62 1.0 0.56 0.48 0.55 0.13 0.21 0.34 0.13 0.29
0.24 0.6 0.73 0.49 0.72 1.0 0.94 0.59 0.74 0.68 0.65 0.43 0.79 0.53 0.59
0.68 0.88 0.67 0.62 0.65 0.55 1.0 0.86 0.96 0.87 0.53 0.9 0.73 0.42 0.43
0.14 0.96 0.74 0.26 0.45 1.0 0.7 0.59 0.55 0.48 0.35 0.29 0.58 0.3 0.27
0.0 0.25 0.22 0.05 0.4 0.0 0.48 0.19 0.8 0.66 0.16 0.05 1.0 0.08 0.06
0.0 1.0 0.83 0.33 0.33 0.23 0.45 0.52 0.55 0.42 0.29 0.19 0.49 0.24 0.16
0.0 0.26 0.44 0.24 0.64 0.36 1.0 0.78 0.67 0.63 0.3 0.29 0.6 0.48 0.29
0.01 0.25 0.36 0.49 0.59 0.24 0.77 0.6 0.87 0.66 0.5 0.45 1.0 0.63 0.52
0.05 0.82 1.0 0.52 0.53 0.23 0.43 0.63 0.85 0.58 0.34 0.33 0.56 0.38 0.32
0.0 0.15 0.15 0.03 1.0 0.0 0.77 0.59 0.71 0.36 0.16 0.02 0.88 0.9 0.06
0.0 0.31 0.47 0.45 0.6 0.44 0.79 0.77 0.68 0.64 0.57 0.33 1.0 0.69 0.41
0.0 0.35 0.28 0.12 0.7 0.14 1.0 0.3 0.69 0.48 0.38 0.11 0.4 0.15 0.03
0.27 0.31 0.82 0.27 0.85 0.12 1.0 0.98 0.95 0.8 0.32 0.25 0.94 0.82 0.32
0.0 0.15 0.09 0.1 0.36 0.08 0.42 0.49 1.0 0.59 0.25 0.22 0.75 0.27 0.26
0.0 0.35 0.5 0.37 0.61 0.61 0.79 0.46 0.92 0.79 0.33 0.26 1.0 0.35 0.37
0.0 0.48 0.52 0.26 0.64 0.31 0.69 0.62 1.0 0.91 0.19 0.11 0.9 0.35 0.23
0.0 0.69 0.55 0.2 0.73 0.48 1.0 0.85 0.91 0.93 0.42 0.38 0.79 0.57 0.6
0.0 0.19 1.0 0.22 0.45 0.35 0.35 0.4 0.42 0.34 0.18 0.18 0.51 0.07 0.18
0.01 0.88 0.91 0.49 0.63 0.39 0.88 0.5 1.0 0.68 0.62 0.39 0.55 0.39 0.53
0.39 0.58 0.65 0.64 0.63 0.51 0.91 0.63 0.99 0.85 0.69 0.56 1.0 0.75 0.47
0.13 1.0 0.85 0.46 0.7 0.73 0.9 0.81 0.99 0.9 0.55 0.44 0.97 0.59 0.53
0.93 0.49 0.92 0.65 0.75 0.69 1.0 0.62 0.94 0.91 0.59 0.69 0.73 0.51 0.53
0.0 0.13 0.2 0.22 0.36 0.3 0.57 0.35 0.47 0.49 0.24 0.16 0.41 1.0 0.21
0.0 0.36 0.7 0.3 0.51 0.35 0.72 0.61 0.77 0.51 0.35 0.3 1.0 0.22 0.33
0.14 0.68 0.58 0.49 0.64 0.62 0.8 0.53 0.9 0.68 0.59 0.47 1.0 0.49 0.57
0.06 0.6 0.65 0.16 0.52 0.16 0.57 0.37 0.78 0.48 0.39 0.42 1.0 0.35 0.36
0.0 0.71 0.59 0.22 0.57 0.24 0.8 0.67 1.0 0.67 0.24 0.2 0.98 0.6 0.17
