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Heatmap: Cluster_268 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
-2.69 -0.91 -0.48 0.03 -0.08 0.07 0.36 -0.72 0.27 0.41 0.64 -0.17 0.05 0.61 0.21
- -1.15 -0.59 0.36 -0.53 1.13 -0.0 0.02 -0.62 -0.07 0.8 -0.77 -0.49 0.65 0.6
-6.72 -0.91 0.5 1.47 -0.79 0.34 0.02 -0.75 -0.23 -0.23 0.44 1.04 -0.91 -0.63 -0.95
- 0.52 1.22 1.66 -1.53 -0.98 -0.55 -1.93 -0.7 -0.36 0.71 0.79 -0.87 -0.15 -4.29
- 0.2 0.1 0.41 -0.26 0.26 0.3 -0.28 0.53 -0.01 0.3 -0.26 0.11 -0.33 -0.02
-7.13 -0.6 -1.29 -1.01 -0.33 -0.91 -0.7 -0.18 -0.52 -0.53 1.73 1.49 -0.48 -2.57 1.14
- -1.36 -0.09 1.29 -1.19 1.18 0.41 - -1.16 -1.39 0.38 1.41 -0.83 0.88 -
-3.83 0.52 0.11 -0.3 -0.09 0.22 0.04 0.09 -0.03 -0.23 0.42 -0.04 0.25 -0.63 0.51
- -0.47 -0.2 -0.37 -0.35 0.31 -0.06 0.61 -0.38 -0.47 0.35 0.11 0.48 0.54 0.51
-3.99 -0.27 -0.08 -0.13 -0.12 0.61 -0.06 -0.33 -0.26 -0.4 0.38 0.7 0.4 0.48 -0.3
- -2.84 -2.76 -0.09 -1.88 -0.79 -1.11 -2.64 -0.23 1.26 1.42 1.48 0.4 -1.7 0.97
0.29 - -3.68 -0.15 -1.01 - -0.77 - -2.23 -0.16 2.15 2.13 - - 0.83
0.56 0.63 0.55 -0.24 -0.44 0.16 -0.3 -0.38 -0.21 -0.24 0.15 -0.34 -0.03 -0.23 -0.34
-3.56 -0.25 -0.04 0.19 -0.26 -0.54 0.25 -0.37 -0.02 0.2 0.77 0.97 0.02 -0.44 -0.13
- -1.82 -0.66 -0.15 0.43 0.22 -0.07 0.53 0.35 -0.09 0.71 0.55 0.26 -0.56 0.11
-3.48 0.41 0.09 -0.41 -0.27 0.56 0.12 -0.1 0.3 -0.1 0.45 -0.32 0.28 -0.23 0.05
-4.31 0.48 0.43 -0.36 -0.52 0.56 0.16 -0.35 -0.02 -0.49 0.37 -0.69 0.86 -0.35 0.19
-4.24 0.31 0.31 -0.06 -0.29 0.29 0.16 -0.65 0.49 -0.52 0.65 -1.12 0.53 -0.75 0.63
-1.68 -0.17 -0.18 -0.0 -0.33 -0.23 0.14 -0.82 0.2 0.16 0.86 0.17 -0.16 0.13 0.49
-2.61 -0.03 -0.03 -0.11 0.14 0.21 -0.02 -0.32 0.25 0.15 0.68 -0.06 0.1 -0.15 0.11
-5.24 -0.81 -0.87 0.32 -0.48 0.24 0.49 -0.12 0.08 0.05 0.49 0.32 0.1 0.4 0.32
-2.2 -2.96 -0.72 -0.8 -0.24 0.53 0.37 -0.52 0.78 0.77 0.83 0.31 0.25 -0.42 -0.32
-3.33 -0.23 -0.05 -0.12 -0.77 -0.14 -0.18 -0.71 -0.57 0.28 1.4 0.38 0.33 0.65 -0.98
- -0.13 -0.35 -0.21 -0.33 -0.2 -0.06 -0.0 -0.12 -0.33 1.43 0.41 0.27 -0.0 -0.19
- -0.96 -0.65 -0.21 -0.13 0.13 0.22 -0.37 -0.13 -0.18 0.8 0.55 -0.13 0.49 0.77
-5.55 0.37 -0.65 0.02 -0.47 0.55 -0.55 -0.19 0.28 0.17 0.33 0.92 0.08 -0.23 -0.16
-2.07 -0.42 -0.51 0.22 -0.46 0.27 -0.2 -1.51 0.06 0.09 0.69 0.41 0.56 0.69 -0.22
- -0.3 0.18 -0.11 -0.38 0.3 0.03 0.12 -0.07 -0.3 0.68 0.53 0.0 0.11 0.17
-2.03 -0.87 -0.82 -0.22 -0.45 -0.15 0.38 -0.73 -0.01 0.04 1.1 -0.06 0.58 0.15 0.6
- - 0.11 0.95 0.18 - 0.7 -3.56 -0.12 0.1 1.92 -1.18 1.02 -1.23 -1.06
-4.41 -2.07 -1.64 0.28 -0.88 -0.4 -0.05 -0.8 -0.18 -0.07 0.9 0.79 0.73 1.13 0.08
-8.74 -0.11 -0.38 0.19 -0.34 0.06 0.2 -0.24 -0.06 -0.06 0.51 1.09 0.03 0.08 -0.34
-1.49 -0.9 -0.16 0.54 -0.28 0.05 0.21 -0.66 0.1 0.21 0.72 0.05 -0.16 0.07 0.33
