Heatmap: Cluster_176 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 1.0 0.89 0.64 0.49 0.85 0.68 0.91 0.67 0.69 0.63 0.85 1.0 0.5 0.91
0.09 1.0 0.86 0.58 0.44 0.91 0.64 0.6 0.45 0.4 0.51 0.46 0.82 0.46 0.61
0.0 0.3 0.32 0.29 0.47 0.51 0.58 0.63 0.41 0.36 0.55 0.61 1.0 0.47 0.47
0.06 0.73 0.84 0.57 0.63 0.94 0.78 0.73 0.69 0.67 0.66 0.66 1.0 0.62 0.74
0.0 0.7 0.62 0.63 0.63 0.7 0.87 0.86 0.59 0.66 0.78 1.0 0.87 0.57 0.92
0.01 0.93 0.83 0.7 0.67 0.9 0.75 1.0 0.49 0.56 0.58 0.69 0.81 0.43 0.92
0.0 0.58 0.66 0.68 0.49 0.92 0.72 0.71 0.45 0.5 0.6 1.0 0.8 0.63 0.81
0.0 0.32 0.55 0.71 0.51 1.0 0.72 0.74 0.44 0.49 0.74 0.62 0.71 0.72 0.48
0.09 0.8 0.79 0.58 0.67 0.93 0.66 1.0 0.58 0.62 0.66 0.76 0.86 0.73 0.83
0.01 0.49 0.5 0.66 0.56 0.71 0.87 0.76 0.62 0.62 0.65 1.0 0.68 0.62 0.85
0.0 1.0 0.86 0.46 0.24 0.35 0.47 0.36 0.47 0.44 0.56 0.7 0.73 0.46 0.45
0.27 0.19 0.26 0.32 0.27 0.47 0.41 0.45 0.37 0.33 0.38 0.71 0.45 0.33 1.0
0.04 0.78 0.53 0.45 0.47 1.0 0.5 0.58 0.44 0.41 0.47 0.43 0.79 0.43 0.48
0.11 1.0 0.49 0.27 0.29 0.41 0.35 0.41 0.34 0.28 0.38 0.4 0.42 0.29 0.3
0.0 0.57 0.67 0.67 0.61 1.0 0.65 0.69 0.49 0.57 0.73 0.84 0.83 0.7 0.78
0.06 1.0 0.8 0.56 0.47 0.73 0.55 0.7 0.48 0.45 0.54 0.56 0.7 0.43 0.68
0.26 0.38 0.39 0.41 0.43 0.85 0.56 0.66 0.47 0.46 0.62 0.87 0.74 0.56 1.0
0.0 0.85 1.0 0.84 0.53 0.73 0.76 0.7 0.58 0.54 0.73 0.83 0.72 0.57 0.81
0.03 0.54 0.52 0.55 0.66 1.0 0.76 0.71 0.61 0.62 0.7 0.9 0.87 0.84 0.77
0.0 0.62 0.76 0.56 0.41 1.0 0.8 0.9 0.46 0.53 0.51 0.89 0.47 0.42 0.84
0.06 0.6 0.77 0.73 0.58 0.52 0.59 0.69 0.42 0.54 0.61 0.63 1.0 0.68 0.55
0.11 0.88 0.99 0.56 0.54 1.0 0.68 0.76 0.65 0.68 0.66 0.66 0.95 0.62 0.73
0.0 0.49 0.48 0.5 0.44 1.0 0.54 0.83 0.45 0.45 0.43 0.55 0.66 0.47 0.62
0.0 0.53 0.48 0.42 0.35 1.0 0.54 0.65 0.49 0.46 0.53 0.71 0.71 0.41 0.73
0.17 0.81 1.0 0.5 0.51 0.75 0.62 0.58 0.53 0.46 0.61 0.55 0.67 0.35 0.72
0.1 0.73 0.81 0.73 0.58 0.7 0.76 0.62 0.61 0.55 0.67 0.63 1.0 0.54 0.68
0.0 0.71 0.76 0.67 0.48 1.0 0.77 0.5 0.61 0.56 0.64 0.79 0.8 0.45 0.79
0.0 0.49 0.67 0.59 0.48 1.0 0.61 0.67 0.39 0.41 0.6 0.66 0.77 0.45 0.77
0.05 0.74 0.45 0.36 0.55 0.6 0.5 0.81 0.35 0.38 0.65 0.39 1.0 0.45 0.62
0.0 0.8 0.69 0.42 0.6 0.94 0.67 0.59 0.51 0.55 0.51 0.75 1.0 0.27 0.58