0.0 0.62 1.0 0.41 0.23 0.07 0.26 0.34 0.29 0.3 0.11 0.17 0.32 0.12 0.12
0.0 0.45 1.0 0.44 0.29 0.11 0.29 0.33 0.32 0.34 0.13 0.24 0.28 0.17 0.22
1.0 0.62 0.88 0.06 0.48 0.0 0.79 0.37 0.59 0.46 0.16 0.11 0.99 0.72 0.25
0.0 0.83 0.68 0.54 0.63 0.72 1.0 0.63 0.87 0.84 0.61 0.46 0.96 0.62 0.57
0.0 0.8 0.4 0.13 0.44 0.27 0.47 0.57 1.0 0.56 0.2 0.26 0.72 0.47 0.17
0.63 1.0 0.45 0.2 0.35 0.11 0.3 0.2 0.32 0.25 0.26 0.06 0.39 0.14 0.11
0.16 0.43 0.44 0.46 0.81 0.49 0.89 0.73 0.75 0.68 0.43 0.54 1.0 0.49 0.71
0.0 0.69 0.73 0.48 0.67 0.55 0.7 0.52 0.94 0.75 0.53 0.45 1.0 0.56 0.54
0.0 0.01 0.15 0.08 0.69 0.22 0.98 0.35 0.32 0.41 0.15 0.16 1.0 0.23 0.19
0.35 0.25 0.31 0.22 0.65 0.17 1.0 0.5 0.78 0.7 0.3 0.2 0.87 0.47 0.21
0.0 0.45 0.74 0.59 0.77 0.96 1.0 0.57 1.0 0.78 0.53 0.36 0.72 0.63 0.63
0.0 0.38 0.23 0.21 0.62 0.29 1.0 0.86 0.97 0.79 0.34 0.23 0.84 0.71 0.24
0.0 0.74 0.26 0.33 0.58 0.06 0.69 0.35 0.67 0.61 0.33 0.61 1.0 0.39 0.37
0.0 0.39 0.1 0.12 0.66 0.05 0.32 0.75 1.0 0.68 0.15 0.27 0.49 0.67 0.2
0.02 1.0 0.71 0.31 0.46 0.45 0.51 0.41 0.57 0.46 0.35 0.3 0.38 0.27 0.27
0.0 1.0 0.54 0.35 0.54 0.52 0.65 0.48 0.76 0.57 0.41 0.46 0.72 0.44 0.48
0.01 0.84 0.95 0.4 0.64 0.39 0.73 0.39 1.0 0.51 0.34 0.24 0.74 0.4 0.32
0.03 0.62 0.4 0.43 0.69 0.28 0.69 0.76 0.88 0.94 0.47 0.17 1.0 0.56 0.21
0.0 0.0 0.1 0.03 0.79 0.83 0.48 0.69 0.29 0.3 0.1 0.18 1.0 0.25 0.0
0.19 0.99 0.77 0.45 0.63 0.48 1.0 0.74 0.66 0.82 0.47 0.24 0.71 0.67 0.42
0.01 0.35 0.39 0.27 0.56 0.19 0.67 0.43 0.79 0.61 0.42 0.26 1.0 0.42 0.18
0.0 0.07 0.11 0.09 0.55 0.16 0.59 0.75 1.0 0.67 0.33 0.39 0.95 0.28 0.19
0.0 0.32 0.41 0.26 0.51 0.39 0.57 0.57 1.0 0.95 0.31 0.14 0.86 0.35 0.25
0.0 0.0 0.05 0.06 0.35 0.0 0.49 0.12 0.43 0.3 0.21 0.22 1.0 0.12 0.14
0.14 0.68 0.65 0.35 0.63 1.0 0.88 0.79 0.77 0.72 0.51 0.53 0.61 0.41 0.52
0.01 0.54 0.4 0.16 0.52 0.25 0.7 0.4 0.79 0.52 0.36 0.35 1.0 0.54 0.27
