Heatmap: Cluster_75 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
- - - 3.88 -6.76 - -2.08 - - - - - - - -
- - - 3.88 -5.96 - - - - - -4.94 -2.22 - - -
- - - 3.49 - - 1.9 - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.9 -3.92 - - - - - - - - - -
- - - 3.89 -4.73 - - - -5.79 - -4.12 - -3.58 - -
- - - 3.79 -3.15 - -2.0 - -0.5 - -4.81 - -6.23 - -
- - - 3.82 - - -0.15 - - - - - - - -
- - - 3.84 -5.18 - -0.57 - -8.4 - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.79 - - 0.23 - -5.68 - -8.51 - - - -
- -0.02 0.72 3.51 -10.39 - 0.0 - - - - - - - -
- - - 3.81 -5.52 - -0.06 - - - - - - - -
- - - 3.83 - - -0.33 - - - - - - - -
- - - 3.85 - - -0.82 - - - - - - - -
- - - 3.78 - - 0.3 - - - - - - - -
- -7.41 - 3.79 -9.99 - 0.21 - - - - -8.74 - - -
- - - 3.81 - - -0.34 - -2.75 - - - - - -
- - - 3.85 -5.76 - -0.76 - - - - - - - -
- -1.12 - 3.83 -5.06 - -2.05 - - - - - - - -
- - - 3.9 -3.32 - - - - - - - - - -
- - - 3.9 -7.02 - - - - - -5.31 - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.83 - - -0.43 - - - - - - - -
- - - 3.87 - - -1.48 - - - -7.1 - - - -
- - - 3.9 -8.03 - - - - - -3.73 - - - -
- - - 3.83 - - -0.43 - - - - - - - -
-1.32 - - 3.81 -4.07 - -2.72 - -5.99 - -3.14 -2.17 - - -
- - - 3.86 -6.14 - -1.33 - - - -5.56 - - - -
- - - 3.86 - - -1.14 - - -5.6 -10.06 - - - -
- - - 3.87 - - -1.43 - - - - - - - -
- -3.48 0.81 3.71 - - -3.65 - - - - - - - -
- - - 3.84 - - -0.63 - - - -8.52 - - - -
- - - 3.82 - - -0.14 - - - - - - - -
- - - 3.83 - - -0.31 - - - - - - - -
- 1.52 - 3.4 - - 0.63 - - - - - - - -
- 0.31 0.14 3.46 -1.23 - -0.46 -1.4 -4.84 - -4.52 -3.81 -7.09 - -
- - - 3.89 -5.35 - - - -5.86 - -3.13 - - - -3.99
- - - 3.9 - - -3.36 - - - - - - - -
- - - - - - 3.48 - 1.93 - - - - - -
- -4.33 -0.88 3.81 -8.89 -4.3 -1.68 -8.78 -7.41 -4.69 -6.36 -9.01 -12.1 -8.34 -
- - - 3.86 - - -1.07 - - - -6.17 - - - -
- 1.76 -2.74 3.5 -7.48 - -2.64 - - - - - - - -
- - - 3.88 - - -1.91 - - - - - - - -
- - -2.22 3.87 -7.33 - - - -6.03 -2.83 -8.33 - - - -
-2.42 - - 3.88 -10.57 - - - -5.2 - -5.79 - -8.76 - -6.56
- - -1.09 3.84 - - -2.13 - - - - - - - -
- - - 3.84 - - -0.67 - - - -3.39 - - - -
- - - 3.87 - - -1.45 - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.88 - - -1.96 - - - -10.93 -8.07 - - -
- - - 3.84 -7.1 - - - -0.67 - - - -4.18 - -
- -0.71 - 3.83 -11.13 - - - - -3.02 -7.22 - -4.24 - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
0.38 -4.45 0.03 3.64 - - -2.67 - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.9 -3.78 - - - - - - - - - -
1.36 -0.14 - 3.0 -6.45 1.7 -2.2 - - - -4.78 - - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- - - 3.87 -7.83 - -1.35 - - - - - - - -
- - - 3.88 - - -1.66 - - - - - - - -
- - - 3.61 - - 1.47 - - - - - - - -
- - - 3.75 - - -0.1 - - - -5.72 - - -0.77 -
- - - 3.82 - - -0.15 - - - - - - - -
0.9 - - 3.72 - - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- 0.34 - 3.73 - - -0.99 - - - - - - - -
- 1.04 -5.73 3.69 - - - - - - -10.01 - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - -4.84 3.62 - - -1.0 - -6.02 - -2.47 -6.94 -2.55 0.82 -
- -3.83 - 3.85 - - -1.11 - - - -10.26 - - - -
- - - 3.9 -5.58 - - - - - -6.49 - - - -
- - - 3.81 - - - - -3.39 -0.36 -4.06 - - - -
