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Heatmap: Cluster_260 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

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Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.75 1.0 0.8 0.45 0.79 0.56 0.87 0.37 0.51 0.69 0.92 0.5 0.38 0.67
0.25 0.83 0.83 0.73 0.69 0.96 1.0 0.77 0.99 0.81 1.0 0.86 0.8 0.8 0.77
0.11 0.84 0.79 0.55 0.61 0.76 0.55 0.79 0.59 0.49 0.75 1.0 0.82 0.59 0.66
0.08 0.86 1.0 0.5 0.57 0.57 0.61 0.68 0.58 0.52 0.7 0.64 0.6 0.28 0.56
0.09 1.0 0.87 0.74 0.75 0.99 0.93 0.81 0.82 0.82 0.96 0.9 0.77 0.79 0.85
0.22 0.34 0.33 0.37 0.35 0.45 0.51 0.34 0.45 0.55 0.51 0.64 0.55 0.61 1.0
0.02 1.0 0.72 0.65 0.55 0.73 0.64 0.55 0.62 0.68 0.63 0.92 0.7 0.51 0.88
0.08 1.0 0.76 0.69 0.62 0.71 0.74 0.7 0.72 0.7 0.64 0.61 0.58 0.48 0.63
0.0 0.52 0.66 0.61 0.83 0.58 0.46 0.88 0.36 0.59 1.0 0.76 0.79 0.54 0.21
0.02 1.0 0.64 0.28 0.23 0.35 0.37 0.27 0.34 0.25 0.43 0.38 0.37 0.24 0.35
0.01 0.61 0.66 0.58 0.82 0.77 0.86 0.94 0.94 0.74 1.0 0.98 0.93 0.64 0.75
0.05 0.84 0.93 0.75 0.5 1.0 0.73 0.82 0.68 0.67 0.8 0.72 0.62 0.4 0.87
0.02 0.54 0.6 0.54 0.99 0.81 0.59 1.0 0.61 0.68 1.0 0.59 0.85 0.77 0.47
0.0 0.55 1.0 0.49 0.35 0.4 0.33 0.55 0.43 0.28 0.25 0.16 0.18 0.1 0.27
0.91 0.63 0.46 0.37 0.58 1.0 0.66 0.72 0.74 0.72 0.7 0.76 0.63 0.41 0.83
0.14 0.82 0.9 0.67 0.76 0.98 1.0 0.87 0.76 0.58 0.83 0.48 0.63 0.58 0.58
0.26 1.0 0.78 0.57 0.85 0.89 0.57 0.99 0.56 0.6 0.84 0.58 0.66 0.56 0.57
0.01 1.0 0.89 0.73 0.67 0.75 0.72 0.92 0.8 0.66 0.77 0.97 0.96 0.4 0.69
0.0 0.45 1.0 0.32 0.52 0.6 0.62 0.55 0.71 0.9 0.46 0.47 0.41 0.3 0.58
0.03 0.85 0.86 0.79 0.73 0.97 0.89 0.94 0.81 0.77 0.87 1.0 0.76 0.6 0.88
0.32 0.82 1.0 0.74 0.66 0.8 0.82 0.61 0.85 0.79 0.74 0.7 0.71 0.43 0.79
0.0 0.61 0.61 0.44 0.44 1.0 0.66 0.87 0.66 0.6 0.63 0.51 0.53 0.24 0.62
0.0 1.0 0.41 0.14 0.11 0.34 0.26 0.29 0.22 0.17 0.21 0.25 0.19 0.11 0.22
0.13 0.93 0.81 0.77 0.67 0.93 0.79 0.75 0.8 0.77 0.92 1.0 0.7 0.74 0.84
0.57 0.75 1.0 0.68 0.46 0.7 0.67 0.51 0.72 0.65 0.47 0.4 0.45 0.31 0.51
0.0 0.97 1.0 0.6 0.72 0.77 0.89 0.75 0.79 0.61 0.91 0.78 0.89 0.62 0.89
0.0 0.66 1.0 0.53 0.55 0.92 0.72 0.53 0.65 0.53 0.72 0.5 0.66 0.5 0.58
0.01 0.92 0.75 0.54 0.45 1.0 0.65 0.52 0.67 0.53 0.67 0.69 0.47 0.41 0.63
0.32 0.66 0.8 0.73 0.66 0.77 0.76 0.43 0.86 0.74 0.77 1.0 0.59 0.4 0.76
0.2 0.8 1.0 0.5 0.18 0.49 0.29 0.32 0.27 0.39 0.48 0.36 0.41 0.24 0.42
0.0 0.29 0.45 0.49 0.77 0.7 0.76 1.0 0.65 0.58 0.79 0.65 0.58 0.43 0.6
0.07 0.38 0.63 0.53 0.8 0.86 0.65 0.77 0.63 0.65 0.92 0.56 1.0 0.58 0.74
