Heatmap: Cluster_249 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.24 1.0 0.88 0.62 0.27 0.6 0.54 0.42 0.44 0.42 0.44 0.5 0.53 0.28 0.5
0.0 0.53 0.84 0.63 0.54 0.46 1.0 0.48 0.87 0.85 0.49 0.65 0.46 0.47 0.94
0.0 0.62 0.5 0.34 0.62 0.55 0.78 0.44 0.84 0.61 0.93 0.56 1.0 0.58 0.68
0.8 0.45 1.0 0.64 0.52 0.51 0.64 0.44 0.67 0.93 0.7 0.87 0.61 0.38 0.83
0.23 0.86 0.91 0.66 0.72 0.78 1.0 0.72 0.86 0.81 0.8 0.49 0.76 0.5 0.87
0.01 0.62 0.77 0.53 0.5 0.61 0.84 0.6 0.78 0.65 0.64 1.0 0.58 0.44 0.73
0.34 0.85 1.0 0.69 0.52 0.76 0.68 0.62 0.71 0.66 0.6 0.82 0.59 0.49 0.82
0.83 0.84 1.0 0.31 0.64 0.69 0.7 0.57 0.62 0.52 0.29 0.5 0.41 0.26 0.23
0.01 0.71 1.0 0.65 0.54 0.52 0.66 0.62 0.97 0.77 0.66 0.93 0.64 0.38 0.66
0.34 1.0 0.84 0.58 0.6 0.81 0.75 0.66 1.0 0.8 0.79 0.83 0.58 0.43 0.87
0.18 1.0 0.94 0.7 0.45 0.63 0.62 0.67 0.64 0.64 0.54 0.6 0.58 0.37 0.58
0.0 0.07 0.53 0.34 0.37 0.86 0.75 0.62 0.38 0.72 0.46 1.0 0.72 0.24 0.1
0.0 0.01 0.14 0.06 0.4 0.27 0.66 0.72 0.29 0.45 0.36 0.71 1.0 0.06 0.26
0.04 1.0 0.53 0.26 0.3 0.42 0.43 0.41 0.38 0.31 0.39 0.3 0.28 0.3 0.31
0.17 0.75 0.83 0.9 0.76 1.0 0.97 0.8 0.97 0.82 0.69 0.77 0.6 0.44 0.92
0.1 1.0 0.55 0.46 0.34 0.31 0.39 0.34 0.45 0.41 0.42 0.42 0.42 0.34 0.44
0.27 1.0 0.62 0.44 0.33 0.39 0.44 0.4 0.55 0.44 0.41 0.41 0.4 0.38 0.47
0.0 0.73 0.46 0.62 0.47 0.72 0.69 0.7 0.64 0.7 0.64 1.0 0.52 0.42 0.86
0.0 0.38 0.42 0.96 0.45 0.39 0.67 0.65 0.87 0.58 0.7 1.0 0.79 0.56 0.87
0.0 0.63 0.66 0.57 0.43 0.75 0.77 0.45 1.0 0.78 0.69 0.32 0.35 0.41 0.45
1.0 0.41 0.87 0.5 0.52 0.53 0.64 0.63 0.74 0.65 0.67 0.53 0.39 0.48 0.64
0.26 0.99 0.57 0.7 0.41 0.54 0.76 0.45 1.0 0.82 0.63 0.64 0.63 0.38 0.52
0.03 0.7 1.0 0.57 0.39 0.7 0.59 0.43 0.54 0.61 0.5 0.41 0.34 0.61 0.31
0.03 1.0 0.98 0.71 0.65 0.85 0.91 0.68 0.88 0.79 0.81 0.71 0.6 0.62 0.68
0.01 1.0 0.55 0.55 0.22 0.37 0.41 0.39 0.35 0.38 0.36 0.45 0.39 0.34 0.38
0.16 1.0 0.62 0.5 0.32 0.49 0.45 0.3 0.35 0.41 0.26 0.26 0.28 0.23 0.32
0.02 0.39 0.73 0.42 0.22 0.31 0.68 0.31 0.82 0.77 0.72 0.22 0.78 1.0 0.49
0.66 1.0 0.74 0.52 0.47 0.62 0.61 0.5 0.61 0.5 0.55 0.45 0.54 0.43 0.56
0.01 1.0 0.57 0.34 0.39 0.75 0.52 0.38 0.91 0.53 0.49 0.4 0.39 0.25 0.45
0.44 0.99 0.97 0.97 0.56 1.0 0.91 0.59 0.81 0.78 0.66 0.81 0.72 0.75 0.94