- -0.53 -0.87 0.88 -0.71 0.74 -0.03 -1.84 -0.53 0.17 1.24 -0.01 -0.06 0.01 0.31
- -2.28 -4.94 -0.85 -0.55 1.32 -0.34 -2.49 -0.18 0.28 2.03 0.98 -0.07 -0.96 -1.21
-3.16 -0.81 -0.08 -0.12 0.06 0.44 0.17 -0.41 0.16 0.26 0.71 -0.02 0.06 0.26 -0.02
-4.95 -0.04 -0.23 0.08 -0.37 0.24 0.4 -0.23 0.21 -0.05 0.65 0.28 -0.06 0.12 0.01
-5.89 - -4.07 -0.02 -0.37 - -0.77 -1.86 -1.99 0.84 2.4 1.41 - - 1.22
- -1.49 0.64 0.05 -0.36 -0.06 0.12 -1.1 0.29 0.84 0.49 0.81 -0.0 -0.46 -0.2
-8.36 -2.08 -0.9 0.44 -0.07 -0.3 0.64 -0.68 -0.01 -0.01 0.92 -0.0 0.27 0.92 -0.1
- 0.05 -0.56 -0.36 -0.18 -0.38 -0.12 -0.1 0.16 -0.03 0.54 1.13 0.27 -0.09 0.16
- -0.17 0.34 0.08 -0.19 -0.18 -0.08 -0.07 -0.36 -0.03 0.79 0.33 0.46 -0.65 0.45
- -1.54 -0.05 0.58 -1.06 0.92 0.18 -3.68 -0.04 -0.53 0.58 1.35 -0.25 -0.08 0.15
-2.18 -0.13 -0.27 -0.12 0.12 0.16 0.35 -0.34 0.16 0.18 0.75 -0.54 0.31 0.3 -0.4
- -0.25 0.29 -0.29 -0.33 1.08 -0.26 -0.83 0.14 0.0 0.26 0.64 -0.09 -0.33 0.27
-3.58 0.06 0.15 -0.03 -0.3 0.77 0.01 -0.25 -0.08 -0.14 0.12 0.29 0.16 -0.48 0.51
-4.74 0.28 0.35 0.36 -0.4 0.49 0.18 -0.46 -0.02 -0.11 0.46 -0.24 -0.11 0.3 -0.21
-3.01 -0.25 -0.67 0.1 -0.69 0.5 0.05 -0.37 0.25 -0.24 0.57 -0.11 0.23 0.47 0.58
-1.93 -0.34 -0.22 0.23 -0.13 0.43 0.07 -0.06 -0.24 -0.26 0.62 0.2 0.12 0.11 0.17
-0.37 -0.09 0.16 -0.24 -0.33 -0.62 -0.17 -0.15 0.3 0.47 0.33 0.29 0.43 0.11 -0.82
-5.12 -0.52 -0.87 -0.55 -0.24 0.16 0.55 0.02 0.4 0.33 0.69 0.6 -0.16 -0.68 0.46
-1.0 -0.24 -0.31 -0.34 -0.24 0.04 -0.26 -0.6 -0.1 -0.57 1.12 0.58 -0.0 -0.12 0.59
- -1.31 -0.99 0.75 -0.41 1.63 -1.22 -1.37 -0.14 -0.46 0.19 0.4 0.33 0.14 0.39
- -1.0 -1.02 1.26 -1.75 2.48 -2.49 - -0.93 -0.37 0.1 -0.25 -0.13 -0.24 -0.82
-4.58 0.03 -0.11 0.04 -0.5 0.59 -0.18 -0.07 0.16 0.29 0.17 0.05 0.28 -0.29 0.49
-7.22 0.2 0.13 -0.08 -0.47 0.63 -0.02 0.2 -0.11 0.09 0.32 0.13 0.09 -0.47 0.35
-3.86 0.35 0.34 0.3 -0.22 -0.02 0.24 -0.27 -0.17 0.18 0.38 -0.04 -0.22 0.36 -0.2
-3.93 0.09 -0.27 0.03 -0.37 0.25 0.23 -0.07 0.16 0.0 0.83 -0.34 0.02 0.08 0.23
- -0.57 -0.25 -0.1 -0.08 -0.36 0.02 0.28 0.04 0.11 0.67 0.29 0.42 0.57 -0.21
-0.93 -0.31 -0.49 -0.5 -0.47 -0.4 0.11 -0.01 0.48 -0.21 0.34 -0.07 0.6 0.86 -0.19
-4.47 0.33 0.42 -0.09 -0.89 -0.2 -0.14 -0.43 0.37 -0.09 0.85 -0.1 0.3 -0.61 0.58
-5.69 -0.2 -0.07 0.1 -0.82 1.04 -0.01 -1.13 -0.42 -0.56 0.93 0.27 0.57 0.25 -0.31
- -0.03 0.26 -0.17 -0.53 1.09 0.52 -1.18 0.05 0.15 0.64 -0.24 -0.61 0.28 -0.26
-1.99 -0.32 -0.49 -0.17 -0.2 0.72 0.33 -0.89 -0.18 0.06 0.77 0.1 0.14 0.21 0.07
-5.71 0.49 -0.89 0.29 -1.14 -0.03 0.05 -2.0 -1.12 -0.18 0.88 0.35 0.62 1.27 -0.52
- -0.02 -0.02 0.33 -0.19 0.18 -0.06 0.22 -0.08 -0.1 0.47 0.1 0.3 -0.01 0.1
-4.8 0.06 0.03 0.42 -0.22 0.37 0.07 -0.09 -0.04 -0.03 0.55 -0.08 0.34 -0.25 -0.07
- - - -0.84 0.6 - -2.07 - 0.33 0.15 1.36 0.94 1.51 1.58 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.