0.0 0.97 0.89 0.67 0.68 0.66 0.71 1.0 0.81 0.65 0.75 0.71 1.0 0.55 0.9
0.15 0.64 0.89 0.61 0.62 0.91 0.7 0.76 1.0 0.87 0.77 0.56 0.9 0.55 0.7
0.07 1.0 0.74 0.71 0.57 0.87 0.7 0.83 0.75 0.68 0.67 0.69 0.81 0.55 0.7
0.06 0.74 0.99 0.45 0.73 0.77 0.65 1.0 0.67 0.51 0.59 0.39 0.45 0.29 0.5
0.09 0.63 0.73 0.64 0.41 0.88 0.64 0.41 0.59 0.58 0.92 0.78 0.58 0.57 1.0
0.01 1.0 0.73 0.28 0.19 0.39 0.44 0.24 0.4 0.31 0.35 0.34 0.29 0.21 0.14
0.0 0.52 1.0 0.62 0.3 0.46 0.38 0.38 0.21 0.28 0.28 0.07 0.36 0.33 0.14
0.03 0.5 0.38 0.32 0.37 0.46 0.47 0.48 0.62 0.55 0.6 1.0 0.51 0.47 0.8
0.0 0.59 0.64 0.64 0.72 0.99 1.0 0.83 0.7 0.57 0.74 0.69 0.57 0.57 0.68
0.01 0.6 0.77 0.6 0.6 1.0 0.81 0.56 0.83 0.75 0.95 0.76 0.58 0.57 0.83
0.07 0.65 1.0 0.77 0.48 0.63 0.72 0.35 0.76 0.67 0.58 0.28 0.54 0.36 0.53
0.02 1.0 0.94 0.46 0.4 0.65 0.47 0.4 0.4 0.43 0.5 0.39 0.48 0.34 0.49
0.05 1.0 0.9 0.45 0.79 0.41 0.82 0.65 0.6 0.91 0.67 0.71 0.55 0.57 0.55
0.0 1.0 0.71 0.47 0.42 0.7 0.5 0.43 0.46 0.62 0.39 0.39 0.47 0.35 0.47
0.0 0.76 0.68 0.65 0.77 0.73 0.6 1.0 0.8 0.74 0.8 0.83 0.84 0.49 0.85
0.05 0.61 0.54 0.49 0.44 1.0 0.61 0.45 0.69 0.62 0.71 0.73 0.65 0.35 0.32
0.09 0.61 1.0 0.54 0.4 0.75 0.54 0.58 0.5 0.45 0.67 0.49 0.52 0.51 0.54
0.0 1.0 0.56 0.54 0.39 0.67 0.7 0.6 0.68 0.71 0.63 0.85 0.62 0.49 0.89
0.02 1.0 0.36 0.5 0.18 0.37 0.3 0.29 0.25 0.26 0.34 0.48 0.29 0.21 0.35
0.0 0.52 1.0 0.16 0.48 0.19 0.44 0.41 0.56 0.44 0.27 0.26 0.37 0.07 0.33
0.02 0.54 0.5 0.55 0.7 0.72 0.74 0.8 0.91 0.87 0.99 1.0 0.83 0.97 0.94
0.0 1.0 0.81 0.46 0.62 0.81 0.72 0.76 0.58 0.47 0.79 0.75 0.84 0.34 0.58
0.0 0.51 0.56 0.45 0.63 0.98 0.65 1.0 0.87 0.66 0.69 0.83 0.81 0.53 0.76
0.06 0.82 1.0 0.71 0.73 0.93 0.77 0.93 0.75 0.76 0.91 0.85 0.83 0.73 0.87
0.0 0.2 0.5 0.53 0.96 0.36 0.7 0.76 0.51 0.51 0.8 0.48 1.0 0.37 0.74
0.06 0.82 0.77 0.74 0.68 0.93 1.0 0.86 0.81 0.81 0.82 0.8 0.79 0.65 0.78
0.0 0.48 0.56 0.51 0.73 0.97 1.0 0.98 0.92 0.58 0.85 0.98 0.7 0.55 0.69
0.02 0.74 1.0 0.5 0.6 0.6 0.82 0.55 0.55 0.54 0.56 0.41 0.6 0.57 0.53
0.09 0.94 0.91 0.7 0.74 0.97 0.94 0.82 0.78 0.69 1.0 0.77 0.81 0.63 0.62
0.3 0.51 1.0 0.54 0.51 0.94 0.85 0.62 0.89 0.69 0.59 0.32 0.76 0.39 0.34
0.04 0.32 1.0 0.23 0.35 0.3 0.37 0.28 0.34 0.26 0.37 0.24 0.33 0.17 0.3
0.01 0.34 1.0 0.28 0.21 0.35 0.31 0.24 0.16 0.19 0.23 0.14 0.15 0.09 0.2
0.01 1.0 0.25 0.42 0.07 0.15 0.42 0.04 0.33 0.37 0.2 0.05 0.21 0.14 0.01
0.0 0.29 0.31 0.42 0.26 1.0 0.49 0.33 0.42 0.4 0.5 0.69 0.46 0.33 0.41
0.0 0.36 1.0 0.36 0.55 0.36 0.53 0.45 0.38 0.37 0.39 0.29 0.29 0.26 0.37

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)