0.67 0.74 0.9 0.64 0.48 0.48 0.58 0.69 0.71 1.0 0.61 0.47 0.77 0.29 0.52
0.06 1.0 0.88 0.74 0.62 0.99 0.83 0.56 0.86 0.84 0.8 0.95 0.54 0.46 0.98
0.0 1.0 0.99 0.41 0.31 0.64 0.61 0.35 0.56 0.7 0.37 0.4 0.34 0.36 0.47
0.0 0.95 0.81 0.41 0.39 1.0 0.5 0.4 0.36 0.35 0.32 0.06 0.21 0.49 0.19
0.05 1.0 0.72 0.65 0.57 0.86 0.73 0.6 0.96 0.79 0.58 0.87 0.61 0.36 0.89
0.0 0.99 0.94 0.7 0.59 0.96 0.86 0.55 1.0 0.87 0.96 0.58 0.72 0.65 0.87
0.09 1.0 0.74 0.67 0.58 0.84 0.72 0.65 0.66 0.65 0.62 0.83 0.74 0.55 0.69
0.0 0.43 0.49 0.58 0.56 1.0 0.9 0.58 0.87 0.74 0.74 0.46 0.52 0.53 0.72
0.0 0.64 0.71 0.76 0.51 1.0 0.7 0.74 0.74 0.66 0.63 0.67 0.77 0.44 0.85
0.01 1.0 0.69 0.43 0.29 0.17 0.34 0.2 0.26 0.22 0.2 0.1 0.14 0.1 0.16
0.09 1.0 0.5 0.46 0.32 0.62 0.49 0.39 0.56 0.5 0.44 0.45 0.4 0.42 0.46
0.14 0.59 0.61 0.7 0.77 0.41 0.91 0.59 1.0 0.83 0.78 0.89 0.59 0.56 0.95
0.02 0.96 0.9 0.77 0.6 0.54 1.0 0.62 0.66 0.74 0.57 0.54 0.53 0.65 0.72
0.37 1.0 0.42 0.28 0.25 0.39 0.43 0.38 0.36 0.29 0.39 0.42 0.38 0.26 0.44
0.05 1.0 0.67 0.6 0.44 0.95 0.52 0.37 0.79 0.75 0.6 0.88 0.64 0.48 0.97
0.19 1.0 0.83 0.68 0.6 0.49 0.76 0.7 0.68 0.56 0.36 0.42 0.3 0.21 0.44
0.26 1.0 0.86 0.98 0.53 0.7 0.85 0.34 0.79 0.66 0.46 0.42 0.43 0.44 0.65
0.41 1.0 0.94 0.67 0.46 0.54 0.78 0.33 0.68 0.57 0.54 0.39 0.43 0.47 0.54
0.01 1.0 0.8 0.69 0.41 0.83 0.59 0.4 0.61 0.62 0.54 0.43 0.42 0.62 0.5
0.0 1.0 0.56 0.26 0.28 0.25 0.54 0.35 0.39 0.63 0.29 0.17 0.19 0.16 0.2
0.0 0.92 0.93 0.99 0.37 1.0 0.64 0.47 0.91 0.95 0.61 0.51 0.7 0.34 0.97
1.0 0.49 0.57 0.3 0.41 0.19 0.29 0.38 0.32 0.26 0.26 0.2 0.23 0.21 0.23
0.0 1.0 0.45 0.26 0.42 0.22 0.61 0.58 0.53 0.66 0.32 0.23 0.42 0.35 0.29
0.0 1.0 0.83 0.79 0.33 0.7 0.74 0.37 0.98 0.67 0.53 0.43 0.7 0.55 0.51
0.06 0.54 0.7 0.71 0.8 0.73 0.89 1.0 0.7 0.67 0.53 0.6 0.8 0.38 0.54
0.01 1.0 0.71 0.63 0.54 0.72 0.6 0.65 0.76 0.6 0.55 0.52 0.57 0.39 0.52
0.49 0.71 0.8 0.69 0.61 0.99 0.82 0.67 1.0 0.9 0.72 0.76 0.76 0.5 0.85
0.09 1.0 0.98 0.74 0.71 0.82 0.79 0.47 0.85 0.72 0.59 0.79 0.73 0.54 0.72
0.0 0.33 0.2 1.0 0.05 0.45 0.39 0.04 0.84 0.62 0.4 0.27 0.22 0.28 0.25
0.01 0.41 0.54 0.73 0.72 0.98 0.8 0.61 0.86 0.88 0.7 0.83 0.74 0.52 1.0
0.06 1.0 0.85 0.68 0.49 0.96 0.72 0.59 0.78 0.81 0.53 0.65 0.64 0.47 0.68