0.0 0.48 0.39 0.4 0.41 1.0 0.52 0.82 0.39 0.41 0.4 0.77 0.57 0.41 0.78
0.65 0.14 0.76 0.57 0.29 0.88 0.57 0.47 0.32 0.38 0.51 1.0 0.9 0.38 0.75
0.02 0.56 0.68 0.56 0.62 0.7 0.72 1.0 0.54 0.56 0.76 0.81 0.69 0.42 0.8
0.11 0.69 0.61 0.55 0.49 1.0 0.6 0.82 0.46 0.46 0.58 0.75 0.71 0.56 0.64
0.34 0.87 0.9 0.6 0.64 1.0 0.9 0.72 0.76 0.59 0.65 0.6 0.87 0.57 0.67
0.0 0.92 0.44 0.6 0.5 0.84 0.7 0.68 0.52 0.47 0.6 0.77 1.0 0.51 0.76
0.01 0.83 1.0 0.66 0.41 0.77 0.66 0.53 0.51 0.54 0.52 0.75 0.8 0.32 0.48
0.12 1.0 0.98 0.44 0.56 0.86 0.59 0.76 0.54 0.57 0.48 0.43 0.83 0.25 0.54
0.0 0.68 0.51 0.44 0.44 0.68 0.52 0.69 0.35 0.39 0.57 0.53 1.0 0.57 0.56
0.0 0.65 0.6 0.52 0.55 0.99 0.64 0.7 0.56 0.53 0.7 0.86 1.0 0.45 0.65
0.11 0.94 0.81 0.64 0.63 0.88 0.7 0.84 0.63 0.59 0.58 0.75 1.0 0.51 0.73
0.0 0.23 0.12 0.34 0.29 1.0 0.58 0.64 0.28 0.3 0.4 0.99 0.6 0.56 0.86
0.07 1.0 0.85 0.45 0.45 0.8 0.58 0.54 0.45 0.45 0.45 0.41 0.78 0.33 0.44
0.77 0.76 1.0 0.46 0.43 0.91 0.63 0.62 0.44 0.39 0.62 0.35 0.77 0.48 0.57
0.01 0.79 0.68 0.56 0.66 0.91 0.95 0.78 1.0 0.7 0.65 0.68 0.99 0.55 0.75
0.06 0.45 0.66 0.77 0.51 0.97 0.84 0.82 0.47 0.51 0.6 0.87 1.0 0.44 0.75
0.02 1.0 0.81 0.57 0.57 0.96 0.79 0.83 0.62 0.64 0.67 0.64 1.0 0.64 0.8
0.0 0.39 0.54 0.53 0.34 1.0 0.48 0.41 0.29 0.35 0.38 0.33 0.58 0.24 0.28
0.0 0.4 0.49 0.45 0.39 0.78 0.43 0.41 0.21 0.46 0.45 0.73 0.82 0.21 1.0
0.44 0.83 0.9 0.57 0.54 0.65 0.71 1.0 0.49 0.48 0.46 0.88 0.59 0.38 0.88
0.15 0.57 0.54 0.29 0.25 1.0 0.32 0.44 0.16 0.17 0.21 0.41 0.43 0.0 0.44
0.0 0.52 0.61 0.64 0.55 1.0 0.78 0.89 0.61 0.59 0.56 0.86 0.58 0.57 0.95
0.0 0.48 0.59 0.43 0.51 1.0 0.67 0.55 0.61 0.61 0.5 0.62 0.71 0.51 0.79
0.04 0.6 0.62 0.58 0.5 1.0 0.67 0.7 0.5 0.43 0.59 0.73 0.67 0.64 0.72
0.0 0.82 0.63 0.76 0.55 1.0 0.71 0.77 0.66 0.63 0.74 0.66 0.81 0.64 0.51
0.0 0.63 0.82 1.0 0.56 0.97 0.69 0.88 0.39 0.59 0.73 0.65 0.98 0.59 0.74
0.23 1.0 0.91 0.73 0.36 0.55 0.51 0.5 0.48 0.37 0.57 0.61 0.7 0.57 0.49
0.0 0.32 0.36 0.5 0.61 0.87 0.5 1.0 0.46 0.42 0.56 0.75 0.82 0.48 0.68
0.0 0.63 0.74 0.74 0.55 0.92 0.83 0.74 0.64 0.63 0.73 0.75 1.0 0.6 0.99
0.0 1.0 0.89 0.48 0.38 0.68 0.44 0.44 0.38 0.47 0.27 0.36 0.39 0.31 0.41
0.0 0.14 0.17 0.35 0.51 0.48 0.53 0.7 0.62 0.5 0.58 0.89 1.0 0.71 0.88
0.04 0.78 0.81 0.66 0.6 1.0 0.86 0.79 0.62 0.61 0.68 0.7 0.86 0.5 0.74