0.0 0.77 0.85 0.43 0.72 0.95 0.82 0.72 0.96 0.81 0.45 0.27 1.0 0.47 0.43
0.0 0.02 0.05 0.08 0.97 0.36 0.9 0.55 0.76 0.88 0.32 0.21 1.0 0.04 0.28
0.0 0.01 0.03 0.03 0.66 0.14 1.0 0.25 0.23 0.39 0.11 0.2 0.87 0.05 0.22
0.0 0.1 0.93 0.36 0.55 0.69 0.64 1.0 0.37 0.41 0.24 0.47 0.43 0.22 0.67
0.0 0.64 0.96 0.46 0.65 0.59 0.83 0.71 1.0 0.86 0.48 0.38 0.51 0.56 0.53
0.0 0.28 0.4 0.27 0.74 0.44 0.94 0.65 0.89 0.62 0.33 0.4 1.0 0.42 0.44
1.0 0.34 0.6 0.45 0.47 0.36 0.59 0.53 0.66 0.62 0.26 0.36 0.66 0.29 0.37
0.0 0.13 0.58 0.46 1.0 0.43 0.98 0.69 0.89 0.76 0.31 0.32 0.81 0.47 0.34
0.23 0.53 0.61 0.5 0.51 0.43 0.89 1.0 0.69 0.57 0.31 0.31 0.46 0.39 0.45
0.0 0.2 0.23 0.07 0.79 0.13 1.0 0.51 0.71 0.5 0.23 0.16 0.59 0.34 0.15
0.45 0.71 1.0 0.24 0.35 0.28 0.36 0.3 0.3 0.35 0.28 0.05 0.36 0.1 0.15
0.29 0.32 0.63 0.34 0.49 0.3 0.58 0.39 1.0 0.78 0.41 0.24 0.78 0.46 0.3
0.02 0.14 0.42 0.32 0.56 0.45 1.0 0.45 0.7 0.78 0.61 0.42 0.77 0.69 0.45
0.03 0.87 0.56 0.4 0.68 0.5 0.98 0.66 1.0 0.72 0.5 0.39 0.76 0.63 0.41
0.01 0.69 0.41 0.42 0.67 0.47 0.68 0.81 1.0 0.69 0.5 0.32 0.91 0.65 0.46
0.0 0.7 0.74 0.6 0.82 0.98 0.86 0.66 1.0 0.98 0.46 0.23 0.58 0.37 0.29
0.22 0.33 0.63 0.58 0.96 0.64 0.89 0.76 1.0 0.81 0.35 0.36 0.86 0.74 0.59
0.09 0.93 1.0 0.34 0.53 0.33 0.68 0.39 0.58 0.45 0.39 0.2 0.54 0.35 0.17
0.19 1.0 0.7 0.7 0.65 0.36 0.83 0.54 0.64 0.55 0.45 0.34 0.49 0.51 0.34
0.0 1.0 0.36 0.26 0.37 0.29 0.53 0.5 0.46 0.35 0.21 0.25 0.3 0.26 0.25
0.14 0.67 0.89 0.38 0.82 0.55 0.89 0.78 1.0 0.72 0.58 0.4 0.63 0.44 0.27
0.0 1.0 0.57 0.33 0.58 0.36 0.73 0.54 0.62 0.54 0.38 0.28 0.53 0.56 0.39
0.54 0.7 1.0 0.35 0.92 0.81 0.76 0.66 0.92 0.6 0.58 0.45 0.63 0.31 0.49
0.06 0.76 0.68 0.52 0.69 0.48 1.0 0.66 0.92 0.76 0.51 0.26 0.48 0.64 0.45
0.07 0.25 0.56 0.16 0.58 0.16 1.0 0.44 0.51 0.52 0.21 0.16 0.28 0.66 0.26
0.57 0.06 0.09 0.07 0.66 0.03 1.0 0.61 0.48 0.46 0.13 0.28 0.64 0.82 0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)