- - - 3.88 -6.21 - - - - - -1.83 - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- -3.0 -2.65 3.77 - - 0.07 - - - - - - - -
- - - 3.59 - - 1.57 - - - - - - - -
- - - 3.89 - - -2.86 - - - - - - - -
- - - 3.87 - - -1.46 - - - - - - - -
- - - 3.89 - - -2.9 - - - - - - - -
- - - 3.89 - - -2.68 - - - - - - - -
- - - 3.89 - - -2.3 - - - - - - - -
- - - 3.87 - - -1.44 -4.56 -7.19 - -7.02 - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
-2.21 - - 3.84 -9.79 - -1.17 -4.84 -7.19 - -8.15 - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.76 - - 0.56 - - - - - - - -
- - - 3.79 - - 0.25 - - - - - - - -
- - - 3.87 - - -1.44 - - - - - - - -
- - - 3.89 - - -2.2 - - - - - - - -
- - - 3.83 - - -0.36 - - - -6.29 - - - -
- - - 3.88 - - -2.16 - - - -4.61 - - - -
- -1.35 - 3.65 - - 1.05 - - - - - - - -
- - - 3.9 - - -3.58 - - - - - - - -
- - - 3.79 - - 0.2 - - - - - - - -
- - - 3.81 -8.65 - -0.5 -2.53 -5.18 - -5.39 - - - -
- - - 3.53 - - 1.8 - - - - - - - -
- - - 3.89 - - -2.9 - - - - - - - -
- - - 3.88 - - -2.01 - - - - - - - -
- - - 3.87 - - -1.46 - - - - - - - -
- - - 3.88 - - -2.0 - - - - - - - -
-4.14 -0.49 -3.6 3.1 -0.81 1.31 -2.49 -0.37 -8.95 -2.26 -8.21 -4.8 - - 0.42
- 1.03 -3.66 3.68 - - -5.62 - - - - - - - -
- -0.73 -2.31 3.74 -9.64 - -0.23 - - - -12.5 - - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- - - 3.68 - - -1.63 - -2.43 0.65 -3.75 - - - -
-2.9 - - 3.8 -9.41 - -0.12 - -6.95 - - - - - -
- -2.85 - 3.84 - - -1.01 - - - - - - - -
- - - 3.89 - - -2.67 - - - -10.66 - -7.61 - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.86 - - -0.96 - - - - - - - -
- - - 3.84 - - -0.58 - - - - - - - -
0.41 - - 3.74 - - -1.62 - - - - - - - -
- - - 3.83 -4.94 - -0.36 - - - - - - - -
- -4.24 - 3.82 - - -0.87 - - -1.88 -5.72 - - - -
- - - 3.84 - - -0.55 - - - - - - - -
- - - 3.21 - - 2.52 - - - - - - - -
- -0.36 - 3.72 - - 0.09 - - - - - - - -
- - - 3.81 -6.97 - -0.83 - -3.51 -1.63 - - - - -
- -3.71 -7.78 3.77 -13.07 - 0.31 - -8.68 - -9.79 - - - -
- - - 3.85 - - - - -4.85 - - - - - -1.0
- -5.79 -3.67 3.86 - - -1.24 - - - - - - - -
- - - 3.8 - - 0.13 - - - - - - - -
- - - 3.82 - - -0.15 - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.86 - - -0.96 - - - - - - - -
- - - 3.84 - - -0.5 - - - - - - - -
- - - 3.86 - - -1.14 - - - - - - - -
- - - 3.85 - - -0.75 - - - - - - - -
- - - 3.53 - - 1.78 - - - - - - - -
- - - 3.86 - - -1.44 -2.91 - - - - - - -
- - - 3.9 -5.24 - - - - - -4.96 - - - -
- -4.56 - 3.81 - - -0.15 - - - - - - - -
- -4.8 -7.19 3.88 - - -1.84 - - - - - - - -
- -4.19 - 3.84 - - -0.64 - - - - - - - -
- - - 3.85 -9.35 - -0.8 - -6.08 - - - - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- - - 3.83 - - -0.44 - - - - - - - -
- - - 3.48 - - 1.93 - - - - - - - -
- -4.11 -4.2 3.83 -3.41 - -3.05 -5.65 -3.58 -4.24 -9.99 -1.68 - - -
- - - 3.87 -2.57 - -2.68 -6.06 -5.98 -5.21 -6.98 - - - -
- - - 3.82 -5.92 - -0.76 -1.8 - - -6.19 - - - -
- - - 3.82 -6.7 - -0.32 - - - -5.74 - - - -
- - - 3.87 - - -1.59 - - - - - - - -
- - - 3.87 - - -1.45 - - - - - - - -
- - - 3.88 - - -1.87 - - - - - - - -
- -2.59 - 3.85 - - -1.2 - - - - - - - -
- -0.59 -0.36 3.66 - - -0.07 - - - - - - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- -6.09 0.1 3.6 -5.62 - -0.42 -7.43 -3.96 -1.2 -4.88 -5.26 -4.47 - -1.44