0.0 0.15 0.41 0.31 0.31 1.0 0.52 0.32 0.41 0.61 0.5 0.37 0.3 0.46 0.43
0.14 0.99 1.0 0.68 0.59 0.87 0.8 0.78 0.69 0.74 0.55 0.41 0.51 0.43 0.51
0.12 0.6 0.79 0.7 0.56 0.62 0.81 0.67 1.0 0.88 0.67 0.57 0.53 0.45 0.87
0.5 1.0 0.74 0.67 0.43 0.66 0.84 0.41 0.74 0.67 0.62 0.45 0.67 0.5 0.61
0.01 1.0 0.44 0.43 0.31 0.36 0.38 0.33 0.36 0.4 0.32 0.32 0.26 0.23 0.36
0.03 1.0 0.69 0.58 0.58 0.5 0.64 0.42 0.69 0.59 0.36 0.33 0.44 0.29 0.39
0.09 0.65 0.86 0.73 0.61 1.0 0.89 0.52 0.93 0.86 0.78 0.49 0.67 0.53 0.56
0.36 0.78 1.0 0.69 0.57 0.45 0.62 0.45 0.51 0.57 0.43 0.31 0.33 0.5 0.39
0.5 1.0 0.59 0.58 0.36 0.48 0.46 0.46 0.55 0.44 0.42 0.5 0.37 0.37 0.43
0.0 1.0 0.68 0.78 0.66 0.77 0.9 0.55 0.77 0.75 0.84 0.91 0.58 0.63 0.61
0.08 1.0 0.65 0.61 0.53 0.89 0.72 0.66 0.77 0.6 0.63 0.68 0.62 0.43 0.85
0.05 0.5 1.0 0.32 0.25 0.27 0.47 0.21 0.63 0.44 0.39 0.18 0.31 0.26 0.16
0.0 0.49 0.53 0.63 0.53 0.98 0.72 0.89 0.78 0.7 0.64 1.0 0.71 0.59 0.69
0.11 0.82 0.8 0.93 0.62 1.0 0.9 0.6 0.71 0.77 0.71 0.77 0.52 0.58 0.55
0.0 0.62 0.41 0.5 0.59 0.35 0.83 0.55 1.0 0.68 0.67 0.37 0.63 0.49 0.52
0.21 1.0 0.89 0.34 0.19 0.17 0.35 0.27 0.5 0.33 0.31 0.3 0.37 0.27 0.14
0.55 0.6 1.0 0.8 0.69 0.8 0.75 0.71 0.88 0.69 0.94 0.56 0.55 0.72 0.79
0.63 0.82 1.0 0.5 0.59 0.57 0.56 0.47 0.48 0.47 0.41 0.42 0.37 0.34 0.54
0.0 0.04 0.21 0.34 0.48 0.36 0.57 1.0 0.72 0.9 0.4 0.41 0.36 0.16 0.67
0.0 1.0 0.96 0.51 0.38 0.75 0.57 0.63 0.59 0.77 0.41 0.43 0.53 0.28 0.43
0.04 0.76 0.93 0.49 0.51 0.74 0.82 1.0 0.96 0.64 0.96 0.57 0.33 0.26 0.36
0.0 0.76 0.76 0.75 0.66 0.92 0.8 0.61 0.86 0.88 0.9 0.8 0.88 1.0 0.99
0.0 1.0 0.61 0.34 0.33 0.52 0.53 0.4 0.55 0.45 0.33 0.29 0.37 0.26 0.38
0.09 0.51 0.87 0.78 0.37 0.71 0.83 0.36 1.0 0.79 0.79 0.54 0.76 0.76 0.71
0.17 1.0 0.65 0.37 0.39 0.47 0.61 0.43 0.5 0.38 0.31 0.2 0.3 0.26 0.27
0.76 0.4 1.0 0.78 0.63 0.75 0.72 0.82 0.85 0.74 0.77 0.71 0.53 0.55 0.7
0.0 0.63 0.6 0.59 0.54 0.63 0.74 1.0 0.75 0.53 0.66 0.44 0.42 0.5 0.55
0.08 1.0 0.81 0.74 0.39 0.62 0.56 0.32 0.49 0.48 0.48 0.4 0.44 0.32 0.47
0.23 1.0 0.86 0.82 0.32 0.18 0.28 0.18 0.24 0.22 0.16 0.12 0.11 0.16 0.12
0.05 1.0 0.38 0.26 0.31 0.33 0.58 0.36 0.37 0.23 0.21 0.25 0.23 0.16 0.49

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)