Heatmap: Cluster_34 (HCCA Clusters (HRR 50 & PCC 0.5))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Pollen
Style
Flower
Fruit
Leaf
Petiole
Stem
Shoot
Root
Stolon
Tuber
Tuber_Meristem
Tuber_Periderm
Tuber_Flesh
Tuber_Sprout
0.0 0.11 0.12 0.62 0.74 0.46 1.0 0.81 0.51 0.16 0.22 0.69 0.74 0.07 0.27
0.22 0.24 0.65 0.45 0.66 0.86 0.92 0.78 0.8 0.71 0.45 0.97 0.66 0.19 1.0
0.01 0.35 0.43 0.46 0.87 0.78 0.51 1.0 0.33 0.32 0.66 0.55 0.5 0.4 0.44
0.0 0.7 0.65 0.71 0.71 1.0 0.89 0.89 0.65 0.73 0.66 0.94 0.8 0.77 0.77
0.0 0.11 0.08 0.15 0.3 1.0 0.6 0.71 0.22 0.12 0.29 0.68 0.76 0.13 0.19
0.0 0.09 0.14 0.5 0.56 0.91 0.84 0.66 0.67 0.76 0.63 0.75 1.0 0.84 0.55
0.0 0.11 0.09 0.12 0.5 0.42 0.3 1.0 0.23 0.29 0.3 0.46 0.75 0.22 0.59
0.04 0.12 0.39 0.42 0.39 0.98 0.6 0.77 0.34 0.28 0.43 0.64 1.0 0.31 0.77
0.0 0.42 0.55 0.57 0.56 0.91 0.76 0.76 0.51 0.37 0.47 0.89 0.76 0.27 1.0
0.0 0.17 0.45 0.78 0.66 0.61 1.0 0.92 0.74 0.65 0.72 0.89 0.88 0.73 0.51
0.0 0.56 0.48 0.62 1.0 0.97 0.81 0.99 0.35 0.37 0.54 0.53 0.69 0.77 0.51
0.0 0.27 0.4 0.49 0.55 0.68 0.68 0.57 0.46 0.51 0.59 1.0 0.99 0.83 0.67
0.0 0.06 0.02 0.43 0.51 0.25 0.63 0.39 0.42 0.43 0.5 0.8 1.0 0.47 0.45
0.0 0.09 0.0 0.08 0.49 0.39 1.0 0.04 0.03 0.13 0.1 0.24 0.31 0.21 0.14
0.0 0.3 0.39 0.51 0.65 0.49 0.69 0.61 0.58 0.51 0.45 1.0 0.62 0.35 0.67
0.12 0.37 0.53 0.53 0.71 0.82 0.97 1.0 0.64 0.59 0.55 0.72 0.81 0.46 0.74
0.0 0.12 0.09 0.09 0.48 0.66 0.31 0.71 0.24 0.16 0.22 0.84 0.8 1.0 0.05
0.0 0.2 0.03 0.12 0.4 0.48 0.46 0.26 0.21 0.15 0.29 1.0 0.66 0.52 0.05
0.0 0.17 0.15 0.49 0.46 1.0 0.83 0.52 0.54 0.66 0.67 0.75 0.8 0.8 0.53
0.02 0.27 0.55 0.41 0.66 0.76 0.82 0.63 0.49 0.67 0.53 1.0 0.68 0.64 0.5
0.0 0.18 0.13 0.41 0.58 0.94 0.94 0.65 0.49 0.49 0.42 1.0 0.84 0.17 0.76
0.0 0.14 0.24 0.2 0.55 1.0 0.77 0.67 0.62 0.43 0.33 0.49 0.62 0.43 0.53
0.0 0.2 0.33 0.64 0.6 0.94 0.61 1.0 0.46 0.48 0.4 0.69 0.48 0.27 0.75
0.0 0.21 0.34 0.38 0.44 0.42 0.69 0.54 0.65 0.43 0.33 1.0 0.41 0.31 0.77
0.0 0.61 0.61 0.52 0.6 1.0 0.66 0.93 0.41 0.37 0.44 0.83 0.69 0.31 0.55
0.02 0.16 0.21 0.32 0.51 0.23 0.65 0.56 0.44 0.44 0.42 1.0 0.71 0.65 0.54
0.0 0.69 0.45 0.36 0.68 1.0 0.47 0.71 0.24 0.23 0.36 0.36 0.4 0.28 0.35
0.0 0.76 0.53 0.5 0.74 0.94 0.95 0.73 0.47 0.45 0.82 0.73 1.0 0.95 0.75
0.0 0.24 0.39 0.33 0.49 1.0 0.62 0.59 0.35 0.4 0.25 0.41 0.7 0.08 0.39
0.0 0.06 0.31 0.37 0.51 0.93 0.68 0.6 0.52 0.57 0.33 1.0 0.81 0.44 0.86