- - - 3.9 -4.06 - - - - - - - - - -
- -1.86 - 3.85 -9.89 - -1.91 - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.86 -6.21 - -1.36 - - - -4.85 - - - -
- - - 3.83 - - -0.44 - - - - - - - -
- -6.26 -2.28 3.87 - - -2.69 - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
0.58 - - 3.71 - - -1.34 - - - - - - - -
- -0.67 -0.56 3.62 - - 0.44 - - - -6.31 - - - -
- - -1.99 3.82 - - -0.75 - - - - - - - -
- - -0.84 3.56 - - 1.42 - - - - - - - -
- 1.36 - 3.62 - - -3.29 - - - - - - - -
- -0.67 - 3.81 - - -1.48 - - - - - - - -
-2.44 -1.13 -3.64 3.78 - - -0.96 - -4.9 - -7.95 - - - -
- - - 3.76 - - 0.52 - - - -9.21 - - - -
- - - 3.52 - - 1.81 - - - - - - - -
- -7.52 - 3.89 -13.64 - -2.47 - -11.58 - -14.82 -9.42 - - -
- - 3.39 - - - 2.18 - - - - - - - -
- - - 3.88 - - -1.72 - -8.22 - - - - - -
- - - 3.81 - - -0.02 - - - - - - - -
- - - 3.87 - - -1.3 - - - - - - - -
- - - 3.81 - - -0.02 - - - - - - - -
- - - 3.9 -7.7 - -4.12 - - - -5.93 - - - -
- - - 3.87 - - -1.58 - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.84 -8.56 - -0.71 -4.86 -10.73 - -9.36 -8.64 - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.76 - - 0.57 - - - - - - - -
- - - 3.85 - - -0.72 - - - - - - - -
- - - 3.83 -10.01 - -0.52 -4.85 - - - - - - -
- -6.07 - 3.83 -9.73 - -0.72 -4.21 -5.23 - -6.24 - -5.8 - -
1.09 - - 3.4 -5.5 - 1.22 - - - - - - - -
- - 1.18 3.39 -3.89 - 1.12 - - - - - - - -
0.71 - - 3.74 - - - - - - - - - - -
- - - 3.87 - - -1.26 - - - - - - - -
- - - 3.72 -4.8 - 0.7 -3.54 -4.37 - -4.31 - - - -
- - - 3.9 - - -3.95 - - - - - - - -
- - - 3.73 - - 0.77 - -4.75 - - - - - -
- - - 3.83 - - -1.06 - - - - - -1.59 - -
- -3.95 -1.72 3.85 -12.96 - -2.27 - - - - - - - -
- -0.21 - 3.8 -8.82 - -2.29 -6.44 -9.87 - -8.28 - - - -
- -3.98 -3.72 3.87 - - -2.32 - - - - - - - -
- - - - 0.06 - 3.8 - - - - - - - -
- - - 3.72 - - 0.85 - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.86 - - -1.05 - - - - - - - -
- - - 3.91 -5.94 - - - - - - - - - -
-2.8 -4.61 -3.62 3.73 -7.22 - -0.89 - -1.85 -3.24 -5.81 -1.43 - -2.96 -
- - - 3.88 - - -1.72 - -7.42 - - - - - -
- - - 3.82 - - -0.14 - - - - - - - -
- - - 3.87 -7.99 - -1.64 -7.56 - - -9.54 - - - -
- - - 3.9 -7.81 - - - -8.67 - -7.08 - -4.75 - -
- - - 3.88 -8.77 - -1.79 - -11.09 - -11.09 -6.08 - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.79 - - 0.23 - - - - - - - -
- - - 3.86 - - -1.19 - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.87 - - -1.46 - - - - - - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- - - 3.67 - - 1.16 - - - - - - - -
- - - 3.81 - - -0.03 - - - - - - - -
- - - 3.88 - - -2.51 - -2.99 - -5.27 - - - -
- - - 3.78 -5.02 - -1.64 - - - - -0.19 - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.91 - - - - - - - - - - -
- - - 3.9 -7.36 - -4.06 - - - - - - - -
- - - 3.85 -8.98 - -0.85 - -4.85 - -8.04 - - - -
- - - 3.89 - - -2.31 - - - - - - - -
- -2.92 -7.67 3.8 -6.45 - -8.2 -7.91 -9.71 -0.84 -5.52 -4.04 -2.04 -6.76 -
- -1.95 - 3.88 -12.71 - - - - - -8.29 - -6.1 - -
- 0.86 - 3.72 - - - - - - - - - - -
- 0.79 -3.79 3.69 -8.85 - -2.23 -6.47 -6.9 -4.91 -7.77 - - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -
- - - 3.9 -4.07 - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.91 - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.