0.0 0.89 0.91 0.77 0.42 1.0 0.64 0.5 0.55 0.61 0.55 0.61 0.48 0.35 0.81
0.17 0.54 0.74 0.54 0.64 0.93 0.89 0.73 0.73 0.6 0.61 0.8 0.89 0.55 1.0
0.04 0.47 0.52 0.65 0.63 0.72 0.82 0.84 0.72 0.67 0.84 0.87 0.95 0.8 1.0
0.02 0.95 0.94 0.48 0.32 1.0 0.52 0.48 0.37 0.35 0.44 0.47 0.54 0.25 0.64
0.01 0.5 0.36 0.28 0.61 0.79 0.6 0.8 0.55 0.45 0.56 0.51 1.0 0.37 0.77
0.06 0.77 0.54 0.47 0.49 1.0 0.6 0.57 0.54 0.57 0.55 0.58 0.64 0.44 0.53
0.0 0.13 0.22 0.3 0.27 0.39 0.46 0.59 0.32 0.31 0.38 0.7 0.67 0.42 1.0
0.22 0.97 1.0 0.58 0.36 0.63 0.49 0.41 0.4 0.38 0.37 0.6 0.7 0.29 0.33
0.05 1.0 0.76 0.32 0.3 0.71 0.48 0.38 0.37 0.35 0.3 0.25 0.61 0.27 0.38
0.29 0.8 0.72 0.5 0.42 1.0 0.55 0.62 0.43 0.43 0.52 0.56 0.71 0.39 0.61
0.04 0.52 0.77 0.77 0.63 0.76 0.79 0.8 0.66 0.69 0.73 0.53 1.0 0.57 0.64
0.06 0.53 0.69 0.73 0.59 0.91 0.74 0.76 0.69 0.61 0.71 0.85 1.0 0.53 0.86
0.0 0.44 0.38 0.46 0.23 0.44 0.38 0.37 0.18 0.21 0.33 0.41 1.0 0.16 0.62
0.0 0.84 0.66 0.53 0.53 0.93 0.78 0.85 0.5 0.52 0.58 0.83 1.0 0.54 0.78
0.0 0.58 0.67 0.49 0.54 0.73 0.73 0.75 0.63 0.64 0.51 0.77 1.0 0.38 0.74
0.0 0.84 0.57 0.53 0.51 0.93 0.61 0.8 0.62 0.63 0.63 1.0 0.77 0.51 0.73
0.02 0.55 0.58 0.41 0.43 0.82 0.61 0.58 0.38 0.42 0.44 0.49 1.0 0.58 0.99
0.85 0.74 1.0 0.92 0.51 0.72 0.61 0.58 0.5 0.45 0.55 0.38 0.82 0.42 0.63
0.0 0.33 0.34 0.4 0.63 0.56 0.54 0.91 0.58 0.5 0.65 1.0 0.9 0.63 0.84
0.0 0.5 0.64 0.5 0.64 1.0 0.8 0.79 0.59 0.53 0.64 0.66 0.76 0.67 0.87
0.16 0.47 0.52 0.29 0.35 1.0 0.49 0.68 0.3 0.28 0.37 0.61 0.75 0.45 0.32
0.0 0.43 0.43 0.32 0.4 0.67 0.45 0.62 0.41 0.36 0.48 0.58 1.0 0.4 0.37
0.0 1.0 0.74 0.5 0.49 0.88 0.68 0.63 0.53 0.49 0.49 0.74 0.7 0.48 0.61
0.0 0.82 0.74 0.43 0.56 1.0 0.66 0.68 0.56 0.45 0.44 0.55 0.83 0.35 0.68
0.0 0.24 0.31 1.0 0.22 0.26 0.32 0.36 0.26 0.21 0.36 0.39 0.79 0.48 0.25
0.16 0.91 0.65 0.59 0.39 1.0 0.49 0.54 0.4 0.35 0.42 0.52 0.48 0.4 0.51
0.0 0.26 0.29 0.55 0.22 1.0 0.59 0.23 0.26 0.28 0.3 0.41 0.34 0.29 0.59
0.0 0.66 0.68 0.5 0.59 1.0 0.67 0.72 0.55 0.56 0.59 0.51 0.84 0.46 0.58
0.08 0.64 0.44 0.46 0.74 0.59 0.7 0.75 0.62 0.65 0.99 0.57 1.0 0.54 0.8
0.11 0.92 1.0 0.54 0.45 0.81 0.61 0.71 0.49 0.55 0.58 0.7 0.82 0.48 0.72

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)