0.0 0.22 1.0 0.7 0.9 0.65 0.58 0.59 0.57 0.36 0.61 0.61 0.84 0.18 0.3
0.0 0.64 0.66 0.55 0.77 0.7 0.93 1.0 0.67 0.63 0.61 0.38 0.43 0.36 0.57
0.0 0.83 1.0 0.56 0.59 0.63 0.62 0.8 0.48 0.45 0.53 0.19 0.9 0.11 0.58
0.0 0.31 0.31 0.45 0.77 1.0 0.99 0.04 0.64 0.61 0.52 0.98 0.83 0.28 0.2
0.0 0.08 0.45 0.44 0.96 1.0 0.78 0.57 0.19 0.31 0.44 0.67 0.82 0.4 0.73
0.0 0.25 0.34 0.47 0.61 1.0 0.82 0.77 0.61 0.52 0.46 0.84 0.96 0.11 0.91
0.0 0.11 0.12 0.18 0.64 0.46 1.0 0.63 0.51 0.53 0.46 0.96 0.42 0.17 0.45
0.0 0.1 0.06 0.15 0.72 0.91 0.76 1.0 0.24 0.23 0.22 0.48 0.71 0.06 0.3
0.0 0.39 0.81 0.42 1.0 0.6 0.79 0.82 0.41 0.28 0.59 0.53 0.62 0.38 0.86
0.0 0.13 0.17 0.49 0.36 0.98 0.68 0.61 0.46 0.46 0.37 0.94 1.0 0.22 0.45
0.05 0.24 0.63 0.65 0.63 1.0 0.88 0.93 0.46 0.52 0.44 1.0 0.77 0.48 0.87
0.02 0.65 0.66 0.49 0.78 0.9 0.62 1.0 0.49 0.44 0.59 0.49 0.62 0.41 0.68
0.0 0.08 0.16 0.25 0.34 1.0 0.52 0.44 0.44 0.3 0.36 0.61 0.78 0.24 0.54
0.14 0.19 0.19 0.34 0.48 0.9 0.75 0.95 0.46 0.25 0.37 1.0 0.71 0.53 0.5
0.0 0.28 0.18 0.15 0.63 1.0 0.68 0.59 0.35 0.35 0.32 0.72 0.8 0.21 0.91
0.0 0.57 0.54 0.52 0.65 0.75 0.61 1.0 0.37 0.37 0.48 0.47 0.91 0.43 0.48
0.0 0.7 0.73 0.52 0.96 0.72 0.79 1.0 0.44 0.45 0.54 0.62 0.67 0.55 0.63
0.0 0.23 0.24 1.0 0.42 0.31 0.92 0.61 0.49 0.39 0.69 0.92 0.66 0.53 0.77
0.0 0.16 0.39 0.38 0.58 0.79 0.81 0.8 0.51 0.53 0.37 1.0 0.76 0.37 0.44
0.0 0.18 0.25 0.6 0.46 1.0 0.94 0.63 0.57 0.61 0.56 0.61 0.9 0.61 0.66
0.0 0.11 0.83 0.27 0.39 1.0 0.63 0.58 0.28 0.29 0.35 0.58 0.61 0.45 0.45
0.0 0.27 0.29 0.56 0.64 0.82 0.81 0.48 0.56 0.64 0.42 1.0 0.69 0.28 0.54
0.0 0.19 0.31 0.64 0.65 0.67 0.92 1.0 0.57 0.56 0.56 0.97 0.68 0.3 0.72
0.0 0.21 0.22 0.36 0.4 0.58 0.79 0.52 0.48 0.48 0.45 1.0 0.46 0.31 0.83
0.0 0.2 0.28 0.36 0.67 0.95 0.58 0.45 0.54 0.5 0.55 0.44 0.39 0.28 1.0
0.0 0.18 0.04 0.1 0.29 0.0 0.75 0.7 0.32 0.23 0.46 0.93 0.94 0.3 1.0
0.0 0.11 0.09 0.44 0.44 0.49 0.8 0.49 0.45 0.37 0.42 1.0 0.76 0.49 0.9
0.0 0.15 0.31 0.95 0.35 0.68 0.5 0.65 0.31 0.31 0.22 1.0 0.58 0.23 0.26
0.0 0.09 0.0 0.38 0.42 0.32 0.59 0.53 0.26 0.11 0.2 1.0 0.12 0.12 0.51
0.0 0.26 0.32 0.3 0.59 0.55 0.68 0.72 0.47 0.44 0.44 1.0 0.65 0.16 0.32
0.0 0.45 0.24 0.29 0.43 0.28 0.31 0.83 0.12 0.15 0.29 0.03 1.0 0.2 0.09
0.09 0.33 0.13 0.35 0.73 0.85 1.0 0.6 0.47 0.38 0.47 0.79 0.49 0.34 0.85
0.04 0.79 0.7 0.49 0.74 0.67 0.48 1.0 0.36 0.33 0.41 0.47 0.53 0.33 0.43
0.0 0.25 0.32 0.25 0.43 1.0 0.35 0.6 0.21 0.24 0.34 0.48 0.53 0.24 0.47
0.0 0.28 0.35 0.23 0.42 1.0 0.33 0.53 0.24 0.19 0.29 0.41 0.5 0.33 0.31
0.05 0.46 0.58 0.47 0.87 0.56 0.6 0.6 0.31 0.37 0.64 1.0 0.77 0.47 0.68
0.0 1.0 0.61 0.48 0.66 0.75 0.84 0.73 0.6 0.5 0.6 0.92 0.94 0.37 0.83
0.0 0.14 0.0 0.47 0.53 0.35 1.0 0.62 0.41 0.31 0.29 0.85 0.17 0.3 0.24
0.0 0.13 0.03 0.19 0.21 0.45 0.62 0.5 0.12 0.17 0.4 1.0 0.59 0.11 0.66
0.0 0.1 0.35 0.46 0.48 0.79 0.68 0.66 0.54 0.53 0.55 0.97 1.0 0.56 0.61
0.0 0.51 0.35 0.42 0.57 0.47 0.62 1.0 0.57 0.44 0.38 0.73 0.44 0.44 0.56
0.0 0.21 0.6 0.56 0.68 0.93 1.0 0.86 0.66 0.63 0.5 0.94 0.74 0.25 0.8
0.0 0.34 0.4 0.41 0.44 1.0 0.63 0.64 0.34 0.41 0.34 0.56 0.96 0.32 0.53
0.0 0.15 0.0 0.0 0.48 0.38 0.41 1.0 0.17 0.21 0.08 0.56 0.24 0.14 0.05
0.0 0.16 0.33 0.41 0.58 1.0 0.52 0.69 0.36 0.34 0.43 0.48 0.55 0.3 0.54
0.0 0.19 0.14 0.74 1.0 0.34 0.88 0.82 0.58 0.53 0.54 1.0 0.69 0.38 0.56
0.0 0.25 0.17 0.35 0.41 0.96 0.99 0.42 0.6 0.43 0.6 1.0 0.77 0.23 0.54
0.16 0.66 0.72 0.54 0.77 0.95 1.0 0.86 0.62 0.59 0.75 0.84 0.88 0.64 0.79
0.0 0.17 0.08 0.62 0.32 0.94 0.58 0.72 0.14 0.19 0.37 1.0 0.43 0.49 0.75
0.0 0.12 0.3 0.48 0.91 0.84 1.0 0.85 0.66 0.41 0.47 0.67 0.92 0.38 0.38
0.0 0.2 0.11 0.56 0.66 0.0 0.78 1.0 0.41 0.49 0.26 0.84 0.45 0.3 0.63
0.0 0.48 0.3 0.83 0.76 0.0 0.99 0.47 0.31 0.38 0.27 1.0 0.39 0.17 0.25
0.0 0.34 0.46 0.41 0.6 1.0 0.54 0.76 0.43 0.36 0.56 0.67 0.79 0.52 0.61
0.0 0.23 0.42 0.38 0.5 1.0 0.58 0.67 0.43 0.39 0.29 0.54 0.55 0.03 0.43
0.0 0.14 0.03 0.2 0.39 0.0 0.63 0.54 0.4 0.27 0.4 1.0 0.84 0.34 0.77
0.0 0.72 0.52 0.51 0.74 0.85 0.73 1.0 0.4 0.55 0.5 0.43 0.37 0.33 0.59
0.0 0.25 0.37 0.0 0.55 0.94 0.69 0.93 0.4 0.37 0.3 1.0 0.99 0.29 0.63
0.0 0.2 0.43 0.89 0.8 0.66 1.0 0.91 0.88 0.77 0.61 0.97 0.72 0.38 0.66
0.0 0.24 0.17 0.38 0.39 0.42 0.67 0.41 0.37 0.41 0.53 0.87 0.76 0.46 1.0
0.0 0.14 0.07 0.18 0.47 0.97 0.8 0.67 0.43 0.44 0.29 1.0 0.42 0.25 0.46
0.0 0.12 0.18 0.6 0.86 1.0 0.76 0.78 0.31 0.3 0.39 0.33 0.42 0.27 0.31
0.0 0.0 0.03 0.29 0.77 0.77 1.0 0.83 0.19 0.15 0.27 0.51 0.5 0.24 0.09
0.0 0.54 1.0 0.73 0.41 0.44 0.38 0.23 0.26 0.38 0.54 0.03 0.92 0.03 0.35
0.0 0.17 0.46 0.43 0.56 1.0 0.61 0.71 0.59 0.5 0.62 0.99 0.85 0.39 0.71
0.0 0.2 0.27 0.26 0.61 0.37 0.59 0.68 0.49 0.4 0.48 0.32 1.0 0.32 0.38
0.0 0.1 0.25 0.48 0.51 0.6 1.0 0.5 0.58 0.46 0.54 0.93 0.88 0.64 0.88
0.0 0.21 0.11 0.2 0.45 0.55 0.77 0.74 0.34 0.23 0.39 0.65 1.0 0.33 0.58

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)